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tidyverse
背景 Tidyverse 是 Rstudio 公司推出的专门使用 R 进行数据分析的一整套工具集合，里面包括了readr，tidyr， dplyr，purrr，tibble，stringr https://github.com/tidyverse/ Tidyverse 包含模块 这些包涵盖了数据读取，清洗，转换，字符串处理，建模，数据可视化，生成报告等完整过程。 《R 数据科学》电子书：https://r4ds.had.co.nz/ tidyverse 包重构了 R 语言处理数据的语法，比默认的 R 函数更加方便，相当于一套新的语法，使用起来更加方便 官网：https://www.tidyverse.org/ 一、tidyr 数据整理 tidyr 包用于将数据重新整合，替代之前的 reshape 和 reshape2 包，用于数据的重塑与聚合 二、tidyr 使用案例 library(tidyverse) library(tidyr) tdata <- mtcars[1:10,1:3] tdata gather(tdata) tdata <-
2.4K10编辑于 2022-10-25 - 来自专栏火星娃统计
tidyverse evaluation
tidy evaluation sunqi 2020/8/5 概述 也称作非标准评估 代码 rm(list = ls()) library("tidyverse") library(rlang) # 在编写代码时遇到不同数据集或者不同变量的操作比如 5.94 ## 3 virginica 6.59 # 如果换个变量，那么就需要重新编写代码 # 于是乎，想到了用自定义函数进行重复性的操作 # 但是R语言函数的传递和python是不一样的 # 因此，在tidyverse setosa 5.01 ## 2 versicolor 5.94 ## 3 virginica 6.59 # 现版本的tidyverse
77330发布于 2020-09-15 - 来自专栏火星娃统计
Tidyverse补充
Tidyverse补充 sunqi 2020/8/13 概述 休息了几天，罪过 tidyverse中的长款数据转换函数，类比于之前的reshape2包中的melt和dcast函数 代码 rm(list= ls()) library(tidyverse) library(patchwork) # 建立示例数据框 df <- data.frame( Day = 1:5, type1 = c(0.6,
75020发布于 2020-09-15 - 来自专栏Echo is learning
centos R包 tidyverse安装
tidyverse安装失败，install.packages('tidyverse') 错误原因大概是其中有个依赖包xml2安装不上，解决办法是yum install libxml2-devel，这样就可以安装 xml2了，也可以安装tidyverse了
1.7K30发布于 2018-07-06 - 来自专栏庄闪闪的R语言手册
tidyverse数据清洗案例详解
library(tidyverse) #加载包 who #数据展示 ? 这是一个非常典型的现实示例数据集。它包含冗余列，奇数变量代码和许多缺失值。我们需要采取多个步骤来对其进行整理。 library(tidyverse) stocks <- tibble( year = c(2015, 2015, 2016, 2016), half = c( 1, 2,
2K10发布于 2021-04-09 - 来自专栏优雅R
「R」tidyverse 中的公式函数
本文的写作由来是知识星球一个朋友对如何在 tidyverse 系列包中使用公式函数（单侧公式）不太熟悉，所以通过本文分享一下我的心得。 library(tidyverse) #> ── Attaching packages ─────────────────────────────────────── tidyverse 1.3.0 ─ 1.4.0 #> ✓ readr 1.4.0 ✓ forcats 0.5.0 #> ── Conflicts ────────────────────────────────────────── tidyverse_conflicts 公式生成匿名函数 利用公式这一特点，tidyverse 系列包有很多函数支持用单侧公式替换函数。如果你仔细阅读过相关文档，例如 ? 好的模型结果残差分布和我们实际加入的噪声分布应该是差不多的： mean(df$rs) #> [1] -1.19e-15 sd(df$rs) #> [1] 1.03 提醒 tidyverse 中使用单侧公式简化匿名函数的构造
5.8K20发布于 2021-01-03 - 来自专栏火星娃统计
R海拾遗-tidyverse
数据框操作总结 sunqi 2020/7/28 概述 基于tidyverse,这个包//包含tidyr 选取列 rm(list=ls()) library(tidyverse) ## -- Attaching packages ------------------------------------------------------------- tidyverse 1.3.0 -- ## √ ggplot2 √ forcats 0.5.0 ## -- Conflicts ---------------------------------------------------------------- tidyverse_conflicts 3.2 1.3 0.2 setosa ## # ... with 140 more rows # 注 如果存在缺失值，一般排序在最后 对列重命名 # 使用tidyverse 2.77 4.26 1.33 ## 3 virginica 6.59 2.97 5.55 2.03 结束语 tidyverse
1.4K10发布于 2020-09-15 - 来自专栏生物信息学
从Tidyverse学起！
那么，tidyverse就提供了一个很好的学习思路（tidyverse first），让我们先忽略编程这道大关，其理念是一开始不谈向量、矩阵、数据框、因子、流程控制等概念，直接从数据的操纵入手，让初学者在最短时间内学会数据的处理与可视化应用 tidyverse 是什么 ? tidyverse出自于R大神Hadley Wickham之手，他是Rstudio首席科学家，也是ggplot2的作者。 library(tidyverse) will load the core tidyverse packages: ggplot2, for data visualisation. (处理因子问题) tidyverse的安装也很简单，在R中输入以下命令： #安装包 install.packages("tidyverse") #使用前，记得载入包 library(tidyverse ) tidyverse的数据处理流程大致分为以下三类： 1.
3.5K30发布于 2020-04-14 - 来自专栏单细胞天地
R包基础实操—tidyverse包
tidyverse包，分享整洁数据的基础设计理念、语法和数据结构。 ： read_csv，read_tsv，read_table，read_delim， write_csv，write_tsv, write_excel_csv，write_delim library(tidyverse ] R语言| 向量化操作purrr包: https://www.huaweicloud.com/articles/f522c9f56cf2d8cca5f7b390aa3f2d7c.html [10] tidyverse 简介与管道: https://zhuanlan.zhihu.com/p/243376822 [11] R语言编程——基于tidyverse: https://zhuanlan.zhihu.com/p/198185888
4.1K30发布于 2021-10-11 - 来自专栏医学和生信笔记
基于data.table的“tidyverse”？
tidyverse作为R语言数据分析中的瑞士军刀，非常好用，一个小小的缺点就是速度慢，data.table速度快，所以他们团队又开发了dtplyr，加快运行速度。 不过今天要介绍的是另一个，基于data.table的tidyverse：tidytable。 使用起来非常简单，只需要在原有函数后面加一个.即可！！！ = z) ## # A tidytable: 2 × 2 ## z avg_x ## <chr> <dbl> ## 1 a 1.5 ## 2 b 3 基本上tidyverse
68850编辑于 2022-11-15 - 来自专栏生信小驿站
数据处理神器tidyverse（2）ggplot2
tidyverse包其中包含着一个重要的可视化包---ggplot2。 Ggplot2是由Hadley Wickham制作的数据可视化软件包，它基于一组称为图层的原则。
2.9K30发布于 2019-08-29 - 来自专栏庄闪闪的R语言手册
新书《R语言编程—基于tidyverse》信息汇总
本书全面采用最新的R语言技术编写，特别是 tidyverse “整洁流、管道流、泛函流”数据科学。 2. 第二章：正式进入tidyverse核心部分：数据操作，侧重讲解数据思维 先简单介绍 tidyverse包以及编程技术之管道操作，接着围绕各种常用数据操作展开，包括数据读写（各种常见数据文件的读写及批量读写 tidyverse最大的优势就是以“管道流”、“整洁语法”操作数据，这些语法真正让数据操作从R base的晦涩难记难用，到tidyverse的“一致”、“整洁”好记好用，比Python的 pandas还好用 另外，tidyverse 的这些数据操作，实际上已经在语法层面涵盖了日常Excel数据操作、SQL数据库操作，活用tidyverse上述数据操作语法已经可以胜任这些工作。 本书所用的软件 本书使用最新版本的R语言4.1.1和RStudio 1.4，主要使用的R包是tidyverse 1.3.1系列。
2.9K21发布于 2021-09-14 - 来自专栏科研菌
生信代码：数据处理（ tidyverse包）
大家在学习R语言的时候，大多参考《R语言实战》这本书，但这本书年代过于久远（中文第二版是2016年），主要着力点也是在R base上，R语言可视化的ggplot2包也只是简要介绍，而对于tidyverse 包，《R语言实战》并未涉及，这也导致R语言的学习难度增加，今天我们给大家引入tidyverse包的学习。 tidyverse 包是 Hadley Wickham 及团队的集大成之作，是专为数据科学而开发的一系列包的合集， 基于整洁数据，提供了一致的底层设计、语法、数据结构，包括数据导入，数据规整，数据处理， 在Rstudio中加载tidyverse包，可以看到该包下有8个子包，著名的ggplot2包即是其中的一个子集，我们先着重讲一下数据处理有关的包——dplyr包。
2.9K10发布于 2021-02-19 - 来自专栏优雅R
「R」数据操作（四）：初学者学习tidyverse
资料来源：DataCamp tidyverse是一组处理与可视化R包的集合（人称“极乐净土”，但我并不喜欢这个称呼），其中ggplot2与dplyr最广为人知。 安装tidyverse： install.packages("tidyverse") 导入： library(tidyverse) ## -- Attaching packages --------- ------------------------------ tidyverse 1.2.1 -- ## √ ggplot2 2.2.1 √ purrr 0.2.4 ## √ tibble 与其他包的冲突 tidyverse_conflicts() # 列出所有tidyverse的依赖包 tidyverse_deps() #获取tidyverse的logo tidyverse_logo() # 列出所有tidyverse包 tidyverse_packages() # 更新tidyverse包 tidyverse_update() 载入数据 library(datasets) #install.packages
1.9K30发布于 2020-07-06 - 来自专栏育种数据分析之放飞自我
我承认tidyverse已经脱离了R语言的范畴
不得不说，R语言的tidyverse是真的好，非常高效。从某种角度，只学R语言没有接触过tidyverse的用户，看到R的代码，觉得它已经脱离了R语言的范畴！！！ 最近在学习tidyverse，批量方差分析之前都是用for循环，然后用formula处理模型，再把结果保存为list的形式，现在学习了tidyverse的操作，可以用pivot_longer将所有性状进行长数据转化 Spacing + Rep, data=.))) %>% mutate(result = map(model,~tidy(.))) %>% unnest(result) 上面的代码，如果没有tidyverse NA NA 然后我们看tidyverse的解决方案： head(fm) fm1 = fm %>% pivot_longer(-c(1:5),names_to = "trait",values_to 下学习，问题来了，tidyverse怎么学？
86220编辑于 2022-05-19 - 来自专栏生信补给站
tidyverse|数据分析常规操作-分组汇总（sumamrise+group_by)
使用tidyverse进行简单的数据处理： 盘一盘Tidyverse| 筛行选列之select，玩转列操作 盘一盘Tidyverse| 只要你要只要我有-filter 筛选行 Tidyverse|数据列的分分合合 ，一分多，多合一 Tidyverse| XX_join ：多个数据表（文件）之间的各种连接 本次介绍变量汇总以及分组汇总。
3K60发布于 2020-08-05 - 来自专栏R记录
Python 中类似 tidyverse 的数据处理工具
Python 中类似 tidyverse 的数据处理工具在 Python 中，有许多类似于 R 的 tidyverse 的数据处理工具包，尽管它们没有完全整合在一个生态系统中，但它们可以组合使用，达到类似 tidyverse 的功能效果。 以下是 Python 中的一些主要库及其功能，和 tidyverse 的模块相对应：1.pandas对应 tidyverse 的核心功能：dplyr（数据操作）tidyr（数据整理）功能特点：数据操作和清洗的核心库 ，支持类似 tidyverse 的管道式操作。 如何组合这些工具实现类似 tidyverse 的功能？可以将上述工具组合使用来构建类似于 R 的 tidyverse 工作流。例如：使用 pandas 或 polars 进行数据操作。
1.4K00编辑于 2024-12-12 - 来自专栏生信补给站
Tidyverse|tidyr数据重塑之gather，spread（长数据宽数据转化）
R-tidyr主要有以下几大功能： gather—宽数据转为长数据； spread—长数据转为宽数据； unit—多列合并为一列； separate—将一列分离为多列 unit和separate可参考Tidyverse 一 载入R包，数据 library(tidyverse) #library(tidyr) #使用mtcars内置数据集 data(mtcars) head(mtcars) ? 参考资料： Working_in_the_Tidyverse
7.3K20发布于 2020-08-05 - 来自专栏优雅R
「Workshop」第四期：Tidyverse 实战批量建模可视化
本次主要介绍了一些基本的正则表达式用法以及公式的创建和使用，然后介绍使用 tidyverse 组合拳进行批量建模和可视化。 基础教程：https://www.datacamp.com/community/tutorials/r-formula-tutorial 因变量与自变量 y ~ x 公式表示 字符串转公式 实战：结合 tidyverse
92920发布于 2020-07-03 - 来自专栏生信补给站
Tidyverse| XX_join ：多个数据表（文件）之间的各种连接
一 载入数据，R包 library(tidyverse) x <- tribble( ~key, ~val_x, 1, "x1", 2, "x2", 3, "x3" )
2.1K20发布于 2020-08-05
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