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单细胞数据复现-肺癌文章代码复现6
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648 单细胞数据复现-肺癌文章代码复现2https://cloud.tencent.com /developer/article/1995619 单细胞数据复现-肺癌文章代码复现3https://cloud.tencent.com/developer/article/1996043 单细胞数据复现 -肺癌文章代码复现4https://cloud.tencent.com/developer/article/2006654 单细胞数据复现-肺癌文章代码复现5https://cloud.tencent.com E2D200", p019 = "#46ACC8", p023 = "#E58601", p024 = "#B40F20", p027 = "#0B775E", p028 = "#E1BD6D "#7294D4", p032 = "#5B1A18", p033 = "#9C964A", p034 = "#FD6467", Alveolar_Macrophages1 = "#6bAEd6
68420编辑于 2022-05-23 - 来自专栏网站漏洞修补
Thinkphp-v6版本漏洞复现
Thinkphp漏洞复现ThinkPHP可以说是快捷、简易的面向对象编程的一个微服务架构，PHP前端框架开发，创建于2006年，遵照Apache2的开源协议进行对外开放，目的是为了快速WEB应用程序开发和优化企业应用软件开发而发展起来的
3.4K40编辑于 2022-12-12 - 来自专栏DrugScience
文章复现-No.1-Rosetta-KIC-Part-6-rosetta-安装
rosetta安装以及下载 写到这里，按说应该实践一波 无奈，常用服务器正在安全检查 只能重新下载一波 那就水一波安装 官网：https://www.rosettacommons.org/softw
42420发布于 2021-04-23 - 来自专栏生信技能树
m6A图文复现02-数据下载和质控
同时也分享了 全套MeRIP-seq文章图表复现代码，其实MeRIP-seq其实就是RNA水平的又叫做m6a测序。 这个全套 MeRIP-seq 图表复现代码在GitHub：https://github.com/al-mcintyre/merip_reanalysis_scripts 这个也是接近2G的压缩包！ 所以有了这个MeRIP-seq 图表复现交流群。 上一篇文章我们提到作者有非常好的代码资源，但是数据没有权限下载。因此，我又重新找了一篇文献，使用这个文章的数据来进行m6A图文复现。 ，大范围、高通量地鉴定了人和小鼠m6A的甲基化水平，这两篇文章是：Nature. 2012 Apr 29;485(7397):201-6 和 doi:10.1038/nprot.2012.148 2 数据下载 7b23cb95ffdf90f23e2784f31ad712de SRR867000.fastq.gz 3d14c4c8fcd95e5fa4a2c379d23f3088 SRR867001.fastq.gz f6d46a57cf66a73d6ea4e1a81e81b06d
1.6K30发布于 2021-07-29 - 来自专栏单细胞天地
手把手带你复现NC图表之Figure6
复现文章信息： 题目：Single-cell analysis reveals prognostic fibroblast subpopulations linked to molecular and 复现图——Figure 6 使用多个NSCLC队列进行生存分析 R包载入与数据准备 options(stringsAsFactors = F) pardefault <- par() library ) library(ggsci) library(survival) library(survminer) library(forestmodel) data_directory <- "H:\\文献复现 Figure 6B 显示TCGA-LUAD中25样品中肌成纤维细胞丰度测量值分布的密度图 Fig_6B <- Opt_cut.plot$Myo_Fibs.pct$distribution + Figure 6F 显示TCGA-LUAD中25样品中肺泡成纤维细胞丰度测量值分布的密度图 Fig_6F <- Opt_cut.plot$Alveolar_Fibs.pct$distribution
57720编辑于 2023-09-26 - 来自专栏作图丫
容易复现！铁死亡相关预后signature轻松发6+~
交互网络表明，JUN、FLT3、PIK3CA、G6PD和GPX4是hub基因。所选候选基因的相关网络如图2E所示，其中不同颜色代表不同程度的相关系数。 + 0.294 * PIK3CA+ (–0.179) * FLT3 + (–0.666) * IFNG + 0.500 * ANO6 + (–0.275) * SLC1A4。 结果表明，来自 TCGA 队列的 DEGs 在 GO 富集中的许多免疫相关生物学过程中显著富集（图 6A，B）。 图 6 为了进一步探索11个基因标记风险评分与免疫状态之间的相关性，本研究使用ssGSEA来量化不同免疫细胞亚群、相关功能或通路的富集评分。 总之，本研究思路清晰，复现较易。
58410编辑于 2022-12-04 - 来自专栏YX’blog
复现
本次教程来自YanXia，转载请注明作者信息,博客地址http://www.535yx.cn，感谢
45410编辑于 2023-04-07 - 来自专栏生信技能树
m6A-seq 数据处理及图表复现交流群
同时也分享了 全套MeRIP-seq文章图表复现代码，其实MeRIP-seq其实就是RNA水平的又叫做m6a测序。 这个全套 MeRIP-seq 图表复现代码在GitHub：https://github.com/al-mcintyre/merip_reanalysis_scripts 这个也是接近2G的压缩包！ 所以有了这个MeRIP-seq 图表复现交流群。 GENCODE (v26; downloaded from https://gtexportal.org/home/datasets Peak calling：MACS2 我们后续就按照这个流程来进行图表复现 如有万能的网友能搞到数据，我就可以给你复现整个文章了。 不过，我还有plan B：准备找一套其他的数据，利用此篇文献的所有代码进行数据分析。后续即将更新~
2.5K50发布于 2021-07-29 - 来自专栏LuckySec网络安全
JBoss 5.x6.x 反序列化漏洞复现
影响版本: JBoss 5.x JBoss 6.x 0x02 漏洞环境 执行下面命令启动漏洞环境： cd /vulhub/jboss/CVE-2017-12149 sudo docker-compose 0x03 漏洞复现 1. 漏洞检测POC 该漏洞出现在/invoker/readonly请求中，服务器将用户提交的POST内容进行了Java反序列化。 print('+ VER: Jboss AS 5.X +') print('+ Jboss AS 6.
64520编辑于 2022-11-02 - 来自专栏登神长阶
【论文复现】YOLOv5复现
概述 YOLOv5是Ultralytics公司在2020年6月发布的一款开源目标检测模型，其特点在于轻量化设计、易用性高以及出色的性能表现。 512 * width), round(1024 * width)] # P1/2 self.layer_1 = Conv(3, self.feat_dims[0], k=6,
1.2K10编辑于 2024-11-30 - 来自专栏生信技能树
m6A图文复现08-Peak结果可视化metaPlotR
同时也分享了 全套MeRIP-seq文章图表复现代码，其实MeRIP-seq其实就是RNA水平的，又叫做m6a测序。 下面是MeRIP-seq 图表复现笔记 上一期我们使用了Guitar包对Peak结果进行可视化，见：m6A图文复现07-Peak结果以及分布特征图 今天展示另一种可视化方法：使用metaPlotR包。 duplicated(temp$gene_name),] # limit m6a data to one transcript per gene (longest) m6a.dist <- m6a.dist T)/median(m6a.dist$cds_size, na.rm = T) utr3.SF <- median(m6a.dist$utr3_size, na.rm = T)/median(m6a.dist < 1, ] cds.m6a.dist <- m6a.dist [m6a.dist$rel_location < 2 & m6a.dist$rel_location >= 1, ] utr3.m6a.dist
3.5K11发布于 2021-10-12 - 来自专栏一名白帽的成长史
【漏洞复现】Apache ActiveMQ相关漏洞复现
Hello，各位小伙伴大家好~ 这里是一名白帽的成长史~ 最近在攻防演习中用到ActiveMQ的漏洞进行getshell 今天就来复现一下它的一系列漏洞吧~ Part.1 环境准备 环境说明 Apache vulhub.org/ 通过vulhub进行漏洞环境搭建： 查看容器端口映射关系，搭建成功： Web服务端口为8161，尝试访问主页： http://192.168.3.129:8161 Part.2 漏洞复现
6.4K10编辑于 2022-03-03 - 来自专栏安全学习
漏洞复现
漏洞编号CVE-2017-18349漏洞搭建这里使用vulhub的fastjson/1.2.24-rce进行复现。 访问http://192.168.146.167:37150/漏洞复现使用工具进行检测发现dnslog有数据，说明存在漏洞。
63710编辑于 2022-12-29 - 来自专栏人工智能基础
googlenet 复现
googlenet是2014年ilsvrc冠军，一共22层。这个网络中，作者使用了新的inception模块来进行多尺度信息融合，让神经网络变得更宽。同时googlenet比他的前辈alexnet相比，在精度大大提升的同时，参数数量大大减少（是alexnet的1/12），使得网络更加精简部署在移动设备上成为可能。 经过试验，googlenet保持一次推理只运行15亿次（乘法、加法）计算的常量。这样在实际生产中，googlenet也具有极大价值。
66600发布于 2020-11-17 - 来自专栏谢公子学安全
漏洞复现 | 通达OA命令执行漏洞复现
通达OA命令执行漏洞复现 目录 漏洞描述 漏洞等级 漏洞影响版本 修复建议 漏洞复现 ▶漏洞描述 通达OA是北京通达信科科技有限公司出品的 "Office Anywhere 通达网络智能办公系统"。 com/oa/security/2020_A1.7.25.exe 2013版 http://cdndown.tongda2000.com/oa/security/2020_A1.6.20.exe ▶漏洞复现 默认账号：admin 密码为空 ◣脚本复现 首先用脚本复现，直接命令执行即可。 python3 tongda_rce.py 目标URL ◣手工复现 手工抓包验证，该漏洞存在于以下两个链接中，并且以下链接无需认证即可访问。
7.9K00编辑于 2022-01-19 - 来自专栏文献分享及代码学习
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现5
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648 单细胞数据复现-肺癌文章代码复现2https://cloud.tencent.com /developer/article/1995619 单细胞数据复现-肺癌文章代码复现3https://cloud.tencent.com/developer/article/1996043 单细胞数据复现 -肺癌文章代码复现4https://cloud.tencent.com/developer/article/2006654 教程3和4主要是分别对epi细胞亚群进行的分析，也是将亚群细分，然后去找里面比较重要的基因 ", Endothelial3 = "#fd8d3C", Endothelial4 = "#FC4E2A", Endothelial5 = "#E31A1C", Endothelial6 "Endothelial6"
1.1K20编辑于 2022-05-22 - 来自专栏文献分享及代码学习
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现7
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648单细胞数据复现-肺癌文章代码复现2https://cloud.tencent.com /developer/article/1995619单细胞数据复现-肺癌文章代码复现3https://cloud.tencent.com/developer/article/1996043单细胞数据复现 -肺癌文章代码复现4https://cloud.tencent.com/developer/article/2006654单细胞数据复现-肺癌文章代码复现5https://cloud.tencent.com /developer/article/2008487单细胞数据复现-肺癌文章代码复现6https://cloud.tencent.com/developer/article/2008704下面主要是对差异基因进行分析
87120编辑于 2022-06-09 weblogic漏洞复现
可导致未授权的用户在远程服务器执行任意命令，T3协议简单来说就是快速传输协议漏洞环境https://github.com/vulhub/vulhub启动环境docker-compose up -d启动如下漏洞复现此漏洞复现需要下载 应为python3编码与python2不同，导致出现问题复制下图，握手成功表示脚本成功运行如下图，进入docker可查看成功创建目录最后我想试着能不能反弹shell能不能成功，但是不知到什么鬼原因无法复现 漏洞环境https://github.com/vulhub/vulhub启动环境docker-compose up -d启动如下漏洞复现输入此命令即可查看weblogic用户密码，密码随机，请自行docker ，但是此漏洞前提是需要知道后台管理员密码CVE-2020-14882（未授权+RCE）简介此次复现是两个漏洞组合导致远程命令执行，分别是CVE-2020-14882和CVE-2020-14883。 javaSerializedData）时，这可能会导致 RCE 漏洞漏洞环境https://github.com/vulhub/vulhub启动环境docker-compose up -d启动如下漏洞复现
1K10编辑于 2024-03-23- 来自专栏文献分享及代码学习
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现4
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648 单细胞数据复现-肺癌文章代码复现2https://cloud.tencent.com /developer/article/1995619 单细胞数据复现-肺癌文章代码复现3https://cloud.tencent.com/developer/article/1996043 前面是主要对 /results/Fig2E.pdf", width = 6, height = 8) heatmap.2(summarized_progeny_scores, trace = "none", density.info group.by = "patient_id") DimPlot(epi_pca, group.by = "histo_subtype") ##可以用于后续的服务器R文件的保存 for (i in c(4, 6, CAMK2N1", "FAM3C", "KRT7", "IFI27", "SLC2A1", "MARCKS", "PLAU", "AHNAK2", "PERP", "S100A4", "KRT19", "COL6A1
1.2K20编辑于 2022-05-18 - 来自专栏文献分享及代码学习
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现9
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1.1K40编辑于 2022-07-11
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