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数感一分钟 | 小猫数钟声
铛~铛~铛~ 上课钟声了 小猫想算出 上课钟声响12次的时间 你能帮他算算吗？ 每周带孩子一起动动脑， 让孩子爱上趣味数学！
48030发布于 2020-05-27 - 来自专栏sowhat1412
10分钟了解啥是数仓
2 数仓 2.1 数仓简介 数仓发展 随着人类IT发展，数据越来越多被产生，并且这些数据还可能跨部门，跨业务。如何把数据集成起来进行OLAP是个巨大挑战。 数仓发展 对于数仓可以理解为原来各个数据孤岛中的数据可能存储位置、存储格式、编程语言等各个方面不同。数仓要做的就是把数据按照所需格式提取出来，进行转换、过滤、清洗。 集市层构建的好坏有一个比较好的衡量标准就是是否可以满足超过80%的应用层数据需要，剩下的20%来源于数仓层。 2.3.2 数仓分层原因 用空间换时间：通过大量的预处理来提升应用系统的效率，因此数据仓库会存在大量冗余的数据。 2.4 元数据介绍 2.4.1 元数据定义 数仓的元数据Metadata是关于数据仓库中数据的数据。
3.7K10编辑于 2022-09-20 - 来自专栏码农小胖哥的码农生涯
10分钟了解啥是数仓
2 数仓 2.1 数仓简介 ? 数仓发展 随着人类IT发展，数据越来越多被产生，并且这些数据还可能跨部门，跨业务。如何把数据集成起来进行OLAP是个巨大挑战。 数仓发展 对于数仓可以理解为原来各个数据孤岛中的数据可能存储位置、存储格式、编程语言等各个方面不同。数仓要做的就是把数据按照所需格式提取出来，进行转换、过滤、清洗。 集市层构建的好坏有一个比较好的衡量标准就是是否可以满足超过80%的应用层数据需要，剩下的20%来源于数仓层。 2.3.2 数仓分层原因 用空间换时间：通过大量的预处理来提升应用系统的效率，因此数据仓库会存在大量冗余的数据。 2.4 元数据介绍 2.4.1 元数据定义 数仓的元数据Metadata是关于数据仓库中数据的数据。
1.2K20发布于 2021-06-24 - 来自专栏数感星球
数感一分钟06 | 快速抢答
第六期 快速抢答 大家好喔~ 现在是数感一分钟 问题抢答时间! 让我们看看 谁才是最聪明的娃~ 每周带孩子一起动动脑 让孩子爱上趣味数学！
40210发布于 2020-05-27 - 来自专栏奇异维度
比较常用的码子记录一下（HTMLCSSJS笔记）
实现img图片不能被拖动的两种简单方法 在img标签中添加属性 draggable="false" 通过css样式设置 img { -webkit-user-drag: none; } 文本溢出处理 //单行 .single{ overflow: hidden; white-space: nowrap; text-overflow: ellipsis; } //多行 .more{ overflow:hidden; work-break: break-all;
34410编辑于 2021-12-30 - 来自专栏数感星球
数感一分钟 | 小猴子吃糖
小猴子也爱吃糖果， 但小猴子不会算糖果的重量， 你能来帮它算一下吗？ 每周带孩子一起动动脑， 让孩子爱上趣味数学！
63020发布于 2020-05-27 - 来自专栏数感星球
数感一分钟 | 小红换牛奶
年中促销， 超市推出优惠换购活动了， 我们来算一算， 参与活动的小红 一共能喝多少瓶牛奶吧！ 每周带孩子一起动动脑， 让孩子爱上趣味数学！
43820发布于 2020-05-27 - 来自专栏数感星球
数感一分钟 | 小鸭子过河
门前小河边游过一群鸭 快来快来数一数 二四六七八...... 你能算出有多少只小鸭子吗？ 每周带孩子一起动动脑， 让孩子爱上趣味数学！
64930发布于 2020-05-27 - 来自专栏数感星球
数感一分钟11|小精灵倒水
小精灵去池塘边量水啦， 让我们帮他想一想， 怎么才能倒出相应高度的水呢？ 后台回复”倒水“可以获得 Q3的详细解答喔。 所有答案皆不唯一 嘻嘻~ 欢迎留言留下你答案！
36020发布于 2020-05-27 - 来自专栏数感星球
数感一分钟08|小怪兽烤肉
第八期 小怪兽烤肉 午餐时间到~ 小怪兽们也开始烤肉啦~ 快来帮它们算算把火腿烤熟 要花多长时间吧~ 还有另外一种解题方法喔~ 欢迎留言留下你的思路！
37230发布于 2020-05-27 - 来自专栏数感星球
数感一分钟12 | 姐姐和妹妹
贴心的姐姐， 带上妹妹一起去公园玩耍啦！ 让我们来算算， 姐姐妹妹今年多少岁了吧！ 每周带孩子一起动动脑， 让孩子爱上趣味数学！
53720发布于 2020-05-27 - 来自专栏生物信息学
密码子使用偏性的分析方法介绍
64组密码子（4*4*4）中，有三组不编码（UAG、UAA和UGA），它们是终止密码子，还有一组AUG既是甲硫氨酸（Met）的密码子，又是多肽合成的起始密码子。 由于密码子具有简并性的特征，即一种氨基酸对应不同的密码子，因此不同氨基酸对应的不同密码子的使用频率是不一定相同的，我们把氨基酸对应的各自密码子使用频次的不同叫做密码子使用偏性。 其中，预测出现的次数为该密码子所编码的氨基酸的所有密码子平均使用的次数，公式如下： 如果密码子使用没有偏好，则该密码子的RSCU值等于1。当某一密码子的RSCU值大于1，则表明其的使用频率相对较高。 有效密码子数（Effective Number of Codon, ENC） 指基因中使用的有效密码子的数量，公式如下： 公式中，n表示基因中所使用的密码子总数，k表示同一密码子数量，p表示密码子使用频率 计算该值需要先提供在对应物种中高表达基因的最优密码子表作为参考，公式如下： L表示基因中所使用的密码子数，CAI值介于0~1之间，该值越大表示适应性越强，CAI值广泛应用于基因表达水平的评估中。
5K10发布于 2020-04-14 - 来自专栏数感星球
数感一分钟09|荷花池
池塘的荷花就要开放啦~ 让我们来想一想， 荷花开满半个池塘要多久吧~ 每周带孩子一起动动脑 让孩子爱上趣味数学！
33540发布于 2020-05-27 - 来自专栏数感星球
数感一分钟12|小熊切金条
小熊熊请小狗帮忙干活， 让我们帮它想想金条怎么分， 才能确保每天都能给小狗相应的报酬？ 还有另外一种解法喔， 欢迎留言留下你的答案~ 每周带孩子一起动动脑 让孩子爱上趣味数学！
43620发布于 2020-05-27 - 来自专栏生信宝典
百度出品，Nature重磅 -- 优化的mRNA设计算法可改善mRNA的稳定性和免疫原性
利用我们的算法（LinearDesign）设计Spike蛋白的mRNA仅需11分钟，并且同时优化稳定性和密码子的使用。 由于CAI的取值范围在0和1之间，但MFE通常与mRNA序列长度成正比，我们将CAI的对数乘以mRNA中的密码子数，并使用一个超参数lambda来平衡MFE和CAI（lambda = 0表示仅考虑MFE 由于我们的联合优化公式将CAI因子分解为每个密码子c的相对适应性w(c)，我们在每个密码子DFA中设置边权重，使得密码子c的路径成本为-log w(c)，这可以解释为与最优密码子的“偏差量”。 最后，我们的波束搜索版本（b=500）进一步加快了设计速度，并且与序列长度呈线性扩展，仅MFE的近似搜索在SARS-CoV-2 Spike蛋白上仅需2.7分钟，而精确搜索需要10.7分钟，近似误差（即能量差异 这种高度出乎意料的类比是这项工作最具创新性的部分，它产生了一个高效的算法，仅需11分钟即可处理SARS-CoV-2蛋白质的设计。
1K20编辑于 2023-08-30 - 来自专栏Y大宽
4️⃣ 核酸序列特征分析(6):密码子使用模式的分析
[序列比对和序列特征分析总目录](https://www.jianshu.com/p/878f2b2495ae 一共20种编码氨基酸，除去3个终止密码子，一共61个密码子。 也就是说61个密码子编码20种氨基酸。会出现每个氨基酸对应几个密码子的现象，这些编码同一个氨基酸的密码子叫同义密码子。但是这些密码子不是平均使用，而是有一定的使用倾向性。 也就是说，某一物种或某一基因通常倾向于使用一种或几种特定的统一密码子，并且这种现象不是随机的，这些最常用的密码子称为最优密码子，这种现象称为密码子使用偏好性。 所以，分析密码子偏好性有重要的生物学意义。 ? code degeneracy 最广泛使用的密码子偏好性软件是CodonW，目前没有界面版本，有Windows，max和linux命令行版本。
1.9K20发布于 2019-02-26 - 来自专栏数感星球
数感一分钟04 | 向上爬的蜗牛
第四期 一步一步往上爬 我要一步一步往上爬~ 小蜗牛在努力地往井口前进呢， 让我们来算一算 它要花几天才能爬到井口吧~ 你弄懂了吗？ 没有的话可以看一下 小蜗牛爬井直播喔~ 每周带孩子一起动动脑 让孩
67730发布于 2020-05-27 - 来自专栏数感星球
数感一分钟07|小兔子拔萝卜
第七期 小兔子拔萝卜 拔萝卜~拔萝卜~ 小兔子们在勤劳的拔萝卜喔， 让我们帮它们算一算， 拔完萝卜需要多少时间吧~ 每周带孩子一起动动脑 让孩子爱上趣味数学！
41020发布于 2020-05-27 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
堆积柱形图（stacked barplot）展示密码子偏向性的RSCU值
研究密码子偏向性的论文通常都会分析RSCU值，论文中通常会用堆积柱形图来展示RSCU的值，之前在论文里也看到过下面这幅图的形式展示RSCU分析的结果 ? 看过这篇文章后突然想到展示密码子偏向性RSCU值的这幅图可以借助拼图来实现，下面介绍自己的实现过程。 [rec.seq for rec in SeqIO.parse('codon_usage_example.fasta','fasta')] rscu = RSCU(seqs) rscu是一个字典，密码子是键 "+c2aa[aa]+","+str(round(bb,3))+","+str(amino_acid[c2aa[aa]])+"\n") fw.close() 获得的rscu.txt四列 第一列是密码子 还发现了一个R包可以分析密码子偏向性sscu，具体用法没看，用到再说 还发现了一个网站分析密码子偏向性http://www.codons.org/Help.html#CU 还看到了一个python模块可以把对应的蛋白质序列弄回核苷酸序列
2.3K10发布于 2020-08-04 - 来自专栏数感星球
数感一分钟10|老奶奶爬楼梯
为响应低碳生活的号召， 老奶奶每天都走楼梯回家， 让我们算一下， 奶奶到6楼要花多长时间吧~ 每周带孩子一起动动脑 让孩子爱上趣味数学！
70220发布于 2020-05-27
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