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毅硕HPC | Rocky Linux 9 SLURM软件编译安装
创建Munge用户Munge用户要确保管理节点和计算(登录)节点的UID和GID相同，所有节点都需要安装Munge：groupadd -g 1108 mungeuseradd -m -c "Munge dnf install epel-release -ydnf install munge munge-libs munge-devel -y注意：munge-devel如果在rocky9官方源找不到，请点击以下链接进行查找 、登录节点）scp -p /etc/munge/munge.key root@login01:/etc/munge/scp -p /etc/munge/munge.key root@compute01: /etc/munge/scp -p /etc/munge/munge.key root@dcv01:/etc/munge/# 所有节点赋权chown munge: /etc/munge/munge.keychmod 测试Munge服务每个节点与控制节点进行连接验证本地查看凭据：munge -n本地解码：munge -n | unmunge验证远程解码：munge -n | ssh compute01 unmungemunge
46310编辑于 2025-11-06 - 来自专栏毅硕HPC
毅硕HPC | Ubuntu 24 SLURM 编译安装
systemd/system--with-pmix=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/pmix2没有报错就执行编译安装：make-j$(nproc)&&makeinstall4.配置Munge 管理节点munge生成keysudo-umunge/etc/munge/munge.key分发到各节点并赋权scp-p/etc/munge/munge.keyroot@login01:/etc/munge /scp-p/etc/munge/munge.keyroot@compute01:/etc/munge/chownmunge:/etc/munge/munge.keychmod400/etc/munge /munge.socket.2AccountingStoragePort=6819AccountingStorageType=accounting_storage/slurmdbdJobCompHost /munge.socket.2#slurmDBDinfoDbdAddr=localhostDbdHost=localhostSlurmUser=slurmDebugLevel=verbose#DefaultQOS
17710编辑于 2026-02-26 - 来自专栏全栈程序员必看
Ant 执行 YUICompressor
refid=“path.build.classpath.yuicompress”/> </taskdef> <compress linebreak=“150” warn=“false” munge = (this.munge ! munge : Boolean.FALSE; this.lineBreak = (this.lineBreak==null) ? this.encoding : “UTF-8”; } this.munge = (this.munge != null) ? munge : Boolean.FALSE; this.lineBreak = (this.lineBreak==null) ?
51320编辑于 2022-09-09 - 来自专栏生物信息与临床医学专栏
如何在Windows电脑上使用LDSC软件(3) ------ LDSC实操与结果解读
LDSC分析主要由两部分组成： （1）数据格式整理，主要使用munge_sumstats.py模块； （2）基于单核苷酸多态性（SNP）的可遗传度（heritability）与遗传关联度分析（genetic /munge_sumstats.py \ --sumstats pgc.bip.full.2012-04.txt \ --N 11810 \ --out bip \ --merge-alleles w_hm3 /munge_sumstats.py \ --sumstats pgc.scz.full.2012-04.txt \ --N 17115 \ --out scz \ --merge-alleles w_hm3
4.8K21编辑于 2022-08-21 - 来自专栏生信菜鸟团
用 LDSC 计算遗传度以及遗传相关性
本教程的 scz 和 bip 示例数据都包含 INFO 列，munge _ sumstats.py 脚本会自动根据这一列的值进行过滤。 默认情况下，munge_sumstats.py 可以识别绝大多数列名，但如果 GWAS 结果中包含一些特殊列名，你可能需要用参数进行指定。 比如，输入中的 foobar 列包含 INFO 得分，则命令应改为 munge_sumstats.py -- INFO foobar。 所以我们应检查日志文件的这一部分内容，以确保 munge_sumstats.py 正确识别了列名。如果不确定脚本是否能够正确识别列名，最简单的方法就是直接运行脚本，如果不能识别命令就会报错。 默认情况下，munge_sumstats.py 会根据 INFO > 0.9，MAF > 0.01 以及 0 < P <= 1 进行过滤。
13.6K43发布于 2020-07-29 - 来自专栏仲儿的专栏
CONQUEST 编译安装指南 Slurm 篇
Ubuntu 上安装 安装 Munge、Slurm 和 PBS 工具，并清理、新建和赋权 slurm 所需文件夹。 sudo apt update \ && sudo apt install munge slurm-wlm slurm-wlm-doc slurm-wlm-torque -y \ && sudo rm Munge 为 Slurm 所必需的服务，需要首先启动。slurmctld 是管理控制模块，slurmd 是计算模块，启动先后无实际影响。 & slurm RUN sudo apt update \ && sudo apt install munge slurm-wlm slurm-wlm-doc slurm-wlm-torque /bin/bash sudo service munge restart sudo service slurmctld restart sudo service slurmd restart sinfo
3.3K10编辑于 2022-10-28 - 来自专栏运维民工
slurm--核算和资源限制
确保数据安全的最好方法是对SlurmDBD的通信进行认证，我们推荐MUNGE来实现这一目的。如果你有一个由Slurm管理的集群，并在这一个集群上执行SlurmDBD，正常的MUNGE配置就足够了。 否则，MUNGE应该被安装在所有Slurm管理的集群的所有节点上，加上执行SlurmDBD的机器。 如果使用MUNGE，而用户的名字不在passwd文件中，行动将失败。如果不使用MUNGE，你应该把任何你想成为管理员或操作员的人加入到passwd文件中。 如果将SlurmDBD与第二个MUNGE守护进程一起使用，请存储MUNGE用来提供全企业范围内的认证的命名套接字的路径名（即/var/run/munge/moab.socket.2） 。 AuthInfo：如果将SlurmDBD与第二个MUNGE守护进程一起使用，请存储MUNGE用来提供企业范围内的命名套接字的路径名。否则将使用默认的MUNGE守护进程。 AuthType。
4.6K20编辑于 2023-03-08 - 来自专栏生物信息与临床医学专栏
如何在Windows电脑上使用LDSC软件(2)------LDSC的安装
/munge_sumstats.py -h #查看munge_sumstats是否能正常运行 但是，如果上述步骤无法完成LDSC安装的话，那么建议按照下面的教程进行安装： 首先，自行创建一个名为ldsc
6K40编辑于 2022-08-21 - 来自专栏育种数据分析之放飞自我
ldsc 计算遗传力+遗传相关+LD score的python程序安装以及测试
/munge_sumstats.py -h 出现下面帮助文档，说明软件安装成功： 2. 软件测试 里面有test文件 夹，里面有测试数据和代码： 下一章节介绍ldsc的运行教程。
1.1K21编辑于 2023-09-06 - 来自专栏育种数据分析之放飞自我
ldsc 计算遗传力+遗传相关程序安装教程
/munge_sumstats.py -h 出现下面帮助文档，说明软件安装成功： 2. 软件测试 里面有test文件 夹，里面有测试数据和代码： 下一章节介绍ldsc的运行教程。
1.1K21编辑于 2023-10-20 - 来自专栏运维民工
slurm--高吞吐量计算管理指南
Munge配置 默认情况下，Munge守护进程以两个线程运行，但更多的线程数可以提高其吞吐量。 我们建议用10个线程来启动Munge守护进程，以支持高吞吐量（例如 munged --num-reads 10）。
1.9K00编辑于 2023-02-22 - 来自专栏datartisan
PEP8-Python代码规范样式编写指南摘录
推荐写法： def munge(input: AnyStr): ... def munge() -> AnyStr: ... 不推荐写法： def munge(input:AnyStr): ... def munge()->PosInt: ... 推荐写法： def munge(sep: AnyStr = None): ... def munge(input: AnyStr, sep: AnyStr = None, limit=1000): .. 不推荐写法： def munge(input: AnyStr=None): ... def munge(input: AnyStr, limit = 1000): ...
2.2K10发布于 2020-01-14 - 来自专栏技术杂记
perl dancer 基础
OK ==> Found dependencies: Data::Munge --> Working on Data::Munge Fetching http://www.cpan.org/authors /id/M/MA/MAUKE/Data-Munge-0.095.tar.gz ... OK Configuring Data-Munge-0.095 ... OK Building and testing Data-Munge-0.095 ... OK Successfully installed Data-Munge-0.095 Building and testing Return-MultiLevel-0.04 ...
2.8K30编辑于 2022-03-25 - 来自专栏Piper蛋窝
不是程序员，代码也不能太丑！python官方书写规范：任何人都该了解的 pep8
# Yesdef munge(sep: AnyStr = None): ...def munge(input: AnyStr, sep: AnyStr = None, limit=1000): ...# Nodef munge(input: AnyStr=None): ...def munge(input: AnyStr, limit = 1000): ...
76030发布于 2020-11-19 - 来自专栏C++核心准则原文翻译
C++核心准则E.12: 当不可能或不愿意通过抛出异常退出函数时使用noexcept
Example（示例） vector<double> munge(const vector<double>& v) noexcept { vector<double> v2(v.size());
85320发布于 2020-08-04 - 来自专栏Hank’s Blog
1.6 Navigating This Book（本书导航）
matplotlib.pyplot as plt import pandas as pd import seaborn as sns import statsmodels as sm 4 Jargon（行话） Munge
48720发布于 2020-09-16 - 来自专栏ShanSan的云原生之路
Elixir 连续运行时代码覆盖率采集方案
BEAM 文件的 abstract_code 的内容, 即 Erlang AST, 关键代码在 cover.erl#L1541, 然后对 Erlang AST From 进行 transform 和 munge 然后对于被 munge 后的 Erlang AST Form, cover 使用了 Erlang Compiler 从被 munge 后的 AST 表达形式中获取 Erlang Beam Code（又称 munge: 用于对数据或文件进行一系列可能具有破坏性或不可撤销的更改. 3.
77350编辑于 2023-10-21 - 来自专栏仲儿的专栏
Docker 快速部署 Slurm 集群
上图引用自 https://github.com/SciDAS/slurm-in-docker ) 安装配置 Slurm 集群的节点之间通过 6817 和 6818 两个端口进行通信，其基础的配置就是 munge 如果不同服务器上采用相同的 Docker 镜像的话，那么 munge key 肯定是一致的。而 slurm.conf 文件的一致性可以在启动时用挂载的方式使用同样的文件来保证。
6.9K20编辑于 2022-10-28 - 来自专栏生信修炼手册
LDSC分析实战
该软件自带了脚本来格式化GWAS结果，生成sumstats格式的文件，用法如下 python munge_sumstats.py \ --sumstats gwas.txt \ --N 2000 \ -
4.3K64发布于 2019-12-19 - 来自专栏云社区活动
在腾讯云上构建高性能计算平台：从零开始的实战指南
noneProctrackType=proctrack/linuxprocReturnToService=2SlurmctldPort=6817SlurmdPort=6818AuthType=auth/munge
74210编辑于 2025-01-22
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