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这使用了Jensen-Shannon距离，并产生了一个排列有序的基因列表，我现在想要测试的是GO的富集。"XLOC_000570" 0.0461264880687295 我首先手动搜索每一个最相似的基因的GO术语，但我想做一个更可靠的分析
浏览 3修改于2016-05-13得票数 1
我尝试用enrichGO和R.对拟南芥进行富集分析，但结果是空白的。是什么导致了这个结果？
浏览 7提问于2021-05-17得票数 0
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R语言进行生信分析，GO分析goplot()反复报错？
r 语言、函数、脚本、可视化、数据
**R语言生信GO分析报错**自己运行时反复报错library(dplyr)library(stringr)
#(1)输入数据：上调和下调
浏览 303提问于2024-10-19
我正在尝试运行一个基因集富集分析，如下图所示：http://yulab-smu.top/clusterProfiler-book/chapter7.html 我一直在尝试使用这个特定的代码： data然后，我想将它和相应的名称(ENTREZ ID)放入一个名为gene的数据框中，这样我就可以运行富集分析了。
浏览 36修改于2021-03-17得票数 0
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我有一个正在分析的数据集。事实证明，它可以很容易地通过人口统计和社区数据来丰富，这极大地改善了分析结果。 join demographics using (zip) 这将使我在输出中获得多个zip或fips列，而我的分析引擎无法处理这些列我不能手动指定每个字段-富集表最终会产生数百列。
我可以执行select *，但这样我就可以拥有样本数据中我不想要的
浏览 2修改于2013-02-25得票数 7
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我有一个事件的源头看起来像这样 String userName;}class EventStats { Map<String,Integer> webPageCounters; 如何确保在开始处理事件流之前，我将为我准备好丰富的数据？
浏览 0修改于2021-05-11得票数 0
我已经进行了阿弗莱米特里克斯数据分析与橄榄和角膜缘。现在我需要对上调和下调的基因进行基因富集分析(在EnrichR上，通过搜索基因符号)。
浏览 7提问于2022-03-24得票数 0
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有没有人知道一个软件包或函数，它接受一个miRNA和一个mRNA的转录ID (ENSTXXXXXXXXXX)，并输出该基因是否是该miRNA的目标？
浏览 3修改于2018-06-22得票数 3
由于某些需求，我们不想使用丰富系统，因为流是从它自己收集的数据对象中获取的。但是，在检索活动时，我们得到以下信息：(iOS)这就是我们要做的..。但是再一次，我们面临着iOS SDK的问题。
浏览 0提问于2020-06-11得票数 1
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我有一个包含SAGE计数数据的矩阵，我想测试GO在路径中的富集。因此，我想在R中使用globaltest。这些样本可以分为两组用于检测途径富集: KI1组和WT2组我找到了函数gtKEGG来做路径分析
浏览 0修改于2012-04-20得票数 0
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这是的延续，我们有一个允许从购物车签出的外部API。综上所述，我们有一个流程，其中我们创建一个空的购物，添加一行项目，最后结帐。上述所有操作都是通过对外部服务的HTTP调用进行丰富的。我们希望同时添加行项(作为添加行项的一部分)调用。我们当前的配置如下所示：@Bean return f -> f.channel("inputChannel")
浏览 2修改于2017-05-23得票数 2
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Scala库使用toJson方法扩展了基本的类型。如果底层类型有这样的皮条客，我希望将Any转换为。我最好的尝试是有效的，但很冗长： case x: BigDecimal => x.toJson case x: Boolean => x.toJson case x: Char => x.toJson
c
浏览 6修改于2013-06-08得票数 2
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我正在为流分析方案评估Flink，并且还没有找到关于如何实现我们今天在遗留系统中所做的一种ETL设置的足够信息。如何有效地将多个(最多10个)数据流与Flink连接起来，比如一个数据流和9个不同的富集流？
浏览 3修改于2017-11-21得票数 1
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我使用R中的软件包topGO来分析基因的富集情况，代码如下：
sampleGOdata <- new("topGOdata", description = "Simple session", ontology
浏览 1修改于2016-08-16得票数 36
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KafkaContainerStoppingErrorHandler是否提交了先前的成功消息--例如，如果我们接收到10条消息，而对于消息1、2、3、4，富集调用就是成功，而对于消息5富集API调用失败
浏览 4提问于2022-04-20得票数 0
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例如，我开始依附于类型浓缩 implicit class RichInt(i: Int){ }我在这样的代码中使用的 def apply(rand: Random) = { rand.nextInt.complexCalculation + 1}
但是我现在怎么能隔离和单元测试算法呢？特别是，我想嘲笑complexCalculation的实现，如下所
浏览 1修改于2016-08-27得票数 11
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我正在在线学习这篇教程，以分析细胞类型之间的RNA-seq数据。https://combine-australia.github.io/RNAseq-R/06-rnaseq-day1.html 我已经能够使用我自己的数据来执行其中的大部分，但我现在正在尝试执行路径丰富分析seqdata是我的data.frame，其中包含来自分析的所有基因信息，第1列是基因ID名称，第15到24列是载体，其中包含10个样本中每个基因的读取计数信息。最终，我试图使用goana对差异表达的基因进行富集途径
浏览 63修改于2020-01-03得票数 0
我正在用gseapy富集酶对一系列基因进行浓缩分析。我添加了一些更正，以有一个列表，然后我可以进一步使用的分析。
浏览 4提问于2022-06-29得票数 0
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这里有一个变量“富集”，等于31.5925925926.在matplotlib.pyplot中是否有显示以下内容的方法？
浏览 2修改于2014-11-06得票数 4
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