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来自专栏生物信息编程笔记
R语言Rscript脚本-参数设置
直接通过Rsript xx.R arg1 arg2 arg3 arg4 arg5运行脚本。这种方法只能设置位置参数，各参数位置固定，不能写乱，所以如果参数简单且数量少，可以用此种方法。如果不设置参数控制，直接在脚本第一行写一句Args <- commandArgs(T)即可，然后直接Rscript xx.R a1 a2运行脚本，参数a1,a2的值会存储在Args中，脚本中使用Args , Args[[1]], Args[[2]], Args[[3]], Args[[4]], Args[[5]])终端中运行Rscript xx.R arg1 arg2 arg3 arg4 arg5。 \nPlease use Rscript xx.R -h to get help info\n") }) }终端运行 Rscript xx.R -n yyds -t 8 -m 1 -p 0.05
1.6K30编辑于 2023-05-17
来自专栏北野茶缸子的专栏
128-R茶话会21-R读取及处理大数据
/xx.R ../Input/split/${id} ../Input/genotype_name.txt .. /xx.R ../Input/split/id.text ../Input/genotype_name.txt ../Out/id.text Rscript ./xx.R .. /xx.R ../Input/split/test10 ../Input/genotype_name.txt ../Out/test10 Rscript ./xx.R ..
67620编辑于 2022-05-19