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我写了一种从FSL神经成像库中解析设计文件的方法。设计文件是带有神经成像软件设置的文本文件。我最初编写的代码是通过文件在一个循环中完成所有处理。
我正在寻找各种各样的建议，但主要是设计技巧和最佳实践。
浏览 0修改于2018-02-07得票数 4
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我会用我的Ubuntu来做神经成像。这是我第一次使用--过去几年我一直在使用Mac，所以我不熟悉在普通PC上使用Ubuntu。几个问题:根分区、交换分区和主分区是否必要？我的规格如下：我想知道我应该做什么‘最大’它出来，因为我计划运行非常密集的成像分析Ubuntu。
浏览 0提问于2015-05-15得票数 0
我运行了许多Pearson的R相关性，然后我想纠正多个比较使用Statsmodel。具体来说，我使用了函数。给定一个p值列表，函数根据所提供的alpha值以及基于指定方法的调整p值返回假设是否被拒绝。在我的例子中，我使用了"fdr_bh“方法，这是分步骤的Benjamini & Hochberg (1995)方法。fdr_p = multitest.multipletests(uncorrected_p, alph
浏览 17提问于2022-05-30得票数 0
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我正在查看一个DLC文件，该文件表示Snapdragon神经处理引擎内部的神经网络所使用的图形。
我想把这个模型想象成像tensorboard这样的东西。
浏览 0提问于2019-02-02得票数 0
我是一个初级的神经网络，我有一个神经网络，经过训练，以适应输入数据与目标数据，然后模拟神经网络在一个新的样本数据，以获得一个预测输出。问题是输出是介于“0”和“1”之间的规范化值，我需要将它们转换成像“小数”这样的实值。我读过，我必须使用激活函数，但我不知道如何做到这一点。
浏览 3提问于2016-10-14得票数 0
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(1.)每个判决使用两个输出神经元，并通过偏爱较高值的神经元作出+ve决策。
(2.)2.)每个神经元对一个特定阈值的决定，例如0.5，因此，通过检查神经元是否输出值>= 0.5来做出+ve决策。比方说，人们希望网络根据输入数据进行预测，比如每次从给定的图像中预测形状的质心，除了让输出神经元得到可能的结果数(这绝对是由于X,Y值对而产生的像素x的全部数量)之外，还能做什么。具体来说，如何才能使输出神经元像质心一样激发(432,50)，在这种情况下，可能的质心(X,Y)坐标是从0到4
浏览 1修改于2018-10-12得票数 0
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好吧，所以-我一直在处理python的神经网络，我做了几个前馈和一些重复的。我知道他们是如何在一个相当基本的水平上工作的。有时候，我会看到一些人用神经网络来生成像文字这样的东西；他们会声称自己已经训练了几千个段落，然后它会写一个新的段落。我最近读到一篇关于神经网络的文章，它分析了成千上万的字体，然后创建了自己的字体。这是一个问题--到目前为止，我建立的所有神经网络都有一个输入和输出的数据集。我读到的这些神经网络看上去好像不接受输入，它们只是看了很多东西的实例，然后创建了一个新的实例(就像
浏览 1提问于2016-07-01得票数 0
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然而，在处理我的神经成像数据时，git附件的性能相当欠缺。这类数据通常来自许多图像文件(5KB)，例如每个参与者每个实验大约36.000个图像文件。如果没有，有没有(大致)类似的软件可以让我管理多个神经影像数据存储库？
浏览 3修改于2015-11-02得票数 2
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第一次来这里
我实验室的人正在对各种私有化的神经成像中心(如)的网络存在进行内容分析(例如逐行阅读一篇文章或成绩单并识别相关主题)。
浏览 12提问于2010-06-09得票数 1
我想在ADNI数据库中的医学神经图像MRI图像扫描数据集上工作。
每个阿尔茨海默病(AD) MRI图像扫描都有多个切片。大多数的医学神经图像是DICOM、NfINT、NII等格式的。对于CNN网络模型，是否必须将其转换为png或jpg，或者将其保留为NfNIT或nii格式？我已经阅读了几篇关于阿尔茨海默病的神经成像的现有论文，但没有找到上述问题的答案。甚至我也给研究论文的作者发了一封电子邮件回复，我得到了他们的无能为力，因为他们很忙，并对此表示诚挚的道歉。
浏览 7提问于2021-02-22得票数 1
我正在尝试实现荧光成像中神经元/轴突数据的3D分割和跟踪算法。我研究了分水岭算法，活动轮廓，OTSU阈值，但无法决定采用哪种算法。
浏览 1提问于2015-02-23得票数 1
我对机器学习和python非常陌生，我正试图建立一个模型来预测病人(N=200)和对照组(N=200)形成的结构神经成像数据。在最初的预处理之后，我将神经成像数据重组成一个2D阵列，我建立了以下模型：svc = SVC(C=1.0, kernel='linear')
浏览 4修改于2016-05-17得票数 2
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我正在处理一些神经成像数据，我的扫描维度是(100,150,100)。我目前正在使用nibabel格式的文件。
有没有一种很好的方法来交换坐标轴？例如，我希望我的图像是(100,100,150)。
浏览 20提问于2020-05-05得票数 1
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目前，对于处理过的钙成像数据，我有两种不同的模式，在这些模式中，我使用了两种不同的预处理方法。我所要做的工作的主要目标是使用来自1个模式的源作为引用，并在第二个模式中提取相应的源。我已经完成了源匹配，这样我就可以知道schema1中的每个神经元在schema2中对应的神经元是什么。在schema1中的表中，每个神经元都有一个名为neurID的整数主键和一个外键(schema2ID)，其中包含schema2中该神经元的对应主键。我遇到的问题是，在schema2中，每个神经元的主键也称为ne
浏览 0提问于2021-04-26得票数 1
我使用的是.NII文件格式，它代表神经成像数据集。我需要使用自动ML标签的图像数据集，是近2GB的大小为每个病人。
浏览 9提问于2022-05-09得票数 0
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我用反向传播算法训练了一个神经网络。我手动运行网络30次，每次更改输入和期望的输出。结果是一个传统的分类器。3个输入，2个隐藏神经元，1个输出神经元
提前感谢
浏览 7修改于2017-04-13得票数 0
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代码涉及到NiBabel，一个用于访问的程序/库，它是一种混乱的神经成像文件格式，我无法真正理解以下代码所做的事情：
folderData = os.path.dirname(ground_truth_path
浏览 0修改于2019-07-10得票数 1
我有大脑神经元的荧光成像数据，基本上是由体素定义的三维图像。我想显示它使用粘度显示的深度，并能够旋转和查看从各个方向的数据。
我不想要一个投影，但是我想把每个像素表示成一个点，然后用粘滞来显示它们。
浏览 1提问于2015-03-15得票数 1
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例如，我们希望通过自动化管道处理我们的神经元钙成像数据的预处理和去噪/分离，但是在进入数据库进行进一步分析之前，每个视频和每个细胞都需要手动审查。处理这些步骤的最佳实践是什么？
浏览 18提问于2021-05-26得票数 0
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