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回答
PacBio
长read纠错算法有哪些,各有什么优缺点?
、
请描述您的问题
浏览 100
提问于2023-07-18
1
回答
当不需要通配符的某些组合(缺少输入文件)和“合并”规则时,如何在snakemake中使用展开?
pacBio
_Hv1
pacBio
_Hv1
pacBio
_Hv1_1.5-2.5.fastq
pacBio
_Mv1_1-1.5.fastq
pacBio
_Mv1_2.5+.'ont' or '
pacBio
'), CAPDESIGNS (capture designs, i.e.
浏览 2
修改于2018-01-15
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1
回答
显式默认函数不能声明为constexpr,因为隐式声明不是constexpr。
5.3.1-14ubuntu2),并得到了这种类型的错误:> /root/pitchfork/workspace/unanimity/include/
pacbio
workspace/unanimity/src/models/P6C4NoCovModel.cpp:42: > /root/pitchfork/workspace/unanimity/include
浏览 0
提问于2017-10-15
得票数 2
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1
回答
将奇点-which目录中的文件夹挂载
run_deepvariant \ --ref="${INPUT_DIR}"/ucsc.hg19.chr20.unittest.fasta \ --reads="${INPUT_DIR
浏览 18
提问于2022-08-26
得票数 0
4
回答
使用sed/awk移除分隔文本列的最后一部分。
第一列
PacBio
读取ID是一个正斜杠分隔的值.我想通过删除最后的斜杠和超出它的值来修改该列。
浏览 0
提问于2017-07-06
得票数 1
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1
回答
在运行Docker脚本时未找到文件,但在另一个Docker脚本中找到了该文件
run_deepvariant \ --ref=/input/ucsc.hg19.chr20.unittest.fasta \ --reads=/input/NA12878_S1
浏览 1
提问于2020-09-23
得票数 0
2
回答
在Ubuntu上以非root方式安装软件
我在我的home/nick/目录中创建了一个名为smrtanalysis的文件夹 我从
PacBio
网站下载了该软件,并将.run文件放入我前面提到的目录中。
浏览 3
提问于2014-04-27
得票数 0
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1
回答
samtools相当慢
原始BAM的大小约为50 of (利用
pacbio
HIFI读取的全基因组序列)。我遇到的问题是“冷静”的速度非常慢!作业已经运行了12个小时,只生成了带有MD标记的600 MD。
浏览 7
提问于2022-02-08
得票数 2
1
回答
尽管包存在于conda环境中,但在snakemake管道中找不到命令错误
ISF1A.subreads.contigs.fasta canu -p F19FTSEUHT1027.PSU4_ISF1A -d canu-outputs genomeSize=8m -
pacbio
-rawhybrid_assembly.yaml" "canu -p {wildcards.sample} -d canu-outputs genomeSize=8m -
pacbio
-raw
浏览 49
修改于2020-01-15
得票数 0
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1
回答
调用snakefile中的另一个管道会导致输出错误
hybrid_assembly.yaml" "canu -p {wildcards.sample} -d canu-outputs genomeSize=8m -
pacbio
-raw
浏览 19
修改于2020-01-08
得票数 0
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