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我需要做一个化合物数据库的聚类分析。我已经从锌数据库下载了191K的3D mol2格式的化合物，现在我需要使用RDKit获取指纹。首先，我不知道是否可以将mol2格式转换为指纹，以及哪种指纹更适合这种类型的分析(我需要了解数据库中有哪些化学类型，以便-最终-找到一些代表)。有没有人有建议？(实用的建议也很受欢迎)。谢谢
浏览 30提问于2021-06-29得票数 0
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如何使用RDkit或其他库对化合物进行计算分类？例如，如何辨别一种化合物是卤化物、胺还是醇？对于这类任务，RDkit有内置的函数吗？
浏览 19提问于2021-10-28得票数 1
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我正在编写一个android应用程序，它将碳水化合物、蛋白质和脂肪的特定价值发送给服务器。我的数据库中包含食物项目，其中还提到了这些食品中所含的碳水化合物、蛋白质和脂肪含量。我想知道如何查询数据库，以返回与应用程序发送的值类似的食品项目。食物表有食物清单，列有碳水化合物、蛋白质和脂肪。
浏览 1修改于2017-01-28得票数 0
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我目前正在开发一种有机转化模拟器，当提供起始化合物和结束化合物时，它将有助于生成转化的中间步骤。我正在寻找一种搜索机制来获得中间化合物。我偶然发现了Brute force作为搜索的解决方案。但由于我的库中有大约200个反应来检查每个化合物，我认为这将导致大量的时间消耗。有哪些其他的技术或算法可以减少我的时间消耗，以有效地完成我的需求。例如，我有模糊逻辑、遗传算法等
浏览 2修改于2013-07-13得票数 0
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我想要制定一个程序，让你输入你想要在一顿饭中摄入的卡路里、脂肪、碳水化合物和蛋白质，它通过一份可能的食物清单来寻找符合输入标准的最接近的食物组合。示例
1根香蕉(105卡路里，0克脂肪，27克碳水化合
浏览 4提问于2013-09-15得票数 0
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我正在尝试将一个MySQL数据库连接到3NF，但我不知道如何到达那里。我是数据库设计新手，所以如果我的理解是错误的，请纠正我。每个采集样本的日期事件有21个地点，每个地点有10个不同类型的化合物。每种化合物都有三种不同的运行方法。因此，在每一天的每个位置上，每个复合类型的每个方法都有一个值(和相关的单位列)。2011-07-03, 3, 2, 1, 345, g
用于所有其他化合物、位置和方法等。显然，每个化合物</em
浏览 0修改于2013-01-04得票数 2
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我正在创建一个库/工具包，用于在数据库中存储和搜索特殊类型的数据(与问题无关，但它是化学结构)。搜索函数返回一个化合物列表，其中一个化合物由一个或多个化学物质组成。使用该工具包的开发人员可以使用它来创建多个存储化合物的应用程序。这个想法是所有应用程序应该只有一个存储。例如，假设他创建了一个库存系统，其中每个容器都包含一个化合物。我们现在有两个类(Container，BiologicalTestResult)，它们包含一个化合物，但是API不知道。我想要的是，当
浏览 0提问于2012-10-01得票数 0
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我正试图编写一个代码来创建一个新的列，该列将用一个数字标记相应的化合物。我有在列表中重复的化合物，我需要用相同的数字来标记这些化合物，但是要用一个字母来分隔这些化合物。我不知道该怎么编码。谢谢，例子如下：Maltose 2Sucrose 4 Fructose 1 Sucrose 3Sucrose 3b
我不能手工标记每个化合物，因为我有这么大的数据集。
浏览 8修改于2015-02-26得票数 0
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我想知道如何在PHP上计算所有显示元素的总和，我有一个包含每种食物所包含的蛋白质、碳水化合物和脂肪数量的食物数据库，所以我有另一张表格，用户可以输入他们正在吃的食物和份量，所以我把蛋白质、碳水化合物和脂肪的数量按比例乘以，给出了一个与数据库中的值不同的值。例如，在数据库中，一块巧克力含有0蛋白质、1碳水化合物和0.5脂肪，所以如果用户输入0.5部分，那么打印出来的值是0蛋白质0.5碳水化合物和0.25脂肪。我已经尝试过执行SUM()，但是这会对数据库中
浏览 2修改于2019-08-26得票数 0
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碳氢化合物中有多少个原子？含有n碳原子的烷烃含有2n+2氢原子。含n碳原子的烯烃含有2n氢原子。含n碳原子的炔中含有2n-2氢原子。您的任务是编写一个函数或程序，接收表示碳氢<e
浏览 0修改于2020-06-17得票数 28
我有一个表，其中VARCHAR(255)字段可能有"-“dahs char用作空白，因为它报告从外部DBs检索到的化合物。同样的化合物可以在没有破折号和空白的情况下写成，而不是它们或其中的一个子集。例如，化合物“2-羟基-丙酸”可以写成。
所有这些都是正确的文字，它们指的是同一种化合物。如果搜索字符串是其他3之一，那么是否有一种选择存储字段“2-羟基-丙酸”的优雅方
浏览 6修改于2021-04-26得票数 0
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我正在尝试从pubchem数据库中提取sdf格式的化合物的化学结构，这些化合物与某个确切的质量相匹配，并且在该确切质量的10ppm (精确质量-cmpndmass/精确质量)*10^6的范围内。
浏览 7提问于2016-05-22得票数 1
我有如下所示的数据：我想用Kruskal试验比较A，B，C，D组化合物1的浓度.例如，化合物1，A组和B组，比较它们的浓度。应对同一化合物内的不同群体进行比较。Kruskal-Wallis test但是它使用所有的组A数据(包括compound1，compound2，我想比较一下一个化合物，如何修改代码？
浏览 11修改于2022-02-21得票数 0
我一直在努力想办法从我的数据库中获取数据，然后以图表可以读取的方式显示它。Record->find('list', 'Mouse' => '1'
浏览 0修改于2013-06-06得票数 0
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第一列标识化合物，第二列标识化合物的浓度，第三列是我的测量数据，称为“面积”。tibble: 12 x 3 <chr> <dbl> <dbl> 2Compound 1 5 44098 4 Compound 1 1000 7084602
5 Compound 20
浏览 22修改于2019-05-02得票数 0
有些化合物的值为IS.Name，该值是文件名的复合值之一。0 IS-2 NA
这是色谱数据。对于每个样品，分析了四个化合物，每个化合物都有一个保留时间值(Chrom.1.RT)。这些化合物中有两个是其他两个化合物使用的参考物。例如，化合物-1使用IS-1，而IS-1没有引用( is )。因此，对于化合物-1，我希望找到与IS.Name字段(IS-1)同名的化合物的Chrom.1.RT值，并将其放在化合物-1
浏览 3修改于2016-04-27得票数 0
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首先，我想知道有多少汽车有1，2，3等化油器。我使用了dplyr动词count()。library(dplyr)
count(carb)> N1 1 733 35 6 1然后我想知道，有多少辆汽车有1碳水化合物，2碳水化合物，巫婆3等，有4，6或8汽缸。carb1cyl8
1
浏览 1修改于2022-04-14得票数 0
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因此，假设我从Ba(Co3Ti)2 + 3BrH20开始，我首先要解析公式中的每个化合物，这在let regions = str.replace(/\s/g, '').split(/\+/g);中非常容易现在，对于每个化合物，我想要标识每个元素及其数值“above”，因此对于上面的例子，对于第一个化合物，Id需要这样的数组： "Ba", "Co3", ],
"<
浏览 2提问于2022-01-06得票数 1
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一个离子化合物的名字是这样的：(metal name) (non-metal suffixed with -ide)。下面列出了需要用-ide替换的所有后缀：化合物中每个元素的原子数不用于命名离子化合物。忽略多价金属命名规则。K2S -> potassium + sulphur -> potassium sulphide (or sulfide).Yb2P3 -> ytterbium + phosphoru
浏览 0修改于2012-12-20得票数 8
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我的问题如下：R1: A + 2B + C <=> D如何以化学计量矩阵的格式以python格式创建数据框架(化合物作为行X反应作为列)，如下所示：A -1 -1 C -1 1观察:方程左
浏览 0修改于2018-04-18得票数 1
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