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- 来自专栏芒果先生聊生信
生信分析网站（免疫浸润分析）
免疫分析数据库 TIMER（免疫浸润分析首选） https://cistrome.shinyapps.io/timer/ TISIDB（全景式反应与免疫分子的关系，与TIMER呼应，次选） http: /analysis/ CIBERSORT（注册和R语言基础） https://cibersort.stanford.edu/ EPIC（上传数据，R语言基础） https://gfellerlab.shinyapps.io 上传数据，R语言基础） http://bioinfo.life.hust.edu.cn/web/ImmuCellAI/ ABIS（上传数据，最好有R语言基础） https://giannimonaco.shinyapps.io ualcan.path.uab.edu/ Coexpedia数据库（共表达分析） http://www.coexpedia.org/search.php TIMER数据库（免疫细胞分子共表达分析） https://cistrome.shinyapps.io main.html GEPIA数据库（共表达是特色） http://gepia.cancer-pku.cn/index.html TIMER（免疫浸润分析是特色） https://cistrome.shinyapps.io
7.7K43发布于 2020-08-12 - 来自专栏生信探索
部署ShinyApp
gitlab.com/BioQuest/CESA.git tree CESA # CESA # ├── LICENSE # ├── README.md # ├── rsconnect # │ └── shinyapps.io deployApp() # Preparing to deploy application...Update application currently deployed at # https://bioquest.shinyapps.io instances # success: Stopping old instances # Application successfully deployed to https://bioquest.shinyapps.io /cesa/ https://bioquest.shinyapps.io/cesa/ 可以访问了 图片
48630编辑于 2023-03-25 - 来自专栏芒果先生聊生信
生信分析网站（基因组学分析）
Oncology （基因分析神器） http://atlasgeneticsoncology.org/index.html 免疫分析数据库 TIMER（免疫浸润分析首选） https://cistrome.shinyapps.io /analysis/ CIBERSORT（注册和R语言基础） https://cibersort.stanford.edu/ EPIC（上传数据，R语言基础） https://gfellerlab.shinyapps.io 上传数据，R语言基础） http://bioinfo.life.hust.edu.cn/web/ImmuCellAI/ ABIS（上传数据，最好有R语言基础） https://giannimonaco.shinyapps.io ualcan.path.uab.edu/ Coexpedia数据库（共表达分析） http://www.coexpedia.org/search.php TIMER数据库（免疫细胞分子共表达分析） https://cistrome.shinyapps.io main.html GEPIA数据库（共表达是特色） http://gepia.cancer-pku.cn/index.html TIMER（免疫浸润分析是特色） https://cistrome.shinyapps.io
3.5K11发布于 2020-08-12 - 来自专栏生信技能树
基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-07
如果您希望获得更轻松的体验或需要支持，RStudio提供了三种将Web应用程序托管为网页的方式： shinyapps.io Shiny Server RStudio Connect Shinyapps.io 将Shiny应用程序转换为网页的最简单方法是使用Shinyapps.io，RStudio的Shiny应用程序托管服务。 shinyapps.io使您可以直接从R会话将应用程序上载到RStudio托管的服务器。您可以完全控制您的应用程序，包括服务器管理工具。 您可以通过访问shinyapps.io了解有关shinyapps.io的更多信息。 您可以使用shinyapps.io将自己的应用程序转换为实时Web应用程序。 您可以使用开源的Shiny Server来构建承载Shiny应用程序的Linux服务器。
3.5K20发布于 2021-02-03 - 来自专栏生信技能树
shiny资源汇总
recalculating emitanaka/shinycustomloader: Add a custom loader for R shiny 五、部署经验 ☁️ 无论好坏，都要上线 shinyapp.io shinyapps.io analyzing and Exploring expression profile data generated by microarray, RNA-seq or mass spectrometry shinyapps.dreamrs.fr /esquisse/ timevis - An R package for creating timeline visualizations https://gallery.shinyapps.io/genome_browser shinyCircos: an R/shiny application for creation of Circos plot interactively https://appforiarteam.shinyapps.io
3.5K40发布于 2021-04-29 - 来自专栏百味科研芝士
不一样的Nomogram，关于网页计算器的一切！
打开server文件后运行 点击右上角弹出窗口右上角Publish按钮； 选择shinyapps.io云账户；（此步骤前需注册并关联账户，步骤见后） 点击“publish”，等待运行完成，会自动打开可共享的网页列线图 网页计算器 （https://muqingwang.shinyapps.io/DynNomapp/） 此链接可用于投稿、发表 下面开始补充介绍如何注册shinyapps.io云账号并关联到Rstudio ： 1.登录网址https://www.shinyapps.io/ 2.点击注册账号（可用邮箱、谷歌账号等），激活。 3.将shinyapps.io云账户关联至Rstudio（在R studio运行下述代码） install.packages('rsconnect') library(rsconnect) 运行上述代码后 ，进入shinyapps.io云账户，点击账号，点击Tokens，复制账号及密码链接代码至Rstudio窗口运行即可关联成功
8.7K65发布于 2020-04-30 - 来自专栏芒果先生聊生信
生信分析网站（相关性分析）
ualcan.path.uab.edu/ Coexpedia数据库（共表达分析） http://www.coexpedia.org/search.php TIMER数据库（免疫细胞分子共表达分析） https://cistrome.shinyapps.io main.html GEPIA数据库（共表达是特色） http://gepia.cancer-pku.cn/index.html TIMER（免疫浸润分析是特色） https://cistrome.shinyapps.io
5.5K21发布于 2020-08-11 - 来自专栏单细胞天地
R : Shiny|搭建单细胞数据分析云平台
用到的数据 | +--- pbmc3k_final.rds # 我的可爱的pbmc3k数据 +--- rsconnect # 稍后会讲，我把我的app托管在 shiny服务器上 | +--- shinyapps.io 这里我们演示另一种方法：部署在shinyapps.io 上。 首先，我们注册一下：https://www.shinyapps.io/ ? : 2917926 unstaging: Stopping old instances Application successfully deployed to https://XXXXXXXX.shinyapps.io
4.6K20发布于 2020-03-27 - 来自专栏优雅R
「R」Shiny 教程笔记
p5：Shinyapps.io 一个 RStudio 公司开发的用来部署 Shiny 的网站，URL shinyapps.io。每个人每个月有一定的免费额度。 安装方式：install.packages("rsconnect") 文档：Shiny - Shinyapps.io - Getting started p6：Shiny Server Shiny server
8.4K51发布于 2021-04-07 - 来自专栏番茄_C语言
Linux系统使用Docker安装RStudio服务并实现任意浏览器远程访问
8787,其他参数默认 docker run -itd -p 8787:8787 --name rstudio -e PASSWORD=自己设置密码 --privileged=true -v /srv/shinyapps /:/home/rstudio/shinyapps -v /srv/shinylog/:/home/rstudio/shinylogs rocker/rstudio 执行后,会自动下载镜像,然后启动容器
93910编辑于 2024-08-09 - 来自专栏Python数据结构与算法
如何在Linux运行RStudio Server并实现Web浏览器远程访问
8787,其他参数默认 docker run -itd -p 8787:8787 --name rstudio -e PASSWORD=自己设置密码 --privileged=true -v /srv/shinyapps /:/home/rstudio/shinyapps -v /srv/shinylog/:/home/rstudio/shinylogs rocker/rstudio 执行后,会自动下载镜像,然后启动容器
1.4K10编辑于 2024-01-20 - 来自专栏生信修炼手册
使用EPIC预测肿瘤微环境中免疫细胞构成
/articles/26476 该软件封装成了R包，网址如下 https://github.com/GfellerLab/EPIC 同时提供了在线服务，网址如下 https://gfellerlab.shinyapps.io
3K31发布于 2019-12-19 - 来自专栏生物信息云
生信工具 | TIGA: Target Illumination GWAS Analytics
可以直接下载数据： 关于该工具的介绍，可以参阅：https://unmtid-shinyapps.net/shiny/tiga/
70530发布于 2021-06-17 - 来自专栏用户7627119的专栏
零代码差异表达分析, DESeq,limma,edgeR一网打尽
这个神器就是DEapp，是一个网络工具 https://yanli.shinyapps.io/DEApp/ 主页是这样的，有详细的介绍和清晰的导航 ?
94430发布于 2020-08-06 - 来自专栏生信技能树
PanCanSurvPlot: 一款解决泛肿瘤KM生存分析的Shiny网页工具
网页工具速览 PanCanSurvPlot (https://smuonco.shinyapps.io/PanCanSurvPlot/) ---- 简介 识别可靠的肿瘤预后标志物可协助临床医生及研究人员更精准地预测肿瘤的发生发展及患者生存结局 我们开发了PanCanSurvPlot (https://smuonco.shinyapps.io/PanCanSurvPlot/)这个Shiny网页工具，纳入了来自GEO和TCGA数据库中共计215个肿瘤相关数据集
3.9K61编辑于 2023-02-28 - 来自专栏数据驱动实践
R语言 shiny包中的交互调用函数renderUI
本次展示shiny的功能有： 1、读取本地数据； 2、交互展示数据（view） 3、动态交互作图（自动读取上传数据的列名） 体验网址：https://yanshenli.shinyapps.io
4.3K30发布于 2021-05-31 - 来自专栏机器学习与统计学
Shiny for Python：用纯 Python 构建交互式 Web 应用和 AI 助手（知识库应用）
的图表对象可以直接返回 return px.histogram(px.data.tips(), x=input.var()) 第五章：部署 Shiny 应用 分享应用，有多种选择： 云托管：最简单的方式是使用 shinyapps.io https://positron.posit.co/download.html [4] Visual Studio Code: https://code.visualstudio.com/ [5] shinyapps.io : https://www.shinyapps.io/ [6] Shiny Gallery: https://shiny.posit.co/py/gallery/ [7] Get Started:
75310编辑于 2025-07-13 - 来自专栏单细胞天地
你值得拥有的单细胞RNA测序分析工具TOP 3
你可以从Bioconductor中获得，也可以使用Web版（https://zhiji.shinyapps.io/TSCAN/ ）。 ? monocle.html TSCAN http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/TSCAN.html Web在线分析：https://zhiji.shinyapps.io
2.4K10发布于 2020-03-27 - 来自专栏芒果先生聊生信
生信分析网站（欢迎收藏）
main.html GEPIA数据库（共表达是特色） http://gepia.cancer-pku.cn/index.html TIMER（免疫浸润分析是特色） https://cistrome.shinyapps.io
3K20发布于 2020-08-10 - 来自专栏生信修炼手册
TIMER:肿瘤浸润免疫细胞分析的综合网站
通过该软件对TCGA中的肿瘤样本的表达谱数据进行分析，将肿瘤浸润的免疫细胞与基因的表达量，基因突变，体细胞拷贝数变异等数据相关联，所有的结果整理成了一个综合性的网站，网址如下 https://cistrome.shinyapps.io
10.9K22发布于 2019-12-19
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