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MIMIC数据库安装保姆级教程（下)
2，mimiciv数据文件。 mimic数据导入脚本可以在官方的github网址上下载，网址为： https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/main。 mimiciv数据文件需要在官网申请权限才可以下载使用，不知道怎么申请的同学，可以参考小编以前的文章： MIMIC数据库下载权限申请保姆级教程（上） MIMIC数据库下载权限申请保姆级教程（下） 安装脚本介绍 01 创建数据库 打开psql 在psql中执行以下代码创建mimiciv数据库 #创建mimic数据库 DROP DATABASE IF EXISTS mimiciv; CREATE DATABASE mimiciv OWNER postgres; 02 创建表 执行以下语句创建表，注意：windows系统下脚本目录请使用正斜杠 #切换到mimiciv数据库 \c mimiciv #生成表，create.sql 数据，其中mimic_data_dir为mimiciv数据存放路径 # 设置mimic数据存放路径 \set mimic_data_dir 'D:/mimic/mimiciv-data/mimic-iv
2.1K31编辑于 2023-07-21 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC数据库提取教程-提取某种疾病下的患者人口统计学指标
在mimiciv数据库中，患者的人口统计学信息主要分为两部分。 本期小编就教大家如何在mimiciv数据库中获取患者的“年龄”，“身高”，“体重”这几个很重要的指标。 一，获取患者的真实年龄 mimiciv数据库为了保护患者的隐私，并没有直接记录患者的真实年龄，patients表中记录了两个关于年龄的字段： anchor_age：患者相对anchor_year的相对年龄 上图小编使用到了DATETIME_DIFF函数，该函数为mimiciv官方函数，作用是求两个时间的差，这个函数小编是安装在mimiciv_derived模块中，如果大家不是安装在这个模块中，请把函数前缀替换成自己的模块名哈 (ad.admittime, mimiciv_derived.DATETIME(pa.anchor_year, 1, 1, 0, 0, 0), 'YEAR'),2)) AS age FROM
1.2K20编辑于 2023-11-17 - 来自专栏mimic数据库
Python连接MIMIC-IV数据库并图表可视化
下所有的表的表名 mimiciv_icu cur.execute(""" SELECT table_name FROM information_schema.tables WHERE table_schema = 'mimiciv_icu' """) for i,table in enumerate(cur.fetchall()): print('表',i,':',table [0]) mimiciv_hosp 1.3 读取表paitients的内容并探索数据 该表记录了患者的个人基本信息。 的数据， 此表包含了国际疾病分类(ICD)的诊断编码资讯，用于记录病患的诊断情况 # # 设置查询语句# # 我们选择从mimiciv_hosp.admissions表中提取hadm_id等于10006 # # 设置查询语句# # 我们选择从mimiciv_hosp.admissions表中提取hadm_id等于10006的行。
99410编辑于 2023-12-12 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC数据提取教程 - 官方提供的时间函数（一）
(P.dod, ad.admittime, 'YEAR' ) AS age FROM mimiciv_hosp.admissions ad INNER JOIN mimiciv_hosp.patients matplotlib.pyplot as pltimport psycopg2schema_name = 'mimic'# 连接到MIMIC-IV数据库conn = psycopg2.connect(dbname='mimiciv # # # 在写sql代码时，最好先执行“set search_path to mimiciv" 随后的所有操作均不需要指明表格的位置；否则，任何操作都应该在表格名前面加前缀mimiciv# query1 = query_schema + 'SELECT subject_id, hadm_id, admittime, dischtime, admission_type FROM mimiciv_hosp.admissions (P.dod, ad.admittime, 'YEAR' ) AS age FROM mimiciv_hosp.admissions ad INNER JOIN mimiciv_hosp.patients
1.5K00编辑于 2023-12-12 - 来自专栏mimic数据库
Python连接MIMIC-IV数据库并图表可视化
下所有的表的表名 mimiciv_icu cur.execute(""" SELECT table_name FROM information_schema.tables WHERE table_schema = 'mimiciv_icu' """) for i,table in enumerate(cur.fetchall()): print('表',i,':',table [0]) mimiciv_hosp 1.3 读取表paitients的内容并探索数据 该表记录了患者的个人基本信息。 的数据， 此表包含了国际疾病分类(ICD)的诊断编码资讯，用于记录病患的诊断情况 # # 设置查询语句# # 我们选择从mimiciv_hosp.admissions表中提取hadm_id等于10006 # # 设置查询语句# # 我们选择从mimiciv_hosp.admissions表中提取hadm_id等于10006的行。
80710编辑于 2023-12-12 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC数据库安装保姆级教程（上）
安装前准备 安装mimic数据库前，我们需要先准备以下工具： 1，postgres数据库安装包； 2，7z安装包； 3，mimiciv数据安装脚本； 4，mimiciv数据集； 为了方便同学们学习，小编已经把上述需要的软件已经整理好了 pgAdmin4是客户端软件，如果同学们已经安装了navicat，则不需要安装pgAdmin4） 选择数据库数据文件存放路径后点击"Next >"（这里一定要选择一个可用容量大于100G的磁盘，因为mimiciv 安装7z解压缩软件 因为mimiciv数据非常大，压缩包就有8G，导入完数据后将近100G，不能直接将数据导入数据库，需要使用到7z解压缩工具进行数据解压导入。
1.6K41编辑于 2023-07-21 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC数据库安装保姆级教程（上）
安装前准备 安装mimic数据库前，我们需要先准备以下工具： 1，postgres数据库安装包； 2，7z安装包； 3，mimiciv数据安装脚本； 4，mimiciv数据集； 为了方便同学们学习，小编已经把上述需要的软件已经整理好了 pgAdmin4是客户端软件，如果同学们已经安装了navicat，则不需要安装pgAdmin4） 选择数据库数据文件存放路径后点击"Next >"（这里一定要选择一个可用容量大于100G的磁盘，因为mimiciv 安装7z解压缩软件 因为mimiciv数据非常大，压缩包就有8G，导入完数据后将近100G，不能直接将数据导入数据库，需要使用到7z解压缩工具进行数据解压导入。
93360编辑于 2023-07-21 - 来自专栏mimic数据库
手把手教会你认识跟安装MIMIC-IV数据库物化视图
进入默认数据库后，我们输入命令切换mimic数据库，输入【\c mimiciv】可以看到已经进入了mimiciv数据库，接下来我们继续物化视图，找到刚刚官方提供的两个sql，首先执行第一个sql，postgres-funcitons
1.6K10编辑于 2023-11-17 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC数据库提取教程-提取某种疾病下的实验室指标
小编今天以提取患“肺栓塞”患者的实验室指标为例子，教大家如何提取mimiciv数据库的实验室指标。
1.3K70编辑于 2023-07-21 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC-IV，重症医学数据库介绍和使用说明
官方介绍见 MIMIC官方网站 : https://mimic.mit.edu/ MIMIC-IV 数据库下载见 MIMIC-IV发布页: https://physionet.org/content/mimiciv
10.2K70编辑于 2023-07-21
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