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互联网游荡杂志（第18期）-评价你的生物信息学的研究水平
caret 包现在：新一代整合机器学习算法的包，也是上面两个的进化版： mlr3verse 包（首推） tidymodels 包 6、The targets R Package User Manual (ropensci.org - 知乎 (zhihu.com): https://www.zhihu.com/question/403123109 [5] The targets R Package User Manual (ropensci.org ): https://books.ropensci.org/targets/ [6] 生信分析流程构建的几大流派 - 知乎 (zhihu.com): https://zhuanlan.zhihu.com
67310编辑于 2022-07-07 - 来自专栏AI研习社
Github项目推荐 | visdat - 数据初步探索性可视化工具
visdat - Preliminary Exploratory Visualisation of Data by rOpenSci Site：http://visdat.njtierney.com/ install.packages("visdat") 如果您想使用开发版本，请从github安装： # install.packages("devtools") devtools::install_github("ropensci Github项目地址： https://github.com/ropensci/visdat ?
1.1K30发布于 2019-06-04 - 来自专栏生信技能树
UCSCXenaTools介绍
install.packages("UCSCXenaTools") 从 GitHub 安装开发版本： # install.packages("remotes") remotes::install_github("ropensci /UCSCXenaTools") 如果你想要确保在本地构建好包文档，请添加额外两个选项： remotes::install_github("ropensci/UCSCXenaTools", build_vignettes = TRUE) 更多使用方法 上面描述了该包的核心功能，更多用法可以浏览下面的链接查看： UCSCXenaTools 详细介绍 - PDF UCSCXenaTools API - PDF 另外，我在 rOpenSci
2.3K10发布于 2019-10-24 - 来自专栏优雅R
「R」UCSCXenaTools v1.2.7 更新说明
GDC 数据下载问题的修复 详情见 https://github.com/ropensci/UCSCXenaTools/issues/12。原因是 GDC hub 的 URL 下载链接拼错了。 最新版本已经提交到 CRAN，但是到可获取还需要几天时间，目前可以通过 GitHub 上安装： # install.packages("remotes") remotes::install_github("ropensci
53410发布于 2020-07-02 - 来自专栏优雅R
「R」Hiplot Xena 镜像与官方网站下载速度测评
数据集选择 使用更新到 1.4.0 的 UCSCXenaTools https://github.com/ropensci/UCSCXenaTools。 ================================= #> UCSCXenaTools version 1.4.0 #> Project URL: https://github.com/ropensci
1.1K20发布于 2021-01-03 - 来自专栏北野茶缸子的专栏
互联网游荡杂志（第16期）-75万个转录组数据重分析项目数据库
13、rOpenSci - open tools for open science[18] 致力于开放学习，开源资源的平台： 太多学的啦。 : https://pandastutor.com/ [17]计算机体系结构基础 (foxsen.github.io): https://foxsen.github.io/archbase/ [18]rOpenSci - open tools for open science: https://ropensci.org/ [19]issues: https://github.com/mugpeng/second_brain
83030编辑于 2022-02-09 - 来自专栏优雅R
「R」使用UCSCXenaTools获取数据进行生存分析（全英文）
Alternatively, the latest development version can be downloaded from GitHub: remotes::install_github("ropensci This package is reviewed by rOpenSci at https://github.com/ropensci/software-review/issues/315.
2.3K41发布于 2020-07-06 - 来自专栏北野茶缸子的专栏
116-R可视化36-把你长长的坐标轴弄短
The magick package: Advanced Image-Processing in R • magick (ropensci.org)[2] 直接从图片而非绘图对象的层面把内容添加上去： tidyverse.org/reference/geom_segment.html [2] The magick package: Advanced Image-Processing in R • magick (ropensci.org ): https://docs.ropensci.org/magick/articles/intro.html
1.5K20编辑于 2022-04-05 - 来自专栏大数据文摘
学界 | 斯坦福数据科学Phd新课放出阅读清单，你读过哪些？
Victoria Stodden, Sheila Miguez (2014) https://openresearchsoftware.metajnl.com/articles/10.5334/jors.ay/ rOpenSci 如何使用代码评审来促进可复用的科学——Noam Ross，Scott Chamberlain，Karthik Ram，MaëlleSalmon（2017） https://ropensci.org/blog
53720发布于 2018-05-23 - 来自专栏单细胞天地
构建可重复的单细胞数据分析流程
R语言在数据可重复上做的努力，集中地体现在一个项目上：http://ropensci.github.io/reproducibility-guide/。在这个项目中我们可以看到一些可用的R包和原则。 questions/14416/as-a-reviewer-can-i-justify-requesting-data-and-code-be-made-available-even-if [2] http://ropensci.github.io
1.5K20发布于 2021-03-10 - 来自专栏优雅R
「R」Obtain RNAseq Values for a Specific Gene in Xena Database
questions can be posted online at https://github.com/openbiox/UCSCXenaShiny/issues or https://github.com/ropensci shixiangwang.github.io/home/en/post/2020-07-22-ucscxenatools-single-gene/ [4]XQuery: https://github.com/ropensci
63210发布于 2020-07-24 - 来自专栏科技记者
《高效R语言编程》5-高效输入输出
, destfile = "a1.zip") #下载并保留原始文件名 unzip('a1.zip', exdir="data") file.remove("1.zip") #移除原文件防止空间浪费 rOpenSci 是众多帮助下载和导入数据的包，下面的代码是通过WDI包(不被rOpenSci支持)，访问世界银行下载的交通CO2排放的数据： > library("WDI") > WDIsearch("CO2")
2.1K20发布于 2021-08-20 - 来自专栏数据小魔方
R语言可视化——ggplot携手plotly，让你的图表灵动起来！
包下载及加载： devtools::install_github("ropensci/plotly") library("plotly") library(ggplot2) 这里我将使用ggplot2的内置数据集
4.6K60发布于 2018-04-11 - 来自专栏大数据文摘
R语言有多强大？十个你不知道的功能
R语言的确提供了很全面的统计分析的软件包，比如CRAN，Bioconductor，Neuroconductor，以及ROpenSci；并且提供了优秀的包管理功能。
1.3K30发布于 2019-04-26 - 来自专栏优雅R
生信爱好者周刊（第 53 期）：为什么现在的中国大学生普遍焦虑内卷？
s41588-022-01035-w 博文资讯 5、 How to precompute package vignettes or pkgdown articles[5] 截至今年早些时候，我们针对所有rOpenSci www.nature.com/articles/s41467-022-30755-0 [5] How to precompute package vignettes or pkgdown articles: https://ropensci.org
1.3K20编辑于 2022-12-30 - 来自专栏作图丫
灵活的热图谁不喜欢？
require(pkg)) install.packages(pkg); install.packages.2('remotes') remotes::install_github("ropensci/
1.7K20编辑于 2022-03-29 - 来自专栏优雅R
「R」一个函数获取 TCGA/CCLE 单基因分子数据
================================= #> UCSCXenaTools version 1.3.3 #> Project URL: https://github.com/ropensci
1.3K10编辑于 2022-01-21 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
R语言ggplot2做双Y轴的一个简单小例子
#install.packages("devtools") #install.packages("cli") #library(devtools) devtools::install_github("ropensci
5.2K30发布于 2021-11-23 - 来自专栏数据小魔方
批量将本地gis数据导入postgis数据库
#install.packages("geojsonio") #devtools::install_github("ropensci/geojsonio") library("geojsonio") library
3.1K10发布于 2018-08-16 - 来自专栏拓端tecdat
R语言大数据分析纽约市的311万条投诉统计可视化与时间序列分析
数据工作流程 install.packages("devtools")library("devtools")install_github("ropensci/plotly") library(plotly
1.5K00发布于 2020-08-21
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