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如何从Talend中的txt文件中提取模式
生物:智人类型:通过
高通量
测序
平台进行表达谱分析: GPL24676 11样例下载: GEO (MTX,TSV) SRA Run Selector:系列加入: GSE152999 ID: 200152999
浏览 4
修改于2021-03-22
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1
回答
使用Python加快并行读取大文件的速度
这些文件在blocks中记录
高通量
的
测序
数据(我们称之为
测序
reads),而每个read包含4行(name、sequence、n、quality)。read记录在两个文件中的顺序相同。
浏览 2
修改于2018-11-06
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1
回答
cummeRbund创建基因集
我正在使用cummeRbund,这是一个用于袖扣
高通量
测序
数据的R可视化包。 我想创建一个基因集,以便能够分析我感兴趣的差异表达的基因。
浏览 0
修改于2016-06-02
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2
回答
RxJ的好教程
如下所示:通过合并元素的索引,将可观
测序
列的每个元素投影到新的可观
测序
列序列中,然后将可观
测序
列的可观
测序
列转换为仅从最新的可观
测序
列产生值的可观
测序
列
浏览 5
提问于2016-08-05
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1
回答
嵌套泛型约束:在被约束到该泛型类型的泛型序列扩展中约束泛型项的T
Sequence where Iterator.Element : ObservableType where E : MyType { 在上述伪代码(不起作用)中,意图是: 此扩展应适用于可观
测序
列,其中可观
测序
列是MyType类型的可观
测序
列,例如,可观
测序
列
浏览 3
提问于2017-01-17
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2
回答
将现有的ERC-20转让给平衡计分卡
我们希望移动到Binance智能链或TRON区块链,因为它提供
高通量
和较低的tx费用。如何将现有的ERC20移动到另一个链,特别是平衡
浏览 0
提问于2021-05-19
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1
回答
删除大文件中的重复行
目前正在使用下一代
测序
(ngs),需要从文件
测序
(大数据)中删除重复读数。我正在尝试在java中使用和,但仍然不能成功。
浏览 19
提问于2018-08-23
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1
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在R中交叉多个数据帧
我的数据帧来自
高通量
测序
实验,如下所示: chr pos orient weight in_nucleosome in_subtelo 1 NC_001133 999
浏览 2
修改于2015-03-31
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1
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隐马尔可夫模型训练中的不等长观
测序
列
观
测序
列的长度不是固定的。我尝试了一些HMM包,如Matlab的HMM工具箱和Kevin的库。它们似乎都要求用户指定转移概率矩阵和发射概率矩阵的大小。我知道,对于隐马尔可夫模型(HMM),转移概率矩阵和发射概率矩阵的大小取决于隐态数和观
测序
列的长度。如果观
测序
列的长度不是固定的呢?或者我可以通过填充零来使观
测序
列保持相同的长度吗?
浏览 0
修改于2018-07-20
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2
回答
利用HIdden马尔可夫模型进行预测
给定n个观
测序
列和这些序列的n+1观
测序
列,HMM能用来预测一个新的n观
测序
列的(n+1)th观测吗?如果是的话,怎么做? 从文档中我无法很好地理解这一点。我找到了一个可能的,但它没有指定如何在Scikit中使用HMM --学习预
测序
列中的下一个值。
浏览 5
修改于2017-05-23
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1
回答
双散列细节
对于双哈希实现的探
测序
列,下列哪一项不是正确的?两个键可以有相同的探针序列C.探
测序
列的元素是哈希表的可能键我相信A,B和D是正确的,所以我认为C是正确的答案。
浏览 1
修改于2016-11-23
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3
回答
f(++i,++i)是未知的吗?
我似乎记得在C++11中,他们对
测序
行为做了一些更改,现在i++和++i有不同的
测序
需求。 f(++i, ++i)是否仍未定义行为?f(i++, i++)和f(++i, ++i)有什么区别?
浏览 0
修改于2015-03-28
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2
回答
DNA序列数据.长而宽的实验数据表的要求
我需要建立一个数据库来保存从DNA
测序
实验中获得的数据。2)有几个数据点为空专栏: bed1,bed2...bed10000..。 行: sample1,sample2..。
浏览 0
修改于2020-05-10
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回答
RNA velocity图的箭头长短有什么含义吗?
velocity
单细胞
测序
分析方法Velocity的箭头长短有什么含义吗?
浏览 253
提问于2022-01-19
2
回答
高通量
全球熵源
是否有提供以下三个属性的熵源?在不同的时间周期内,在相隔不到10公里的两个设备上产生相同的(随机)数据。我考虑像大气噪音或类似的来源,但我不确定它们是否符合性质(2) (和(3)).
浏览 0
修改于2017-01-03
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1
回答
基于序列对齐算法的NER构建
问题:,因为命名实体识别器和DNA序列库都进行近似字符串匹配--使用DNA
测序
库(如)并构建NER是实用的吗?不使用现有的NER开源,而是使用DNA
测序
库来构建NER的原因之一是希望在我的NER中自动获得“拼写错误更正”。 如果我以上的假设是有意义的
浏览 0
提问于2015-12-18
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高通量
刀片的NoSQL技术
在现有的非sql技术中,哪一种更适合高吞吐量插入?我确信这也取决于硬件,但假设我使用的是具有固定步长的amazon集群计算节点,并且理想情况下需要最少的节点数。我需要一个存储系统,它可以提供20 is /min的插入,在这里我的数据是完全结构化的,每一行大约是110字节。Theoretically,我可以不确定地增加硬件来实现这一点,但是我想知道哪种技术更适合这种高吞吐量的插入?
浏览 7
提问于2012-03-27
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1
回答
测序
渲染反应
我想创建一个简单的问答应用程序。<Text style={styles.text}>{question.question}</Text> TypeError: TypeError:未定义不是对象(计算'question.question') 我怎么才能解决这个问题?import React from "react"; import { View, Styl
浏览 1
修改于2019-11-21
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1
回答
合并可观
测序
列,其中一些序列是异步的,并保持顺序
例如,我有两个可观
测序
列,"data1“和"data2”,我希望将它们合并成一个可观
测序
列,同时保持初始顺序。当两个可观
测序
列没有异步工作时--这里用一个小延迟建模--这在Rx.Observable.merge中是很容易做到的。但是,使用这种方法,任何异步工作都会破坏顺序。是否有可能合并可观
测序
列,传递值,如果他们的已知值和等待值还不知道,使用内置运算符?如果没有,我应该建造哪种类型的操作员?
浏览 1
修改于2015-05-19
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回答
在列表中添加1到L元素,从随机位置开始
这是一个问题:用一个包含G元素的列表来表示G大小的基因组,其中每个元素都包含有关该位置的相关信息,例如,该位置的核苷酸被
测序
了多少次。若要模拟一次
测序
过程,请执行以下步骤:·将列表中的所有元素设置为0(标记每个核苷酸已被
测序
0次)。·随机选择L大小R读的起始位置,并对每次读更新所包含的核苷酸序列的次数进行测定。
浏览 2
提问于2017-10-11
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