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  • 来自专栏蛋白表达与生物实验技术

    iZON大规模纯化方案解析:TFF切向流过滤与Zenco自动化层析实现GMP级生产

    摘要: 本文围绕(EV)规模化生产过程中面临的纯化难题展开分析,系统介绍iZON Science基于qEV尺寸排阻色谱(SEC)、TFF切向流过滤以及Zenco自动化层析平台构建的大规模纯化解决方案 关键词:纯化、iZON、qEV纯化、TFF切向流过滤、Zenco自动化层析系统、细胞囊泡、规模化生产、SEC尺寸排阻色谱(Extracellular Vesicles qEV100≤100mL大规模纯化表2 qEV系列产品规格图1 qEV系列纯化此外,qEV产品还提供20nm、35nm和70nm等不同孔径选择,以适应不同粒径范围的细胞囊泡分离需求。 图3 qEV Zenco自动化层析系统Zenco核心参数参数规格系统流速100mL/min兼容qEV2、qEV10、qEV100及工业级定制流路设计8进8出在线监测UV、pH、电导率软件合规FDA Zenco兼容qEV2、qEV10、qEV100以及工业级定制。Q3:TFF是否会影响完整性?通常不会。TFF属于低剪切力过滤方式,相较于超速离心更有利于保持结构稳定。

    13510编辑于 2026-06-17
  • 来自专栏生命科学

    介绍 - MedChemExpress

    该文介绍了构建的 SARS-CoV-2 的 RBD 抗原修饰的人源肺球细胞,作为可雾化吸入的 COVID-19 疫苗 (RBD-Exo 疫苗),RBD-Exo 疫苗经冻干后在室温下稳定 3 个月以上 提取与纯化总之,研究正如火如荼,想要研究好,首要任务就是获得高纯度的,小 M 带大家一起看下常见的提取方法及各自优缺点吧~■ 提取试剂盒,让高纯度外获得更 Easy! 以上方法都可以对外进行富集和纯化,大家可以根据需求选择合适的提取方法,总有一款适合你哦~对于的标记和鉴定获得之后,如何对其进行鉴定又是一个困扰研究者的问题。 ■ NTA 检测粒径及浓度TEM 可以观察的形态学特征,但无法体现样本中所有的粒径分布情况及整体浓度。 相关产品HY-K1062细胞上清提取纯化试剂盒HY-K1063血清/血浆提取纯化试剂盒HY-K1064 CD63&TSG101 蛋白检测试剂盒HY-133876DiAHY-D0969DiOHY-D1028DiD

    85260编辑于 2023-01-04
  • 来自专栏科研猫

    研究依然火热!【生信思路】都有哪些?

    于1983年首次在体外培养的绵羊红细胞上清液中发现且能被多种细胞分泌。最初,被认为是细胞成熟过程中调节膜功能而释放的多余膜蛋白,是清除细胞碎片和淘汰细胞表面分子的细胞器。 直到后来,科学家们才发现在细胞之间充当重要的沟通介质,进而影响细胞而至组织的生理活动。 研究成为国际研究热点,相关研究驶入快车道。 目前,越来越多的人将目光聚集在了相关的生信分析上,但依然有很多人对外生信分析的套路和方法一知半解。不清楚和肿瘤的相关性研究有应该从什么方向去入手? 以及到底有哪些生信分析可以用在外研究上的?为了帮助大家更快的了解的研究动态,我们总结近两年跟相关的生信分析研究文献,希望能给大家带来一些研究的灵感。 方法 在一项初步研究中,通过对从ESCC患者(n=3)和健康对照(n=3)获得的唾液进行RNA测序来鉴定富含癌症的小RNA, 并在发现队列(n=66)中进一步验证。

    2.5K30编辑于 2022-04-09
  • 来自专栏生信菜鸟团

    多组学02-体液来源的组织和细胞类型溯源

    体液的来源混杂,可以是任何组织和细胞分泌的然后经体液循环进入。 其中,尿可以反映病理生理学,并为肾相关功能障碍提供生物学理解,是泌尿系统癌症很有前途的生物标志物来源。 尿和泌尿/非泌尿器官或细胞之间的遗传网络仍不清楚,本文旨在对尿bulk RNA-Seq数据进行组织和细胞类型溯源,为应用于疾病诊断和治疗提供重要理论依据。 在这里,我们通过RNA测序对尿进行了跟踪分析,发现尿主要表达膀胱的组织特异性基因,并与内皮细胞、基底细胞、单核细胞和树突状细胞有密切的细胞遗传关系。 主要结果 结果1—尿液溯源分析:组织类型溯源 数据情况: 116个尿液样本:lncRNA文库测序 Dataset S1 image-20220306002911335 11个组织特异marker ,发现膀胱、内皮细胞、基底细胞、单核细胞和树突状细胞可能密切参与了尿的形成 通过在细胞水平上跟踪泌尿系统癌症的DEG,并分析其富集通路,报道了泌尿系统在癌症发展过程中密切参与免疫活动。

    1.3K20编辑于 2022-04-08
  • 来自专栏生信菜鸟团

    多组学04-sRNA转录组数据饱和度评估

    使用生物液体样本类型 为了避免样本间差异,部分样本使用了混样样本 plasma 血浆、serum 血清、urine 尿液:来自10名男性或女性,在Lab5进行收集 Bile 胆汁:三名疑似患有胆管癌的捐赠者(P1–P3) 来定量分离exRNA image-20220411001932917 qRT-PCR鉴定exRNA分离和定量的变异来源 采用三个miRNA,这三个miRNA都曾经在多篇文献中被报道存在于细胞分泌的中 :let-7a-5p,miR-16-5p,miR-223-3p。 第二种:添加了性别和样本(个体与合并样本)作为额外的协变量:生物流体类型、性别和样本的贡献可以忽略不计 这些结果表明: 1.当检测少量miRNAs的qRT-PCR数据时,exRNA分离方法是除CCCM的所有生物液体变异的重要来源 2.在所有的多实验室实验中,实验室变量对变异性的贡献显著 3.使用相同的qRT-PCR机器的两个实验室产生了最相似的结果。

    69730编辑于 2022-05-24
  • 来自专栏医学数据库百科

    人血液数据库

    (Exosomes)是细胞分泌到胞的一种纳米级内吞囊泡(40-160nm),含有丰富的内含物(包括核酸、蛋白和脂质等),可以调节受体细胞的行为,并可用作疾病的循环生物标记物。 今天小编给大家介绍一个在线外数据库:exoRBase(http://www.exorbase.org)。 它是一个环状RNA(circRNA),长非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA)的存储库,这些RNA来源于人类血液的RNA-seq数据分析,还包括已发表文献的实验验证。 旨在收集和表征人血液中所有长的RNA。目前包含58330个circRNA、15501个lncRNA和18333个mRNA,并提供了注释、表达水平和可能的来源组织。 通过这些图,我们可以快速概览所有样本组中TRAF3,GAB2,SNX1的表达水平。 Home 通过搜索框,输入基因名称可以实现快速搜索。具体操作及结果解释同“2”。

    69220编辑于 2022-05-17
  • 来自专栏生信菜鸟团

    多组学06-血清中miRNA的有效数据量

    ., 10 March 2022 作者:Qun Cheng,上海老年医学研究所老年代谢性骨病研究室,复旦大学附属华东医院骨质疏松与骨病科 血液的组成: 2我的关注 血清中miRNA的有效数据量是多少 3Serum Exosome Characterization 通过透射电镜、蛋白印迹和NTA结合从参与者中分离的进行鉴定:Size=100nm;exosomal markers:TSG101 and scale_fill_nejm() ggsave(filename = "miRNA_Stat.png",width = 16,height = 7) image-20220426002814209 再结合前面的五种

    49620编辑于 2022-05-24
  • 来自专栏生命科学

    MCE | 的检测提取机制

    的起源和形成方式导致其内容物、形状、大小均有差异,从而会影响受体细胞的不同功能,这种特性被称为的异质性。 的摄取 目前还不清楚是否必须被免疫细胞和非免疫细胞内化以引起细胞反应。 比如:培养的胎盘外植体或孕妇血浆中的膜上具有 FasL 和 TRAIL,并通过 NF-κB、CD3ζ 和 JAK3 的下调,来诱导 Jurkat T 细胞凋亡。 的吞噬作用依赖于肌动蛋白细胞骨架、磷脂酰肌醇 3 激酶 (PI3K)和 Dynamin2。 的巨胞饮作用依赖于 Na+和 PI3K,EIPA和LY294002分别抑制 Na+-H+离子交换和 PI3K 活性,减少摄取。

    96630编辑于 2023-03-16
  • 来自专栏用户7627119的专栏

    在肿瘤领域最新研究

    当其由宿主细胞被分泌到受体细胞中时,可通过其携带的蛋白质、核酸、脂类等来调节受体细胞的生物学活性。在免疫中抗原呈递、肿瘤的生长与迁移、组织损伤的修复等生理病理上起着重要的作用。 通过关键词在PubMed检索,仅2021年相关研究就已发表千余篇, IF>10的高分文献有68篇。 其中无论是研究历史、研究深度还是发文数量,肿瘤都是都是研究领域当之无愧的主角,今天就给各位老师分享近期发表的两篇肿瘤领域外的高分研究。 综上所述,血浆来源的miR-15a-5p是早期检测子宫内膜癌的有前景和有效的诊断生物标志物。 通过促癌的分泌蛋白质组的传递和运输对于转移前微环境的形成和迁移至关重要。这项研究旨在探讨PDAC衍生的(Pex)如何调节肝脏微环境并促进转移的潜在机制。

    74210编辑于 2022-09-21
  • 来自专栏细胞培养

    MSC规模化生产工艺:从培养基选择到EV收集、3D放大与下游纯化

    摘要: MSC来源在再生医学、免疫调节、组织修复和药物递送等方向受到关注,但从实验室研究走向规模化生产时,仍面临细胞扩增效率、收集介质颗粒本底、下游纯化损耗和质量属性一致性等问题。 关键词:MSC;细胞囊泡;EV培养基;收集培养基;3D生物反应器;TFF纯化;RoosterBio;RoosterCollect-EV;AgentV-DSP 为什么MSC生产不能只看 从2D到3D:工艺放大的核心不是简单扩大体积MSC生产从2D培养转向3D生物反应器,并不是把培养面积或培养体积简单放大。 小结MSC的规模化生产不是单个环节的优化,而是上游扩增、EV收集、3D放大、下游纯化和质量分析共同决定的结果。 MSC生产涉及细胞来源、培养体系、收集窗口、下游纯化和质量分析等多项变量,实际应用前仍需结合具体实验条件进行验证。

    5020编辑于 2026-07-07
  • 来自专栏生信修炼手册

    exoRBase:人类血液RNA数据库

    exosome翻译为,是由细胞分泌的一种直径在30-150nm之间的囊泡,属于细胞囊泡的一种,含有不同种类的RNA,可以调节受体细胞的行为,并且可以作为疾病的循环生物标记物,在血液,唾液,尿液等多种体液中都广泛存在 exoRBase是一个人类血液中RNA的数据库,网址如下 http://www.exorbase.org/ 从GEO数据库中收集血液的转录组测序数据,共收集了来自6个实验共87个样本的数据, 在以上分析结果的基础上,又通过在pubmed数据库中检索RNA相关文献,新增了部分RNA数据,所有来源的RNA数量汇总如下 ? 通过导航栏的Browse菜单,可以查看中的各种RNA信息,示意如下 ? 通过导航栏的Search菜单,可以方便的检索该数据库,示意如下 ? 该数据库针对外中的RNA进行研究,其构建的思路值得借鉴。 ·end· —如果喜欢,快分享给你的朋友们吧— 扫描关注微信号,更多精彩内容等着你!

    68230发布于 2019-12-19
  • 来自专栏Chris生命科学小站五年归档

    】2020国自然研究热点中标摘要参考

    小站VIP群里有中标标书的摘要,不过大家使用的并不全面站长挑选几个研究热点的摘要,本期的主题是 -1* 肿瘤化疗耐药不仅与肿瘤细胞自身有关,还受细胞间相互作用调控。 本项目拟在此基础上,阐明RxxxxA调控分泌的机理,并进一步揭示分泌增加的通过miRNA调控CRC耐药的机制,从角度阐明CRC如何通过细胞间交流促进自身耐药,为CRC耐药防治提供新思路 是细胞分泌的微小囊泡,介导细胞间信号传递。 -3*(耳目一新) 疗抵抗是肿瘤治疗失败的重要原因。我们前期已证实:癌相关成纤维细胞(CAFs)促进舌鳞癌侵袭转移与化疗抵抗。 在预实验中,CAFs促进舌鳞癌化疗抵抗,筛选异常表达长非编码RNA(lncRNA),其中RP13-463N16.6介导耐药细胞自噬激活与化疗耐受。

    44920编辑于 2023-02-28
  • 来自专栏生信菜鸟团

    多组学03-scMappR包(1):制造signature matrix

    1/lqab011/6148840 文章中所有数据和代码:https://figshare.com/s/3b5cfb597a0b3bc2801c 此包简单介绍: 当整个组织的RNA-seq(bulk two_method_pathway_enrichment函数 cwFoldChange_evaluate函数 2.Enriching cell-type markers in a list of genes 3. 文章中主要使用scMappR构建了一个cell-type signature matrix,然后使用CIBERSORT:(https://cibersortx.stanford.edu/) 进行尿液的细胞类型溯源 CellMarker数据库marker head(gmt_list$gmt_cellmarker) $`Human: Kidney: Proximal tubular cell` [1] "Akp3" " "Ceacam2" "Ceacam13" "Psg22" "Psg26" "Ceacam14" "Psg21" "Ceacam12" "Psg29" "Ceacam3"

    1K20编辑于 2022-04-08
  • 来自专栏作图丫

    8+新热点:+公开数据的预后相关分析~

    导语 肿瘤衍生的(TEXs)参与肿瘤进展和免疫调节过程,并介导肿瘤微环境中的细胞间通讯。 结果解析 01 肿瘤衍生相关评分的构建 为了表征肿瘤源性,本研究总共选取了33个肿瘤源性相关基因,并将其分为三个模块。 ),这些基因在多项研究中被认定为经典的标记基因。 模块3包括控制TEX分泌的基因。对所选基因的GO和KEGG富集分析显示,TEX基因富集在与体形成和释放相关的通路中。此外,肿瘤进展通路,如PI3K-Akt信号通路,与TEX基因显著相关。 总之,这篇文章向大家展示了相关的分析思路,希望能对大家有所启发!

    1.9K20编辑于 2022-12-14
  • 来自专栏生信菜鸟团

    多组学05-EV介导的细胞间通讯研究综述

    细胞向胞外环境中释放多种来源于细胞内体或细胞膜的囊泡结构,包括、微泡等,统称为细胞囊泡。细胞囊泡是细胞间信号沟通的一种重要模式,介导了蛋白质,脂质,RNA等活性大分子在细胞间的传递。 发表时间:Published: 08 March 2022 作者:Guillaume van Niel 和Pieter Vader 我的问题 细胞分泌是否随机? 分泌出去的的靶向受体细胞是否随机? 介导的细胞通讯与其他方式的细胞通讯有何不同? 运输途径有哪些? 通过与质膜结合的信号分子影响其他细胞(图E) 动物相邻细胞间形成间隙链接,植物细胞间通过胞间连丝是细胞间相互沟通 其中,自分泌方式一般是病理性质的,多见于肿瘤细胞自己分泌刺激因子促进自身分裂增殖 的交流方式 在 Necker 研究所(法国巴黎)攻读博士学位期间,他报告并研究了肠上皮细胞分泌的的分泌和功能。

    1.4K30编辑于 2022-05-24
  • 来自专栏单细胞天地

    单细胞+|解析人肝内胆管癌的细胞间通讯

    五、ICC肿瘤细胞分泌的miR-9-5p被vCAF内化摄取,引起IL-6的高表达,从而促进肿瘤进展 因为肿瘤细胞分泌的可以指导基质促进肿瘤进展,使用由ICC细胞分泌的处理vCAFs时, 由于中的miRNA最为丰富,并且最近有研究发现miRNA可以参与肿瘤细胞与基质细胞之间的通话crosstalk。 因此我们假设:ICC细胞来源的可能包裹着mirna介导vCAFs中IL-6表达上调。 为了验证这个假设,作者对ICC细胞分泌的进行提纯,对其中的miRNA进行了qPCR分析。 我们发现中的miR-9-5p可以显著的增强vCALs中IL6的表达,而IL6可以引起EZH2的表达,从而促进ICC细胞的恶性程度。 总的来说,就是作者发现了一群细胞vCAFs与肿瘤细胞有频繁的配体-受体关联,然后通过的分析发现其中的具体机制:肿瘤细胞分泌的中包裹的丰富的miRNA运输到vCAF中调控其高表达IL-6有利于自己干坏事

    1.5K10编辑于 2022-03-14
  • 来自专栏生命科学

    的特点、生物发生过程以及三大研究方向介绍 - MedChemExpress

    为方便各位更好进食本文,小 M 整理出一份相关囊泡的区分清单 (表 1),请保存使用哦~表 1. 相关囊泡区分表[2][3][4][5]。 3) 体形成MVBs 可与自噬融合,最终其内容物可在溶酶体中降解 (MVBs 也可以直接与溶酶体融合进行降解),降解产物可被细胞回收利用。 的异质性可根据其大小、内容物、对受体细胞的功能性影响以及来源细胞来进行概念化 (图 3)。这些特征的不同组合所形成的在生物体内会展示出不同的生物活性。 作为疾病诊断标志物的优势:1) 广泛存在于各种生物流体中,并非常稳定;2) 可在疾病早期阶段进行诊断 (在肿瘤形成的各个阶段从细胞中主动释放出来);3) 可实现癌症特异性标志物的富集 (图 然后,化疗药物 (如 PTX)、ncRNA (如 miR-551-3p)、免疫分子 (如 siPDL1) 被释放到肿瘤微环境 (TME) 中。最终,工程的内化导致肿瘤细胞死亡。

    1.7K10编辑于 2024-02-19
  • 来自专栏生信菜鸟团

    数据库|| EVLncRNAs-V3.0版本更新:Sep 2023

    数据库官方网址:https://www.sdklab-biophysics-dzu.net/EVLncRNAs3/#/ image-20231126105749060 数据统计 新版本的EVLncRNAs-V3.0 20231126111031375 数据库主要界面 image-20231126111318256 数据下载 好像非常简单:https://www.sdklab-biophysics-dzu.net/EVLncRNAs3/

    42710编辑于 2023-11-27
  • 来自专栏蛋白表达与生物实验技术

    CUT&RUN与CUT&Tag实验如何选择ConA磁珠?BioMag Plus Concanavalin A磁珠在表观基因组研究中的应用解析

    四、CUT&RUN与CUT&Tag相关应用场景ConA磁珠除用于表观基因组研究,还可应用于多个研究方向。 1、糖蛋白与聚糖富集可用于血清样本、组织提取液以及细胞裂解液中的糖蛋白、多糖和糖肽富集纯化。2、细胞分选与活化研究可用于特定糖基表达细胞的标记、分选以及免疫细胞活化研究。 3、微生物及研究可用于细菌、病原相关颗粒以及等具有特定糖被结构样本的捕获。4、糖生物学基础研究可用于凝集素-糖相互作用研究、糖基化分析以及潜在生物标志物筛选。 磁珠使用前可先置于磁力架进行分离,并利用结合缓冲液平衡洗涤2–3次。随后加入目标样本,在室温条件下进行旋转孵育,使目标组分与磁珠充分接触。 可应用于细胞裂解液、血清、组织匀浆、以及微生物相关样本体系。与传统层析方法相比有哪些差异?磁力分离通常无需离心或过处理,可在较短时间内完成目标组分富集,同时更适用于微量样本和自动化工作流程。

    14010编辑于 2026-05-25
  • 来自专栏单细胞天地

    单细胞+|解析ER阴性乳腺癌他莫昔芬耐药机制

    三、CD63+ CAF分泌的miR-22促进他莫昔芬耐药 是一个纳米级别的囊泡结构,在细胞间通讯起到一个非常重要的作用,因此,我们想知道CD63+CAFs分泌的是否能够引起癌细胞中ERa的低表达 首先,分离和提纯来自CAF分泌的的电镜结构: WB鉴定中包含的蛋白: 使用 CAF-derived exosomes治疗ER-positive乳腺癌,观察到 CD63+ CAF-derived 由于中miRNA含量非常丰富,并且介导的miRNA传递被广泛认为有助于许多癌症的耐药。 因此,我们想知道是否CD63+ CAFs来源的mirna可诱导BCs ER下调。 接下来定位中具体的miRNA,实验设计如下: miRNA-seq:CD63+ CAFs vs CD63+-depleted CAFs 差异分析:top miRNAs (fold change -148a, miR-152-3p) 确定miR-22,是 CD63+ CAF-derived的中最多的miRNA 随后的实验证明:肿瘤中的miR-22是从CAFs分泌的中内吞摄取的:miR

    1.1K10编辑于 2022-03-14
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