第二个是基于步骤衔接 比如Ruffus和bpipe,参考我们《生信菜鸟团》的:Bpipe | 教你轻松搭建分析流程 其实就是在原有的shell脚本的基础上,将每个分析步骤进行包装,然后利用Bpipe的语法进行串联
Explicit framworks 这一类代表的流程有Ruffus和bpipe,它们的特点与Implicit convention frameworks不同的是,它们的执行不依赖于文件名规则,而是类似