探索ImmGen: 4-小鼠器官免疫细胞基因空间图谱

介绍

ImmGenMaps是免疫基因组计划联盟（ImmGen）启动的全新开源项目，旨在利用空间转录组学技术绘制小鼠器官中免疫细胞的综合空间图谱。该项目第一阶段将生成25个健康小鼠器官的高质量数据集，建立雄性和雌性标本的基线图谱，以揭示免疫细胞在自然组织环境中的多样性、动态及其与非免疫细胞的整合。作为基础工具，该项目致力于增进对免疫学过程的理解，并指导未来的创新治疗策略。

1. 在输入框输入需要分析的组织，然后Explore点击注册BioTuring账号后，进行组织空间转录组分析。

2.在Bioturing开发的单细胞数据分析平台Talk2Data分析了小鼠胸腺空间转录组图谱。聚类分析：提供Clustering（聚类）与Cell type prediction（细胞类型预测）功能。差异表达分析：支持Differential expression（差异表达）及Marker genes（标记基因）查找。 高级分析：包含Region segmentation（区域分割）、Image segmentation（图像分割）、Neighborhood analysis（邻域分析）、Deconvolution（去卷积）以及Cell-cell communication（细胞通讯）分析。具体用法还需要用户进一步学习与探索。