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- 来自专栏数据科学（冷冻工厂）
ChIP-seq 分析：数据比对（3）
myMapped <- align("mm10_mainchrs", "filtered_ENCFF001NQP.fastq.gz", output_format = "BAM", output_file library(R.utils) gunzip("filtered_ENCFF001NQP.fastq.gz", remove = FALSE) bowtie2(bt2Index = "BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 .mainChrs", samOutput = "ENCFF001NQP.sam", seq1 = "filtered_ENCFF001NQP.fastq") 由于 Rbowtie2 还输出 bowtieBam <- asBam("ENCFF001NQP.sam") 使用 Rbowtie2 时的一个重要考虑因素是其未压缩文件的输入和输出。 unlink("ENCFF001NQP.sam") 4.3. 排序 和以前一样，我们分别使用 Rsamtools 包 sortBam() 和 indexBam() 函数对文件进行排序和索引。
68410编辑于 2023-02-27 - 来自专栏数据科学（冷冻工厂）
ChIP-seq 分析：数据比对（3）
myMapped <- align("mm10_mainchrs", "filtered_ENCFF001NQP.fastq.gz", output_format = "BAM", output_file library(R.utils)gunzip("filtered_ENCFF001NQP.fastq.gz", remove = FALSE)bowtie2(bt2Index = "BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 .mainChrs", samOutput = "ENCFF001NQP.sam", seq1 = "filtered_ENCFF001NQP.fastq")由于 Rbowtie2 还输出 SAM bowtieBam <- asBam("ENCFF001NQP.sam")使用 Rbowtie2 时的一个重要考虑因素是其未压缩文件的输入和输出。 unlink("ENCFF001NQP.sam")4.3. 排序和以前一样，我们分别使用 Rsamtools 包 sortBam() 和 indexBam() 函数对文件进行排序和索引。
84400编辑于 2023-02-13 - 来自专栏数据科学（冷冻工厂）
ChIP-seq 分析：原始数据质控（2）
fqSample <- FastqSampler("~/Downloads/ENCFF001NQP.fastq.gz", n = 10^6)fastq <- yield(fqSample)生成的对象是一个 fqStreamer <- FastqStreamer("~/Downloads/ENCFF001NQP.fastq.gz", n = 1e+05)现在我们遍历文件，过滤读取并写出过滤读取的 FASTQ "] < 10] TotalReadsFilt <- TotalReadsFilt + length(filt2) writeFastq(filt2, "filtered_ENCFF001NQP.fastq.gz
93200编辑于 2023-02-07 - 来自专栏数据科学（冷冻工厂）
ChIP-seq 分析：原始数据质控（2）
fqSample <- FastqSampler("~/Downloads/ENCFF001NQP.fastq.gz", n = 10^6) fastq <- yield(fqSample) 生成的对象是一个 fqStreamer <- FastqStreamer("~/Downloads/ENCFF001NQP.fastq.gz", n = 1e+05) 现在我们遍历文件，过滤读取并写出过滤读取的 FASTQ < 10] TotalReadsFilt <- TotalReadsFilt + length(filt2) writeFastq(filt2, "filtered_ENCFF001NQP.fastq.gz
59720编辑于 2023-02-27 - 来自专栏Python项目
基于Python实现一个在线加密解密网站系统
cryptography.fernet import Fernetapp = Flask(__name__)# 硬编码的密钥，务必在生产环境中避免这样做key = b'9P5o8VfVP54FAtlC5tgDc7dY-nQP-romGLMDx0tM8wY
1.3K20编辑于 2023-09-13 - 来自专栏V站
PHP神注释记录一番,一个程序员专用的注释包
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1K20发布于 2018-06-19 - 来自专栏Linux云运维
Linux—搭建Apache(httpd)服务
wzOTNvvy7wrkHXyMDt4M0DOFc051sPwT4ncBQQKcHjDpi9A8iCAgWTbInNXvLjHg FV2E4HxPlhgzNwf99D01JJVK8qZSeL+aj0gYlmpBvh60czHfi28nqp8qqZocmUXf Dt4M0DOFc051sPwT4ncBQQKcHjDpi9A8iCAgWTbInNXvLjHgFV2E4HxPlhgzNwf9 9D01JJVK8qZSeL+aj0gYlmpBvh60czHfi28nqp8qqZocmUXfBDUHK27usf8s3Pmd
7.3K32编辑于 2022-08-20 - 来自专栏Hadoop数据仓库
用 MySQL 批量生成强密码
DW$jyg | 100 | | | 9I+nqP-#p6^|xYg5 | 100 | | | 9Z=Uh)+=0;XdSIPp | 100 | | |
63310编辑于 2024-07-26 - 来自专栏前端公虾米
开发人员真实编写的骚注释，你学废了么？
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54510编辑于 2021-12-23 - 来自专栏前端の进行时
代码注释，我们不一样
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79260发布于 2019-07-02 - 来自专栏雨临Lewis的博客
分享一些有趣的代码注释
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1K20编辑于 2022-01-12 - 来自专栏Bypass
Web中间件常见安全漏洞总结
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18K44发布于 2020-02-26 - 来自专栏运维一切
calico网络原理、组网方式和使用
4GbueNC2iWajKnxO" -j MARK --set-xmark 0x0/0x7000000 -A cali-FORWARD -m comment --comment "cali:bq3wVY3mkXk96NQP
24.4K1311发布于 2019-08-08 - 来自专栏季春二九
Typecho的Joe主题新增QQ打开自动跳转到浏览器
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3.5K20编辑于 2023-03-31 - 来自专栏全栈程序员必看
闭包及作用域销毁练习
wBtiqvbZg3OFfXkXfURFxxlufq1Y3Edw/amWY5UZLrhcYL63zpFeflkhK2cN/JMh+7lztG21sH/5j6hPHCsC+RhQEAAAAAGnH1qg5K3NQp8qkrRukfM5mXqQvTo1xJdLX
55010编辑于 2022-11-07 - 来自专栏JokerDJ
RocketMQ
jokerdj-blog-images.oss-cn-shanghai.aliyuncs.com/RocketMQ/img/实体数据实例2.png)] 2.2.3.2 路由注册 #####1）发送心跳包 [外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-FYw2NQP8
2.3K11编辑于 2023-11-27 - 来自专栏全栈程序员必看
图片和Base64编码相互转换[通俗易懂]
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1.3K10编辑于 2022-09-07 - 来自专栏全栈程序员必看
【Ruby】【改gem源镜像】【Win10 + Jruby-9.1.2.0 + Rails 5.1.3 + gem 2.6.4 】
6INaUFjpiou5XaHc3ZlKHzZnu0jkg7Y360g6rw9njxcH6ATK72oxh9TAtvmUcXtnZLi2kUpCe2Uu MGoM9ZDulebyzYLs2aFK7PayS+VFheZteJMELpyCbTapxDFkH4aDCyr0NQp4yVXPQbBH6TCfmb5h
1.2K20编辑于 2022-09-06 - 来自专栏全栈程序员必看
win7 64位官方旗舰版上搭建ruby on rails的步骤
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97350编辑于 2022-09-06
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