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拆分数据矩阵
我有一个数据矩阵,其中包含100,000行的值,这些值对应于几种细胞类型的
甲基化
值。我想在集群热图中直观地显示
甲基化
的变化。为了使数据更易于管理,我正在考虑每10行左右创建一个新的数据矩阵。
浏览 0
修改于2013-06-11
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回答
标识特定范围内的值数
我有一个数据表,列名为单元格类型(20种细胞类型),然后是每种细胞类型的23000个基因的行名及其
甲基化
值(介于0到1之间)。确定
甲基化
值在以下范围内的基因数目: 0-0.0999,0.1-0.1999,0.2-0.29999等,每种细胞类型的
甲基化
值为0.9-1。我还想对整个数据表进行类似的分析(即
甲基化
值在上述范围内的基因数目)。
浏览 1
修改于2017-09-10
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回答
在具有协变量的两个数据帧之间进行一系列t检验。
我有两个数据,一个是病人样本的协变量,另一个是样本的
甲基化
数据。我需要做t检验来比较按性别划分的
甲基化
数据。caucasiansample6 p6 1 caucasian
甲基化
因此,如果我想对前8个样本的
甲基化
数据和性别进行一系列的t检验,我是否可以指定:t.test(t(methylation[,1:8]) ~ covariates$sex)?
浏览 0
修改于2018-10-17
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回答
做一个正则表达式来验证整数和十进制数。
[
5-9
]+)","1.1") # true correctre.search("([+-]?[0-9]+\.[0-9]+)|([+-]?[
5-9
]+)","5") # true correct re.search("([+-]?[0-9]+\.[0-9]+)|([+-]?[<em
浏览 4
修改于2020-01-23
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回答
通过比较两个表来识别缺少的组合
得分( 0-99,100-110) 下面是我主表中的组合 0-99
5-9
A 0-99 10-15 A0-99
5-9
B 100-110
5-9
浏览 1
提问于2018-08-28
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1
回答
比较两个表并找出缺少的组合
得分( 0-99,100-110) 下面是我主表中的组合 0-99
5-9
A 0-99 10-15 A0-99
5-9
B 100-110
5-9
浏览 0
修改于2018-08-28
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2
回答
使用两个矩阵进行聚类
Matrix Expr包含每个基因和样本的基因表达;Matrix Methyl包含每个样本的这些基因的
甲基化
状态。是否有可能同时基于表达和
甲基化
信息对基因和/或样本进行聚类?
浏览 3
修改于2016-05-27
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回答
在熊猫中使用DataFrame索引时,我如何保存to_json索引名称?
Kuwaiti Non-Kuwaiti Total0-4 164483 156459 320942当我这么做时:我得到: '{"Kuwaiti":{"0-4":164483,"
5-9
":158377},"Non-Kuwaiti":{"0-4":15
浏览 5
提问于2014-06-07
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3
回答
如何将终端的数值传递给计算器?
我想做
5-9
=-4,去掉-减号,然后在4中添加3。
5-9
=-4. 4 + 3 = 7我试过echo "
5-9
" | bc | last + 3了。 但它不起作用。
浏览 1
修改于2014-12-26
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2
回答
PHP数组按项数排序
=> Array [0] => 2-3 ( ) ( [1] => 2-3( (
浏览 25
修改于2021-04-01
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2
回答
如何将选中的值从选中的页面传递到下一页?
<option value="0-4">0-4</option> <option value="10-14">10-14</option>15-19<
浏览 15
修改于2020-07-27
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2
回答
谷歌图表x1-xn和xn-xm的不同标签
如何设置1-5之间的值的X标签,以及
5-9
和9-15等的不同标签。 我有一个折线图。我想为beetwe1-5(15,y)值设置一个标签,为beetwe
5-9
(
5-9
,y)值设置一个不同的标签。
浏览 0
修改于2013-07-05
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1
回答
无法使用正则表达式解析sqlite查询
import sqlite3 q = "SELECT Number FROM 'Pick 3'" rez = c.fetchall() for i
浏览 1
修改于2016-10-08
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3
回答
来自DMwR包的时间错误:无效的‘knnImputer’参数
数据集有两列-一列用于染色体上的位置(数字,整数),另一列用于
甲基化
值(也是数字,双精度),许多
甲基化
值缺失。这个想法是,距离应该基于染色体上的位置。我还有其他几个功能,但我选择不包括这些功能)。
浏览 66
提问于2016-03-27
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3
回答
python RE vs html5 RE
Python中遇到了一个bug:(Python2.7.3(默认,Apr 10 2012,23:24:47) MSC v.1500 64位(AMD64)在win32上)<_sre.SRE_Match object at 0x0000000002D3FC60> >>> re.match("0[5-7][
5-
9][0-9]{7}", "
浏览 12
提问于2012-09-15
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回答
两个矩阵R中每个对元的样条回归系数
我正在用一种方法来找到
甲基化
调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因
甲基化
与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器,我得到了418个基因的子集,其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出
甲基化
和每个基因表达的b样条三次回归系数。
浏览 1
提问于2015-06-24
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回答
使用regex (简易)查找括号缩略词的完整形式
以下是一个例子- CIMP - CpG岛
甲基化
表型 问题是,我已经能够使用re.findall('(\(.*?
浏览 2
修改于2020-06-20
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回答
如何匹配两列,然后与另一列变量之和,并为其添加具有不同名称的新行?
9 years", "1-4 years", "
5-9
years", "1-4 years", "
5-9
years", "
5-9
years", "1-4
浏览 3
提问于2022-09-19
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1
回答
根据特定条件选择矩阵中的多个观测值
我有一个β
甲基化
值矩阵,维度如下:485577x894。 我想确定哪些β
甲基化
值> 0.5,这样我就可以从进一步的分析中排除它们。在这样做的时候,我需要数据保持矩阵格式。
浏览 2
提问于2014-01-24
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回答
如何为数据帧的特定列创建一行SD值?
这是探针β- DNA
甲基化
的值。
浏览 7
修改于2022-01-21
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