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R基础
虽然有object的概念，但是R本身仍然是一种自顶向下式的编程方式，大部分功能都是通过各式各样的函数来实现的。 输入输出调节 将写好的R脚本运行会在命令行中调用source()函数运行脚本，并将结果输出到命令行中。 数据结构 R中的数据结构有很多种类型，不同的数据结构存储不同的数据，标注以及索引的方式也会有所不同。 refer R的索引也支持python中":"的操作，不过需要注意的是r中的索引初始位置从1开始，对于vectors，共有三种索引方式: a <-c("xiaoming","xiaohong","xa" R的matrix是有行列标签的，可通过dimnames传入。
1.6K21编辑于 2023-04-27 - 来自专栏R语言 / Linux
R基础
R语言基础 R语言是用函数处理数据 1、R与Rstudio 2、数据类型 3、数据结构 4、函数和R包 5、文件读写 6、绘图（一个应用的方向） 7、应用专题 一、R语言 入门认知 1.R语言与RStudio 1.1 什么是R 是什么：编程语言，软件，环境 作用：数据处理，统计，可视化 优点：开源，可扩展（R包，安装到电脑上使用这些R包），简单有效 1.2 什么是R Studio（让R语言变得更好用的软件 ）R语言的命令提示符是 “>” 集成开发环境 图形界面（给简陋的R语言披上了好看的外衣） 开源免费 1.3 如何在R Studio中新建项目（管理工作目录的最佳方式，setwd也可以，但是这个更简单） ） history（历史命令）、集成窗口 1.6 字号设置（略） 1.7 与R”交互“ 用户——发送命令 R——执行并返回结果 （1）控制台窗口 sqrt() #函数的典型特征，英文单词后面加一个括号 ，那么怎么看R语言自己的想法呢？
1.9K22编辑于 2023-03-13 - 来自专栏小汪Waud
R||R语言基础（三）_R包
今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”) #务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败，解决方法https://mp.weixin.qq.com 这里的“,”怎么理解呢，在我们上一期推文中提到，提取元素时z[x,y]指代提取z中第x行，第y列，如果我们只需要提取行，则应该写作z[x,],同理，如果只需要提取列，应该写作z[,y] dplyr五个基础函数 经过这几期的R语言基础，你应该能够入门R了，渐渐的也要自己去学会看帮助文档，去搜报错，还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗？ ? +命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题，那么恭喜你，你的R应该没问题啦！ 应该没问题了！！！！吧？
4.5K50编辑于 2023-02-16 - 来自专栏小汪Waud
R||R语言基础（一）
学习生信时，最常用的可视化软件就是R，可大家在使用的时候又好像用的是Rstudio，究竟什么是R和Rstudio？ R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。 RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。 01 安装R 进入R的官网https://www.r-project.org/ 第一步 点击红框中的download R 第二步 在镜像这里中选择第一个 第三步 接下来按照红框点点点就能完成R的安装 第四步 第五步 R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。 参考资料：https://m.bilibili.com/video/av25643438.html R-project管理多个R工作目录
2.7K20编辑于 2023-02-16 - 来自专栏R语言 / Linux
R基础-3
3.1 数据框来源 （1）用代码新建 （2）由已有数据转换或处理得到 （3）读取表格文件 （4）R语言内置数据 3.2 新建数据框（数据框是以列为单位组织的） 3.2.1 用代码新建 data.frame change = rep(c("up","down"),each = 2), score = c(5,3,-2,-4)) 可以R中跑一次上面的代码看看 >df1$p.value<- c(0.01,0.02,0.07,0.05) #这个列的名字之前的里面没有 >df1 #行名和列名的修改，也就是向量的修改 >rownames(df1)<- c("r1 ","r2","r3","r4") #修改全部行名 > colnames(df1)[2] <-"CHANGE" #改一个列名，比如修改第二列的列名，就是修改【列明这个向量】的第二个元素
1.4K50编辑于 2023-03-13 - 来自专栏学生信_小向
R基础（一）
比较运算的结果是逻辑值 < , > , >= ,<= , ==, !=
47610编辑于 2023-03-07 - 来自专栏学习记录
R语言基础
准备工作安装R和Rstudio此处注意，如果电脑的用户名是中文，需要改成英文才能安装Rstudio查看用户名是中文还是英文：1.在开始菜单中找到控制面板2.在控制面板中找到“用户帐户”并进入，在“用户帐户 3.在“管理本地用户和组”中找到当前用户的用户名，就可以看到用户名是英文还是中文了下载R和Rstudiob站有教程，暂时不需要装R包什么是RR是一种编程语言，也可以统计计算、绘图，它汇集了很多函数RStudio 是免费提供的开源集成开发环境（IDE），RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，方便用户在终端中使用R页面如下各窗口的功能如下：1.控制台（左下窗口）脚本运行和结果展示2.脚本编辑器 （左上窗口）在处理数据时，通常会编写一份脚本文件，即一组命令的集合来表示整个操作过程的逻辑流，该脚本文件可以直接读取并由R引擎执行。 6.绘图窗口（plots）（右下窗口）用来展示R代码生成的图形。7.扩展包窗口（packages）（右下窗口）展示所有安装过的拓展包。
58510编辑于 2024-06-10 - 来自专栏我的作业
R语言基础
1.设置字体大小 tools→Global Options→Appearence→Editor font size 2.R语言基本操作 2.1用Rproject管理工作目录 每项工作任务要单独新建一个project
42650编辑于 2023-11-20 - 来自专栏阿涛的生信入门笔记
R语言-基础
R的使用 在Rstudioy中新建项目（R project） File-New Project-New Directory-New Project-Directory name-Creat 文件中不要有中文和字符） 新建脚本 (Ctr+shift+N) 更改字号 (Tools-Global options-Apearance-Editor font size) 重启 session-restart R shift+F10) 工作目录（working directory）默认在 .Rproject文件夹下 打开文件时，双击打开 .Rproject 即可打开RStudio,打开后工作目录自动设置好了 R界面文字放大 “control” + “shift” + “+” R界面文字缩小 “control” + “-” 二.报错 报错: Error 。
2.3K00编辑于 2023-05-05 - 来自专栏R语言学习——Magnolia
R语言基础
R基础概念及数据类型重要提示1.Tab键可以补全函数、变量名、指定数据框的行名列名等，能够有效避免错误输入与提高效率2.只有赋值才会使变量发生变化，没有赋值R只是单纯展示出数据3.在R中，Error是唯一代表错误的 ，大部分Warning可以忽略，但并不是出现了Error才是错误，一定要反复检查代码是否完成了目的，小心暗流4.R中“=”与“<-”均可表示赋值，但是在函数的形式参数=实际参数中，仅可用"="<em>R</em>中数据类型分为字符 is.numeric(a)> a<-1> class(a)[1] "numeric"> a<-as.character(a) #仅当赋值了a才会改变> is.numeric(a)[1] FALSE向量向量将R中不同元素组合生成
1.6K20编辑于 2023-01-06 - 来自专栏YoungGy
R语言_基础
() #列出当前工作空间中的对象 rm(list=ls()) dir() #列出当前目录 dir.create(“c:/myproject”) options() #查看R软件默认选项的设置 "mylife") #保存工作空间到mylife文件中 load("mylife") #载入工作空间 #输入与输出 #重定向至文本文件和图像文件 source("inputFile.R" class mode names c(obj1,obj2) cbind(obj1,obj2) rbind(obj1,obj2) head tail ls() rm(obj1,obj2) #批处理 R CMD BATCH options infile outfile #linux "c:\program\r\r.exe" CMD BATCH --vanilla --slave "c:\myscript.R #R函数调用 sum.of.squares <- function(x,y) { x^2 + y^2 } sum.of.squares(3, 4)
1.1K70发布于 2019-05-27 - 来自专栏技术一点点成长
基础R绘图
前言： 在前面介绍了R的基础入门语法之后，现也将最近整理好的一些R的基础绘图实例提供给需要的朋友参考。（温馨提示：代码慎用！按照本博文实例进行练习的话最好能做到举一反三。 #基础R绘图 x <- 1:100 y <- 100 + x*5 windows(300,200);plot(y) #默认情况绘制散点图type="p" windows(300,200);plot 首字母 #正态分布随机数图 x2 <- rnorm(100,10,5) View(x2) plot(x2) #频数直方图 x3 <- rnorm(1000,20,10) hist(x3) #在直方图基础上绘制密度曲线 ) #绘制QQ图 y1 <- rnorm(500,10,5);qqnorm(x) #曲线图 curve(sin,-2*pi,2*pi,xname="t"); #低水平绘图函数：在高水平绘图的基础上进行修饰和补充 (1:10) rect(1,5,4,8,col="blue") dev.off() dir() #查看"myplot.jpeg" #end------------------ 结语： R作为一款越来越受追捧的数据分析工具
79020编辑于 2022-08-09 - 来自专栏Linux基础入门
R语言 | R基础知识
1安装包 问题： 如何安装R包？ 方法： 使用install.packages()函数来安装包，括号中写上要安装的包的包名。
1.7K10编辑于 2022-03-29 - 来自专栏生信喵实验柴
R语言基础
一、R 语言简介 1.1 R 语言历史 R 语言是一款统计软件，R 语言也是一门编程语言，R 语言也是一个数据分析平台。 该项目始于 1993 年，2000 年发布了首个官方版本 R 1.0.0 ，后期维护由 R 核心团队(R Core Team)负责。截止 2019 年 4 月，已发布到 3.6 版本。 凭借其开源、免费、自由等开放式理念，R 迅速获得流行，目前已成为学术研究和商业应用领域最为常用的数据分析软件之一。随着大数据行业的发展，R 语言变得越来越流行，R 语言发挥了越来越重要的作用。 2.4 R 语言与 Python 对比 1、R 语言具有更强大的统计学功能； 2、R 语言的 Bioconductor 项目可以处理生物数据，例如基因表达数据，单细胞测序等； R 语言更擅长处理结构化数据，因此，在使用 R 之前，尽量确保数据是严格的表格结构。也就是二位的表格，分为行和列。在 R 语言中，行称为“观测”，列称为“变量”。
1.1K10编辑于 2022-10-25 - 来自专栏R语言 / Linux
R基础-2
1.2 向量及后续 使用已准备好的Rproject（钉钉群里的R_01文件） 脚本打开是乱码的解决方式 2 向量 2.1 向量的生成（向量是一串同一种数据类型组合成的整体） 有4种办法 （1）用c 这个非常重要，需要记住】 >x=c(1,3,5,1) >table(x) 【 #重复值统计】 >x=c(1,3,5,1) >sort(x) 【#排序，R语言按照自己的想法排，那么怎么看R语言自己的想法呢 >a=seq(from=2,to=15,by=2) >paste0(rep("student",times=length(a)),seq(from=2,to=15,by=2) ) R语言里函数思想：能用函数代替 >x == 8:12 >x[4] == 40 #改一个元素 >x >x[c(1,5)] == c(80,20) #改多个元素 R语言里的修改，都要赋值，没有赋值就没有发生过 2.6 简单的向量作图
75540编辑于 2023-03-13 - 来自专栏学生信_小向
R基础（二）
In x == y : longer object length is not a multiple of shorter object length
48200编辑于 2023-03-09 - 来自专栏R语言数据分析
R语言基础5（绘图基础）
常用可视化R包和函数 1，作图 base ggplot2 ggpubr 2，拼图 par里的mfrow grid.arrange cowplot patchwork 3，导出 经典三段论 ggsave eoffice——topptx 绘图 图片 基础包 plot(iris[,1],iris[,3],col = iris[,5]) text(6.5,4, labels = 'hello') dev.off = my_comparisons)+ # Add pairwise comparisons p-value stat_compare_means(label.y = 9) 图片保存 图片 #1.基础包作图的保存 file_name x = x[colnames(y),] colnames(y) = x$ID # 2.一些搞文件的函数---- dir() # 列出工作目录下的文件 dir(pattern = ".R$ ") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 file.exists("douhua.txt") #某文件在工作目录下是否存在 file.remove
1K71编辑于 2023-09-23 - 来自专栏生信小驿站
R语言基础操作①基础指令
基础指令 程序辅助性操作： 运行 q()——退出R程序 tab——自动补全 ctrl+L——清空console ESC——中断当前计算 调试查错 browser() 和 debug()——设置断点进行 R帮助页面中的关键词或短语（互联网）RSiteSearch(‘neural networks’) 准备 文件目录设置 setwd（）——设置工作文件目录 getwd（）——获取当前工作文件目录 list.files()——查看当前文件目录中的文件 加载资源 search()——通过search()函数，可以查看到R启动时默认加载7个核心包。 基础函数：数学计算函数，统计计算函数，日期函数，包加载函数，数据处理函数，函数操作函数，图形设备函数 setRepositpries（）——选择软件库（CRAN，Bioconductor，R-Forge )——执行commands.R （存放批处理命令的）脚本文件。
2.1K20发布于 2018-08-27 - 来自专栏优雅R
「R」自己动手进行R基础绘图
/ 基本绘图和R本身一样古老，但对大多数用户来说，它仍然是神秘的。 本文试图通过为外行提供友好的介绍来揭开基础图形的神秘面纱。 相关阅读： 「R」传统图形绘制 「R」R 的基本图形绘制 「R」ggplot2数据可视化 解构一个图 在学习R之后，用户可以很快开始通过调用plot()、hist()或barplot()生成各种图形 许多人会惊讶地发现，在底层基础绘图遵循一组小函数的范式，每个函数做一件事，并与另一个函数很好地协作。 总结 R基础绘图系统有几个抛光和易于使用的包装器，有时很方便，但从长远来看只会混淆和隐藏东西。因此，大多数R用户从来没有被正确地介绍过基本绘图范式背后的真正功能，并被其许多感知到的特性所迷惑。
1.3K10编辑于 2022-12-30 - 来自专栏PPV课数据科学社区
【R系列】概率基础和R语言
R语言是统计语言，概率又是统计的基础，所以可以想到，R语言必然要从底层API上提供完整、方便、易用的概率计算的函数。让R语言帮我们学好概率的基础课。 1. 随机变量 · 什么是随机变量？ R程序：计算样本(1,2,3,7,21)的方差 > S<-c(1,2,3,7,21) > var(S) [1] 68.2 3). 相关系数是按积差方法计算，同样以两变量与各自平均值的离差为基础，通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度。 R语言：中心极限定理模拟，从指数分布到正态分布 if (! 掌握R语言，就可以快速的把概率的知识，用R语言进行现实，非常有利于帮助我们解决生活中遇到的问题。
2.6K80发布于 2018-04-20
腾讯云开发者
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