免疫球蛋白普遍存在于血液、组织液、淋巴液及多种外分泌液中,是介导体液免疫的主要功能分子。 根据其重链恒定区结构差异,免疫球蛋白可分为IgA、IgD、IgE、IgG和IgM五种亚型,分别承担不同的免疫效应功能并在机体防御网络中发挥协同作用。 二、免疫球蛋白G的核心特征与生物学功能免疫球蛋白G是血清和细胞外液中含量最高、分布最广的免疫球蛋白亚型,约占血清总免疫球蛋白的75%至80%。其在机体免疫防御体系中占据核心地位。 三、IgG在哺乳动物乳汁中的分布及营养意义在牛乳及牛初乳中,IgG是含量最高的免疫球蛋白,其浓度被广泛用作评价牛初乳质量的功能性指标成分。 -自身免疫病与免疫缺陷病辅助诊断:定量监测血清中总IgG或特定IgG亚类的水平,有助于评估体液免疫功能状态,辅助诊断原发性或继发性免疫缺陷病、多发性骨髓瘤及部分自身免疫性疾病。
放射免疫法(RIA)和酶联免疫吸附法(ELISA)是利用抗体和抗原直接结合的检测方法,两者原理相同,但其检测的方式不同。 放射免疫分析常用于测量血液和组织液中的激素水平,而酶联免疫吸附法常用于病毒诊断,如检测人类免疫缺陷病毒(HIV)引发的艾滋病。 这类检测的另外一种方法是以标记的抗免疫球蛋白抗体作为RIA 或ELISA 的二抗,将未标记的抗体与未标记的抗原涂层板结合,因为每个未标记的抗体上能够结合两个分子以上标记的抗免疫球蛋白抗体,所以使用这种二抗放大了信号 图1 酶联免疫吸附法(ELISA)的原理:为了检测抗原A,纯化的抗原A特异性抗体与酶发生化学反应。将待测样品涂布于塑料孔表面,非特异性结合;塑料上残留的黏性位点被添加的无关蛋白(未显示)封闭。 在此基本方法基础上的改进版可检测未知样本中的抗体或抗 捕获酶联免疫吸附法(capture ELISA)或夹心酶联免疫吸附法(sandwich ELISA)是ELISA 的一种改良方法,常被用于检测细胞因子等分泌性产物
️ 免疫应答与抗原 免疫应答:免疫系统可对病原体抗原或简单非活性抗原产生应答,表现为释放细胞因子、特异性抗体(体液免疫)及诱导效应T细胞(细胞免疫)。 免疫原(Immunogen):指能刺激机体免疫细胞活化、增殖、分化并产生免疫效应物质(抗体或致敏淋巴细胞)的物质。 关系:所有免疫原都是抗原,但并非所有抗原(如半抗原)都是免疫原。 免疫接种与抗原递呈 免疫接种:有目的地诱导免疫应答称为免疫接种,抗原的注入途径、剂量和形式会影响免疫应答的类型和强度。 口服/鼻内:可引起肠道局部抗体应答,但同时可能诱导系统性免疫耐受,防止食物过敏。 佐剂的作用机制 佐剂(Adjuvant):是一种非特异性免疫增强剂,能增强抗原的免疫原性或改变免疫应答类型。 免疫应答的监测与抗血清 在免疫诱导过程中,通过检测个体的免疫产物(如血清中的抗体、细胞因子,或脾脏、外周血中的T细胞)来跟踪免疫应答。血清是血液凝固后的液体部分,经特定抗原免疫后的血清称为抗血清。
今天,我们就来聊聊两种核心的“打捞”技术:免疫沉淀(Immunoprecipitation, IP)和免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation, Co-IP)。 一、 免疫沉淀(IP):精准捕获目标蛋白 免疫沉淀是利用抗体从复杂的混合物中分离特定蛋白质的技术。 1. 免疫沉淀与 SDS-PAGE 分析 免疫沉淀法用于从细胞裂解液中富集特定抗原。细胞可通过 ³⁵S-蛋氨酸代谢标记(标记所有新合成蛋白)或 表面碘化/生物素化(仅标记膜蛋白)进行示踪。 最后通过放射自显影(或显色)确定蛋白位置 三、 免疫共沉淀(Co-IP):验证蛋白互作 如果说免疫沉淀是“抓单个”,那么免疫共沉淀就是“抓团伙”。 总结 免疫沉淀技术不仅帮助我们纯化和鉴定蛋白质(分子量、等电点),更是通过免疫共沉淀技术,成为了揭示蛋白质之间物理相互作用的金标准实验方法。
(四)肿瘤细胞低表达MHC分子MHCI类分子提呈功能的缺乏常常是导致肿瘤免疫逃逸的主要原因之一。 其中,抑制性的免疫细胞对肿瘤的免疫逃逸起了重要作用。下面从来源和功能的角度,介绍几种最重要的肿瘤相关免疫细胞。 关于Treg功能机制和Treg新亚群发现的研究正在进展当中。由于Treg在机体免疫调控过程中发挥重要作用,控制体内Treg的数量和功能,有望将靶向Treg疗法与其他生物治疗联合应用。 细胞功能。 因此,研究诱发NK细胞功能耗竭的关键节点,有望成为抗肿瘤免疫治疗的新策略。
一、固有免疫应答(一)固有免疫的概念和功能固有免疫(innate immunity)是通过种系编码的保守性识别受体,识别病原体或机体自身损伤等所特有的保守性分子模式,产生非特异性免疫防御、监控、自稳等保护作用的过程 Mφ在维持组织免疫平衡、调控适应性免疫应答的强度与持续时间、炎症反应、免疫缓解以及组织修复与重构等方面也发挥着重要作用。Mφ具有很强的可塑性,可根据不同的组织微环境而展现出独特的表型和功能。 特异性使免疫系统能够识别不同抗原之间的细微差异;多样性则赋予了免疫系统识别数量庞大的外来抗原上特定结构的功能;记忆性是指免疫系统一旦识别了某一特定抗原后就会发生免疫记忆,当机体再次遭遇相同抗原时能迅速产生更强的免疫应答 TH细胞主要通过分泌多种细胞因子对免疫反应发挥调节作用,而TC细胞则主要作为效应细胞特异性地杀伤靶细胞,同时具有维持抗肿瘤免疫记忆的功能。 此外,CD8+CTL细胞具有免疫记忆功能,在相同肿瘤抗原再次刺激后,能很快分化成效应细胞,并显示杀伤活性。
免疫组库(immune repertoire, IR):是指某个体在特定时间点其循环系统中所有功能多样性B淋巴细胞和T淋巴细胞的总和。 免疫组库分析:通过分析决定B细胞受体(BCR)或T细胞受体(TCR)多样性的互补决定区(CDR区),全面评估免疫系统的多样性,深入挖掘免疫组库与疾病的关系。 ? 应用领域:免疫组库中每一种免疫蛋白彼此间结构差异很小,但亚型种类繁多,正是这种多样性对健康的维护起着至关重要的作用;免疫蛋白的亚型越多,越能有效抵抗病原体。 正因为如此,免疫组库在肿瘤研究、移植和免疫重建、自身免疫性疾病、感染性疾病、抗体开发、用药及疫苗评估等多个方面均有重要的应用价值。 单细胞测序揭示新型模式 ? 抗体在免疫应答反应中发挥着至关重要的作用,抗体的多样性是抗体能够抵御各种各样入侵病原体的关键所在。
免疫算法的基本步骤: 抗原识别。输入目标函数和各种约束作为免疫算法的抗原。 初始抗体生成。随机生成初始抗体种群。 亲和力计算。计算抗体的适应值。 免疫处理。 免疫处理包括免疫选择、克隆、变异和抑制。 免疫选择:根据抗体的亲和力选出亲和度较高的抗体。 克隆:对选出的亲和力较高的抗体进行复制。 变异:对克隆得到的个体进行交叉、变异操作,使其亲和力发生改变。 将免疫选择的抗体和免疫抑制后的抗体组成一个集合,保留其中亲和度较高的抗体,使这些抗体进入新的种群。新的种群中不足的部分随机生成,以增加多样性。 免疫算法流程图: ?
白细胞介素-10(IL-10)作为一类具有强效免疫抑制功能的多效性细胞因子,在限制免疫应答强度、维持免疫耐受及促进组织修复中发挥核心作用。 IL-10通过与其特异性受体复合物结合,激活以JAK-STAT3为轴心的信号转导级联,调控免疫细胞的分化、活化与效应功能。 IL-10与IL-10R1结合后招募IL-10R2,形成功能性三元复合物,启动胞内信号转导。下游信号分子:JAK1及TYK2分别与IL-10R1及IL-10R2胞内区结构性关联。 四、IL-10信号通路与疾病关联自身免疫与炎症性疾病:IL-10信号功能缺陷是多种自身免疫病的重要发病机制。 败血症早期IL-10代偿性升高,其持续高水平常提示免疫麻痹状态及不良预后。肿瘤:IL-10在肿瘤微环境中的功能具有复杂性。
.:86639-52-3)还具有免疫调节作用,可通过剂量依赖性调控肿瘤细胞内的FoxO3a(上调)和c-Myc、PD-L1(下调)的表达,增强自然杀伤(NK)细胞的功能。
IL-5通过特异性调控嗜酸性粒细胞的生成、活化与趋化,参与机体抗寄生虫免疫及过敏反应过程,并在黏膜免疫中通过调节B细胞功能促进IgA合成,构成免疫稳态维持的重要调节节点。 三、IL-5的免疫生物学功能(一)嗜酸性粒细胞谱系的定向调控IL-5是嗜酸性粒细胞分化、扩增与功能激活最为特异性的细胞因子,其作用机制涵盖以下层面:1.促进骨髓定向分化:IL-5可驱动骨髓造血干细胞向嗜酸性粒细胞谱系分化 ⁺)B细胞类别转换,并促进其进一步分化为分泌IgA的浆细胞;2.协同调节效应:IL-5可与IL-4、IL-6等细胞因子协同作用,增强B细胞免疫球蛋白合成,尤其是IgA型抗体的产生效率,从而维系黏膜局部免疫屏障功能 (三)对其他免疫细胞的作用1.嗜碱性粒细胞活化:人IL-5可诱导嗜碱性粒细胞释放组胺、白三烯等前炎症介质,增强其效应功能;2.细胞毒性T细胞分化辅助:IL-5可在胸腺微环境中辅助细胞毒性T细胞前体分化为功能性 CTL,参与适应性细胞免疫应答的建立。
Abstract 本文研究了HPV+/HPV- (Human Papillomavirus) 的Head and Neck Squamas Cancer (HNSCC) 患者的肿瘤免疫微环境,发现这两类患者中 免疫疗法为HNSCC的一个新疗法,但只有20-30%患者在PD-1/PD-L1的临床试验中获益,且原因不明。因此,有必要研究HNSCC的免疫微环境,从而为免疫治疗提供可能靶点。 ?
前段时间有个关于自身免疫性疾病的小新闻......But!咱们今天不聊这个。咱们聊聊自身免疫性疾病是否可治愈? 哎嘿~有一新突破:序贯免疫疗法,让你的免疫系统 "开机重启"! 当免疫系统将健康细胞误认为外来入侵者并对其进行攻击时,就会引发自身免疫性疾病。这种病理性错误识别会导致炎症、组织破坏和器官功能受损。 过渡期,会发生复杂的免疫过程,例如免疫复合物的形成或沉积 (例如在关节或肾脏中) 以及免疫细胞募集的启动。在效应期,许多细胞类型被激活并启动细胞反应。这些效应功能介导宿主组织损伤并维持慢性炎症。 序贯免疫治疗的“重启”功能一共包括 3 个阶段: (1) 控制炎症; (2) 重置免疫系统; (3) 维持免疫稳态。第一步:控制炎症步骤 1 是通过靶向免疫抑制来控制炎症 (图 2)。 所以序贯免疫疗法的第二步是重置免疫系统,其主要目标是通过消除病理性免疫记忆细胞来减少免疫系统的异常反应,从而恢复免疫系统的正常功能[3]。
免疫浸润结果可视化 在之前的推文中我们介绍了2行代码实现9种免疫浸润方法,今天给大家介绍下常见的免疫浸润结果的可视化。 就以大家最常见的cibersort为例进行介绍。 首先大家要对每种免疫浸润方法的结果有一个大体的认知,比如cibersort的结果是各种免疫细胞在样本中的比例,所以一个样本中所有的免疫细胞比例加起来总和是1! 但是ssGSEA就不是这样了。 scale_color_manual(values = palette4,name=NULL) plot of chunk unnamed-chunk-24 除此之外也是可以添加分组,画热图等,其他的免疫浸润结果也是同样的可视化思路
前面的推文给大家介绍了3种识别免疫相关lncRNA的方法:免疫相关lncRNA的识别 今天再给大家介绍下如何使用WGCNA识别免疫相关lncRNA,也算是WGCNA的实战教程。 基因和性状的相关性:gene significance GS 基因和模块的相关性:module membership MM 选择我们感兴趣的性状(临床信息),这里是cluster,也就是根据ssGSEA免疫浸润的结果而得到的分子亚型 ,所以只要提取和这个性状信息相关的基因,就得到了免疫相关lncRNA! 那加上今天介绍的识别免疫相关lncRNA的方法,就一共有4种方法了! 这么多方法又有选择困难症了?天真,小孩子才做选择,大人都是全都要!
现在看这话简直是“大型真香现场”——胸腺根本不是“意外”,而是T细胞发育的“命运之地”:它负责筛选能识别外来抗原、同时不攻击自身的T细胞,是免疫耐受和免疫功能的“起跑线”。 三、胸腺的“衰老萎缩”:免疫功能的“下坡路开关” 胸腺的“一生”:从胎儿期的发育,到青春期后逐渐萎缩(被脂肪组织替代)。 胸腺衰老带来的后果很直接: T细胞受体(TCR)库多样性下降; T细胞功能受损; 疫苗应答变弱; 对新病原体的抵抗力降低。 简单说:胸腺老了,免疫系统的“新兵质量”和“兵力储备”都垮了。 七、T细胞老化:是“全身老”+“细胞自己老”的双重结果 T细胞老化不是单一因素导致的,而是“两个锅一起背”: •造血干细胞(HSC)整体老化:HSC本身的功能下降,给胸腺的“原料”不行了; •T细胞特异性衰老信号 :T细胞自己的基因表达也会“跑偏”——比如年轻T细胞高表达核糖体、翻译相关基因(保证功能),老年T细胞则高表达凋亡、炎症相关基因(忙着“内耗”)。
在利用 RNA-seq 数据来进行免疫浸润计算方面,已经有很多的算法可以进行分析,我们在 [[免疫算法原理]] 当中也进行了总结。 另外如果是想要分析 TCGA 的免疫浸润情况的话,也可以使用 [[TIMER2 TCGA-免疫浸润评估数据库]] 以及 [[GEPIA2021-TCGA免疫细胞分析数据库]]。 的算法来进行免疫细胞计算的。 这类的算法主要是通过每一个免疫细胞特征基因的表达来进行免疫浸润评分的。默认的 ImmuCellAI 是以这些基因作为每个免疫细胞的 marker 基因的。 除了要计算免疫细胞评分,如果还想观察免疫细胞在不同分组的区别以及和免疫检查点封锁(Immune checkpoint blockade, ICB)的关系。可以进行额外的勾选。
导语 GUIDE ╲ ImmPort项目是收集、整理、共享免疫学相关研究的资源,由为不同的生命科学研究者社区提供科学数据的归档和交换方面的先进信息技术支持,并作为研究和临床数据的长期、可持续的归档。 ③加速科学发现,同时扩大免疫学研究所有领域的科学数据的价值。④促进重要发现的快速可用性,使新的发现可供研究界进一步分析和解释。 ⑤提供分析工具,以推进基础和临床免疫学的研究 在NIAID/DAIT的支持下,ImmPort项目为不同的生命科学研究者社区提供科学数据的归档和交换方面的先进信息技术支持,并作为研究和临床数据的长期、可持续的归档 在BISC项目的整个生命周期中,ImmPort的功能将不断扩展,以适应不断扩大的研究社区的需要。注册后,任何研究人员都可以使用在ImmPort共享的研究和临床数据以及分析工具。 如①Gene Lists提供了免疫基因列表 ②ImmuneRegulation 识别感兴趣的免疫系统基因的调节因子 ③Immcantation framework 为高通量B细胞和T细胞受体序列测序
宿主通常具有多样的肠道微生物组,肿瘤包含更具刺激性的常规树突状细胞(cDC)、CD4 Th1 T细胞和功能性CD8 T细胞,即所谓的热肿瘤(Chen和Mellman,2017;O'Donnell等人,2019 这些改变导致免疫“沙漠”表型,其代谢改变有利于肿瘤生长,同时抑制免疫细胞生存和功能,如高糖酵解、细胞外腺苷和犬尿氨酸增加、细胞外NAD+和色氨酸减少(Chen and Mellman,2017;O'Donnell 存在于这些耐药肿瘤中的少数T细胞显示出与功能失调状态和额外检查点分子(或介质)如TIM3、LAG3和Vista的上调相关的慢性TCR信号(Kalbasi and Ribas,2020)。 从Escape 2中出现的肿瘤细胞可能在JAK1和JAK2中表现出功能缺失突变,这导致对IFNB的反应受损,IFNB是一种抑制肿瘤形成的细胞因子(Kalbasi和Ribas,2020)。 此外,肿瘤细胞可通过在基因B2微球蛋白中获得截断或功能缺失突变,从而逃避T细胞识别,导致细胞表面MHC-I表达缺失。此外,缺乏假定新抗原的肿瘤的克隆选择会导致随后的免疫逃避和耐药性。
关键是看如何定义免疫特征,比如kegg数据库里面的就有很多免疫特征相关的功能基因列表,首先它区分成为了如下所示的7个大类: 1. Metabolism 2. Drug Development 然后细分的时候就可以看到两个免疫相关的亚类: 5.1 Immune system 6.6 Immune disease 如下所示: 两个免疫相关的亚类 详见kegg 如果你感兴趣这些基因集,可以自己去阅读文献拿到Supplementary Table S4,然后针对这些通路去任意单细胞转录组数据集里面打分,肯定不会是这些免疫基因集仅仅是在免疫相关细胞亚群有活性。 重点是第二层次降维聚类分群里面的 decidual stromal cell和免疫细胞的亚群,如下所示: 其中可以看到,免疫细胞亚群细分的时候有一个iDSC, immune-featured decidual 但是呢,如果把这一群细胞(iDSC)放在所有的DSC里面它又是无法融入进去,而且它的免疫打分又过高。所以作者做了个层次聚类,蛮直观的展示了这个iDSC其实是与DSC更加接近,如果是跟免疫细胞相比。