与R一起使用BLAST SRA函数

Question

我是一个R新手，但是我能从R中的命令行控制NCBI BLAST中的SRA函数吗？NCBI的网站是众所周知的不可靠，我希望能够管理批文件。

Answer 1

ape和BoSSA包在一起应该能做你想做的事情。BoSSA有一个blast函数，它调用blast API并使用ape中的DNAbin格式。