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1
回答
( R) Seurat:样品分组
我用Seurat软件包
分析
了六个
单细胞
RNA-seq数据集。同时,在6个数据集中,数据1、2、3和4属于“未处理”
组
,而数据5和6属于“处理”
组
。我合并了所有的6个数据集与批处理校正,但我也需要比较的特点“未处理”与“处理”。如何将数据1,2,3和4分
组
为“未处理
组
”,数据5和6分
组
为“处理
组
”,然后执行下游
分析
? 谢谢。
浏览 15
修改于2020-07-16
得票数 0
回答已采纳
1
回答
错误帕伽索斯包: TypeError: highly_variable_features()得到了一个意外的关键字参数'consider_batch‘
我正在使用Pagesus软件包
分析
我的
单细胞
RNA测序数据。我遇到了以下错误,使用飞马软件包进行
单细胞
分析
。
浏览 7
修改于2022-04-19
得票数 -2
0
回答
单细胞
分析
seurat完成后,如何提取多样本数据集data?
r 语言
、
数据分析
、
data
、
对象
、
数据
单细胞
分析
后,构建了seurat对象,使用的是多样本数据,想要提取data做cellchat
分析
,但是data按样本分开了,想问如何全部提取合并?
浏览 120
提问于2024-11-22
0
回答
RNA velocity图的箭头长短有什么含义吗?
velocity
单细胞
测序
分析
方法Velocity的箭头长短有什么含义吗?
浏览 247
提问于2022-01-19
0
回答
基因数不同的
单细胞
数据如何整合进行后续
分析
?
r 语言
、
生物基因
、
数据分析
、
数据
我下载的
单细胞
数据集中,每个
单细胞
数据的基因数彼此都不相同,这种数据集该用什么方法进行整合??上面几个数据中 每个数据中的基因数都在2万个左右 但是基因数不一致 那么这四个数据该如何整合起来做后续
分析
?用harmoy吗?具体如何操作?
浏览 111
提问于2025-12-15
1
回答
Seurat数据可视化
嗨,我正在使用公共数据pbmc来练习
单细胞
分析
,我在这一点上被这个错误信息卡住了。刚从R开始,遇到困难,有人能给一个指针吗?非常感谢代码: RidgePlot(pbmc3k.final,features = features,ncol = 2) FetchData.Seurat中的错误(对象=对象
浏览 3
修改于2022-08-11
得票数 0
1
回答
所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker(包括免疫细胞,内皮细胞,成纤维细胞)?
数据分析
全血管的
单细胞
测序进行数据
分析
时发现在所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker(包括免疫细胞,内皮细胞,成纤维细胞等等),为什么?
浏览 382
提问于2022-01-09
2
回答
批量
转录
和LUIS集成
我需要在批量
转录
和LUIS之间进行集成,其中我将把
转录
作为这样的方式传递给LUIS,并获得音频的意图。 据我所知,我们可以将用于意图
分析
的数据作为一个只接受500个字符的查询传递给LUIS。因此,问题来了,是否有可能将完整的从语音到文本的
转录
批量
转录
API传递给LUIS进行意图
分析
,或者我们必须将数据分块提供给LUIS?
浏览 20
提问于2020-06-11
得票数 3
1
回答
认知批量
转录
情感
分析
当使用Azures批量
转录
服务(“api/ true /v2.0/
转录
/”)时,我可以通过将"AddSentiment“属性设置为true来获得句子级别的情感
分析
。然而,结果并不像文本
分析
API那样包含对整个文档的情感
分析
。 是否有添加文档级情感评分的标志?
浏览 15
提问于2020-08-31
得票数 0
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1
回答
在Hibernate HQL中,当多个子类具有相同名称的属性时,如何让join获取子类的链接实体?
背景 我正在模拟一个基于冬眠的系统中的基因
组
特征(基因、
转录
本和外显子)和遗传变异。基因、
转录
本和外显子都是GenomicFeature的亚类,每个变体都可以有零到多个GenomicFeatures.反过来,基因有零对多的
转录
本--就像外显子一样--
转录
本也有零到多的基因和外显子。有时,我想获取一个变异体及其所有的基因
组
特征,以及从直接的基因
组
特征中连接的所有基因
组
特征。我想取一个特定的变体,与该变异相关的基因/
转录
本
浏览 2
提问于2016-09-01
得票数 6
3
回答
安装Seurat -R
单细胞
基因
组
工具包
我是R的新手,并试图安装Seurat来
分析
我的基因
组
单细胞
数据。但是,我想使用Seurat (),但是在安装软件包时遇到了困难。
浏览 3
修改于2019-11-29
得票数 1
1
回答
“捐赠这个语音邮件”和“允许自动谷歌系统
分析
你的语音邮件”是不是多余的?
如果我“允许自动谷歌系统
分析
您的语音邮件信息,以帮助提高
转录
质量”:在编辑成绩单时,是否建议检查“捐赠此语音信箱”选项?📷 我感到惊讶的是,当“允许自动谷歌系统
分析
语音邮件信息以帮助提高
转录
质量”时,默认情况下不会检查该选项,这让我怀疑这两种选项之间是否有任何区别。
浏览 0
提问于2014-08-12
得票数 2
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1
回答
单细胞
:如何把想要的cluster提取出来,再进行
分析
?
您好,可以请教您一个小小的问题嘛,我最近也在做
单细胞
,用Seurat把cluster分完了,可是我想要把cluster8和16单独拿出来,在进行
分析
,这个代码要怎么写呢,万分感谢
浏览 770
提问于2021-05-10
2
回答
如何分割和合并错误分割的区域
我已经完成了分水岭分割的图片上的一
组
细胞。似乎有许多细胞簇还没有被分割好,或者根本没有被分割。也有一些
单细胞
被过度分割。我可以用什么方法来合并过度分割的
单细胞
并进一步分割未分割的细胞簇?
浏览 5
修改于2016-06-15
得票数 2
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2
回答
从voip或sip系统获取实时音频流
我正在构建一个应用程序,从我们组织的VoIP系统获得实时音频,记录呼叫并
转录
实时语音。然后
转录
传递到我们的
分析
引擎并获得洞察力。 我们能够
转录
录音,并从
转录
中获得洞察力。我们也有一个实时
转录
的解决方案。它将
转录
的声音从麦克风,甚至RTSP流也。我们很难找到从SIP/VoIP系统获取实时音频的解决方案。我读到和选项以及WebRTC也是另一种选择。
浏览 0
修改于2019-01-31
得票数 6
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1
回答
从miRNA微阵列表达数据重建miRNA
转录
因子的层级模型?
有谁知道如何找到一
组
miRNA基因的
转录
因子,并重构调节miRNA基因的层次化miRNA
转录
因子?
浏览 1
提问于2013-09-03
得票数 0
1
回答
阿里巴巴云支持文本
转录
吗?
我目前使用亚马逊
转录
,以获得情感
分析
的文本聊天。我有兴趣切换到阿里巴巴云,并想知道该平台是否提供类似亚马逊AWS的情感
分析
功能?
浏览 1
提问于2020-08-02
得票数 0
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1
回答
更改R中pheatmap中树状图的线宽
我使用存储在
单细胞
实验
分析
中的
单细胞
RNA-seq数据,使用R中的pheatmap对~ 11.3000个表达基因(而不是聚类样本)进行层次聚类,以显示数据的异质性。
浏览 5
提问于2018-05-22
得票数 2
0
回答
为什么FPKM不能
分析
转录
组组间差别?
composition
转录
组组间差异
分析
中library composition指什么?为什么FPKM不能解决这个问题,而DEseq2能解决
浏览 194
提问于2022-02-15
1
回答
如何从GEO数据库中提取
单细胞
RNA测序数据?
我很难找到教我如何从GEO NCBI数据库中
分析
R上的
单细胞
RNA测序数据的材料。如果您对教程有任何指导或建议,我将非常感谢。 谢谢!
浏览 12
提问于2020-04-14
得票数 0
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