基因组学:什么是最有效的空间间隔索引(chr: ENUM，pos: INT8RANGE)？

Question

在基因组学中，一个区间由染色体1-22，x，y和染色体上的位置(开始，结束)组成。染色体可以被编码为一个具有24个不同值的enum，染色体上的位置可以编码为INT8RANGE。

为了进行有效的范围查询和区间联接，我想在列(chr，pos)上构建一个索引，但是我读了这个如果第一列只有几个不同的值，即使附加列中有许多不同的值，GiST索引也会相对无效。。

在PostgreSQL的基因组范围内什么是最好的索引类型？

Answer 1

在我的经验中，文档中的警告是不正确的。

或者至少它的正确性取决于对“相对”的一种相当无用的解释。相对于什么？使用不支持需要支持的操作的不同索引类型？索引不同的数据集，哪些不是您需要索引的数据集？

您可以交换索引中列的顺序，但我怀疑这也是一个改进。这可能取决于范围通常有多大，所以您可以在实际的数据集中试用它，而不仅仅是一些简单的随机数生成的数据。在您发现更直观的索引用法有问题之前，我甚至不会同时测试这一点。

我将使用您指定的索引，然后尝试解决性能问题，如果/当它们出现时，您就有了问题所在的证据。