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我有一个数据矩阵，其中包含100,000行的值，这些值对应于几种细胞类型的甲基化值。我想在集群热图中直观地显示甲基化的变化。为了使数据更易于管理，我正在考虑每10行左右创建一个新的数据矩阵。
浏览 0修改于2013-06-11得票数 0
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嗨，我需要从二叉树中得到四样东西
-4+(-5-2)/(-1+x)-(-3)-4+(-5-2)/(-1+x-(-3))
-4+(-5-2)/(-1+x)-(
浏览 1提问于2016-10-27得票数 1
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我有一个数据表，列名为单元格类型(20种细胞类型)，然后是每种细胞类型的23000个基因的行名及其甲基化值(介于0到1之间)。确定甲基化值在以下范围内的基因数目: 0-0.0999，0.1-0.1999，0.2-0.29999等，每种细胞类型的甲基化值为0.9-1。我还想对整个数据表进行类似的分析(即甲基化值在上述范围内的基因数目)。
浏览 1修改于2017-09-10得票数 2
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我有两个数据，一个是病人样本的协变量，另一个是样本的甲基化数据。我需要做t检验来比较按性别划分的甲基化数据。caucasiansample6 p6 1 caucasian甲基化因此，如果我想对前8个样本的甲基化数据和性别进行一系列的t检验，我是否可以指定：t.test(t(methylation[,1:8]) ~ covariates$sex)？
浏览 0修改于2018-10-17得票数 0
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[1627865.078080] usb 5-2: Product: AM335x USB[1627905.547204] rndis_h
浏览 0修改于2013-12-01得票数 1
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Matrix Expr包含每个基因和样本的基因表达；Matrix Methyl包含每个样本的这些基因的甲基化状态。是否有可能同时基于表达和甲基化信息对基因和/或样本进行聚类？
浏览 3修改于2016-05-27得票数 0
dmesg | tail[ 685.499737] usb 5-2: new full-speed=c52e[ 685.673041]usb 5-2: Product: USB Receiver
[ 685.673046] usb 5-
浏览 0修改于2014-02-04得票数 0
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Out[49]= 0 Out[51]= 0 Out[53]= {{x->-Sqrt[5-2 Sqrt[6]]},{x->Sqrt[5-2 Sqrt[6]]},{x->-Sqrt[5+2 Sqrt[6]]},{x->Sqrt[5+2 Sqrt[6]]}} Out[54]= {{x->-Sqrt[5-2 Sqrt[6]]}
浏览 7修改于2011-12-20得票数 7
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数据集有两列-一列用于染色体上的位置(数字，整数)，另一列用于甲基化值(也是数字，双精度)，许多甲基化值缺失。这个想法是，距离应该基于染色体上的位置。我还有其他几个功能，但我选择不包括这些功能)。
浏览 66提问于2016-03-27得票数 3
我有一个Thorlabs直流电机控制器，可以用以下dmesg日志检测到：usb 5=2, SerialNumber=3usb 5-2: Manufacturer: Thorlabsftdi_sio 5-2:1.0: FTD
浏览 2修改于2017-05-23得票数 1
我正在用一种方法来找到甲基化调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因甲基化与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器，我得到了418个基因的子集，其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出甲基化和每个基因表达的b样条三次回归系数。
浏览 1提问于2015-06-24得票数 1
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以下是一个例子-
CIMP - CpG岛甲基化表型
问题是，我已经能够使用re.findall('(\(.*?
浏览 2修改于2020-06-20得票数 1
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我想在这样的表达式中将(number)替换为number：它应该是：如果表达式是：应该是这样的：
2+2-(5-2/5)
浏览 0修改于2015-12-15得票数 5
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下面是dmesg的输出：[ 1010.192060] usb 5-2: new low-speedUSB device number 20 using uhci_hcd[ 1010.844046] usb 5-2: new low-speed USB device number 21 usin
浏览 0修改于2012-07-08得票数 0
我有一个β甲基化值矩阵，维度如下:485577x894。
我想确定哪些β甲基化值> 0.5，这样我就可以从进一步的分析中排除它们。在这样做的时候，我需要数据保持矩阵格式。
浏览 2提问于2014-01-24得票数 0
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我连接了它，并使用dmesg获得了输出：[ 78.953772] usb 5-2:new full-speed USB device number 4 using uhci_hcd
[ 79.110482] cdc_acm 5-2:1.0: ttyACM0: USB ACM device
浏览 0提问于2015-12-26得票数 -1
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我有一个类似"5-2,5-12,15-27,5-22,50-3,5-100"的字符串5-25-22匹配它们的正确的正则表达式是什么
浏览 9修改于2015-07-04得票数 0
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我在人类样本上进行了450K Illumina甲基化芯片，并想要寻找连续变量和β之间的关联，并对其他协变量进行了调整。为此，我使用了R中的CpGassoc包。我还想根据重要的CpG站点搜索差异甲基化区域。然而，Champ软件包和其他用于450K DMR分析的软件包中的探头套索函数总是假设需要找到DMR的2组。我没有两组，而是这个连续变量。
浏览 2提问于2015-09-25得票数 0
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