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回答
DRMAA
- Cant在编译c文件时的链接
drmaa
库
我编写了一个小的c文件来测试
DRMAA
,但是它一直告诉我,我使用的
DRMAA
函数没有定义。我在C代码中包含了
drmaa
.h文件。[
DRMAA
_ERROR_STRING_BUFFER];errnum =
drmaa
_init (argv[0], error,
DRMAA
_ERROR_STRING_BUFFER=
DRMAA
_ERRNO_SUCCESS) { fprintf (stderr, "Couldn't
浏览 3
修改于2014-10-03
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回答
SGE
DRMAA
python作业进程
我正在使用Python
drmaa
库在SGE集群上启动作业。我的服务在REST API上可用,在我的测试期间,所有工作都正常,作业提交/等待完成/完成后检索结果。进程在同一
drmaa
会话中运行一次。在我的web界面上,作业不会被处理:-作业提交-在SGE上启动的作业-另一个时间的作业状态(通过调用
drmaa
.session.jobStatus(jobId) )有没有办法从另一个会话获取作业
浏览 4
提问于2016-06-17
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3
回答
DRMAA
与shared.library.path
我尝试在
DRMAA
中使用sun网格引擎,方法是遵循在:上找到的教程。为此,我需要加载位于/srv/sge/lib/lx24-AMD 64/
drmaa
.so中的c库。但我还是得到了这个例外: 当试图检索会话时,将引发此异常
浏览 3
修改于2013-04-10
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1
回答
用pbs-
drmaa
进行动态连接误差
我已经安装了pbs-
drmaa
库,但是在运行C程序时遇到了一个错误。$ gcc teste_
drmaa
1.c -L /usr/lib/pbs-
drmaa
/lib -I /usr/lib/pbs-
drmaa
/include -ldrmaa-o teste_
drmaa
1 但当我试图逃跑时,我会发现一个错误
浏览 3
提问于2014-08-12
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1
回答
sun网格引擎出现
drmaa
错误-没有活动会话
但是,我想使用python
drmaa
库来运行作业,并且我已经在主节点上安装了:pip install
drmaa
import
drmaa
"""Query the system."""s =
drmaa
.Session() s.initialize()
浏览 1
提问于2014-06-02
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1
回答
在
drmaa
-python中关闭调试消息
我正在使用
DRMAA
python绑定(请参阅这里的)来管理集群上通过Condor的分布式作业。调试:现在正在等待...DEBUG:
drmaa
_join_files DEBUG: Join_files已设置DEBUG:
drmaa
_block_email: 1 有什么想法吗?
浏览 0
提问于2013-02-09
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1
回答
获得具有
DRMAA
接口的运行作业主机
使用
DRMAA
接口到Grid之子,我希望获得运行特定作业的主机的名称。我想要下面这样的内容(使用
drmaa
-python接口)>>> s =
drmaa
.Session()>>> s.jobStatus(jobid) >>
浏览 3
提问于2016-10-13
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1
回答
等待作业完成的有效方法: python和
drmaa
我想问一下我通过Python使用的
drmaa
中的“等待”特性。它是否执行常量qstat(如果我们在SGE上运行它)来检查程序是否已经完成执行。一般来说,wat将是一种通过
DRMAA
检查作业状态的有效方法,而不会过度使用调度程序。 谢谢!-Abhi
浏览 0
提问于2012-06-07
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3
回答
是否有与Torque/PBS一起工作的
DRMAA
Java库?
有人知道
DRMAA
的Java实现吗?众所周知,它与PBS/Torque集群软件一起工作?
drmaa
是一个标准,因此Java只需要符合标准的
drmaa
绑定。
浏览 13
修改于2012-07-02
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1
回答
是否可以使用
DRMAA
列出正在运行的作业?
我想知道是否有可能使用
DRMAA
库列出资源管理器中所有正在运行的作业,而不仅仅是那些通过
DRMAA
本身启动的作业? 也就是说,获取与的输出类似的数据。
浏览 0
提问于2013-04-19
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1
回答
如果指定了--
drmaa
-log-dir,则snakemake作业将失败
无论是在本地启动还是通过snakemake --
drmaa
提交到SLURM,管道都能正常运行:提交作业后,一切都按预期运行。但是,在后一种情况下,会在当前目录中生成多个slurm日志文件。使用--
drmaa
-log-dir选项调用的Snakemake将创建选项中指定的目录,但无法执行规则。不会生成日志文件。 下面是一个最小的例子。下面是snakemake --
drmaa
的输出 Building DAG of jobs...jobs 1 [Fri Apr 10 21:03:50 202
浏览 28
提问于2020-04-11
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回答
在使用
DRMAA
时用Snakemake设置SGE集群作业名?
snakemake --jobs 100 --
drmaa
"-V -S /bin/bash -o log/mpileup/mpileupSPLIT -e log/mpileup/mpileupSPLITsnakemake --jobs 100 --
drmaa
"-V -S /bin/bash -o log/mpileup/mpileupSPLIT -e log/mpileup/mpileupSPLIT我通常的电话是: s
浏览 2
修改于2017-05-25
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回答
如何在非
DRMAA
批处理调度环境中使用Dask?
不幸的是,我们使用的批处理调度程序不支持
DRMAA
,所以我不能使用dask-
drmaa
。我们为所有主机提供了NFS。有没有办法开始使用Dask,或者我需要让批处理调度器支持
DRMAA
?
浏览 0
提问于2017-03-13
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1
回答
将作业数组索引作为
drmaa
-python中的参数进行传递
我正在使用lsf-
drmaa
实现,并通过
drmaa
-python进行接口。我通常将环境变量$LSB_JOBINDEX作为参数传递给我的run.sh脚本。通过
drmaa
-python,我创建了JobTemplate jt,并希望将其作为参数传递。我已经尝试过使用PARAMETRIC_INDEX,但是这个命令不适用于我:jt.args = [str(
drmaa
.JobTemplate.PARAMETRIC_INDEX)]。我收到以下错误: W #29c0 [ 1227.22] * '$
drmaa
浏览 0
提问于2016-03-23
得票数 2
1
回答
为什么python库(
DRMAA
)有时不能确定提交给SGE的作业的状态?
因此,我知道问题不在于SGE,而在于
drmaa
库。 有人知道为什么
drmaa
不能确定状态吗?
浏览 1
修改于2013-10-23
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2
回答
SGE上
DRMAA
的Web服务API
有人知道有什么项目可以将 (Sun Grid Engine)的 (作业调度和维护API)公开为web服务API吗?一个RESTful API将是最好的。
浏览 0
提问于2011-12-29
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1
回答
如何使用
DRMAA
等待外部启动的作业?
我想等待外部提交的作业完成。
浏览 0
提问于2014-10-22
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1
回答
本地Java程序可以使用
DRMAA
通过SSH远程启动作业吗?
DRMAA
是如何工作的?使用
DRMAA
的本地Java程序能否通过SSH在远程集群上启动作业(这样就不需要在服务器端安装任何东西)?
浏览 4
修改于2013-04-16
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2
回答
使用python
drmaa
包装器更改SGE中作业的优先级
当我尝试使用python包装提交作业时,我得到一个DeniedByDrmException: code 17:作业拒绝:正提交优先级需要操作符特权。
浏览 4
提问于2015-06-09
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1
回答
在
DRMAA
集群上运行许多作业时,是否有一种方法可以获得一个很好的错误报告摘要?
我需要在
DRMAA
集群上运行一个snakemake管道,其总数为>2000个作业。当一些作业失败时,我想最终收到一份容易阅读的摘要报告,其中只列出失败的作业,而不是日志中给出的整个作业摘要。
浏览 0
提问于2019-08-20
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