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TCGA数据挖掘—肿瘤免疫浸润分析思路2
想不想知道不同临床分期的肿瘤样本免疫微环境的差异？想不想知道自己研究的目的蛋白基因的不同表达情况下免疫微环境的差异？想不想知道自己关注的某个功能或通路的不同状态下免疫微环境的差异？ 在上图中，T3期的样本免疫激活功能富集情况相比T1、T2整体偏低，T2期有部分样本免疫激活功能富集也偏低，这部分人群可能实际处于T2、T3的中间状态。 同时我可以根据每个免疫基因集的富集分数进行差异分析，分析不同临床分期的肿瘤病人显著差异的免疫功能（如下图）。 ? 从图中可以看出淋巴细胞功能基因集LIexpression_score在T1期高富集，并且跟T2、T3期差异显著。 我们除了可以比较不同分组情况下肿瘤病人免疫微环境的差异，还可以给临床免疫治疗方案提供指导意义，同时可以结合自己关注的蛋白或功能进行关联，丰富科学研究的内容。
1.3K30发布于 2020-08-06 靶向TGF-β2：重塑免疫抑制性肿瘤微环境以增强抗肿瘤免疫
转化生长因子-β（TGF-β）在这一微环境的塑造中扮演了核心角色，它不仅能促进癌症相关成纤维细胞的活化与细胞外基质的沉积，形成物理与生化屏障，还能直接抑制效应T细胞的功能并诱导调节性T细胞的生成，从而建立强大的免疫抑制状态 二、TGF-β2蛋白作为特定靶点的聚焦TGF-β家族包含三个主要亚型（TGF-β1、β2、β3），它们共享信号通路（主要通过Smad蛋白）但具有不同的表达调控模式与生物学功能。 三、核心研究策略：TGF-β2反义寡核苷酸联合IL-2近期一项研究利用人源化免疫系统小鼠模型，深入探究了靶向抑制TGF-β2联合免疫刺激在胰腺癌治疗中的作用。 1.治疗策略设计：研究采用TGF-β2反义寡核苷酸（TASO）来特异性抑制肿瘤微环境中TGF-β2蛋白的产生，并联合应用免疫刺激因子白细胞介素-2，旨在同时解除免疫抑制并激活抗肿瘤免疫应答。 其作用机制涉及对纤维化基质的调控和免疫细胞功能的恢复，为开发针对"冷肿瘤"的有效免疫治疗方案提供了重要的理论依据和实践路径。进一步探索以TGF-β2为靶点的精准免疫干预策略，具有重要的临床转化前景。
14810编辑于 2026-01-30免疫球蛋白G：结构、功能与生物学意义
免疫球蛋白普遍存在于血液、组织液、淋巴液及多种外分泌液中，是介导体液免疫的主要功能分子。 根据其重链恒定区结构差异，免疫球蛋白可分为IgA、IgD、IgE、IgG和IgM五种亚型，分别承担不同的免疫效应功能并在机体防御网络中发挥协同作用。 二、免疫球蛋白G的核心特征与生物学功能免疫球蛋白G是血清和细胞外液中含量最高、分布最广的免疫球蛋白亚型，约占血清总免疫球蛋白的75%至80%。其在机体免疫防御体系中占据核心地位。 2.胎盘转运与新生儿被动免疫：IgG是唯一能够通过人类胎盘屏障的免疫球蛋白亚型。这一特性依赖于其Fc段与滋养层细胞表面新生Fc受体的特异性结合，介导IgG从母体血液循环主动转运至胎儿循环。 2.主要应用领域：-基础免疫学研究：定量检测细胞培养上清、血清、血浆、唾液或乳汁等样本中的总IgG浓度，或特定抗原刺激后产生的抗原特异性IgG抗体水平，用于评价体液免疫应答强度。
14710编辑于 2026-02-13- 来自专栏百味科研芝士
单基因免疫相关分析发7分+2区SCI
并研究SEMA3F与免疫细胞浸润和免疫检查点表达的相关性。 此外，SEMA3F水平与肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞生物标志物、免疫检查点表达呈显著正相关。综上所述，作者的研究阐明ncRNA介导的SEMA3F上调与HCC患者预后不良和肿瘤免疫浸润有关。 流程图 ? SEMA3F与免疫细胞标志物表达水平相关性 如表2所示，SEMA3F与B细胞标志物（CD19和CD79A）、CD8+ T细胞标志物（CD8A和CD8B）、CD8+ T细胞标志物（CD4）、M1巨噬细胞标志物 （NOS2、IRF5和PTGS2）、M2巨噬细胞标志物（CD163、VSIG4和MS4A4A）、中性粒细胞标志物（ITGAM和CCR7）和树突状细胞标志物（HLA-dpb1、HLA-DRA、HLA-dpa1 表2 SEMA3F与免疫细胞标志物的相关性 8. SEMA3F与免疫检查点的相关性 图7A-7C所示，SEMA3F的表达水平与PD1,PD-L1和CTLA-4显著正相关。（图7A-7F）。
79720发布于 2021-07-12 - 来自专栏用户7627119的专栏
细胞焦亡结合免疫发7分+2区SCI
PRGScore-高的样本CD8+ T细胞效应功能，抗原加工和免疫检查点和预后较好有关。总的来说，作者的研究为研究细胞焦亡及其免疫微环境和MIBC治疗提供有价值的信息。 流程图 结果 1. 接下来，作者使用蛋白互作网络评估半胱天冬酶，颗粒酶和GSDM的潜在功能。结果表明，这些调控因子主要参与调控免疫反应和基质及致癌物质激活（图1B）。 图2 TCGA-MIBC的细胞焦亡模式和生物学特征 4. 细胞焦亡模式与临床特征和分子特征的相关性 为研究不同焦亡模式的潜在生物学功能差异，作者对这三个簇进行GSVA分析。 簇1和簇3富集于完全激活的免疫功能相关通路，包括淋巴细胞迁移，抗原加工和呈递，toll样受体信号通路，干扰素介导的信号通路和趋化因子信号通路，簇2与免疫抑制相关过程显著相关（图2D和2E）。 ssGSEA分析表明簇1患者富集与免疫分化和干扰素应该，簇2富集于尿路上皮和管腔分化相关通路，簇3富集于免疫分化和干扰素应答打分（图2F）。 5.
79910编辑于 2022-09-21 【免疫学实验】放射免疫法、酶联免疫吸附法和竞争抑制分析
放射免疫法（RIA）和酶联免疫吸附法（ELISA）是利用抗体和抗原直接结合的检测方法，两者原理相同，但其检测的方式不同。 放射免疫分析常用于测量血液和组织液中的激素水平，而酶联免疫吸附法常用于病毒诊断，如检测人类免疫缺陷病毒（HIV）引发的艾滋病。 这类检测的另外一种方法是以标记的抗免疫球蛋白抗体作为RIA 或ELISA 的二抗，将未标记的抗体与未标记的抗原涂层板结合，因为每个未标记的抗体上能够结合两个分子以上标记的抗免疫球蛋白抗体，所以使用这种二抗放大了信号 竞争性抑制法解决了这个问题，如图2 所示。其原理是利用未知样本中特定抗原与一个标记的参考抗原竞争结合塑料板上附着的抗体，从而检测特定抗原的含量。 图2 未知样品中抗原的竞争抑制分析：将未标记抗体固着于一组孔内，并将标记的抗原标准制剂与之结合。然后将未标记的标准品或试验样品以不同剂量加入，测量标记的抗原被标准品取代的量，生成特征性的抑制曲线。
21910编辑于 2025-12-29【免疫学笔记】免疫原、抗原与佐剂：免疫应答的基础
️ 免疫应答与抗原 免疫应答：免疫系统可对病原体抗原或简单非活性抗原产生应答，表现为释放细胞因子、特异性抗体（体液免疫）及诱导效应T细胞（细胞免疫）。 免疫原（Immunogen）：指能刺激机体免疫细胞活化、增殖、分化并产生免疫效应物质（抗体或致敏淋巴细胞）的物质。 关系：所有免疫原都是抗原，但并非所有抗原（如半抗原）都是免疫原。 免疫接种与抗原递呈 免疫接种：有目的地诱导免疫应答称为免疫接种，抗原的注入途径、剂量和形式会影响免疫应答的类型和强度。 免疫应答的监测与抗血清 在免疫诱导过程中，通过检测个体的免疫产物（如血清中的抗体、细胞因子，或脾脏、外周血中的T细胞）来跟踪免疫应答。血清是血液凝固后的液体部分，经特定抗原免疫后的血清称为抗血清。 干扰因素：即使是简单的抗原，产生的抗血清中也包含多种抗体分子，且免疫前血清中已有的非特异性抗体可能会干扰检测。 解决方案：可通过亲和层析法纯化抗体，或制备单克隆抗体来解决特异性问题。 2.
39510编辑于 2025-12-21- 来自专栏网罗开发
了解 StoreKit 2 新功能
StoreKit 2 引入了一种基于现代 Swift 的 API，用于构建类型安全的应用内购买。下面我们将开始关于 StoreKit 2 的系列文章。 构建支付功能 让我们开始构建我们的支付功能，引入 Store 类型来处理与应用内购买相关的所有逻辑。 一旦获取了交易，应该解锁用户购买的功能，并在特定交易上调用 finish 函数。请记住，只有在解锁已购买的功能后才应该完成交易。 实现应用内购买和订阅功能。 通过详细的示例和解释，开发者可以轻松了解如何利用 StoreKit 2 构建强大的应用内购买功能。 我正在参与2023腾讯技术创作特训营第四期有奖征文，快来和我瓜分大奖！
1.4K10编辑于 2024-01-02 肿瘤免疫逃逸
(2)白介素-10(IL-10):IL-10在很多人类肿瘤中都有过量表达，如肾癌、结肠癌、黑色素瘤及神经母细胞瘤等，其过量分泌会导致负向调节功能增强，打破机体的免疫自稳。 前列腺素主要通过以下几个方面来促进肿瘤免疫逃逸:PGE2能诱导产生抑制型T细胞和抑制型Mφ,降低LAK细胞的活性，抑制抗原特异性T细胞增殖和产生细胞因子等:与此同时,PGE2还能抑制APC的分化和功能; 3.趋化因子 趋化因子及其受体家族在肿瘤免疫中的作用主要有以下几点:①募集免疫细胞进入肿瘤组织调控机体免疫功能，如C2、 CCL5能募集髓系细胞,CXCL9、CXCL10能够趋化T细胞,CCL19、CCL20 Treg主要通过以下机制发挥免疫抑制作用:①通过免疫抑制因子,如IL-10、TGF-B等抑制效应细胞的功能;②通过颗粒酶和穿孔素直接杀伤效应细胞;③影响效应细胞的代谢，如高表达CD25、大量消耗IL-2 2.组织局部的促炎反应 人的实体瘤是癌细胞与浸润免疫细胞长期“共进化”的结果,通常可按解剖结构分为癌旁、癌旁间质、侵袭边缘和癌巢等多个区域，各自具有独特的组成、功能特性与区域微环境。
52810编辑于 2024-02-28【免疫学实验】揭秘蛋白互作：免疫沉淀与免疫共沉淀
今天，我们就来聊聊两种核心的“打捞”技术：免疫沉淀（Immunoprecipitation, IP）和免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation, Co-IP）。 一、 免疫沉淀（IP）：精准捕获目标蛋白 免疫沉淀是利用抗体从复杂的混合物中分离特定蛋白质的技术。 1. 抗体的制备为了获得针对膜蛋白等难以纯化蛋白的抗体，通常采用全细胞或粗细胞提取物对小鼠进行免疫接种。随后通过杂交瘤技术，生产出能识别这些细胞表面抗原的单克隆抗体。 2. 最后通过放射自显影（或显色）确定蛋白位置 三、 免疫共沉淀（Co-IP）：验证蛋白互作 如果说免疫沉淀是“抓单个”，那么免疫共沉淀就是“抓团伙”。 总结 免疫沉淀技术不仅帮助我们纯化和鉴定蛋白质（分子量、等电点），更是通过免疫共沉淀技术，成为了揭示蛋白质之间物理相互作用的金标准实验方法。
30910编辑于 2025-12-29- 来自专栏c++与qt学习
SpringBoot2----容器功能
容器功能 2.1、组件添加 1、@Configuration 基本使用 Full模式与Lite模式 这里有无依赖多指是否在一个类中使用到另一个类，例如在People类里面，Cat类是People里的一个属性 以供随时使用； ---- 方式一:@Component + @ConfigurationProperties 对应要绑定的类: /** * 只有在容器中的组件，才会拥有SpringBoot提供的强大功能 //2、把这个Car这个组件自动注册到容器中 @SpringBootApplication public class SpringBoot2Demo1Application { public ---- 3.3、修改默认配置 springmvc文件上传功能，下面是springboot默认配置的文件上传功能: @Bean @ConditionalOnBean(MultipartResolver.class but named it incorrectly return resolver; } 给容器中加入了文件上传解析器； 下面展示springmvc原生的springmvc.xml中对文件上传功能的
52950发布于 2021-11-15 IL-2IL-2R信号通路：免疫平衡的双重调控与靶向药物开发
一、IL-2/IL-2R信号通路的结构与功能复杂性白细胞介素-2是一种在免疫调控中发挥核心作用的细胞因子。其生物学效应的实现依赖于与细胞表面白细胞介素-2受体的精确结合。 IL-2与受体结合后，主要激活JAK-STAT5信号通路，进而调控包括Cd25（IL-2Rα基因）在内的众多靶基因转录，深刻影响T细胞的增殖、分化与功能。 二、IL-2在免疫治疗中的双重角色与开发挑战IL-2信号的复杂性赋予其独特的双重免疫调节功能，这也构成了其临床开发的核心矛盾与机遇：1.促效应功能：在高浓度下，IL-2通过中亲和力受体强烈激活CD8+T 细胞和自然杀伤细胞，促进其增殖与细胞毒性功能，从而驱动强大的抗肿瘤免疫应答。 2.促耐受功能：在低浓度下，IL-2因其对高亲和力受体的偏好，可选择性激活并扩增调节性T细胞。
18210编辑于 2026-01-21- 来自专栏用户7627119的专栏
免疫组库
免疫组库（immune repertoire, IR）：是指某个体在特定时间点其循环系统中所有功能多样性B淋巴细胞和T淋巴细胞的总和。 免疫组库分析：通过分析决定B细胞受体（BCR）或T细胞受体（TCR）多样性的互补决定区（CDR区），全面评估免疫系统的多样性，深入挖掘免疫组库与疾病的关系。 ? 区）、恒定区（C 区）、跨膜区和胞质区等几部分，α链的可变区由V、J两个基因片段编码，β链的可变区由V、D、J三个基因片段编码，而α和β两条肽链的V区（Vα、Vβ） 又各有3 个高变区CDR1、CDR2 轻链的可变区由V、J两个基因片段编码，重链的可变区由V、D、J三个基因片段编码；V区由3个互补决定区（CDR1、CDR2 和CDR3） 组成，而互补决定区CDR3比CDR1、CDR2更具多样性，是B细胞识别抗原的主要部位 应用领域：免疫组库中每一种免疫蛋白彼此间结构差异很小，但亚型种类繁多，正是这种多样性对健康的维护起着至关重要的作用；免疫蛋白的亚型越多，越能有效抵抗病原体。
1.6K30发布于 2020-08-06 肿瘤免疫与单细胞、空间、外显子和免疫疗法
常见的区分B淋巴细胞与T淋巴细胞的CD分子标记CD标记功能B细胞TH细胞TC细胞CD2黏附分子，信号转导-++CD3TCR 的信号转导组分-++CD4结合 MHCI类分子，信号转导-+CD5ND（not TH细胞主要通过分泌多种细胞因子对免疫反应发挥调节作用，而TC细胞则主要作为效应细胞特异性地杀伤靶细胞，同时具有维持抗肿瘤免疫记忆的功能。 TH和TC细胞根据功能上的差异还能够再细分为 TH1、TH2、TC1和TC2 四个亚群，其中参与抗肿瘤细胞兔疫反应的主要是THI和TC1这两种T细胞亚群。 CD8细胞的功能与活性;②活化的CD4+TH2细胞参与辅助B细胞产生特异性抗肿瘤抗体;③活化的CD4+T淋巴细胞可辅助固有免疫细胞(如NK细胞、DC)的活化;④部分活化的CD4+T细胞可直接杀伤肿瘤细胞 此外，CD8+CTL细胞具有免疫记忆功能，在相同肿瘤抗原再次刺激后，能很快分化成效应细胞，并显示杀伤活性。
52710编辑于 2024-02-27- 来自专栏爱明依
1、Redis服务搭建 2、为功能添加缓存功能
1.课程计划 1、Redis服务搭建 2、为功能添加缓存功能 2.redis介绍 2.1.什么是redis Redis是用C语言开发的一个开源的高性能键值对（key-value）数据库。 3.0版本主要增加了redis集群功能。 (2)节点的fail是通过集群中超过半数的节点检测失效时才生效. (2):什么时候整个集群不可用(cluster_state:fail)? 192.168.101.3:7001 cad9f7413ec6842c971dbcc2c48b4ca959eb5db4 是7007结点的id，可通过cluster nodes查看。
70320发布于 2019-03-12 - 来自专栏生信菜鸟团
综述 | Nature | 更新一下关于 2 型免疫的认知
Abstract Para_01 近年来，我们对2型免疫的理解经历了重大转变，揭示了其之前未知的功能。 Main Para_01 近四十年前，两种不同的CD4辅助T细胞亚群的鉴定，即T辅助1（TH1）和T辅助2（TH2）细胞，每个亚群都有其独特的细胞因子产生特征和功能，为我们理解针对不同敌人的不同免疫反应奠定了框架 这揭示了肿瘤抑制蛋白 p53 在调控肠道对寄生虫感染的 2 型免疫反应中的一个先前未被认识的功能。 然而，最近的观察强调了CAFs的功能异质性，并且已经表征了两种功能不同的CAFs群体：促进癌症的CAFs（pCAFs）和抑制癌症的CAFs（rCAFs）。" 的受体表达及其功能。
92000编辑于 2025-02-03 （2）深度对比：Apipost vs Apifox （2）文档功能
本文将从文档生成、样式展示、版本更新以及协作支持等角度，深入对比 Apipost 和 Apifox 的文档功能。Apifox 文档分享在梳理好我们项目的接口后面，在左侧切换到 “分享文档” 模块。 总结在文档功能的对比上，Apipost 和 Apifox 都很出色。两款工具生成的文档不仅足够精美，还能详细展现 API 的各种关键信息，从响应体到请求示例，再到状态码，所有验收所需的信息都一目了然。 相比之下，Apifox虽功能全面，但对初学者或习惯追求效率的开发者来说，稍显复杂。当然，工具的选择最终还是取决于你的个人操作习惯和团队需求！
24300编辑于 2025-02-26- 来自专栏人工智能与演化计算成长与进阶
不完全免疫算法简介HEIA--AIS学习笔记2
After the hybridized evolution from item 2) shown above is undertaken, the subpopulations are combined then operated by selecting some less-crowded individuals (measured by the crowding distance metric [2] by the immune system, MOIAs can be classified into three categories:1) clonal selection approaches; 2) (在这种情况下，免疫抑制是指在变量和目标空间中去除相似的抗体。)
55020发布于 2020-08-14 - 来自专栏技术杂记
Rails 构建评论功能（2）
添加删除模型 rails 命令可以方便的添加删除模型 [root@h202 blog]# rails --help Usage: rails COMMAND [ARGS] The most common rails commands are: generate Generate new code (short-cut alias: "g") console Start the Rails console (short-cut alias: "c") server Start
67120发布于 2021-10-20 - 来自专栏DPDK VPP源码分析
learning vpp:dhcp relay功能（2）
将DHCP 服务器与VPP其中一个接口设置在同一个网段互联，这样可以使用dhcp relay功能了。 tap1和tap2，tap1模拟PC客户端，tap2模拟远程dhcp 服务器。 相关配置如下：首先在linux系统上创建2个命名空间: ip netns add tap1 ip netns add tap2 启动vpp程序，然后在vpp命令行视图中通过exec 命令加载上述组网配置 ： creat tap id 1 host-ns tap1 host-if-name tap1 creat tap id 2 host-ns tap2 host-ip4-addr 192.168.1.2 192.168.2.1/24 set interface state tap2 up set interface ip addr tap2 192.168.1.1/24 set dhcp proxy
58010编辑于 2024-11-23
腾讯云开发者
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