.fasta和.genbank格式之间的文件转换

Question

我必须创建两个函数，使我能够打开.genbank文件并将其转换为.fasta文件，反之亦然。目前我所拥有的是：

def Convert(file, file1)
    handle_input=open('file', 'rU')
    handle_output=open('file1', 'w')
        while True:
        s=handle_input.readline()
        t=handle_output.write(s, '.genbank')
    print(t)
Convert('file.fas', 'file.genbank')

这也可能是不正确的，但我不知道该怎么做。

Answer 1

你可以在互联网上找到很多关于这方面的文档。看看这里：https://docs.python.org/2/tutorial/inputoutput.html#reading-and-writing-files

但为了让你开始:我假设这两个文件在未来不会完全相同，因为否则你可以只复制文件。

我有几句话要说。

1)你的循环while true会一直运行到时间结束。将其更改为类似于

for line in handle_input:

2)完成后关闭文件：

handle_input.close() handle_output.close()

3)t=handle_output.write(s, '.genbank')删除'.genbank‘参数

4)不需要做print(t)

注意:我还没有测试过这段代码，所以我可能犯了一些小错误