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对于遗传程序来说，每一代都是主染色体，每一条染色体都是从染色体。突变后，染色体必须将结果回馈给世代。一个世代的所有染色体都可以并行处理。如何在App Engine中实现此功能？如果我去寻找一个任务队列，每个染色体都是一个任务，我会面临以下问题。1.染色体如何将结果返回给调用世代。在数据存储中存储结果很麻烦(染色体的数据结构有一个KDTree) 2.如何通知代代一个染色体已经完成了一个任务，以便代可以聚合所有染色体的结
浏览 0提问于2014-12-26得票数 0
原始文件有5条染色体，分别命名为"1染色体“、"2染色体”、"3染色体“、"4染色体”、"5染色体“。现在我想把这五条染色体重新命名为chr1，chr2，chr3，chr4，chr5。
浏览 0提问于2022-01-03得票数 1
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现在我的代码在某一点上被卡住了，给出了这个错误： in stochasticUniversalSamplingKeyError: 0 我试图为每个染色体分配一个与其适合度相等的长度范围和一个在前一条染色体终点之后的起点(例如，第一条染色体0-1.53，第二条染色体1.54-2.26，第三条染色体2.27-3.42，等等)。选择其范围包含一个标记的染色体(请注意，一个染色体可能有两个标记，在这
浏览 20修改于2019-10-20得票数 0
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我有一个基因组测序文件，格式如下：所有染色体的数据都存储在一个文件中，我希望
3 chr2 3000726 4 5 chr3 3000901 0
我还可以通过染色体标签
浏览 2修改于2015-11-05得票数 0
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我正在用JGAP实现一个遗传算法来解决染色体是一个整数列表的问题(我希望在结果中保持N个良好的拟合解，而不仅仅是最合适的)。每个整数必须在染色体上出现一次(我将fitness=0设置为具有重复等位基因的染色体，这样就可以了.)在我的问题中，数字出现在染色体上的顺序是不计数的(12，3和2，1，3)。因此，在执行结束时，我列出了一些可能的解决方案 conf.getNaturalSelectors(false).clear()
浏览 2修改于2017-05-23得票数 0
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我有一个.csv文件，里面有不同染色体的数据。染色体名称存储在第一列(列名: Chr)。我的目标是分离每个染色体的数据，即(Chr1，Chr2等)，并为每个染色体创建单独的csv文件。
浏览 1修改于2011-11-16得票数 2
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第一列代表1-22以及X和Y染色体的染色体数目.我只想提取22号染色体和X染色体的数据，然后放到一个单独的文件中。我知道如何做后者，但我搞不懂如何只获取这两条染色体的数据。
浏览 4修改于2013-12-16得票数 2
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问题是我不知道如何考虑染色体的转换。我想像这样计算距离:基因2的起始位置--基因1的停止位置。然后，这些基因之间的距离。但是我该如何解释:当你到达下一个染色体时，R码获取了第2号染色体上一个基因的起始位置，但是一个基因在第1号染色体上的终止位置是不可能的(至少对于我的研究来说)。所以我想知道如何在R中解释这一点，如果基因位于不同的染色体上，我只需要略过这些基因。关于下面的代码:这三个向量
浏览 0提问于2019-01-09得票数 1
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我有一个具有属性适应度的对象(染色体)列表(chromosome.fitness介于0和1之间)我发现了一些Python和伪代码实现，但是它们对于这个需求来说太复杂了:函数只需要一个染色体列表。染色体将自身的适合度存储为内部变量。
我已经写的实现是在我决定允许染色体存储它们自
浏览 0修改于2021-01-09得票数 19
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在一开始，这个程序正在为10,000条染色体产生19次移动。我的交叉函数从最适合的人群中随机选择了第一条染色体，另一条随机从前20%的人群中选出。选择的染色体然后被交叉，一个突变函数被称为。我相信我受到最大打击的地方是计算每条染色体的适合度。(即，在位置2,1处的H是Cord 1,1，2,0或2,2也是H，如果找到H，则只会增加所发现的键数)
在计算完成后，从我的种群中删除最不适合的染色体，并添加新的染色体，然后对染色体阵列列表进行排序。从分析人员告诉我的情况来看，最大
浏览 0修改于2020-12-03得票数 4
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我有一个遗传算法，我必须计算每个染色体的适应度分数。所有染色体的适应度得分必须不同，或者其中一些染色体的适应度得分相同？
浏览 0提问于2017-05-17得票数 0
我正在使用ggplot2做一些基因组数据的绘图，所以基本的格式是有一个染色体和一个位置。我将位置转换为连续的比例，然后将断点放在染色体的边界上：就实际绘制而言，这看起来很棒，但标签随后被放在染色体的开头和结尾。我希望它们沿着每个染色体居中，在默认情况下绘制小断点的位置。
这个是可能的吗？
浏览 1提问于2009-10-12得票数 2
例如群体大小为300，交叉概率为0.75,224个染色体选择为亲本，突变概率为0.005，导致2条染色体发生突变。随着精英的尺寸1，我们将有227个后代解决方案。73条染色体的其余部分将如何产生，以完成300个群体的大小？
浏览 1提问于2019-05-12得票数 1
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我有SNP结果数据的植物，如小麦，有染色体名称的字母，例如3A，3B，3D。
我有许多植物基因组的数据，其中含有染色体名称中的字母。
浏览 10提问于2022-05-06得票数 2
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我有一份染色体清单(有23条染色体--第1至21号染色体，然后是X染色体和Y染色体)如下：然而，由于python的
浏览 19修改于2022-09-02得票数 4
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在基因组学中，一个区间由染色体1-22，x，y和染色体上的位置(开始，结束)组成。染色体可以被编码为一个具有24个不同值的enum，染色体上的位置可以编码为INT8RANGE。
浏览 2提问于2020-04-27得票数 1
在库中似乎没有一种内置的方法，所以我试图通过评估函数保存每个染色体，x。我以为印刷染色体的数量将等于群体大小的迭代次数，但似乎并不是一直都在尝试。问题是，我想知道每个染色体属于哪一代(或迭代)，我无法判断染色体的数目是否与iter倍popSize不同。
这是什么原因，以及我如何“修复”它。还是有另一种方法来保存每条染色体，以及它
浏览 6提问于2016-04-13得票数 0
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我有两个遗传数据集有匹配的染色体位置ID。我想数一下文件1's染色体位置in出现在文件2中的次数。例如，我的数据看起来如下：Gene pval ...... 03:3304593_GA_G_1CYP3 0.34 ... 09:9433933_GA_G_1
文件2(染色体位置是我的第一栏如果我能找到一种方法来编码‘所有的1号文件染色体位置是否匹配&
浏览 0修改于2020-02-01得票数 2
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这个问题涉及到使用染色体表示法，其中每个基因包含一个整数值，它表示房间的类型，例如0=起始室，1=怪物室，等等。
问题是，我想确保在一个水平上只有一个起始空间(在一个染色体中只有一个0的基因)。我读过，特别是染色体和基因类，但没有找到直接的方法来做到这一点。我也考虑过使用定制的基因，但这似乎是无用的，因为我认为这种“验证”需要由染色体类而不是基因类来完成。我目前对这个问题的解决方案是在对不满足上述条件的染色体进行健康评估时给予很大的惩罚。有什么想法、解决方案、建议或评论吗？谢谢
浏览 2提问于2015-04-11得票数 4
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