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拆分数据矩阵
我有一个数据矩阵,其中包含100,000行的值,这些值对应于几种细胞类型的
甲基化
值。我想在集群热图中直观地显示
甲基化
的变化。为了使数据更易于管理,我正在考虑每10行左右创建一个新的数据矩阵。
浏览 0
修改于2013-06-11
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1
回答
用最近的时间戳间隔连接两个数据集
3", "
5-3
", "
5-3
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5-3
", "
5-3
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5-3
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5-3
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5-3
",7 2019
浏览 0
修改于2019-03-25
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2
回答
标识特定范围内的值数
我有一个数据表,列名为单元格类型(20种细胞类型),然后是每种细胞类型的23000个基因的行名及其
甲基化
值(介于0到1之间)。确定
甲基化
值在以下范围内的基因数目: 0-0.0999,0.1-0.1999,0.2-0.29999等,每种细胞类型的
甲基化
值为0.9-1。我还想对整个数据表进行类似的分析(即
甲基化
值在上述范围内的基因数目)。
浏览 1
修改于2017-09-10
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2
回答
如何将datetime对象或interval对象分解为R中的逐行分钟
datetime datetime_end id disc我想把它分成几分钟来做这样的事情:2019-03-19 12:48:00
5-3
start2019-03-19 12:49:00
5-3
start 2019-03-19 12:50:00
浏览 1
修改于2019-06-15
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1
回答
在具有协变量的两个数据帧之间进行一系列t检验。
我有两个数据,一个是病人样本的协变量,另一个是样本的
甲基化
数据。我需要做t检验来比较按性别划分的
甲基化
数据。caucasiansample6 p6 1 caucasian
甲基化
因此,如果我想对前8个样本的
甲基化
数据和性别进行一系列的t检验,我是否可以指定:t.test(t(methylation[,1:8]) ~ covariates$sex)?
浏览 0
修改于2018-10-17
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1
回答
Python eval表达式算术运算符的所有排列
给定string = '1*7/
5-3
'代码:string = '1*7/
5-3
' print eval
浏览 0
修改于2015-10-31
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2
回答
使用两个矩阵进行聚类
Matrix Expr包含每个基因和样本的基因表达;Matrix Methyl包含每个样本的这些基因的
甲基化
状态。是否有可能同时基于表达和
甲基化
信息对基因和/或样本进行聚类?
浏览 3
修改于2016-05-27
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1
回答
基于部分行的最小-最大归一化
对于第一行,4列(3,5,3,3) min和max为3,5,然后是(3-3/
5-3
,
5-3
/
5-3
, 3-3/
5-3
, 3-3/
5-3
),然后对于(9,2,2,5),min和max为2,9,然后是(9-
浏览 3
修改于2022-04-22
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3
回答
来自DMwR包的时间错误:无效的‘knnImputer’参数
数据集有两列-一列用于染色体上的位置(数字,整数),另一列用于
甲基化
值(也是数字,双精度),许多
甲基化
值缺失。这个想法是,距离应该基于染色体上的位置。我还有其他几个功能,但我选择不包括这些功能)。
浏览 66
提问于2016-03-27
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1
回答
如何获取组中嵌套括号的内容
让我来展示一下:所以我的数组应该有这样的值:我试图通过使用.split()来实现这一点,但它并没有像预期的那样工作。
浏览 0
修改于2020-06-02
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1
回答
使用regex (简易)查找括号缩略词的完整形式
以下是一个例子- CIMP - CpG岛
甲基化
表型 问题是,我已经能够使用re.findall('(\(.*?
浏览 2
修改于2020-06-20
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1
回答
两个矩阵R中每个对元的样条回归系数
我正在用一种方法来找到
甲基化
调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因
甲基化
与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器,我得到了418个基因的子集,其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出
甲基化
和每个基因表达的b样条三次回归系数。
浏览 1
提问于2015-06-24
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1
回答
根据特定条件选择矩阵中的多个观测值
我有一个β
甲基化
值矩阵,维度如下:485577x894。 我想确定哪些β
甲基化
值> 0.5,这样我就可以从进一步的分析中排除它们。在这样做的时候,我需要数据保持矩阵格式。
浏览 2
提问于2014-01-24
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1
回答
如何根据R的前半部分对字符串进行分组?
但是,我的文件名如下:2^
5-3
^3-18-uniform.dat2^7-3^4-33-uniform.dat .所以,现在我想根据第一部分创建2组,所以我希望2^
5-3
^3-18-simul.dat和2^
5-3
^3-18-uniform.dat是一个组,另外两个文件是一个组等等。
浏览 0
提问于2018-04-12
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回答
如何为数据帧的特定列创建一行SD值?
这是探针β- DNA
甲基化
的值。
浏览 7
修改于2022-01-21
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3
回答
在bash中的算术语句之前,什么时候需要美元符号?
((
5-3
))echo ((
5-3
))为什么会这样呢?语法看起来好像是将算法应用于一个空白变量,然后应用到echo函数中。为什么我不能把算法的结果传递给echo函数呢?
浏览 6
提问于2014-12-11
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4
回答
Python算法:在差分等于k的列表中搜索
5-3
=2,
5-3
=2, 3-1=2
浏览 2
修改于2016-06-24
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1
回答
如何使Makefile编译一个目录中的多个c文件和h文件
我的制作文件 gcc -Wall -v -g -o 5-1 5-1.c getch.c // Also, I feel the format of
5-3
does not looks correct.
5-3
: 5-3.o string.o
浏览 5
提问于2015-07-18
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1
回答
如何基于回归连续变量~β(使用CpGassoc)找到差异
甲基化
区域(例如,使用Champ中的探针套索)
我在人类样本上进行了450K Illumina
甲基化
芯片,并想要寻找连续变量和β之间的关联,并对其他协变量进行了调整。为此,我使用了R中的CpGassoc包。我还想根据重要的CpG站点搜索差异
甲基化
区域。然而,Champ软件包和其他用于450K DMR分析的软件包中的探头套索函数总是假设需要找到DMR的2组。我没有两组,而是这个连续变量。
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提问于2015-09-25
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1
回答
去
甲基化
有多深?
我取消了一个OLTP数据库在DWH中的使用。目前我正在取消学习小组的职务。 换句话说,当你去有机化的时候,你会走多深?
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修改于2019-05-09
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