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  • 来自专栏生信喵实验柴

    stamp 分组比较

    一、利用 STAMP 分组检验 如果一次测序多个样品,需要进行分组比较,可以选择 stamp 软件。 STAMP 是一款用于分析微生物分类和功能谱的软件,不仅可以做统计,更能绘制多种图形,可直接放到文章中发表使用。stamp 完全图形化操作模式,支持两两分组,多样品分组比较。 stamp 部分可视化结果展示 二、软件安装 软件支持 Windows、mac,Linux 等多个系统平台,选择自己的系统平台进行下载安装。 下载地址: https://beikolab.cs.dal.ca/software/STAMP github 主页: https://github.com/dparks1134/STAMP 使用说明下载 /software/STAMP_image_gallery 三、输入文件 stamp 不仅可以做物种组成差异的比较,还可以做功能差异的比较。

    2.2K30编辑于 2023-02-24
  • 来自专栏技术小黑屋

    Tar Time Stamp in the Future 问题解决

    最近遇到过一个这样的问题,我在我的Mac机器将一个刚刚创建的文件进行tar打包生成文件scripts.tar.bz2,然后在一台Centos得到这个文件,进行解压,然后出现了如下问题 time stamp in the future. 1 2 3 $ tar xvjf scripts.tar.bz2 temp tar: temp: time stamp 2014-07-17 13:34:02 is 2459.292801106

    1.4K10发布于 2018-09-04
  • 方法迭代----基于STAMP的空间转录组学可解释的空间aware降维(Stereo-seq)

    Workflow of STAMP核心就是需要同时考虑基因表达基因和空间邻域,也要可以处理超高通量的数据。 STAMP在小鼠海马空间域的运用(Slide-seq V2)STAMP揭示了癌症相关的成纤维细胞( CosMx SMI,NSCLC)STAMP整合小鼠前、后脑切片(10x Genomics Visium )STAMP识别跨不同技术的空间数据(Slide-seq V2, Stereo-seq and 10x Genomics Visium)STAMP揭示了胚胎发育的时空主题(Stereo-seq)示例代码在 /STAMP/Reproducibility/ProcessedData/Visium_Mousebrain/adata_benchmark.h5ad")adata.var_names_make_unique adata.X.copy()sq.gr.spatial_neighbors(adata, library_key="data")sctm.seed.seed_everything(5)model = sctm.stamp.STAMP

    50620编辑于 2024-10-16
  • 来自专栏韩曙亮的移动开发专栏

    【Linux 内核】实时调度类 ② ( 实时调度实体 sched_rt_entity 源码分析 | run_list、timeout、watchdog_stamp、time_slice 字段 )

    文章目录 一、sched_rt_entity 源码分析 1、run_list 字段 2、timeout 字段 3、watchdog_stamp 字段 4、time_slice 字段 5、back 字段 2、timeout 字段 sched_rt_entity 结构体的 timeout 字段 , 用于 设置 调度 超时时间 ; unsigned long timeout; 3、watchdog_stamp 字段 sched_rt_entity 结构体的 watchdog_stamp 字段 , 用于 记录 jiffies 的值 ; unsigned long watchdog_stamp; 4、time_slice 用于将 " 实时调度实体 " 加入到 优先级队列 中的 unsigned long timeout; // 用于 设置 调度 超时时间 unsigned long watchdog_stamp

    43410编辑于 2023-03-30
  • 来自专栏程序员小航

    除了读写锁,JUC 下面还有个 StampedLock!还不过来了解一下么?

    锁获取方法返回一个 stamp 用来表示并控制锁状态的访问;这些方法的“try”版本可能会返回特殊值零,以表示无法获取访问权限。 锁的释放和转换方法需要使用 stamp 作为参数,如果它们与锁的状态不匹配,则会失败。 三种模式是:写锁、读锁、乐观读锁。 并且具有以下特征: 获取锁的时候(无论读锁还是写锁或者乐观读锁)都会返回一个 stamp,在释放锁的时候需要使用这个 stamp; 支持三种模式转换; 不是可重入的,所以获得锁的时候,不要尝试再次获取。 ); } } // 乐观读 int read() { // 获取乐观读锁;返回 stamp long stamp = stampedLock.tryOptimisticRead stampedLock.validate(stamp)) { // 被写锁持有,那只能获取读锁 stamp = stampedLock.readLock

    40420发布于 2020-11-23
  • 来自专栏JavaEdge

    架构师四面遭遇StampedLock,这么应对保拿offer

    不同在于:StampedLock写锁、悲观读锁加锁成功后,会返回一个stamp;释放锁时,需传入该stamp。 stampedLock.validate(stamp)) { // 升级为悲观读锁 stamp = stampedLock.readLock(); 这个 version 字段就类似于StampedLock里面的stamp。 sl.validate(stamp)){ // 升级为悲观读锁 stamp = sl.readLock(); try { // 读入方法局部变量 ..... } finally { //释放悲观读锁 sl.unlockRead(stamp); } } //使用方法局部变量执行业务操作 StampedLock写模板 long stamp = sl.writeLock

    38030编辑于 2025-12-21
  • 来自专栏技术文章

    C# 实现 Word 加盖骑缝章效果

    = 0; //水印章每页X public int stamp3Y = 0; //水印章每页Y public int stamp3Angle = 0; / 图章类 foreach (stamp Stamp in Stamps) { bool isfirst = true; Stamp.stampAngle : rnd.Next(Stamp.stampAngle); } ; } else if (Stamp.stamp2Direction = = ""&&isfirst==true) { int ra = Stamp.stamp3Angle

    43710编辑于 2024-06-20
  • 来自专栏XINDOO的专栏

    StampedLock源码分析

    stampedLock.validate(stamp)) { // 2 try { stamp = stampedLock.readLock( ),你可以认为这个stamp就是锁的版本号,这个stamp还不能丢,后续解锁时都得用到这个stamp,而这个stamp是用来确认之后锁状态是否有变化的标记,stamp的存在所以这个锁也叫StampedLock stampedLock.validate(stamp)) { stamp = stampedLock.tryOptimisticRead(); curData 乐观锁的使用原理就是只要stamp没有变,就认为数据没有变化,所以在上面的demo中用到了validate(stamp)方法来校验stamp有没有变化,代码也很简单。 public boolean validate(long stamp) { VarHandle.acquireFence(); return (stamp & SBITS

    56710发布于 2021-01-22
  • 来自专栏小麦苗的DB宝专栏

    【DB宝31】Oracle DG环境中主库使用rman做不完全恢复后,备库如何修复继续同步

    STAMP=1054919858 input archived log thread=1 sequence=23 RECID=15 STAMP=1054919903 input archived log thread=1 sequence=24 RECID=17 STAMP=1054919906 input archived log thread=1 sequence=25 RECID=19 STAMP =14 RECID=55 STAMP=1055236420 input archived log thread=1 sequence=15 RECID=57 STAMP=1055236421 input STAMP=1055236425 input archived log thread=1 sequence=21 RECID=69 STAMP=1055236425 input archived log =28 RECID=83 STAMP=1055236430 input archived log thread=1 sequence=29 RECID=85 STAMP=1055236430 input

    1.2K30发布于 2020-12-08
  • 来自专栏Java编程技术

    JDK8并发包新增StampedLock锁

    票据变量用来表示该锁的版本,当释放该锁时候需要unlockWrite并传递参数stamp。 乐观读锁tryOptimisticRead,是相对于悲观锁来说的,在操作数据前并没有通过CAS设置锁的状态,如果当前没有线程持有写锁,则简单的返回一个非0的stamp版本信息,获取该stamp后在具体操作数据前还需要调用 validate验证下该stamp是否已经不可用,也就是看当调用tryOptimisticRead返回stamp后到到当前时间间是否有其他线程持有了写锁,如果是那么validate会返回0,否者就可以使用该 stamp版本的锁对数据进行操作。 sl.validate(stamp)) { // 如果被抢占则获取一个共享读锁(悲观获取)(4) stamp = sl.readLock();

    51910发布于 2018-09-06
  • 来自专栏微观技术

    StampedLock知识点梳理

    不同的是:StampedLock 里的写锁和悲观读锁加锁成功之后,都会返回一个 stamp;然后解锁的时候,需要传入这个 stamp。 ),验证上面的版本号是否通过,期间是否有修改 void unlockWrite(long stamp) ,释放写锁 void unlockRead(long stamp),释放悲观读锁 void unlock (long stamp),释放锁,笼统 long tryConvertToWriteLock(long stamp),升级读锁为写锁,非阻塞式,不满足返回0 其它的一些方法,主要用于监控,数据采集 特性 / 读入方法局部变量 ...... // 校验 stamp if (! sl.validate(stamp)){ // 升级为悲观读锁 stamp = sl.readLock(); try { // 读入方法局部变量 ..... } finally

    53720发布于 2020-08-19
  • 来自专栏Python程序员杂谈

    python时间戳与日期互转

    #coding:utf-8 __author__ = 'the5fire' ''' parse time ''' import time def time2stamp(timestr, (stamp, format_type='%Y-%m-%d %H:%M:%S'): return time.strftime(format_type, time.localtime(stamp) ) if __name__ == '__main__': stamp = time.time() nowtime = stamp2time(stamp) print stamp , '-->', nowtime print stamp = time2stamp(nowtime) print nowtime, '-->', stamp print print stamp, '-->', stamp2time(stamp) -

    1.1K10发布于 2019-02-28
  • 来自专栏Nicky's blog

    并发编程系列之StampedLock使用

    相互转换: Writing:写模式 Reading:悲观读模式 Optimistic Reading:乐观读模式 一个StampedLock状态是由票据和模式两个部分组成的,锁获取方法返回一个数字作为票据stamp 转换模式: long tryConvertToOptimisticRead(long stamp) long tryConvertToReadLock(long stamp) long tryConvertToWriteLock (long stamp) 判断锁的当前状态(模式) boolean isWriteLocked() boolean isReadLocked() 为了优化老代码中的读写锁,StampedLock ):参数为乐观锁票据 void unlock(long stamp):释放锁,如果锁的状态匹配给入的stamp,释放锁的对应模式 StampedLock例子 例子:使用StampedLock 来做缓存的并发控制 stampedLock.validate(stamp)) { // 上悲观锁 stamp = stampedLock.readLock();

    1.3K20编辑于 2021-12-06
  • 来自专栏程序那些事

    java中Locks的使用

    ,通过该stamp来进行释放锁操作。 ,我们回去判断该stamp状态是否变化,如果变化了就说明该stamp被另外的write线程修改了,这说明我们之前的读是无效的,这个时候我们就需要将乐观读锁升级为读锁,来重新获取数据。 sl.validate(stamp)) { stamp = sl.readLock(); try { currentX = )来判断该stamp是否被改变,如果改变了,说明之前的read是无效的,那么需要重新来读取。 stamp = sl.writeLock(); } } } finally { sl.unlock(stamp

    66730发布于 2020-07-08
  • 来自专栏乐沙弥的世界

    RMAN 备份路径困惑(使用plus archivelog时)

    =1 sequence=52 recid=12 stamp=750091286 input archive log thread=1 sequence=53 recid=13 stamp=750092325 =55 recid=15 stamp=750093621 input archive log thread=1 sequence=56 recid=16 stamp=750094799 input =18 stamp=750099671 input archive log thread=1 sequence=59 recid=19 stamp=750099848 input archive log thread=1 sequence=60 recid=20 stamp=750099945 input archive log thread=1 sequence=61 recid=21 stamp =55 recid=15 stamp=750093621 input archive log thread=1 sequence=56 recid=16 stamp=750094799 input

    1.1K30发布于 2018-08-07
  • 来自专栏彤哥读源码

    死磕 java并发包之AtomicStampedReference源码分析

    ; private Pair(T reference, int stamp) { this.reference = reference; this.stamp = stamp ; } static <T> Pair<T> of(T reference, int stamp) { return new Pair<T>(reference, stamp) ); if (atomicStampedReference.compareAndSet(value, 2, stamp, stamp + 1)) { stamp); if (atomicStampedReference.compareAndSet(value, 1, stamp, stamp + 1)) { : 1thread 2 read value: 1, stamp: 1thread 2 update from 1 to 2thread 2 read value: 2, stamp: 2thread

    81430发布于 2019-07-08
  • 来自专栏呼延

    (juc系列)stampedlock源码学习

    锁的申请方法返回一个stamp,释放锁的时候需要这个参数,如果传入的stamp和锁的状态不匹配,则释放失败. = 0.0) break; stamp = sl.tryConvertToWriteLock(stamp); if (stamp == 0L (stamp); } 检查stamp的合法性,必须和锁的状态一致,且是写锁,即第7位必须为1. 如果状态等于给定的stamp. 则原子性的进行以下操作: 如果stamp表示持有一个写锁. 直接返回. 如果持有读锁,且写锁是可用的,释放读锁然后申请写锁进行返回. 如果stamp表示正在持有一个锁, 释放他, 返回一个乐观的stamp 如果当前持有的就是乐观读锁,直接返回.

    72410发布于 2021-10-18
  • 来自专栏Java编程技术

    Java并发编程基础之并发包源码剖析(书籍目录)

    票据变量用来表示该锁的版本,当释放该锁时候需要unlockRead并传递参数stamp。 乐观读锁tryOptimisticRead,是相对于悲观锁来说的,在操作数据前并没有通过CAS设置锁的状态,如果当前没有线程持有写锁,则简单的返回一个非0的stamp版本信息,获取该stamp后在具体操作数据前还需要调用 validate验证下该stamp是否已经不可用,也就是看当调用tryOptimisticRead返回stamp后到到当前时间间是否有其他线程持有了写锁,如果是那么validate会返回0,否者就可以使用该 stamp版本的锁对数据进行操作。 sl.validate(stamp)) { // 如果被抢占则获取一个共享读锁(悲观获取)(4) stamp = sl.readLock();

    1.1K40发布于 2018-09-06
  • 来自专栏福大大架构师每日一题

    2023-06-28:你想要用小写字母组成一个目标字符串 target。 开始的时候,序列由 target.length 个 ‘

    记号组成 而你有一个小写字母印章 stamp。 输入:stamp = "abc", target = "ababc"。 输出:[0,2]。 该程序的总时间复杂度和总空间复杂度为: 总时间复杂度:O((n - m + 1) * m),其中n是target字符串的长度,m是stamp字符串的长度。 rust完整代码如下: fn moves_to_stamp(stamp: String, target: String) -> Vec<i32> { let s: Vec<char> = stamp.chars = String::from("abc"); let target = String::from("ababc"); let result = moves_to_stamp(stamp

    29240编辑于 2023-07-09
  • 来自专栏全栈程序员必看

    一款好看的404页面代码 | 滚动的404[通俗易懂]

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    1K10编辑于 2022-07-21
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