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我在excel中工作，有许多带有基因和相应表达值的文件。不同的文件(不同的样本)包含不同顺序的不同数量的基因。如何排列数据，使每个样本中的表达值与正确的基因对齐。Gene A - 9
Gene A - 10, 9Gene C - 2, N/A
Gene D - N/A, 4 我可以用以下方法对基因进行比对： =IF(ISNA(MATCH(A1,C:C,0)),&
浏览 61修改于2021-02-10得票数 0
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它们(应该)包含相同的表达式数据，但它们具有不同的示例标识符。我需要做的是找到基因表达中最接近的匹配点，这样我就知道哪些样本对应。o 1214 a 4 14.413 a 2 13 2每一个样本有一
浏览 1修改于2022-10-26得票数 1
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类似以下单基因高表达的生存曲线，我想获得双基因高表达的生存曲线，请你百忙之中指教一下，感谢
1db08e6727190d698187d8ef0c0dba9.jpg
浏览 432提问于2019-08-29
我已经得到了一个数据(超过9000行)，它保存了每个细胞集群(列)特定基因(行)的平均基因表达，现在我需要将基因名(行名)更改为同义词。52.13 18.42 4.12 GeneName NewGeneName[2] Tppp2 TPPP3
[3] Slc39a9</e
浏览 3修改于2020-06-04得票数 0
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我有一个基因表达的大型数据集。这些行就是基因。柱子是特定的组织--因此它是该组织中的基因表达。我使用下面的代码来制作一个热图：我不知道如何创造一个传奇
浏览 3修改于2021-05-06得票数 0
0.8250437 8 Radio Censored 0.9428735 4.7143673 我想对每种处理的“死亡”和“审查”中的每个基因表达进行比较。我现在只能做一个基因表达，就像这样：
ggboxplot(df, x="Treatment", y= "gene1", f
浏览 15修改于2019-08-21得票数 0
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我的问题是如何制作散点图来显示过度表达和表达不足的基因的颜色。目前散点图仅显示黑色。我想在图中用红色表示过度表达的基因和蓝色表示不足的基因。我附上了散点图的快照和。我需要代码方面的帮助。显示一组与另一组的散点图dataB <- rowMeans(filtered_condensed$E[,10
浏览 2修改于2017-03-24得票数 1
下面是一些基因的表达数据表： expMERGED:PITG_23017_PITG_23018 0.00000000> exp_names
[1] "PI
浏览 4修改于2020-07-24得票数 2
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在R中，我有一个包含9个命名列的数据框，用于描述实验数据。第一列包含基因名称，下面8列包含基因表达值。最终目标是根据表达式值的标准差对数据帧进行排序。基本上，我想计算第2列到第9列的标准差，并根据这些值对整个数据帧进行排序。我该怎么做呢？
我的第一个想法是使用标准差添加第十列，使用sd()函数计算，然后对表进行排序，最后再次删除第十列。
浏览 7修改于2011-10-26得票数 2
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我正在用一种方法来找到甲基化调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因甲基化与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器，我得到了418个基因的子集，其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出甲基化和每个基因表达的b样条三次回归系数。我的数据包含在一个包含两个矩阵的列表中，如下所示： AAAS ABCA7 ABCC12 ABCF1 ACN90.851
浏览 1提问于2015-06-24得票数 1
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我是R的新手，我有1200个基因表达文件，只有两列基因名称和基因表达值。我希望过滤出63个这些基因，并生成一个仅包含这些基因的基因表达值的基因文件，这样最终就可以在单个数据库中为每个1200个样本生成63个值row .基因表达式文件只有两列，包含基因Id和基因表达<
浏览 18修改于2019-10-24得票数 1
我想下载由微阵列实验产生的基因表达数据。我对这个主题了解不多，但据我所知，行通常对应于基因，列通常对应于样本。理想情况下，我希望得到一个基因表达数据矩阵。我一直在互联网上搜索，虽然看起来有很多地方可以下载这样的数据，但当我真正下载数据时，我并不了解基因表达的矩阵。有没有人可以让我知道有没有地方或者如何以我期望的格式下载基因表达数据？
浏览 0修改于2013-11-24得票数 7
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DF有数千行，因为每个样本都有许多基因名称。我正在尝试使用一组10个管家基因来执行一个QC步骤，其中我删除了所有“样本I”，对于这些“样本I”，只有不到9/10的管家基因的表达高于一个截止值。基本上，我希望获取DF$hugo_name中与10个基因列表匹配的所有基因，并对每个基因名称检查其表达值，以确保它高于我的截止值列表。4.31 7 REEP5
浏览 37提问于2018-06-02得票数 0
我有一个含有基因名称和样本编号的矩阵。每一行都是一个逻辑向量，指示检测到基因的样本。基因必须至少出现在8个样本中的4个样本中才能做到这一点(仍在矩阵中)。编辑:这个问题源于尝试重新创建这个：
假设样本集包含不到50%的离
浏览 6修改于2015-01-18得票数 2
大家好，我是R/ ggplot2的新手，我想请教一下如何创建一个像这样的图：说明:一个不同的条形图显示了生物学功能，表达增强的基因(黄色)指向右侧，表达降低的基因(紫色)指向左侧。条形的长度代表差异表达基因的数量，颜色强度根据它们的p值而变化。
请注意，x轴在两个方向上都必须是“正”的。(在已发表的关于基因表达实验研究的文献中，向左的条表示表达减少的基因，向右的条表示表达增加的
浏览 0修改于2018-03-22得票数 0
我在一栏中列出了这些基因的具体表达形式。我想要做的是，如果一个基因的最低表达量高于一个阈值。将该基因的名称添加到空的dataframe中，并使用此函数在开始的dataframe中循环遍历所有基因：data <- data.frame(gene = c("a", "a", "a",3505 b 17
浏览 4修改于2022-11-24得票数 0
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我正在处理一个大的数据集，对某个基因进行多个观察，在不同的日期和不同的表达水平上。我想把所有的“表达式”列值之和到
我试着做了一个for循环，但是我对R相对来说
浏览 1提问于2022-05-12得票数 0
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它代表了生物样品中基因表达的测量。问题是，有时测量直接在基因上(“探针”然后为空)，有时测量是通过基因的“探针”进行的(“基因”仍然是设置的)。一个基因可以有多个探针。没有其他表格包含基因-探针关系。"probe" INTEGER REFERENCES "probes" ON DELETE CASCADE,);
常见的查询包括获取给定样本中所有基因</e
浏览 2修改于2020-05-10得票数 0
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我有一个以teb分隔的文件，其中一列包含基因名称，另一列包含这些基因的表达值。我想使用grep从这个文件中删除某些基因。所以，这是："42262" "SNHG8" "25.3981""42264" &
浏览 1修改于2011-09-22得票数 0
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