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人肝非实质细胞NPC如何突破传统肝细胞模型局限？Kupffer Cells、肝星状细胞与LSECs应用解析
近年来，人肝非实质细胞（HepaticNon-ParenchymalCells，NPC）逐渐成为高生理相关性肝病模型的重要组成部分。 关键词：人肝非实质细胞；肝NPC；KupfferCells；肝星状细胞；LSECs；肝病模型；药物ADME-Tox；NASH；肝纤维化；3D肝脏模型；原代肝细胞一、为什么传统单一肝细胞模型越来越难满足现代肝病研究需求 图1：肝脏代表性细胞类型及其在健康与疾病状态下的旁分泌与自分泌信号。二、什么是肝非实质细胞（NPC）？肝脏细胞通常可分为肝实质细胞与肝非实质细胞两大类。 其中，肝实质细胞主要指成熟肝细胞，承担代谢、解毒、蛋白合成等核心功能；而肝非实质细胞则是除成熟肝细胞外，所有构成肝脏微环境的细胞群统称。 本文内容基于人肝非实质细胞、人原代肝细胞、肝NPC、肝毒性等公开科研资料、应用文献等内容曼博生物整理，仅用于科研技术交流。
13510编辑于 2026-05-18 - 来自专栏药物代谢与原代肝细胞研究
肝星状细胞与肝窦内皮细胞研究进展：生物学特性、培养方法指南
摘要肝脏功能的稳定运行不仅依赖肝实质细胞，也高度依赖肝非实质细胞构成的复杂微环境。 关键词：肝星状细胞、肝窦内皮细胞、肝非实质细胞、HSCs、LSECs、LECs、原代肝细胞培养、肝纤维化模型、药物肝毒性、肝脏微环境、3D肝脏模型一、肝非实质细胞为什么是肝病研究中的关键对象？ 四、人原代肝星状细胞培养流程与关键控制点人原代肝星状细胞的体外培养需要重点关注细胞复苏、接种密度、贴壁均匀性、培养基更换、形态观察以及传代时机。 七、人原代肝窦内皮细胞培养流程与实验注意事项人原代肝窦内皮细胞培养同样需要严格控制复苏、接种、培养维护、消化传代和冻存流程。 九、FAQ：肝非实质细胞培养与研究常见问题Q1：原代HSCs和LSECs可以传代多少次？人原代HSCs在体外培养过程中会逐渐自发激活，因此通常不建议过多传代。
12810编辑于 2026-06-10 - 来自专栏单细胞天地
人肝肿瘤微环境单细胞图谱
总览 肿瘤细胞与组成肿瘤微环境tumor microenvironment (TME) 的基质细胞之间的相互作用，影响了恶性细胞的生长。人的肝脏是肿瘤和转移的主要部位。 在这些病理情况中，不同细胞类型间分子类型和细胞间相互作用还不清楚。在这篇文章里，作者对5例胆管癌或肝转移患者的恶性和邻近非恶性肝组织进行单细胞RNA测序和空间转录组分析。 3例样本因结直肠转移而接受肝切除，2例样本因肝内胆管癌而切除，1例因良性囊肿而接受切除。作者将组织解离为单个细胞，并使用MARS-seq测量其转录组。 人肝肿瘤微环境的细胞图谱 除胆管癌患者p2外，非恶性部位均未显示纤维化的组织学征象。 来自非恶性肝部位的细胞包括肝细胞簇和几个非实质细胞群-肝星状细胞，血管平滑肌细胞（vSMC），库普弗细胞，T细胞，B细胞，肝窦窦内皮细胞（LSEC），肝血管内皮细胞（LVEC）和胆管细胞，后者与癌细胞成簇
1.2K20发布于 2021-03-10 - 来自专栏用户7627119的专栏
28例人肝组织单细胞表达图谱
发表于Journal of hepatology 作者对目前已发表的单细胞肝脏数据集进行了整合，绘制了巨大的肝脏单细胞图谱 并搭建了在线的可视化交互工具 网址为：http://liveratlas-vilarinholab.med.yale.edu 高质量的人体正常肝组织难以获得，过去的两年，共有5篇文章在单细胞水平分析了正常肝组织细胞成分： 故而作者收集、整合并分析了上述数据，并搭建了可视化交互网站。 过滤条件：细胞表达基因数介于250-2500；线粒体基因表达低于30%。 肝组织来源于：1.结肠癌转移或胆管癌时的肝切 2.肝移植供肝 共获得了36188个细胞，包括6,895肝细胞, 2,357 胆管细胞, 6,876 内皮细胞, 1,604 间充质细胞和18,223 免疫细胞
35040编辑于 2022-09-21 - 来自专栏单细胞天地
10x单细胞测序技术揭示肝脏细胞全景图
然而人们对构成人体肝脏的细胞类型和免疫微环境知之甚少。作者使用10x单细胞RNA测序手段绘制了人类肝脏细胞全景图，从来自五个人新鲜肝脏组织中分离得到的8444个实质和非实质细胞转录谱。 单细胞分辨率的健康人肝脏细胞全景图对于理解肝病的发病机制和治疗至关重要。但是这种全景信息很难获得，主要是因为新鲜的人体肝脏组织很难获得，组织很难分割，其中一些脆弱的常驻细胞群很容易被破坏。 正常人肝脏细胞全景图 肝脏的主要“构建块”是肝小叶。 肝小叶包括门静脉三联体（肝动脉，门静脉和胆管），肝细胞排列在毛细血管网和中央静脉之间。 在肝窦之间发现的是实质细胞（肝细胞）和非实质细胞（内皮细胞，胆管细胞，巨噬细胞，肝星状细胞和肝脏浸润淋巴细胞（包括B细胞，αβ和γδ，T细胞和NK细胞））。 ? ? ? 以前有过小鼠肝脏图谱的研究，而现在人肝脏转录图谱则又向前发展了一大步，对研究微环境及肝功能和疾病提供了支持。 ?
5K31发布于 2020-03-30 - 来自专栏单细胞天地
肝上皮细胞单细胞亚群
反而是上皮细胞，大家很少涉及到，但是肝癌既然是来源于肝这样的组织， 它的上皮细胞就不可能是一个纯粹的上皮，理论上是可以细分的。 那么，正常的肝组织上皮细胞主要是什么呢？ ，比起前面的结直肠，胃，肾，肺来说，当然了，也有可能是我们目前对肝上皮细胞的认知程度不够啦。 而且我们常见的巨噬细胞在肝脏里面被改名成为了Kuffer cell：枯否细胞 而我们常见的成纤维细胞，在肝脏里面被改名成为了 Hepatic stellate cell：肝星状细胞 大家也可以去测试一下这些基因在你的肝脏单细胞数据集里面是否好用 去除细胞效应和基因效应 06.单细胞转录组数据的降维聚类分群 07.单细胞转录组数据处理之细胞亚群注释 08.把拿到的亚群进行更细致的分群 09.单细胞转录组数据处理之细胞亚群比例比较 最基础的往往是降维聚类分群
2.6K60编辑于 2022-04-18 - 来自专栏生信菜鸟团
Cell | 单细胞转录组揭示肝实质细胞及NPC细胞的早期细胞谱系
为了解决这些问题，该研究分析了从胚胎E7.5天(内胚层祖细胞被指定时)到E10.5天(肝实质细胞和非实质细胞谱系出现时)的45334个单细胞转录组。 该研究描述了两种不同的间皮细胞类型以及早期肝星状细胞，并揭示了这些细胞群的不同时空分布。该研究捕获了成肝细胞特异性和迁移的转录谱，包括肝充质细胞类型的出现和成肝细胞集体迁移的证据。 ? 结果： 1.在肝发生中追踪细胞系 ? 作者分析了从胚胎发生第7.5天到第10.5天的内胚层及肝组织。 3.早期肝脏中，横隔和肝间充质细胞的异质性 关于间充质（包括STM、间皮和肝星状细胞）的研究不多。因此，对于在早期肝脏中涌现的间充质细胞群体的完整多样性和时机了解甚少。 4.早期肝脏中存在肝充质杂交祖细胞 胚胎肝形成于后腹前肠内胚层，它根据迁移的线索侵入STM。
3.2K20发布于 2020-11-11 - 来自专栏单细胞天地
单细胞+外泌体|解析人肝内胆管癌的细胞间通讯
j.jhep.2020.05.039 作者及单位：北京工业大学环境与生命学部阎新龙教授团队、解放军总医院第五医学中心刘兵研究员团队、军事科学院军事医学研究院裴雪涛研究员团队和岳文研究员团队 文献概述 单细胞转录组数据集是分析人肝内胆管癌细胞多样性和细胞间 昨天看了个研究56个样本，测了20多万细胞，我看见他的过滤是：>3k 基因的细胞被搞掉了。。。 二、恶性细胞分析 对上皮细胞进行重新聚类分群，分为6个亚群，根据inferCNV可以判断出来。 由于原始数据集合中只有498个纤维细胞，作者使用的dataset2，共 13,150个细胞，又经过严格筛选，剩下 2,941个细胞。 （vCAFs），免疫荧光染色发现CD146+ vCAF位于肿瘤中心与微血管区，细胞内L-R分析发现：纤维细胞表达更多的配体与癌细胞作用。 通过前面的分析和后续的各种实验验证了这个：IL-6/IL-6R在vCAFs细胞与ICC细胞之间的相互作用。并且vCAFs能够引起ICC细胞的进展。
1.5K10编辑于 2022-03-14 外泌体通过模拟病毒入侵机制传递IFN-α抗病毒信号的机制研究
然而，HBV主要感染的肝实质细胞本身对IFN-α的应答能力有限，而肝内的非实质细胞（如巨噬细胞）却能产生并传递强烈的IFN-α诱导的抗病毒效应。 前期研究发现，巨噬细胞等非实质细胞可通过释放外泌体，将IFN-α诱导的抗病毒活性传递至HBV复制的肝细胞中，从而有效抑制病毒复制。 二、核心发现：外泌体"模拟"病毒的完整入侵通路该研究系统揭示了巨噬细胞来源的外泌体传递抗病毒效应的完整路径，发现其巧妙地"借用"了病毒入侵宿主细胞的多个关键步骤。 1.表面受体识别与结合：研究发现，巨噬细胞外泌体表面暴露有磷脂酰丝氨酸。PtdSer作为一种"吃我"信号，可被肝细胞表面的T细胞免疫球蛋白黏蛋白分子-1受体识别并介导结合。 研究证实，抑制肝细胞TIM-1的表达，会显著阻碍外泌体的内吞及其抗病毒效应的传递。
13410编辑于 2026-02-10- 来自专栏单细胞天地
单细胞水平上解析人肝硬化的纤维化生态位
对超过100,000个单个人类细胞的转录组进行了分析，从而得到了健康和肝硬化人类肝脏中非实质细胞类型的分子定义。 第一层次降维聚类分群 文章中提到肝纤维化涉及多种非实质细胞（NPC）谱系之间的复杂相互作用，包括免疫细胞、内皮细胞和间充质细胞，它们在纤维化区域内空间定位，被称为纤维化微环境。 ： 免疫细胞： T细胞：包括CD4+辅助T细胞和CD8+细胞毒性T细胞等亚群。 间充质细胞： 成纤维细胞：包括活化的成纤维细胞和静止的成纤维细胞等亚群。 脂肪细胞：包括白色脂肪细胞和棕色脂肪细胞等亚群。 骨髓间充质干细胞：包括多能干细胞和成骨细胞等亚群。 ： 其它加分项 除了对淋巴细胞和内皮细胞进行细分之外，对疤痕相关巨噬细胞的纤维化表型进行了分析： 并且发现了一种新的与疤痕相关的TREM2+CD9+巨噬细胞亚群，在肝纤维化中扩增，由循环单核细胞分化而来
88920编辑于 2023-09-19 - 来自专栏单细胞天地
单细胞揭示人胎儿肝造血图谱
当然一个人的力量终归是小的，我也希望汇聚一群人，形成一个场，这里头最重要的生产力不是单个人多聪明，多厉害，而是每个人相互作用，形成的那个氛围。 希望大家能有所收获！ 胎肝单细胞转录组概况 作者制备了7-17 PCW 胚胎和胎肝单细胞悬液以研究胎肝血液及免疫细胞的发育变化。 ，但是总体肝组织呈增加态势；造血岛浮现于血窦及周边肝组织中，血窦CD68+ 巨噬细胞被血型糖蛋白A红系细胞包裹；来自B细胞系的CD1c+树突细胞和CD79a+、CD20+细胞零散分布。 MKI67及调控周期基因在不同组织中的表达比较 胎肝及NLT中的淋巴细胞系分析 此前有相关报道，人胎肝中存在T细胞、B细胞、NK细胞和先天淋巴细胞。 相较于人，早在7 PCW时，已可以观察到胎儿肝脏和NLT中的髓样祖细胞，单核细胞，巨噬细胞以及DC1和DC2细胞簇。 ?
1.7K10发布于 2020-03-30 - 来自专栏类器官/器官芯片/3D培养
FDA联合研究：3D肝脏微组织评估152种药物肝毒性，DILI预测准确率显著提升-InSphero数据分析
关键词：DILI、药物诱导性肝损伤、3D肝脏微组织、hLiMTs、InSphero、FDA NCTR、肝毒性评估、Akura 384孔板、3D细胞培养、临床前药物安全性评价一、为什么DILI预测需要更高生理相关性的体外模型 这说明传统模型在预测人体肝毒性方面仍存在不足，尤其是对于涉及代谢、长期暴露以及多细胞互作的药物反应，单一二维肝细胞模型往往难以完整反映人体肝脏环境。 人类肝脏微组织通常由原代实质性肝细胞和非实质性肝细胞共同形成三维结构，能够更好维持细胞间相互作用、肝细胞功能以及部分代谢特征。 三、研究如何建立肝毒性评估方案？研究团队将152种FDA批准的小分子药物在人类肝脏微组织中的细胞毒性结果与药物标签肝毒性信息及药物总峰值血浆浓度（Cmax）进行对比分析。 实验中以细胞ATP水平作为细胞活性指标，并计算细胞ATP IC50。随后，研究人员将ATP IC50与Cmax之间的比值定义为C2C，用于评估体外毒性暴露与临床相关暴露之间的关系。
13510编辑于 2026-06-05 - 来自专栏类器官/器官芯片/3D培养
人原代肝细胞3D肝球培养技术解析：LifeNet长期稳定肝球模型在药物代谢与肝脏研究中的应用
本文围绕LifeNetHealth人原代肝细胞3D肝球培养方案展开介绍，并结合细胞复苏、接种密度、培养维护以及肝球形成特征，分析长期稳定3D肝球模型在药物代谢、肝毒性评价以及肝疾病研究中的应用价值。 关键词：人原代肝细胞；PrimaryHumanHepatocytes；3D肝球；肝细胞球体；LifeNetHealth；肝毒性；药物代谢；ADME；肝细胞培养；长期培养模型一、为什么3D肝球模型正在逐渐替代传统 尤其在人原代肝细胞研究中，3D肝球体系能够帮助细胞形成更加接近体内肝组织的微环境，从而提高白蛋白分泌、CYP450代谢酶活性以及长期培养稳定性。 在人原代肝细胞相关研究中，3D肝球还可用于构建NASH、肝纤维化以及药物性肝损伤等疾病模型，从而帮助研究人员分析疾病相关机制。 相比2D培养，基于人原代肝细胞建立的3D肝球能够更好维持细胞间相互作用、代谢功能以及长期培养稳定性，因此在药物代谢、肝毒性以及疾病模型研究中具有较高应用价值。
14510编辑于 2026-05-14 - 来自专栏生信菜鸟团
单细胞+空转分析之数据下载：胎肝中的造血干细胞多能祖细胞（一）
接着，通过对单细胞和空间转录组的联合分析，发现了新的 HSC/MPP “口袋状” 单位（P ‘pocket-like’ units，HSC PLUS），由生态位细胞 niche cells（hepatoblasts 其中，巨噬细胞在 HSC PLUS 中显示出 11 倍的富集。 后续，文章用实验验证了巨噬细胞和生长因子（MDK、PTN 和 IGFBP5）在 HSC/MPP 扩增中的支持作用。 数据下载 取样背景：从胚胎第11.5天（E11.5）到胚胎第12.5天（E12.5），定植于胎肝（FL）的造血干细胞/多能祖细胞（HSCs/MPPs）获得了明确的 signatures，随后从胚胎第12.5 作者的实验设计如下，采用10×Genomics技术，在E11.5到E14.5之间每隔一天取一个胎肝。 然后还让小张老师介绍了受控的数据如何下载： GSA受控数据下载 点进去看到单细胞和空转的链接：单细胞的GSA编号CRA002489，空转的GSA编号CRA003651。
40400编辑于 2025-02-18 - 来自专栏生信菜鸟团
人肺内皮细胞整合单细胞图谱
推荐一篇单细胞转录组测序对人肺内皮细胞进行详细解析的文献。 背景：肺内皮细胞的多样性在人类中尚未得到系统的描述。我们提供了人类肺内皮细胞(ECs)的参考图谱，以促进更好地理解肺内皮细胞的表型多样性和组成。 除了淋巴、毛细血管、动脉和静脉内皮细胞的宽泛细胞类别外，还在静脉EC中发现了以前难以区分的亚群，分别为定位于肺实质的肺静脉EC (COL15A1neg)和定位于气道和肺胸膜的全身静脉EC (COL15A1pos 在毛细血管EC中，我们确认了它们的亚分类为最近发现的以EDNRB、SOSTDC1和TBX2为特征的空化细胞和一般毛细血管EC。 结论：作者综合分析提供了一个全面和精心制作的正常肺内皮细胞参考图谱，并确认和详细描述了大量人类和小鼠中此前未被识别的内皮细胞群。
56720编辑于 2022-10-31 - 来自专栏单细胞天地
人血细胞的单细胞转录组图谱
，得到了总共7551个人血细胞，发现蛋白质编码基因和lncRNAs 构建的人血单细胞转录图谱（atlas of blood cells ，ABC）具有高度一致性。 分析每个特定细胞群(HSPCs、B细胞、NK细胞、T细胞、单核细胞、中性粒细胞和红细胞)的分化轨迹和特征，发现有核红细胞与免疫信号通路密切相关。 发现从HSPC开始，向淋巴细胞(B细胞、NK细胞和T细胞)、髓系细胞(单核细胞和中性粒细胞)和红细胞分支，揭示了造血分化的总体轨迹。 B细胞、NK细胞、T细胞、单核细胞、中性粒细胞和红细胞)的分化轨迹和特征。 Atlas 总结 该研究借助单细胞转录组深度测序技术，覆盖了从造血干细胞到祖细胞再到各谱系成熟血细胞在内的32种类型的血细胞，绘制了人全血细胞的精细分子图谱。
1.4K20编辑于 2022-03-14 - 来自专栏流式抗体推文
告别杂细胞干扰！Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒，精准富集人初始 T 细胞
内容概要Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒凭借阴性分选技术，可从新鲜或冻存的人 PBMC 样本中快速分离高纯度人初始 T 细胞。 产品介绍Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒是一款操作快速简便的细胞分离产品，核心用于分离人初始 T 细胞。 检测原理Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD3⁻非 T 细胞、CD45RO⁺记忆 T 细胞等非目标细胞，实现人初始 T 细胞（CD3⁺CD45RA 样本兼容性广：支持新鲜人 PBMC 样本和冻存 PBMC 样本，适用场景灵活。细胞活性佳：分离过程温和，不损伤细胞活性，可直接用于下游各类实验。 总结Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒 以高纯度、便捷性、广兼容性等核心优势，成为人初始 T 细胞分离的优选工具。
19310编辑于 2025-11-13 单细胞 + ATAC + 突变 + 空间揭示了肝母细胞瘤中克隆进化和细胞可塑性的相互作用
单细胞检测突变已经分享了很多了，大家可以查看：课后补充----单细胞突变分析的高分文章运用课后补充--关于单细胞突变联合inferCNV的分析课前准备--单细胞突变矩阵的获得与有害位点的识别单细胞空间突变信息分析导论肝母细胞瘤 (HB)表现出影响临床结果的异质性细胞表型体细胞突变的单细胞图谱揭示了每个肿瘤的克隆结构，表明每个遗传亚克隆在分化状态下表现出自己的细胞可塑性范围。 知识背景肝母细胞瘤(HB)通常在5岁前被诊断出来，是最常见的儿科肝脏肿瘤。 单细胞 + ATAC + 突变 + 空间结果1、肝母细胞瘤的单细胞多组学特征结果2、肝母细胞瘤细胞沿两条分化轴呈连续状态这其中体现了转录组 + ATAC的轨迹变化以及分化的空间变化结果3、HB分化极染色质可及性图谱不同轨迹的开放染色质差异结果 总体而言，在单细胞数据中检测到347/11,798(2.9%)体细胞突变。9.7%的细胞显示出至少一种体细胞突变，从而以97%的精度将细胞分配到其来源样本。
36520编辑于 2024-08-20文献分享--单细胞图谱描绘化疗后肝母细胞瘤的免疫细胞重塑与增强的肿瘤-成纤维细胞相互作用
今天我们分享文献知识积累肝母细胞瘤（HB）定义：一种罕见的婴幼儿肝脏恶性肿瘤，发病率近三十年显著上升。起源：被认为起源于肝脏前体细胞（肝母细胞）。 肿瘤细胞异质性：恶性上皮细胞呈现肝细胞样和间质样表型的混合；高度增殖的肿瘤细胞主要属于肝细胞谱系，且高表达FGFR4。 免疫细胞（占14%）：包括T细胞、自然杀伤T细胞、巨噬细胞、浆细胞样树突状细胞和B细胞。基质细胞（占10%）：包括成纤维细胞和内皮细胞。 细胞功能实验验证实验设计：通过流式细胞分选技术从肿瘤样本中分选出CD69+ CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和PD-1+ CD8+ T细胞（Tex），分别与GFP+HepG2肝癌细胞共培养，监测肿瘤细胞存活率 化疗可能通过两种机制在肝母细胞瘤中诱导抗肿瘤免疫反应：富集CD69+ CD8+ 组织驻留样T细胞。增强不同T细胞亚群的细胞毒性功能。
18220编辑于 2026-03-30- 来自专栏生信菜鸟团
Cell | 单细胞技术揭示人肝细胞图谱
progenitors 该团队对来自9个正常人体的肝组织的10000+个细胞进行单细胞分析，描绘了一个详尽的肝细胞图谱（GSE124395），确认了内皮细胞、Kupffer细胞和肝细胞新的亚型。 个人正常细胞、1052个类器官细胞、1282个肝癌细胞和311个移植后小鼠细胞 使用RaceID3（FateID包）进行后续分析；并标准化 6.扩散伪时间分析和自组织映射 使用destiny包 7.对比小鼠 )、肝星状细胞和肌成纤维细胞、库普弗细胞和免疫细胞。 2.人肝细胞类型的分带 ? ? ? 3.人肝免疫细胞群 对CD163+VSIG4+ Kupffer细胞进行详细分析，发现其亚群具有明显的基因表达特征。 总结 该研究建立了一个人肝细胞图谱，揭示了主要肝细胞群的异质性和成人肝脏中上皮祖细胞的存在。
6.7K31发布于 2020-03-30
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