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2-6 R语言基础 缺失值
> is.na(x) [1] FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE
36820发布于 2020-09-16 - 来自专栏R语言
生信入门马拉松之R语言基础- R语言作图(Day 6)
Day6. 1.5 ggplot2基础语法ggplot(data = <DATA>)+ <GEOM_FUNCTION>( mapping = aes(<MAPPINGS>), position = <POSITION 1.9 拼图R包patchwork：堪比R语言领域的“美图羞羞”语法简单，兼容ggplot2拼图比例设置简单，具体见下图和下图二维码。1.10 练习? 该笔记工作目录下基础包画图500行代码zz_basic plot ... .Rggplot2画图50个案例：top50ggplot.html小洁老师语雀的画图合集如何控制横坐标、纵坐标顺序？？ <- str_remove_all(x5," rep3")x6x7 <- str_replace(x6,"C","c")x8 <- str_replace(x7,"V","v")x8load("test1
69430编辑于 2024-04-16 - 来自专栏小明的博客
R基础
虽然有object的概念，但是R本身仍然是一种自顶向下式的编程方式，大部分功能都是通过各式各样的函数来实现的。 输入输出调节 将写好的R脚本运行会在命令行中调用source()函数运行脚本，并将结果输出到命令行中。 数据结构 R中的数据结构有很多种类型，不同的数据结构存储不同的数据，标注以及索引的方式也会有所不同。 refer R的索引也支持python中":"的操作，不过需要注意的是r中的索引初始位置从1开始，对于vectors，共有三种索引方式: a <-c("xiaoming","xiaohong","xa" R的matrix是有行列标签的，可通过dimnames传入。
1.6K21编辑于 2023-04-27 - 来自专栏R语言 / Linux
R基础
R语言基础 R语言是用函数处理数据 1、R与Rstudio 2、数据类型 3、数据结构 4、函数和R包 5、文件读写 6、绘图（一个应用的方向） 7、应用专题 一、R语言 入门认知 1.R语言与RStudio 1.1 什么是R 是什么：编程语言，软件，环境 作用：数据处理，统计，可视化 优点：开源，可扩展（R包，安装到电脑上使用这些R包），简单有效 1.2 什么是R Studio（让R语言变得更好用的软件 例如 >a=3+5 > #运行完出现大于号，表示已运行完成 5、太长时间卡住不懂 中止（点击红色键）或重启 6、出现“+“ 命令不完整，补全或按ESC键退出 7、出现提示信息 检查是否有 2 向量的生成 2.1 向量的生成（向量是一串同一种数据类型组合成的整体） 有4种办法 （1）用c()逐一放到一起 【 虽然只有一个字母，但是这也是个函数c】 >c(2,5,6,2,9) >c(" rnorm 【随机数函数可以用来编数据练习】 >rep("x",times=3) #输出的结果是 "x""x""x" >seq(from=3,to=21,by=3) #输出的结果是：3,6,9,12,15,18,21
1.9K22编辑于 2023-03-13 - 来自专栏生信矿工
R语言笔记-6
arrange(Sepal.Length) %>% head(,3) 输出结果： 图片 图片 #模拟一个表达矩阵数据 set.seed(1) exp = matrix(rnorm(18),ncol = 6) exp = round(exp,2) rownames(exp) = paste0("gene",1:3) colnames(exp) = paste0("test",1:6) exp[,1:3] =
78520编辑于 2023-06-26 - 来自专栏小汪Waud
R||R语言基础（三）_R包
今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”) /s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw 03 R包及数据准备 install.packages("dplyr") library(dplyr) test <- iris[c(1:2,51:52,101 这里的“,”怎么理解呢，在我们上一期推文中提到，提取元素时z[x,y]指代提取z中第x行，第y列，如果我们只需要提取行，则应该写作z[x,],同理，如果只需要提取列，应该写作z[,y] dplyr五个基础函数 tidyverse是一个汇总包，一包更比6包强，用于数据清洗、转换、可视化等。 经过这几期的R语言基础，你应该能够入门R了，渐渐的也要自己去学会看帮助文档，去搜报错，还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗？ ?
4.5K50编辑于 2023-02-16 - 来自专栏小汪Waud
R||R语言基础（一）
RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。 01 安装R 进入R的官网https://www.r-project.org/ 第一步 点击红框中的download R 第二步 在镜像这里中选择第一个 第三步 接下来按照红框点点点就能完成R的安装 list.files() #同上 示例 2.加减乘除 和其他编程语言相同，直接输入即可 示例 3.赋值 赋值符号 <- 或 ALT - x <- 2+3 #将2+3的结果赋值给x y <- 5/6 #将5/6的结果赋值给y 赋值结束后即可在右上角environment栏中看到现在赋值过的变量 4.删除变量 x <- 2+3 #将2+3的结果赋值给x y <- 5/6 #将5/6的结果赋值给y rm(x,y) #删除x和y变量 rm(list = ls()) #清空所有变量 5.列出历史命令 history() #列出所有使用过的命令 或直接点击右上角History一栏中查看 6.清空控制台
2.7K20编辑于 2023-02-16 - 来自专栏Chris生命科学小站五年归档
R基础|do包（6）：长型数据转宽型数据
R基础|do包（3）：宽型数据转长型数据reshape_toLong（1） R基础|do包（4）：宽型数据转长型数据reshape_toLong（2）进阶 R基础|do包（5）：宽型数据转长型数据reshape_toLong df = data.frame( id=c(1,1,1,2,2,2), 年龄=c(1,3,2,2,1,3), 身高=c(1,3,2,3,2,4), 体重=c(4,6,5,6,5,7 do包中的其他命令 R基础|do包（1）：左截取、右截取、中间截取 R基础|do包（2）：替换replace R基础|do包（3）：宽型数据转长型数据reshape_toLong（1） R基础| do包（4）：宽型数据转长型数据reshape_toLong（2）进阶 R基础|do包（5）：宽型数据转长型数据reshape_toLong（3）直升机 课程目录 1、简介 2、安装R语言及Rstudio 软件 3、安装nsfc包 4、abstract命令：批量查询（含摘要） 5、search命令：让查询--随心所欲 6、总结
76710编辑于 2023-02-28 - 来自专栏R语言 / Linux
R基础-3
3.1 数据框来源 （1）用代码新建 （2）由已有数据转换或处理得到 （3）读取表格文件 （4）R语言内置数据 3.2 新建数据框（数据框是以列为单位组织的） 3.2.1 用代码新建 data.frame change = rep(c("up","down"),each = 2), score = c(5,3,-2,-4)) 可以R中跑一次上面的代码看看 >df1$p.value<- c(0.01,0.02,0.07,0.05) #这个列的名字之前的里面没有 >df1 #行名和列名的修改，也就是向量的修改 >rownames(df1)<- c("r1 ","r2","r3","r4") #修改全部行名 > colnames(df1)[2] <-"CHANGE" #改一个列名，比如修改第二列的列名，就是修改【列明这个向量】的第二个元素
1.4K50编辑于 2023-03-13 - 来自专栏学生信_小向
R基础（一）
比较运算的结果是逻辑值 < , > , >= ,<= , ==, !=
47610编辑于 2023-03-07 - 来自专栏学习记录
R语言基础
3.在“管理本地用户和组”中找到当前用户的用户名，就可以看到用户名是英文还是中文了下载R和Rstudiob站有教程，暂时不需要装R包什么是RR是一种编程语言，也可以统计计算、绘图，它汇集了很多函数RStudio 是免费提供的开源集成开发环境（IDE），RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，方便用户在终端中使用R页面如下各窗口的功能如下：1.控制台（左下窗口）脚本运行和结果展示2.脚本编辑器 （左上窗口）在处理数据时，通常会编写一份脚本文件，即一组命令的集合来表示整个操作过程的逻辑流，该脚本文件可以直接读取并由R引擎执行。 6.绘图窗口（plots）（右下窗口）用来展示R代码生成的图形。7.扩展包窗口（packages）（右下窗口）展示所有安装过的拓展包。 <- 赋值符号，小于号加上减号，也可以按Alt加上减号实操运行x<-56+89x1 145y<-43*16y1 688删除变量：代码依然是rm()实操运行a<-3b <- 1c <- 4u <- 5+6rm
58510编辑于 2024-06-10 - 来自专栏我的作业
R语言基础
1.设置字体大小 tools→Global Options→Appearence→Editor font size 2.R语言基本操作 2.1用Rproject管理工作目录 每项工作任务要单独新建一个project
42650编辑于 2023-11-20 - 来自专栏阿涛的生信入门笔记
R语言-基础
R的使用 在Rstudioy中新建项目（R project） File-New Project-New Directory-New Project-Directory name-Creat shift+F10) 工作目录（working directory）默认在 .Rproject文件夹下 打开文件时，双击打开 .Rproject 即可打开RStudio,打开后工作目录自动设置好了 R界面文字放大 “control” + “shift” + “+” R界面文字缩小 “control” + “-” 二.报错 报错: Error 。 x==y #比较运算 1 FALSE FALSE TRUE FALSE x\*y #计算 1 3 6 25 6 paste(x,y,sep = "/") 1 "1/3" "3/2" "5/ 5" "1/6" 两个向量（长度不一致）的操作 x <- c(1,3,5,1,6) y <- c(3,2,5) x==y #长度不一致，发生循环补齐 Warning: longer object length
2.3K00编辑于 2023-05-05 - 来自专栏YoungGy
R语言_基础
"mylife") #保存工作空间到mylife文件中 load("mylife") #载入工作空间 #输入与输出 #重定向至文本文件和图像文件 source("inputFile.R" class mode names c(obj1,obj2) cbind(obj1,obj2) rbind(obj1,obj2) head tail ls() rm(obj1,obj2) #批处理 R CMD BATCH options infile outfile #linux "c:\program\r\r.exe" CMD BATCH --vanilla --slave "c:\myscript.R font.axis=3) plot(dose, drugA, type=”b”, pch=19, lty=2, col=”red”) plot(dose, drugB, type=”b”, pch=23, lty=6, col=”blue”, bg=”green”) par(opar) par(mfrow=c(1,1)) #R函数定义与实现 #R函数调用 sum.of.squares <- function(x,y
1.1K70发布于 2019-05-27 - 来自专栏R语言学习——Magnolia
R语言基础
R基础概念及数据类型重要提示1.Tab键可以补全函数、变量名、指定数据框的行名列名等，能够有效避免错误输入与提高效率2.只有赋值才会使变量发生变化，没有赋值R只是单纯展示出数据3.在R中，Error是唯一代表错误的 ，大部分Warning可以忽略，但并不是出现了Error才是错误，一定要反复检查代码是否完成了目的，小心暗流4.R中“=”与“<-”均可表示赋值，但是在函数的形式参数=实际参数中，仅可用"="<em>R</em>中数据类型分为字符 is.numeric(a)> a<-1> class(a)[1] "numeric"> a<-as.character(a) #仅当赋值了a才会改变> is.numeric(a)[1] FALSE向量向量将R中不同元素组合生成 表示生成包含数字1-5的向量 (2) seq函数指定起点、终点与步长 (3) rep函数重复某一字符或数字 (4) paste及paste0实现字符的连接 (5) 通过判断生成逻辑型向量 (6)
1.6K20编辑于 2023-01-06 - 来自专栏技术一点点成长
基础R绘图
前言： 在前面介绍了R的基础入门语法之后，现也将最近整理好的一些R的基础绘图实例提供给需要的朋友参考。（温馨提示：代码慎用！按照本博文实例进行练习的话最好能做到举一反三。 #基础R绘图 x <- 1:100 y <- 100 + x*5 windows(300,200);plot(y) #默认情况绘制散点图type="p" windows(300,200);plot lines(density(x4),col="blue") box() #加方框 #茎叶图,条形图 x5 <- rnorm(100,5,2) stem(x5) barplot(x5) box() x6 <- 1:5;pie(x6,col=rainbow(5)) box() #绘制箱线图 x7 <-rnorm(10,10,3);boxplot(x7) data(iris) sunflowerplot (1:10) rect(1,5,4,8,col="blue") dev.off() dir() #查看"myplot.jpeg" #end------------------ 结语： R作为一款越来越受追捧的数据分析工具
79020编辑于 2022-08-09 - 来自专栏Linux基础入门
R语言 | R基础知识
1安装包 问题： 如何安装R包？ 方法： 使用install.packages()函数来安装包，括号中写上要安装的包的包名。 去除第一列，指定之后3列的类型 data <- read_excel("datafile.xlsx", col_types = c("blank", "text", "date" ,"numeric") 6管道操作符
1.7K10编辑于 2022-03-29 - 来自专栏生信喵实验柴
R语言基础
一、R 语言简介 1.1 R 语言历史 R 语言是一款统计软件，R 语言也是一门编程语言，R 语言也是一个数据分析平台。 该项目始于 1993 年，2000 年发布了首个官方版本 R 1.0.0 ，后期维护由 R 核心团队(R Core Team)负责。截止 2019 年 4 月，已发布到 3.6 版本。 ，基因组圈图等复杂图形； 6、R 语言的 Bioconductor 项目可以处理生物数据，例如基因表达数据，单细胞测序等； 7、R 语言学习成本较大，不如 Excel 简单。 3、R 语言的绘图能力更强，尤其是 ggplot2 包； 4、python 兼容性不好； 5、python 具有更强大的文本处理能力； 6、python R 语言更擅长处理结构化数据，因此，在使用 R 之前，尽量确保数据是严格的表格结构。也就是二位的表格，分为行和列。在 R 语言中，行称为“观测”，列称为“变量”。
1.1K10编辑于 2022-10-25 - 来自专栏生信迟
Day 6 学习R包
安装和加载R包1.镜像设置2.安装R包安装命令是install.packages(“包”)或者BiocManager::install(“包”)3.加载library和require，两个函数均可。 dplyr五个基础函数1.mutate(),新增列2.select(),按列筛选3.filter()筛选行4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序5.summarise()：汇总dplyr inner_join,取交集2.左连left_join3.全连full_join4.半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join6.
30330编辑于 2023-09-08 - 来自专栏R语言 / Linux
R基础-2
1.2 向量及后续 使用已准备好的Rproject（钉钉群里的R_01文件） 脚本打开是乱码的解决方式 2 向量 2.1 向量的生成（向量是一串同一种数据类型组合成的整体） 有4种办法 （1）用c 这个非常重要，需要记住】 >x=c(1,3,5,1) >table(x) 【 #重复值统计】 >x=c(1,3,5,1) >sort(x) 【#排序，R语言按照自己的想法排，那么怎么看R语言自己的想法呢 >a=seq(from=2,to=15,by=2) >paste0(rep("student",times=length(a)),seq(from=2,to=15,by=2) ) R语言里函数思想：能用函数代替 重点：%in%（没有快捷键） >x=c(1,3,5,1) >y=c(3,2,5,6) >x%in%y #x的每个元素在y中存在吗？ >x == 8:12 >x[4] == 40 #改一个元素 >x >x[c(1,5)] == c(80,20) #改多个元素 R语言里的修改，都要赋值，没有赋值就没有发生过 2.6 简单的向量作图
75540编辑于 2023-03-13
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