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我是ggplot2的新手，我很难用两个因素来为每个基因做一个作图。
GENOTYPE AGE X1.2.SBSRNA4 A1BG A1BG.AS1A1CF A2LD1 A2M A2ML1 A<em
浏览 1修改于2015-08-19得票数 0
0.1182451815023 gene3 Sample2 -0.1576990015140 gene8 Sample2 0.4509615415171Sample8 -0.31132355
104629 gene
浏览 3修改于2018-03-21得票数 1
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我是R的新手，我有1200个基因表达文件，只有两列基因名称和基因表达值。我希望过滤出63个这些基因，并生成一个仅包含这些基因的基因表达值的基因文件，这样最终就可以在单个数据库中为每个1200个样本生成63个值row .基因表达式文件只有两列，包含基因Id和基因表达<
浏览 18修改于2019-10-24得票数 1
我有一个“标识符文件”，看起来如下( 1050行为2列)：
模块1基因2
基因2样本1样本2等
我想根据基因标识合并这两个文件，并具有来自标识符和目标文件的匹配表达式值和模块关
浏览 3提问于2014-02-02得票数 0
Sample1 Sample2 Sample3 Sample4 Sample5 Sample6 Sample7 Sample8 假设样本集包含不到5
浏览 6修改于2015-01-18得票数 2
我有一个表达矩阵，也就是一个包含一些基因在不同人类样本中表达水平的矩阵，还有一些样本是重复的，所以我需要将这些重复中的表达组合起来，并计算出中位数。我将样本的名称作为行，在每一列中我有一个基因的表达。(我有大约200,000个基因，所以大约有200,000列)。第一列如下所示：Adipocyte - breast, donor2Adipoc
浏览 0提问于2015-12-13得票数 0
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我在excel中工作，有许多带有基因和相应表达值的文件。不同的文件(不同的样本)包含不同顺序的不同数量的基因。如何排列数据，使每个样本中的表达值与正确的基因对齐。For example:Gene A - 10. Gene B - 7 Gene C - 2.Gene A - 9
Gene A - 10, 9
Gene
浏览 61修改于2021-02-10得票数 0
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我有一个包含各种基因的基因表达数据的数据集，跨越24个不同的样本。在我目前的数据框架中，每行都是一个基因，每列都是一个样本。我想创建一个点图，其中每个点都是一个基因，y轴表示该基因在样本A中的表达，x轴表示该基因在样本B中的表达。sample_A<-
浏览 12提问于2018-01-15得票数 0
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我有一个数据框架，列1是基因，所有其他列都是该基因在不同条件下的基因表达数据。我想逐个基因，把所有的表达值除以该基因的中位表达值。我有一个名为s.med.df的数据框架中的中介。我试图指示R除以所有表达列(2:n)，但不是第一列除以每个基因的中值。我是R的新手，但到目前为止，我的脚本如下：Con2<
浏览 3修改于2016-03-29得票数 0
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我有一个包含基因表达水平信息的数据。如何制作条形图，其中X轴是基因名称，Y轴是表达水平？如果不将A基因和B基因合并到同一列并在单独的列中键入基因A和B，我就无法找到在ggplot2中标记A基因和B基因的方法。row.names(
浏览 3修改于2022-01-19得票数 0
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我有一个包含患者数据/存活率和基因表达数据的数据帧，如下所示1 Patient_1 1 356 3455 ... 593933 Patient_3 0 1224 3636 ._1)的基因表达数据细分为四分位数，然后在生存分析中选择最低和最高的四分位数进行比较：
library(dplyr); library(survival)
浏览 5修改于2016-12-29得票数 0
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我正在研究单核rna测序，我做了一个由所有特征的基因子集组成的矩阵，显示每个基因的数量。我想要计算在每个特性中表达的基因的比例，但是不能得到我的代码来返回正确的结果。没有表达的基因有一个“。值，所以我想计算每一列中有多少个，将其计算为基因总数的一小部分，并使用(1-分数)来找出每个特征所表达的基因的比例。marker <- c(
浏览 9修改于2022-05-13得票数 0
我感兴趣的是使用Spearman相关系数分析来关联两个变量，如基因表达(基因符号和折叠变化)和蛋白质表达(基因符号和折叠变化)，如图所示。A(内部J. Mol.Sci。B. ( ggplot2 :快速相关矩阵热图-R软件和数据可视化-简易指南-维基- STHDA.我需要一个热图，显示来自1个轴上的基因表达数据(var 1)和其他轴上的蛋白质表达(var 2)的变量。
浏览 76提问于2021-03-31得票数 0
它们(应该)包含相同的表达式数据，但它们具有不同的示例标识符。我需要做的是找到基因表达中最接近的匹配点，这样我就知道哪些样本对应。13.3我需要做的是编写一个函数(或类似的函数)，它试图尽可能地匹配数据中基因的表达(对于所有的基因)，并用最接近的匹配来报告样本标识符。13 2每一个样本有一个额外的列，使基因表
浏览 1修改于2022-10-26得票数 1
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我有一些生物钟基因的表达数据，我需要表示的是，哪个阶段(某个基因的最高表达高峰)的某些基因。我所指的图表就像一个时钟，在这个时钟里，你可以看到一个基因在什么时候有它最大的表达高峰。
(C)在指示光周期下，TOC1 1:LUC和CAB2 2:LUC在野生型和TMG植物中的表达相图。相(相/周期×24 h)用相对振幅误差表示的节律强度作图。
浏览 2修改于2015-06-09得票数 0
我想下载由微阵列实验产生的基因表达数据。我对这个主题了解不多，但据我所知，行通常对应于基因，列通常对应于样本。理想情况下，我希望得到一个基因表达数据矩阵。我一直在互联网上搜索，虽然看起来有很多地方可以下载这样的数据，但当我真正下载数据时，我并不了解基因表达的矩阵。有没有人可以让我知道有没有地方或者如何以我期望的格式下载基因表达数据？
浏览 0修改于2013-11-24得票数 7
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数据集的部分如下所示：1 Both Deceased 3.1934860 63.8697194 9 None Censored 3.3001750 10.7255686 ggboxplot(df, x=&qu
浏览 15修改于2019-08-21得票数 0
我有两个文件/数据集: 1) 2列和80,000行。第一列只包括行名(基因列表)，第二列它们的表达值2)是一个基因簇文件，我有超过27,000个簇，每个簇由多个基因(从200到1)识别。我想计算每个基因簇的平均表达值。gene1 2.4gene3 0.1gene80000 2.1
#dataset 2<
浏览 2修改于2019-12-31得票数 1
案例1对hBD-1和LL-27基因的表达无明显影响.expression\b)', r'\1 expression', str_a)输出字符串：输入字符串：输入字符串：
后，hBD-1和LL-27基因的表达不受痤疮的影响，因此痤疮和非痤疮患者的基因受癌
浏览 1修改于2021-06-02得票数 1
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