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Angew：靶向肿瘤和免疫细胞中GRPr的肽偶联的铱（III）复合物
胃泌素释放肽受体（GRPr）在生命系统中起着增生和炎性的作用。本文报道了一种高度选择性的GRPr拮抗剂（JMV594）-铱（III）络合物，用于探测活肿瘤细胞和免疫细胞中的GRPr。 这是第一个肽偶联的铱（III）复合物，被开发为GRPr生物成像探针和GRPr活性的调节剂。这种诊疗制剂在揭示GRPr在生命系统中的各种作用方面显示出巨大潜力。 总体而言，此工作为开发肽偶联的金属基探针提供了一种有效的方法，该探针不仅保留了金属化合物的优异光物理特性，而且还结合了肽的理想生化特性。
57310发布于 2021-02-04 - 来自专栏纳米药物前沿
氧化石墨烯-环R10肽核靶向纳米平台克服肿瘤多药耐药
在这项工作中，环状R10肽（cR10）与聚甘油覆盖的纳米氧化石墨烯缀合，该工程化纳米平台可克服肿瘤多药耐药性。 由cR10肽促进的纳米制剂的核靶向，以及随后的激光触发释放的阿霉素释放实现有效的抗癌活性，这在体外和体内实验中均得到证实。 合成的纳米平台具有多种不同特征的组合，包括主动核靶向，高负载能力，药物的受控释放和光热性质，为克服耐多药癌症提供了新的策略。 本文证明了通过聚甘油覆盖的石墨烯纳米片靶向细胞核可以在体内和体外成功克服肿瘤的多药耐药性。 这项工作介绍了一种新开发的环状肽的核靶向纳米药物，为克服肿瘤多药耐药打开了新的大门。
39620发布于 2021-02-04 - 来自专栏DrugOne
. | 跨物种线粒体靶向序列的生成式设计
因此，提升线粒体靶向能力对于核酸酶和药物分子的高效递送也具有重要意义。 要将蛋白质定向至线粒体，需在核编码蛋白的N端添加一段靶向肽。 然而，目前被系统表征的靶向肽数量有限，导致相关序列在工程应用中被反复使用。 结果 构建用于人工线粒体靶向序列设计的变分自编码器 线粒体靶向序列（MTSs）是一类带正电荷的肽段，具有形成两性α螺旋的倾向。 此外，双靶向肽的C末端保留了RR、R-2或R-3剪切位点模体，提示其具备在线粒体内被正确剪切的潜力。综合分析支持双靶向序列可能是由线粒体靶向序列进化而来。 随后，研究人员在潜在空间中进行线性插值，生成了62条假设具有双靶向能力的肽段。通过分析插值路径中肽段的特征变化，研究人员揭示了这类双靶向序列可能源自线粒体靶向肽的进化轨迹。
66810编辑于 2025-05-08 - 来自专栏DrugOne
. | 通过模拟结合界面实现精准肽分子设计
DRUGONE 肽类在靶向治疗中具有口服生物利用度、细胞通透性和高特异性等优势，使其区别于传统的小分子和生物制剂。 研究人员开发了一种人工智能算法 PepMimic，能够将已知受体或抗体转化为短肽结合剂，通过模拟已知结合界面生成候选肽。 表面等离子共振成像显示约 8% 的肽分子具有 10⁻⁸ M 级别的亲和力，26 条肽的 KD 值低至 10⁻⁹ M，明显优于随机文库筛选。 小鼠乳腺癌、骨髓瘤和肺癌模型中的注射实验验证了候选肽的膜结合效果，展示了其在临床诊断成像和靶向治疗中的潜力。 实验验证结果表明，该方法在多个肿瘤模型中展示了靶向成像和治疗的潜力。未来，PepMimic 不仅可用于药物开发，还可应用于基础研究中的蛋白互作机制解析和诊断工具开发。
40210编辑于 2025-10-14 - 来自专栏DrugAI
Science | 靶向无序蛋白的新一代结合蛋白设计
DRUGONE 无结构蛋白质和肽在生物过程中发挥关键作用，但由于其缺乏明确定义的结构且具有高度可变的序列和构象特性，因此难以被传统方法靶向。 研究人员先在6条合成序列上进行了测试，在平均每个靶标8个设计中获得了高亲和力结合，且多为10~100纳摩尔范围。 疾病靶点识别：用于识别突变型肽段（如CTN4），在临床质谱检测中具有潜力。 肿瘤细胞标记：结合MSLN的设计子能特异性标记表达该受体的细胞，表现出良好的肿瘤靶向潜力。 讨论 研究人员提出，靶向无结构蛋白实际上比靶向折叠结构更具优势，因为其构象异质性使其能被诱导至有利的结合状态。 其框架还可推广至： 靶向多种肿瘤相关受体的无结构区域； 检测神经肽、非典型开放阅读框编码蛋白； 通过设计双特异性结合子，提高结合特异性与亲和力； 融入催化功能，实现结合与功能调控的一体化； 探索翻译后修饰靶标
21520编辑于 2026-01-06 - 来自专栏DrugOne
. | 挑战难成药蛋白，PepPrCLIP设计精准结合肽
设计结合剂以靶向难成药蛋白在药物研发中是一项重大挑战。在本研究中，作者提供了一个算法框架，用于设计短小、能与靶点结合的线性肽，仅需靶蛋白的氨基酸序列。 靶向蛋白降解已成为治疗疾病的一种有前途的替代方法，但主要依赖于小分子弹头结合并招募内源性E3泛素连接酶到靶点，因此仍然需要存在可接触的表面结合位点。 由于UltraID是一种高度结构化的新型蛋白，不存在于两种模型的训练集中，作者评估了PepPrCLIP和RFDiffusion生成靶向UltraID催化口袋的IP（抑制性肽）序列的能力，该催化口袋基于AlphaFold2 在20个PepPrCLIP生成的IP中，19个显示成功的UltraID抑制，其中4个（IP_PpC_2、IP_PpC_8、IP_PpC_18和IP_PpC_19）表现出超过75%的抑制效率（图3C）。 相比之下，PepPrCLIP优先考虑多样化的序列，这些序列促进了与UltraID的强抑制性结合相互作用，这在靶向不同蛋白构象时可能进一步带来优势。
35300编辑于 2025-03-03 - 来自专栏纳米药物前沿
上海大学王艳丽Small Methods：一种通过细胞核靶向和线粒体介导的凋亡途径治疗肿瘤的高效碳基药物递送系统
据报道，负载DOX的CBNs可用于靶向肿瘤细胞核，但为了提高药物靶向率，通常需要修饰活性靶向配体，如抗体、叶酸和肽（RGD和核靶向肽）等，这些活性靶向配体在提高药物靶向性的同时也存在潜在的缺点，如抗体成本高 、肿瘤穿透率低（因其体积大）、适体稳定性低（因血浆中的核酸酶）以及肽的循环半衰期低（因血浆中的肽酶）等问题。 此外，修饰的靶向配体也使得合成过程繁琐且难以操作。 上海大学王艳丽教授课题组在之前的工作中通过改进的碱基介导的水热分子融合合成了一种新型石墨烯基肿瘤细胞核靶向荧光纳米探针，该探针具有肿瘤细胞靶向性的特点，是一种CBN。 结果表明，CPD在肿瘤细胞核中的DOX靶向率高达36.78 %，在肿瘤组织中的ID/g百分比高达30.09 %，肿瘤生长抑制率高达79.42±2.83 %，大大降低了DOX的全身副作用。
1K00编辑于 2022-08-15 - 来自专栏纳米药物前沿
中国药科大学周建平/丁杨团队AS：仿生脂质纳米复合物组装体实现“药物-载体”协同清除Aβ和抑制Tau蛋白磷酸化治疗
以天然高密度脂蛋白活性组分载脂蛋白A-I（ApoA-I）和磷脂仿生组装Aβ高亲和纳米复合物，并荷载Tau蛋白磷酸化抑制剂亚甲蓝（MB）；为高效渗透入脑，经apoA-I模拟肽仿生锚定并优化靶向配体Ang密度 通过修饰不同密度的脑靶向肽Ang，在细胞和动物水平进行靶向效果比较和优化：纳米复合物APLN/MB的脑靶向效果与靶向肽Ang的修饰密度并非正相关，过高的优势密度可能会因位阻作用降低纳米复合物与靶向配体的相互作用 图3 靶向肽Ang密度优化及APLN/MB靶向效果考察。 优化并评价纳米复合物体内靶向效果及体内致病毒蛋白Aβ清除和Tau蛋白磷酸化抑制效果和机制。 “药物-载体”协同治疗策略通过同时靶向AD双致病诱因，有望阻断甚至逆转AD病程，为AD药物研发提供新策略，极具应用前景。
1.3K50编辑于 2022-08-15 STTT | 从胰岛素到司美格鲁肽，读懂百年明星分子的现在与未来
不过，作为基于天然氨基酸的药物，多肽也有两大天生短板： 膜通透性差：多肽很难穿过细胞膜，因此约 90% 以上处于临床开发的多肽靶向的是细胞外靶点（如 GPCR、GnRH 受体、GLP-1 受体）； 体内稳定性差 心血管疾病：靶向 RAAS 与利钠肽 合成血管紧张素 II 于 2017 年获批，用于脓毒症 / 感染性休克的升压治疗； 利钠肽（ANP / BNP / CNP）是心血管稳态的关键调节因子。 肿瘤：诊疗一体化的新希望 多肽在肿瘤领域有四大应用方向：显像探针、偶联纳米材料、肽疫苗、靶向药物。 例如镥[Lu-177]氧奥曲肽用于神经内分泌肿瘤的诊断与治疗，多种靶向 PD-1 / PD-L1 的多肽正在研发。 图 4｜多肽在肿瘤治疗中的四大应用：(a) 候选肽筛选；(b) 显像与诊断；(c) 肽偶联纳米材料；(d) 肿瘤免疫与靶向治疗。
6200编辑于 2026-06-02- 来自专栏DrugOne
. | 机制驱动AI新策略：设计专门攻击MRSA持留细胞的抗菌肽
单细胞微流控实验显示，该肽能够杀死指数生长期的持留细菌，证明机制型人工智能可用于开发针对耐药和持留菌的新型抗菌肽。 为解决这一问题，研究人员提出一种机制型人工智能策略，将机器学习模型与生物物理约束评分结合，通过同时考虑统计预测和膜作用机制，从而优先筛选具有真实膜破坏能力的抗菌肽，并专门用于靶向持留细胞和生物膜。 通过这一双重筛选流程，研究人员能够在大规模候选肽库中优先选择具有膜靶向活性并可能对持留菌有效的序列，并进一步通过体外实验、单细胞分析和动物模型验证其抗菌效果。 图4：WP-CAMPER1靶向细菌膜的结构与生物物理机制解析。 研究人员认为，膜靶向抗菌肽是一种有前景的抗感染策略，而将机器学习与机制约束结合，可以显著提升新型抗菌分子的发现效率。
19810编辑于 2026-03-25 - 来自专栏DrugOne
Briefings in Bioinformatics | 用于PPI抑制剂设计的深度分子生成模型
首次将针对PPI的抑制剂的定量类药性指标QEPPI用于PPI靶向化合物的分子生成模型的评估。结果表明生成的分子具有较好的PPI靶向药物的类药性。 结果表明，生成的分子具有更好的PPI靶向药物相似性和药物相似性。生成的分子与 iPPI-DB 共享化学空间。探索了 PPI 抑制剂的基于肽和基于配体的分子生成。 基于肽的生成分子案例 为了评估基于肽生成的化合物是否可以成为有效的候选分子，研究人员选择了基于p53(肽)生成 MDM2-p53 靶标的潜在候选抑制剂。 该方法依赖于分子或肽作为种子分子生成多样性的PPI类药性化合物库。目前是第一次将深度分子生成模型应用于 PPI 抑制剂的从头设计。 研究人员探索了基于肽的 PPI 抑制剂设计和基于配体的 PPI 抑制剂设计。结果表明，生成的分子具有更好的 PPI 靶向药物相似性和药物相似性。
77050编辑于 2022-11-28 - 来自专栏生命科学
MCE | HIV 衣壳蛋白有望成为 HIV 治疗新靶标
例如衣壳不仅充当保护屏障使病毒基因组免于被识别和降解，而且还能促进逆转录，与核孔复合体接触，并直接整合位点靶向。 靶向CA 的抑制剂靶向 CA 可以干扰 HIV-1 复制周期的早期和晚期步骤。近年来，越来越多抑制 CA 功能的小分子和基于肽的化合物被发现或开发。 靶向HIV-1 GagGag 蛋白是逆转录病毒编码的三种基因产物之一，HIV-1 的组装主要由 Gag 蛋白控制。 Nat Rev Microbiol. 2015 Aug; 13(8): 471–483.8. Rebeca Bocanegra, at al. Nat Rev Microbiol. 2015 Aug; 13(8): 471–483
56830编辑于 2023-03-15 - 来自专栏DrugOne
ACS Fall 2025 |12个最新公布的临床候选药物
5、IID432（Novartis） Ph-1 | 靶向克氏锥虫的拓扑异构酶 II 抑制剂 基于 氰基三唑骨架，对 T. cruzi 高选择性。 8、AZD0233（AstraZeneca） Ph-1 | CX3CR1 拮抗剂 针对 CX3CL1–CX3CR1 轴，应用于扩张型心肌病。 9、FOG-001（Parabilis Medicines） Ph-1/2 | 稳定化 α-螺旋肽（Helicon™ 技术） 抑制 β-catenin/TCF4 相互作用，靶向 Wnt 通路。 11、MOMA-341（MOMA Therapeutics） Ph-1 | 共价 WRN 抑制剂 靶向 Cys727，利用合成致死机制，适用于 MSI-H/dMMR 肿瘤。 肽类与宏环分子 在放射配体和 PPI 靶向中展现潜力。 耐药克服与新型作用机制 成为焦点（如 FGFR2、WRN、PIP4K2C）。 传染病与炎症疾病 领域同样迎来小分子突破。
32910编辑于 2025-09-02 - 来自专栏智能生信
BMC Bioinf｜基于双向LSTM和Multi-head Attention的HLA与肽的结合预测
在HLA分子与肽的结合预测任务中，基于深度学习的预测模型虽然表现出较好的性能，但许多依赖于特定类型的HLA分子或特定的肽表位长度，且对数据量依赖较大，这导致数据量较少的HLA-C类分子和长肽表位的预测性能相对不佳 一、研究背景 1.1 背景 近年来，基于特异性T细胞的免疫治疗不断发展，取得了较好的成果，而靶向识别是免疫治疗过程的重要一环。对于靶向识别而言，准确预测HLA与肽的结合是其中的关键。 然而，许多模型都依赖于特定类型的HLA分子或特定的肽表位长度，且深度模型对数据量依赖较大，这导致数据量较少的HLA-C类分子和长肽表位的预测性能相对不佳。 (2) 由于现存数据中多数位点序列长度为8-11，导致长位点序列的数据量较小，在模型上预测准确度较低。 HLA分子结合的模式特征刻画 四、总结 本文基于双向LSTM和Multi-head Attention提出了MATHLA预测模型，在HLA分子与肽结合预测任务上表现出了很好的性能，并对HLA-C类分子和长肽表位有十分明显的性能提升
1K20发布于 2021-04-13 - 来自专栏生命科学
科研助攻 | 一文讲清：如何破解 PPI 靶点成药难题 | MedChemExpress (MCE)
随着相关研究的深入，热点 (Hot Spots) 的发现使有效靶向 PPI 成为可能。 FBDD 法开发 PPI 抑制剂的流程[8]。▐ 虚拟筛选虚拟筛选是基于专业的应用软件从化合物库中筛选出命中化合物，通过分析蛋白质表面来定位结合位点。虚拟筛选可被分为基于结构进行筛选和基于配体的筛选。 基于结构设计的 PPI 抑制剂策略分为两种，第一种是基于界面热点结构设计小分子药物，第二种是拟肽设计，依靠计算机建模模拟 PPI 中关键肽的二级结构，根据关键肽形成的 α 螺旋结构设计肽/拟肽类化合物。 Signal transduction and targeted therapy vol. 8,1 335. 6 Sep. 2023.[7] Wu, Defa et al. B vol. 13,10 (2023): 4060-4088.[8] Wang, Zhi-Zheng et al.
45910编辑于 2024-06-27 - 来自专栏生命科学
MCE | “神药”二甲双胍后，糖尿病药物研究谁将是下一个顶流？
1、胰高血糖素样肽-1 (GLP-1) 受体激动剂胰高血糖素样肽-1 (GLP-1) 是一种肠促胰岛素，由胰高血糖素原基因转录、翻译及加工而成，主要由分布于空肠、回肠和盲肠的 L 细胞分泌。 常见的 GLP-1 受体激动剂有艾塞那肽 (Exenatide)、利拉鲁肽 (Liraglutide)。 因此，研发非肽类 GLP-1 受体激动剂成为了目前糖尿病研发的热点。 靶向 11β-HSD111β-HSD 是糖皮质激素的代谢酶，抑制 11β-HSD 有益于控制血糖。 CCK8Cell Counting Kit-8，简称CCK-8试剂盒或CCK8试剂盒，是一种基于WST-8而广泛应用于细胞活性和细胞毒性检测的快速、高灵敏度试剂盒。
48330编辑于 2023-03-22 - 来自专栏智能生信
. | 机器学习设计非溶血性抗菌肽
Antimicrobial peptides, AMP)，合成并测试了28个生成肽，鉴定出针对绿脓杆菌、鲍曼不动杆菌和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 (MRSA) 的8种新的非溶血性 AMP。 作者第一次将监督学习和无监督学习结合，最大限度地利用了高度精选后的数据，合成并测试了28个筛选出的生成序列，结果产生了12个新的活性AMP，其中有8个具有非溶血性。 最终获得的序列都至少有5个位置与AMP活性和溶血性分类器的训练集和测试集不同，来自模型a的序列标记为GN(Gram-阴性靶向化合物)，来自模型b的序列标记为GP(Gram-阳性靶向化合物)。 表1测定结果显示，GN肽中有9种活性肽，6种对绿脓杆菌、鲍曼不动杆菌均有活性和非溶血性，GP肽中只有3种对MRSA有活性，其中2种有非溶血性。 ? 并在28种合成肽中检测到有12种对设计使用的病原体具有活性，其中8种对 MHC ≥500 μg mL -1 的人血细胞显示出低溶血性。实验证明，ML能够设计非溶血性AMP。
1.3K20发布于 2021-06-24 细胞免疫疗法TCR-T和空间VDJ测序
TCR在特异性识别APC递呈的抗原多肽过程中，T细胞表面的CD4或CD8分子作为共受体，参与同pMHC分子的结合，从而增强TCR与特异性抗原肽-MHC复合物结合的亲和力，并提高T细胞对抗原刺激的敏感性。 与CAR-T相比，TCR-T不仅能够靶向细胞表面蛋白质，还可以靶向胞内蛋白质。正是这点，使TCR-T更适合应用于实体瘤治疗（扩大靶点选择范围）。 TCR-T与CAR-T的差异TCR-T疗法具有多方面的优势第一个方面，TCR识别的靶点是HLA分子递呈的抗原肽，来自胞膜、胞浆和胞核中蛋白的抗原肽都可以被HLA呈递至细胞膜表面，从而成为TCR的靶点（细胞表达蛋白的 即使在输注过继功能细胞后，靶向肿瘤抗原的丢失也会导致肿瘤复发。 靶向在肿瘤存活中具有核心功能的蛋白质可以克服靶抗原的下调；用不同的肿瘤特异性TCR注入多个T细胞克隆；或注入靶向两种或多种肿瘤抗原的T细胞。
46721编辑于 2024-02-18- 来自专栏DrugScience
榕树集--利用机器学习在全球微生物组中发掘新型抗菌肽
亮点 使用ML对全球基因组进行预测，预测出大概100万种新的抗生素 在100个测试多肽中，79个体外实验验证有活性，63种靶向病原体 一些肽可能通过基因组碎裂从较长的序列中产生。 抗菌肽（Antimicrobial peptides ，AMPs) 抗菌肽（AMPs），也称为宿主防御肽（host defence peptides，HDPs），是所有生物类群中先天免疫反应的一部分。 原核和真核细胞之间的基础差异，可能成为抗菌肽的发挥作用的靶标。这些肽是强效的广谱抗菌剂，有潜力成为新型治疗药物。抗菌肽能杀死革兰氏阴性和阳性细菌、包膜病毒、真菌，甚至转化或癌变的细胞。 这些肽具有多种抗菌活性，从膜渗透到作用于各种细胞质目标。 Macrel 预测候选抗菌肽 AMPSphere使用机器学习（ML）模型Macrel来预测候选抗菌肽（c_AMPs）。 PeerJ 8:e10555.
1.1K10编辑于 2024-06-18 多肽与多肽的固相合成技术_MedChemExpress(MCE 中国)
近年来，科研工作者成功打造了一款针对肥胖的“神级装备”——司美格鲁肽，使“减肥”成为科研圈的现象级词条。 Section.02多肽的功能及其应用作为搭建多肽的“分子积木”，氨基酸种类、序列组合及修饰的多样性共同决定了多肽结构和功能的多样性，使其能执行信号转导与调控、免疫防御、酶催化、靶向识别运输等多种生理功能 药物与疫苗开发多肽可直接作为治疗性药物 (如胰岛素用于治疗糖尿病，司美格鲁肽被批准用于治疗 2 型糖尿病和肥胖)；也可作为靶向载体，辅助药物递送，例如 177Lu-dotatate (Lutathera ®)，其载体肽 Tyr3-octreotate 可将核素 177Lu 递送至表达生长抑素受体的肿瘤部位，实现靶向治疗。 多肽还可作为底物用于酶活研究，例如，MOCAc-PLGL(Dpa)AR 可作为荧光底物肽研究 MMP 的活性。
86110编辑于 2025-06-10
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