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Circoletto可视化Blast结果
package for offline use） https://github.com/infspiredBAT/Circoletto 各有优缺点：网页版对上传文件大小有限制，最大文件20M；本地版安装依赖Bioperl
1.3K10发布于 2020-03-03 - 来自专栏生信技能树
【生信菜鸟经】如何系统入门Perl
但是也几乎没有人用了； XML/pdf/excel/Json 相关的模块可以用来读取非文本格式数据，或者输出格式化报告； socket通信相关，高手甚至可以写出一个QQ的模仿版本； 最后不得不提的就是Bioperl 大家可以仿造bioperl里面的各个功能，用自己的脚本来实现！
2.2K90发布于 2018-03-08 - 来自专栏微生态与微进化
基因组CRISPR序列及Cas酶预测
gem-pasteur/MacSyFinder/macsyfinder-1.0.5.tar.gz Muscle version 3.8.31 (http://www.drive5.com/muscle) BioPerl version 1.6.2 or upper (http://bioperl.org/) clustalW version 2.1 (http://www.clustal.org/download/
1.6K30编辑于 2022-05-05 - 来自专栏生信修炼手册
HLAforest:使用RNA-seq数据进行HLA分型
需要注意的是该软件依赖bioperl和bowtie,由于我的系统是已经装过了的，所以这里没给出这两个软件的安装过程。
67110发布于 2020-05-08 - 来自专栏DrugOne
BioPython安装与入门
整合BioSQL，一个也被BioPerl和BioJava支持的数据库架构。 ---- BioPython安装：通过pip安装 pip install biopython 测试安装 ?
1.1K20发布于 2021-01-28 - 来自专栏生信修炼手册
biopython简介
biopython和bioperl, biojava项目类似，都是Open Bioinformatics Foundation组织的项目之一，旨在提供一个编程接口，方便生物信息数据的处理。
1.2K30发布于 2021-01-11 - 来自专栏yw的数据分析
生物结构变异分析软件meerkat 0.189使用笔记（一）
BioPERL 1.5.0及以上（自行安装） 5. Primer32.2.0及以上（自行安装） 1.2 需要准备的文件 1.参考基因组fasta文件（单独放在文件夹），运行perl脚本，用BioPerl的Bio:DB::Fasta进行处理 #!
85330编辑于 2022-03-22 - 来自专栏科技记者
脚本分享—将GenBank格式的文件转换为GFF3格式
MyConfig.pm # 这一行修改为中科大的源，这样就能节省很多模块的下载时间啦 'urllist' => [q[http://mirrors.ustc.edu.cn/CPAN/]], cpan # 安装 Bioperl
1.7K00编辑于 2024-01-26 - 来自专栏生物信息学
快速寻找同源基因---自动化运行OrthoMCL
命令下载 git clone https://github.com/apetkau/orthomcl-pipeline.git 安装perl依赖包 使用cpan或者cpanm安装依赖包 $ cpanm BioPerl
1.3K32发布于 2020-04-14 - 来自专栏生物信息云
Biopython | 介绍和安装
它具有兄弟项目，例如：BioPerl，BioJava和BioRuby。 官网：https://biopython.org/ (1).
1.9K10编辑于 2022-12-16 - 来自专栏微生态与微进化
你想知道你的基因组是什么物种吗？
GlobalDestruction）： perl -MCPAN -e"install Moose" perl -MCPAN -e"install IPC::Run" perl -MCPAN -e"install Bundle::BioPerl
2.1K30编辑于 2022-05-05 - 来自专栏生信技能树
安装VEP及其注释数据库
AUTO af --SPECIES mus_musculus --ASSEMBLY GRCm38 --DESTDIR $VEP_PATH --CACHEDIR $VEP_DATA ## 这中间会安装 BioPerl
4.9K61发布于 2018-07-27 - 来自专栏生信喵实验柴
熟悉数据库的下载
批量下载基因序列有多种方式，例如可以通过编程实现，也可以通过固定模块例如 bioperl，biopython 等。如果不会编程，那么 batchentrez 就是最好的选择了。
2.1K20编辑于 2021-12-21 - 来自专栏bit哲学院
Python 高性能编程
biopython 一个生物信息学库，类似于 bioperl。 tornado 一个提供了并发机制的库。
1K30发布于 2020-11-30
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