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  • 来自专栏生命科学

    MCE | Hippo 途径与靶向策略

    YAP/TAZ 蛋白是 Hippo 途径的枢纽,上游的多种信号分子通过直接或间接作用于 YAP/TAZ,主要是调控 YAP/TAZ 的定位,即调节 YAP/TAZ 滞留在细胞质或是进行核定位(定位于细胞核 YAP/TAZ 被 14-3-3 蛋白保留在细胞质中或通过 β-Trcp E3 连接酶介导降解,抑制 YAP/TAZ 的核输入 → 下调下游靶标。 1、靶向 YAP/TAZ-TEAD 复合物 由于 YAP 和 TAZ 特殊的结构性质,直接靶向 YAP/TAZ 蛋白并不容易。因此,靶向 YAP/TAZ-TEAD 复合物的是一个更好的策略。 靶向 YAP/TAZ-TEAD 复合物 Verteporfin YAP 抑制剂,可破坏 YAP-TEAD 相互作用;诱导细胞凋亡 (apoptosis)。 /D5) 激动剂;刺激 YAP 磷酸化,从而抑制 YAP 的核易位。

    68920编辑于 2023-03-16
  • 来自专栏生信技能树

    转录组讲师带你读文献(4)-转录组数据到底起多大作用呢?

    基于以上数据,我们推测机械张力可能通过活化Yap而触发肝细胞去分化。 2 Yap介导的肝细胞去分化伴随着机械张力 在皮氏培养皿中培养的贴壁细胞,细胞拉力随着细胞的扩散而增大。 肝细胞功能基因:Alb(白蛋白),Hnf4a, 3 机械张力通过活化Yap诱导肝细胞去分化 Yap是决定细胞命运的关键机械传感器和机械传导器。小鼠肝脏特异性过表达Yap可引起肝器官过度生长和肝细胞癌。 **实验证明,Yap缺失也显著抑制其靶基因Ctgf和上皮-间质转化(EMT)标记物vimentin (Vim)的表达。这些数据证实了Yap激活是机械张力诱导的肝细胞去分化所必需的。 Yap:yes-associated protein。 相比之下,LBDXL 3w与FH and FH YAP-/- 中的肝脏功能基因表达相似。这些数据进一步证实了机械张力通过激活Yap诱导肝细胞去分化。

    90110发布于 2021-05-27
  • 来自专栏Chris生命科学小站五年归档

    【NS基金GPT】课题1:运用3D打印和生物反应器构建仿生尿道模型探索Hippo-YAP信号通路调控尿道损伤修复的机制研究

    本研究旨在探讨Hippo-YAP(Yes-associated protein)信号通路在尿道损伤修复中的潜在作用,拟体内外模型中探索Hippo-YAP信号通路在尿道损伤修复中的作用。 特别是在组织修复和再生方面,Hippo-YAP信号通路显示出巨大的潜力和应用价值。 这一领域的研究还相对较少,因此,有必要进一步探索Hippo-YAP信号通路在尿道损伤修复中的潜在作用。 Hippo-YAP信号通路是由一系列的激酶和转录因子组成的复杂网络。 在接收到这些信号后,Hippo-YAP信号通路通过一系列的激酶级联反应来调控细胞的多种生物学功能。 最终效应因子是Yes-associated protein(YAP)和其同源物转录共激活因子(TAZ)。

    28110编辑于 2023-09-12
  • 多组学文献--早期激活的细胞外基质蛋白塑造肾脏纤维化微环境的代谢和空间动态

    机制上,TGFβ促进TEAD4募集至Pgc1a启动子区抑制其转录,而沉默Yap可解除此抑制并上调Pgc1a表达。 在成纤维细胞特异性Ecm1敲除小鼠纤维化肾脏中,YAP/TAZ表达显著降低,且免疫荧光共染证实AAV9-ShEcm1或Col1a2-Ecm1⁻/⁻小鼠肾脏中成纤维细胞与肾小管细胞YAP水平均下降。 结果7、靶向YAP信号通路可增强管状OXPHOS并减轻纤维化使用TEAD1棕榈酰化抑制剂VT103处理单侧IRI小鼠。 结果显示,VT103显著降低YAP、TAZ及TEAD1/4蛋白水平,抑制YAP/TAZ-TEAD转录活性,并改善肾功能(Scr降低),下调纤维化相关基因(Fn、Col1a1、Col3a1)及促炎因子(Il6 该研究证实,成纤维细胞特异性Ecm1缺失通过干扰整合素α2β1-RhoC轴,抑制肾小管YAP活性,减少YAP核转位及YAP-TEAD4复合物形成,从而解除TEAD4对Pgc1a的转录抑制,增强小管细胞线粒体

    3120编辑于 2026-03-16
  • 来自专栏生信技能树

    转录组讲师带你读文献-使用siRNA干扰LINC00152前后看结直肠癌表达量差异

    /LINC00152/FSCN1 Signaling Axis Prevents the Progression of Colorectal Cancer 标题:靶向YAP1/LINC00152/FSCN1 相关的LINC00152在人类CRC组织中高表达 首先使用siRNA处理的YAP1沉默表达细胞系和对照组细胞系的lncRNA表达谱(GSE92335),以此找到YAP1相关的lncRNA。 LINC00152的表达在CRC样本中与靶基因CTGF正相关 以上结果的图: 2.YAP1转录调控CRC细胞中LIC00152的表达 此部分是为了确定YAP1与LIC00152之前的调控关系,结果如下: YAP1的高表达或者抑制能够显著改变LIC00152表达水平 在CRC中YAP1诱导的细胞增殖和肿瘤增长LIN00152是必须的 LINC00152启动子区域有两个转录因子TEAD1的结合位点 LINC00152 的表达与TEAD1的表达正相关 抑制YAP1 or TEAD1的表达就会抑制LINC00152的表达 TEAD1可以通过LINC00152的启动子一位点调控其表达 以上所有结果的结论就是YAP1可以在TEAD1

    77030发布于 2021-05-27
  • 来自专栏生命科学

    蛋白 A/G 磁珠免疫沉淀(IP)实验 精选参考文献|MCE

    目录号:HY-K02021、乳腺癌中细胞质YAP 1介导的ESCRT-III组装促进自噬细胞死亡并被NEDD 4L泛素化Cancer Commun (Lond). 2023 May;43(5):582- 用0.5% PBS‐Triton X‐100、1 × SDS‐P洗涤后结果:YAP 1在乳腺癌细胞中主要表达于胞浆。胞质YAP 1促进乳腺癌细胞的自噬性死亡。 EGCG将YAP 1保留在细胞质中,促进CHMP 2B-VPS 4 B的组装,从而促进乳腺癌细胞的自噬死亡。YAP 1与NEDD 4L结合,NEDD 4L介导YAP 1的泛素化和降解。 乳腺组织微阵列显示,高水平的细胞质YAP 1有利于乳腺癌患者的生存。 结论:胞浆YAP 1通过促进ESCRT-III复合物的组装介导了乳腺癌细胞的自噬性死亡,并建立了基于胞浆YAP 1表达的乳腺癌生存预测模型。

    32610编辑于 2025-09-10
  • 来自专栏飞鸟的专栏

    PHP面向对象-继承和派生类的定义(二)

    \n"; }}class Poodle extends Dog { public function bark() { echo "Yap! Poodle();$poodle->name = "Fifi";$poodle->speak(); // Output: I am an animal$poodle->bark(); // Output: Yap

    68530编辑于 2023-04-28
  • 来自专栏机器之心

    死蜘蛛转世成为机械臂:人们求之不得的微型气动抓手来了

    下图展示了蜘蛛抓手的力与位移表征: 论文作者之一 Faye Yap 说这项研究的灵感来源于生活中的观察:「有一天我们在实验室里移动东西时注意到走廊边缘有一只蜷缩的蜘蛛,我们就很好奇为什么蜘蛛死后会蜷缩起来 Faye Yap 他们搜索百科知识找到了答案:蜘蛛没有对抗性肌肉对(例如人类的二头肌和三头肌一样),它们只有屈肌,可以让他们的腿弯曲,并通过液压向外伸展。 Yap 和其他研究成员觉得这很有趣,于是他们试图找到一种方法来利用这种机制。 值得注意的是,较小的蜘蛛承受负载的能力可能比较大的蜘蛛更强。

    48880编辑于 2022-08-26
  • 来自专栏全栈程序员必看

    db4o的使用

    通过浏览目录可以发现,与传统的 RDBMS 一样,db4o 也有自己的数据库文件, 在 db4o 中数据库文件的后缀名是“*.yap”。 本地模式是指直接在程序里打开 db4o 数据库文件进行操作: ObjectContainer db = Db4o.openFile("auto.yap"); 而服务器模式则是客户端通过 IP 地址、 端口以及授权口令来访问服务器: 服务器端: ObjectServer server=Db4o.openServer("auto.yap",1212); server.grantAccess("admin //保存对象 db.set(peo); }finally{ //关闭连接 db.close(); } } } 当我们运行上述代码,db4o 会自动创建“auto.yap 对象数据库管理工具 “File”->“Open File”->选择刚才我们保存的“auto.yap”文件(“auto.yap”文件可在项目的根目录下找到),最新的 ObjectManager 1.8

    53410编辑于 2022-09-14
  • 来自专栏聊点学术

    促心肌再生?巨噬细胞的最新作用机制!

    (2)作为OSM的共同受体,激活后的gp130可通过Src激活Yap来促进心肌细胞增殖。 (3) gp130是改善心脏损伤后心脏再生的潜在治疗靶标。 该团队通过严格的实验设计,证实gp130-Yap-Notch信号转导通路在心肌细胞增殖中发挥了重要作用。这区别于既往认知的经典Hippo信号通路。 如果今后大家要进行增殖或再生一类的研究,gp130-Yap-Notch信号转导通路也是一个可供探索的方向。

    91930发布于 2020-08-04
  • 来自专栏作图丫

    ActivePathways整合多维组学通路分析

    重点研究了Hippo信号通路在器官大小控制、组织稳态和癌变中的作用,并研究了两种转录因子(TFs) YAP和TAZ(由YAP1和WWTR1编码)的下游调控网络。 首先,共表达分析和Robust rank aggregation(RRA)方法预测了YAP和TAZ的转录靶基因(分别为1898和1319个基因)。 其次,研究了来自ReMap数据库中重新分析的YAP ChIP-seq study的YAPYAP个靶基因。将三个基因列表以及相应的显著性值输入到ActivePathways中进行整合分析。 综合分析YAP/TAZ的转录和DNA结合的靶基因,发现有225个显著富集的GO生物学过程和Reactome通路(Fig.4a)。 接下来使用了ENCODE项目的161个TFs的靶基因数据集,进一步阐明在YAP / TAZ下游的下游的网络。

    1.2K30编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏DT数据侠

    你离餐饮界最懂顾客的老板,只差一个爬虫的距离

    数据侠 John Yap 希望为餐饮老板们设计一个爬虫工具,通过分析用户评价,来让他了解自己的饭店的表现情况,制定相应的运营策略。让我们来看看John Yap 具体是怎么做的吧。 作者 | John Yap 题图 | 站酷海洛 ▍数据侠门派 John Yap是一名在临床试验以及观察性研究方面有多年工作经验的统计学家。他参加了NYCDSA的课程来提高自己的数据科学能力。

    58201发布于 2018-08-08
  • 来自专栏DotNet 致知

    06_代码演示,状态码路由相关

    http://mpvideo.qpic.cn/0bf2giar6aab4yap4qgiwnpvcmwdd4zachya.f10002.mp4?

    30610编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏生信技能树

    开局一个转录组,收获一篇science

    本次要介绍的文章也不旧,发表于2019年2月,在science杂志,标题是;《Tumor metastasis to lymph nodes requires YAP-dependent metabolic FAO,这个时候根据作者的背景知识选择性检查了 oncogenic signaling genes Transcriptional coactivator yes-associated protein (YAP YAP activation is critical for enhanced FAO and tumor LN metastasis. Fig. 4. LN-metastatic tumors produce bile acids that can activate YAP, and YAP activation is correlated with

    1K20发布于 2021-04-13
  • 来自专栏全栈程序员必看

    Db4o数据库:细说查询[通俗易懂]

    一种非常简单直观的查询方式,通过模板进行对比查询,比如说查一个名为Sunth的职工信息 static void Main(string[] args) { string DbPath = "Pilot.yap 还是那个例子,查询一个名为Sunth的职工信息 static void Main(string[] args) { string DbPath = "Pilot.yap"; if 查询一个名为Sunth的职工信息,具体的注释请看代码 static void Main(string[] args) { string DbPath = "Pilot.yap";

    46710编辑于 2022-09-14
  • 来自专栏百味科研芝士

    分享一本审稿快,国人友好型的3分杂志

    第四篇文章(Stree-triggered YAP1/SOX2 activation transcriptionally reprograms head and neck squamous cell carcinoma for the acquisition of stemness)讲的是转录因子yap1/sox2在癌症干细胞中的作用,这篇文章在2019年5月11日投稿,在8月5日被接收,从投稿到接收用时两个月,想必审稿人返回的审稿意见后

    2.4K20发布于 2020-01-16
  • 来自专栏DT数据侠

    糖尿病的数据可视化分析,比“药神”来得靠谱

    作为一位长期关注临床健康问题的统计学家,数据侠 John Yap 希望用数据可视化的方式,帮助人们更好地认识疾病。这次,他把目光聚焦在了糖尿病问题上。 作者 | John Yap 题图 | 站酷海洛 ▍数据侠门派 John Yap是一名在临床试验以及观察性研究方面有多年工作经验的统计学家。他参加了NYCDSA的课程来提高自己的数据科学能力。

    60000发布于 2018-08-08
  • AbMole丨Deferiprone:铁死亡研究中的抑制剂在多模型中的应用

    Deferiprone还在脑室出血(GMH)模型中,通过上调线粒体铁蛋白(FTMT),抑制NDRG1/YAP信号通路,减少神经元铁死亡并改善神经功能缺陷,这一机制在小鼠模型中得到了验证[2]。 upregulation by deferiprone reduced neuronal ferroptosis and improved neurological deficits via NDRG1/Yap

    4500编辑于 2026-01-21
  • 来自专栏生信技能树

    肿瘤拷贝数变异的差异分析应该以这个肺癌脑转移为标准

    为了让在数据分析更可信,研究者们还加入了实验验证: 实验验证数据分析的拷贝数变异 图例是:e, Frequencies of amplifications of MYC and YAP1 in the 最后作者的结论是:Amplified candidate drivers (MYC, MMP13, YAP1) tended to occur after the divergence of the metastatic

    77510编辑于 2021-12-10
  • 来自专栏新智元

    亡蛛复活!「死灵机器人」竟抓走了同类

    论文一作Te Faye Yap称,当时我们正往实验室搬东西,便注意到了走廊边上一直蜷缩的蜘蛛。 这激起了Yap的好奇心,「为什么蜘蛛死后会蜷成一团?」 作者介绍 论文一作Te Faye Yap目前莱斯大学机械工程的博士研究生,导师便是这次论文通讯作者Daniel Preston教授。

    43030编辑于 2022-08-26
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