我们在引入R语言之前需要先安装OpenBUGS这个软件,软件下载地址:http://www.openbugs.net/w/Downloads。 ? 今天我们就介绍R语言中是如何实现的。 首先还是需要加载一个主要的R包R2OpenBUGS。安装嘛,还是install.packages(“R2OpenBUGS”)。接下来我们看下其实现的过程。 ? 构建模型。 不过这个代码需要在OpenBUGS中进行编写,因为他有自己的编码规则。当然你也可以在R中写成函数然后利用write.bug生成。 如果显示则为T,运行时会显示OpenBUGS运行日志。 ? 3. 模型的结果展示。 可以用自带的函数print()展示,其中主要的参数是digits.summary设置结果保留的小数位数。 ? 样例的代码: library(R2OpenBUGS) data(schools) J <-nrow(schools) y <-schools$estimate sigma.y<- schools$sd
可自由使用的贝叶斯软件程序(如OpenBUGS,WinBUGS或JAGS)可用于执行贝叶斯NMA,但它们需要非常复杂的程序代码。此外,这些统计学软件可能不包含绘图工具。 R语言用户无需在OpenBUGS,WinBUGS或JAGS中编程便可以实现这些包的功能同时输出美观的可视化结果,从而最大限度地减少了用户所需的编程。
JAGS相对于WinBUGS/OpenBUGS的主要优点在于平台的独立性,可以应用于各种操作系统,而WinBUGS/OpenBUGS只能应用于windows系统;JAGS也可以在64-bit平台上以64
JAGS相对于WinBUGS/OpenBUGS的主要优点在于平台的独立性,可以应用于各种操作系统,而WinBUGS/OpenBUGS只能应用于windows系统;JAGS也可以在64-bit平台上以64
JAGS相对于WinBUGS/OpenBUGS的主要优点在于平台的独立性,可以应用于各种操作系统,而WinBUGS/OpenBUGS只能应用于windows系统;JAGS也可以在64-bit平台上以64
JAGS相对于WinBUGS/OpenBUGS的主要优点在于平台的独立性,可以应用于各种操作系统,而WinBUGS/OpenBUGS只能应用于windows系统;JAGS也可以在64-bit平台上以64
在 R2OpenBugs 或 rjags 中,可以使用代码调用单独的文本文件,并且可以对 rstan 执行相同操作,但出于我们的目的,我们在 R 代码中显示它。首先要注意的是模型代码。
在 R2OpenBugs 或 rjags 中,可以使用代码调用单独的文本文件,并且可以对 rstan 执行相同操作,但出于我们的目的,我们在 R 代码中显示它。首先要注意的是模型代码。
基于这些MCMC算法,开发了许多采样软件包,包括WinBUGS、OpenBUGS和JAGS(Lunn等人,2000;Spiegelhalter等人,2007;Plummer,2003)。
基于这些MCMC算法,开发了许多采样软件包,包括WinBUGS、OpenBUGS和JAGS(Lunn等人,2000;Spiegelhalter等人,2007;Plummer,2003)。