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- 来自专栏育种数据分析之放飞自我
R语言读取 xlsx 和xls 文件
「前言：」 ❝今天我用openxlsx包中的read.xlsx读取xls文件时，竟然报错了。我记得有一个包是可以读取Excel2003的，搜索了一下，发现不太容易查找，就写一遍博客记录一下。 ❞ xlsx文件，是2007,2013,2016版本的Excel文件，R语言中可以通过openxlsx包进行读取。 1. 读取xlsx文件 > dd = read.xlsx(".. CHN65101423 1024 65113820 CHN65102226 110015 65114832 CHN11103630 1101086 65114831 CHN11103630 11070 2. openxlsx 读取xls文件报错 如果读取xls文件，报错： > dat = read.xlsx("计算遗传力.xls")Error in read.xlsx.default("计算遗传力.xls") : openxlsx 汇总 openxls通过函数read.xlsx读取xlsx文件 readxl通过函数read_xls读取xls文件 软件安装方法：install.packages("openxlsx") 以及 install.packages
12.2K40发布于 2020-07-22 Day5-数据结构
install.packages("readxl") library(readxl) data <- read_excel("路径/你的文件.xlsx") # 读取excel文件（.xlsx格式） # 使用 openxlsx 包 install.packages("openxlsx") library(openxlsx) data <- read.xlsx("路径/你的文件.xlsx") # 读取R数据文件（.RData/
35610编辑于 2024-03-09- 来自专栏庄闪闪的R语言手册
如何将多份数据保存在一个excel中？
较聪明的方法：使用openxlsx包（或者其他类似包），将每一组参数模拟结果放到一个excel中，其中各个表格依次放到单独的sheet中，这样最后只会生成10个表格啦。 注意需要下载包 openxlsx。 #下载包 install.packages("openxlsx") #加载包 library(openxlsx) # 整理数据 sheets = list("LEN"=round(len1/mc,3),
2.2K30发布于 2021-04-09 - 来自专栏叶子的数据科技专栏
R语言技巧 - 多sheet文档读取并合并输出
代码如下: rm(list = ls()) library(librarian) shelf(openxlsx, dplyr, plyr) setwd("Project/EXCEL/") shtnames data.frame(), xlsxlist[[i]] ) } # View(xlsxlist) dat <- do.call(plyr::rbind.fill, xlsxlist) openxlsx
1.5K01编辑于 2023-02-26 - 来自专栏生信菜鸟团
对单细胞每个cluster进行批量富集分析
="none",] dim(sce.markers) head(sce.markers) #sce.markers=openxlsx::read.xlsx("~/silicosis degs_compareCluster-KEGG_enrichment-2.png',plot = p4,width = 13,height = 25,limitsize = F) gg openxlsx ::write.xlsx(gg,file = "compareCluster-KEGG_enrichment.xlsx") getwd() openxlsx::write.xlsx(sce.markers degs_compareCluster-GO_enrichment-2.pdf',plot = p2,width = 6,height = 20,limitsize = F) xx openxlsx ="none",] dim(sce.markers) head(sce.markers) #sce.markers=openxlsx::read.xlsx("~/silicosis
1.5K41编辑于 2023-09-24 - 来自专栏生信喵实验柴
文件操作
方法二：readr，xlsx，openxlsx 等包 R 中有大量可以读写 Excel 电子表格的包，使用方法与 read.table()函数类似，只需注意Excel 的电子表格分为工作簿与工作表 #安装 openxlsx 包 install.packages("openxlsx") #加载 openxlsx 包 library(openxlsx) #读入 excel 文件，指定 sheet 号
4.1K10编辑于 2022-10-25 - 来自专栏云深之无迹
安装读取的Excel的包
编写Excel文件：示例文件datasets.xlsx，datasets.xls是在openxlsx（和Excel）的帮助下创建的。openxlsx提供“编写，样式化和编辑工作表的高级界面”。 l <- 列表（虹膜 = 虹膜，mtcars = mtcars，chickwts = cockwts，地震 = 地震） openxlsx :: write.xlsx（l，文件 = “ inst 它比openxlsx简约得多，但是在简单的示例上，它的速度似乎快两倍，并且可以写入较小的文件。 非表格数据和格式设置：tidyxl专注于从Excel导入尴尬和非表格数据。
2.8K41发布于 2020-10-23 - 来自专栏育种数据分析之放飞自我
Excel的SNP数据变为plink格式的数据--代码分享
示例数据是这样的： 我把它放到了D盘，然后运行我的代码： setwd("D:/") library(openxlsx) library(tidyverse) library(data.table) 所以完整的代码是： setwd("D:/") library(openxlsx) library(tidyverse) library(data.table) dat = read.xlsx("SNP.xlsx
64020编辑于 2022-07-27 - 来自专栏科研猫
R语言从入门到精通：Day4
这里我给大家推荐一个不需要这些依赖的R包：openxlsx（openxlsx包的安装如图8）。 openxlsx包的帮助文档里介绍了三个写入数据和一个读取数据的函数，其中读取数据的函数read.xlsx()就能实现xlsx文件的读取。 图8:包openxlsx的安装 ? 图9:函数read.xlsx()的参数 4. 常用的数据操作函数 要求：掌握 读取数据之后，大家就可以开始做一些简单的数据处理了。
1.6K30发布于 2019-09-24 - 来自专栏TechBlog
R语言之数据获取操作
还可以借助第三方包（例如 openxlsx 包、readxl 包和 gdata 包）直接读取 xlsx 或 xls 格式的数据文件。 以 openxlsx 包为例： library(openxlsx) write.xlsx(patients, "patients.xlsx") patients.data <- read.xlsx("patients.xlsx
1.7K40编辑于 2023-10-13 - 来自专栏yiyun 的专栏
多元统计分析：多维标度 MDS 分析
简介 多元统计分析：多维标度 MDS 分析 案例 各地区工资水平的多维标度分析 library(openxlsx) Case12 = read.xlsx("..
58020编辑于 2022-04-01 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
R-ggplot2 空间绘图 - 房价气泡图的绘制
进行了房价分布的地图推文教程，本期我们将使用绘图功能更加强大的ggplot2 以及其推展包进行地图绘制和图表美化工作，主要涉及的知识点如下： geojsonio包对geojson数据格式读取 ggplot2 可视化展示 openxlsx 散点图层添加 同样，我们使用上篇推文中的房价数据，这里的数据为xlsx 格式数据，我们需使用openxlsx 包进行excel文件数据的方便读取，代码如下： library(openxlsx) #读取Excel
1.8K20发布于 2021-02-22 - 来自专栏yiyun 的专栏
判别分析 练习题
首先读取数据： library(openxlsx) d6.3 = read.xlsx('.. detach(d3) library(openxlsx) d6.4 = read.xlsx(".. 首先读取数据： library(openxlsx) d1 = read.xlsx(".. xlsx", 'E6.5', cols=c(12,13,14,15));d3$label = 3;d3 # 第三组 d6.5 = rbind(d1,d2,d3);d6.5 # 行合并 library(openxlsx
4K10编辑于 2022-04-01 - 来自专栏育种数据分析之放飞自我
R语言中如何写入xlsx的不同sheet表格
测试思路 模拟两个数据框 新建一个list表 写入excel中 代码 aa<-data.frame(1:5,2:6)ab<-data.frame(2:60,13:71)library(openxlsx)
4.4K20发布于 2019-06-13 - 来自专栏生信补给站
ComplexHeatmap|根据excel表绘制突变景观图（oncoplot）
TRUE)) # install.packages("BiocManager") #BiocManager::install("ComplexHeatmap") #install.packages("openxlsx ") #install.packages("circlize") #后面直接加载即可 library(openxlsx) library(ComplexHeatmap) library(circlize
2.4K20发布于 2020-08-05 手把手教你R语言复现mindfulness_PTSS_COVID19文献结果
readxl", "gtsummary", "stringr", "writexl", "psych", "rstatix", "Hmisc", "mediation", "lavaan", "openxlsx gtsummary_1.7.2 Hmisc_5.1.3 huxtable_5.5.6 #> kableExtra_1.4.0 lavaan_0.6.17 mediation_4.5.0 openxlsx
33310编辑于 2024-06-11- 来自专栏yiyun 的专栏
多元统计分析：对应分析
对应分析就是 通过 数学变换，把 Q型 、R型 因子分析 结合起来 卡方效验 H_0: 相互独立 H_1: 相互影响（不独立） library(openxlsx) d10.1 = read.xlsx(' d10.2', rowNames=T) ca2 = ca(d10.2);ca2 对应分析图 plot(ca2) summary(ca2) 案例 对应分析在农民收入分析中的应用 library(openxlsx
1.3K20编辑于 2022-04-01 - 来自专栏育种数据分析之放飞自我
Excel的SNP数据如何变为plink格式
转化的代码 library(openxlsx) library(tidyverse) library(data.table) dat = read.xlsx("genotype.xlsx") dat 更新的代码中，判断是否有空行，将NN作为缺失读取到R中，可以避免上面的情况，更新后的代码如下： library(openxlsx) library(tidyverse) library(data.table
2.1K10编辑于 2022-07-27 - 来自专栏R学习思考：上课笔记+作业
改数据类型
批量进行数据转换：sapplyread.xlsx读取了数据后，很多时候是character格式的library(openxlsx)library(ggplot2)library(magrittr)library
19810编辑于 2023-12-18 - 来自专栏生信补给站
ggballoonplot|气球图-多分类数据可视化
一 载入数据，R包 一、载入R包 数据 #使用示例数据 library(ggpubr) library(ggplot2) library(openxlsx) #载入示例数据集 my_data <-
1.4K10发布于 2021-03-19
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