实操分享-使用MAGeCK分析Bulk CRISPR Screen数据

在mageck count中设置(--trim-5 23)参数， 看接下来的代码 4.4 Step4 mageck count的使用 目的：输出library文件中包含的基因的表达量。 ：library文件和原始数据要在一个文件夹里面 mageck count -l yusa_library.csv -n escneg --sample-label "plasmid,ESC1" --trim escneg'输出结果文件名,输出文件名为escneg.count.txt # '--sample-label "plasmid,ESC1"',告诉mageck你的实验分组与样本号一一对应 # '--trim