首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
    • 综合排序
    • 最热优先
    • 最新优先
    时间不限
  • 来自专栏csdn_blog

    MIMIC III数据集详细介绍

    MIMIC数据集包括MIMIC-II数据集和MIMIC-III数据集,MIMIC-II数据集的数据是2001—2008年间贝斯以色列迪康医学中心(BIDMC)重症监护室中病人的医疗数据,MIM-IC-III 数据集的数据是2001年6月—2012年10月重症监护室病人数据数据集MIMIC数据库从发布到现在,随着更多数据变得可用,数据导入和提取方法的改进,以及数据库维护人员一直根据社区提供的数据库内容的反馈定期更新数据集,因此MIMIC数据集有多个版本,目前最新的版本是2016 null - HADM_ID INT not null - SEQ_NUM INT 操作顺序 ICD9_CODE VARCHAR(10) ICD-9 编码 参考文章 官方文档:https://mimic.mit.edu /about/mimic/ 信息资源管理学报 的一篇文章: MIMIC-III电子病历数据集及其挖掘研究 陈 静1 李保萍2 (1.华中师范大学信息管理学院,武汉,430079; 2.武汉大学信息管理学院

    4.6K20编辑于 2021-12-07
  • 来自专栏mimic数据库

    MIMIC-IV-ED数据集介绍

    MIMIC-IV-ED v2.2 Abstract MIMIC-IV-ED 是一个大型的免费数据库,记录了2011年至2019年间急诊部门(ED)贝斯以色列女执事医疗中心的入院情况。 MIMIC-IV-ED 旨在通过提供一个大型的数据库来支持急诊护理中的数据分析,该数据库位于马萨诸塞州波士顿的一个三级学术医疗中心。 虽然 MIMIC-IV-ED 的核心目标是为研究目的提供真实世界的临床数据,因此限制了在数据发布之前进行的预处理的数量,但在转换过程中需要一些数据清理步骤。在使用表特定的主键插入时,观察数据被删除。 我们进一步在基于云的数据库服务(包括 Google BigQuery)中提供 MIMIC-IV-ED,允许有资质的调查人员立即使用该数据集。 Data Linkage MIMIC-IV-ED 可以作为一个独立的研究数据库使用,但也可以链接到 MIMIC-IV 和 MIMIC-CXR [1,3]。

    1.6K10编辑于 2024-01-15
  • 来自专栏mimic数据库

    MIMIC-IV 数据查询加速教程

    MIMIC-IV查询加速保姆级教程为什么查询会这么慢? 这个过程时间比较长,2分钟左右,耐心等待我们现在看看文章开头的SQL查询速度, 9秒就完成了查询PostgreSQL 索引索引是加速搜索引擎检索数据的一种特殊表查询。 简单地说,索引是一个指向表中数据的指针。一个数据库中的索引与一本书的索引目录是非常相似的。拿汉语字典的目录页(索引)打比方,我们可以按拼音、笔画、偏旁部首等排序的目录(索引)快速查找到需要的字。 索引有助于加快 SELECT 查询和 WHERE 子句,但它会减慢使用 UPDATE 和 INSERT 语句时的数据输入。索引可以创建或删除,但不会影响数据。 唯一索引使用唯一索引不仅是为了性能,同时也为了数据的完整性。唯一索引不允许任何重复的值插入到表中。

    98210编辑于 2023-11-28
  • 来自专栏yuezhimi

    ceph-mimic

    Infernalis November 2015 - June 2016 Jewel 10.2.9 2016年4月 Kraken 11.2.1 2017年10月 Luminous 12.2.12 2017年10月 mimic 13.2.7 2018年5月 nautilus 14.2.5 2019年2月 mimic新版本特性 Bluestore ceph-osd的新后端存储BlueStore已经稳定,是新创建的OSD yum.repos.d/ceph.repo [Ceph] name=Ceph packages for $basearch baseurl=http://mirrors.aliyun.com/ceph/rpm-mimic gpgcheck=0 priority=1 [Ceph-noarch] name=Ceph noarch packages baseurl=http://mirrors.aliyun.com/ceph/rpm-mimic mimic版 (nautilus版) dashboard 安装。

    1.3K21发布于 2020-09-30
  • 来自专栏mimic数据库

    MIMIC数据库安装保姆级教程(下)

    安装前准备 执行安装前需要准备以下文件: 1,mimic数据导入脚本。 2,mimiciv数据文件。 mimic数据导入脚本可以在官方的github网址上下载,网址为: https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/main。 mimiciv数据文件需要在官网申请权限才可以下载使用,不知道怎么申请的同学,可以参考小编以前的文章: MIMIC数据库下载权限申请保姆级教程(上) MIMIC数据库下载权限申请保姆级教程(下) 安装脚本介绍 ,通过7z加载mimiciv数据,其中mimic_data_dir为mimiciv数据存放路径 # 设置mimic数据存放路径 \set mimic_data_dir 'D:/mimic/mimiciv-data /mimic-iv-2.2' # 加载数据 \i D:/workspace/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/load_7z.sq 数据导入过程会比较漫长

    2.4K31编辑于 2023-07-21
  • 来自专栏mimic数据库

    MIMIC数据库安装保姆级教程(上)

    安装前准备 安装mimic数据库前,我们需要先准备以下工具: 1,postgres数据库安装包; 2,7z安装包; 3,mimiciv数据安装脚本; 4,mimiciv数据集; 为了方便同学们学习,小编已经把上述需要的软件已经整理好了 ,关注“科研收录”公众号,后台回复"mimic安装"就可以获取下载地址。 安装Postgres数据mimic官方推荐使用postgres数据库进行数据分析。 安装7z解压缩软件 因为mimiciv数据非常大,压缩包就有8G,导入完数据后将近100G,不能直接将数据导入数据库,需要使用到7z解压缩工具进行数据解压导入。 双击7z安装文件 选择7z安装目录(记住这个目录,后面设置环境变量要用) 点击"Install",很快就安装完毕 02 设置环境变量 安装完7z之后,还需要设置7z的环境变量,才可以使用7z进行mimic

    1.8K41编辑于 2023-07-21
  • 来自专栏mimic数据库

    MIMIC数据库安装保姆级教程(上)

    安装前准备 安装mimic数据库前,我们需要先准备以下工具: 1,postgres数据库安装包; 2,7z安装包; 3,mimiciv数据安装脚本; 4,mimiciv数据集; 为了方便同学们学习,小编已经把上述需要的软件已经整理好了 ,关注“科研收录”公众号,后台回复"mimic安装"就可以获取下载地址。 安装Postgres数据mimic官方推荐使用postgres数据库进行数据分析。 安装7z解压缩软件 因为mimiciv数据非常大,压缩包就有8G,导入完数据后将近100G,不能直接将数据导入数据库,需要使用到7z解压缩工具进行数据解压导入。 双击7z安装文件 选择7z安装目录(记住这个目录,后面设置环境变量要用) 点击"Install",很快就安装完毕 02 设置环境变量 安装完7z之后,还需要设置7z的环境变量,才可以使用7z进行mimic

    1K60编辑于 2023-07-21
  • 来自专栏mimic数据库

    MIMIC数据库,常用查询指令SQL基础(一)

    SELECT 语句 SELECT 语句用于从数据库中选取数据。 结果被存储在一个结果表中,称为结果集。 SQL SELECT 语法 SELECT column1, column2, ... (去重) 我们平时在操作数据时,有可能出现一种情况,在一个表中有多个重复的记录,当提取这样的记录时,DISTINCT 关键字就显得特别有意义,它只获取唯一一次记录,而不是获取重复记录。 ,就可以在 SELECT 语句中添加 WHERE 子句,从而过滤掉我们不需要数据。 语法 以下是 SELECT 语句中使用 WHERE 子句从数据库中读取数据的通用语法: SELECT column1, column2, columnN FROM table_name WHERE [condition1 示例 BETWEEN BETWEEN 操作符选取介于两个值之间的数据范围内的值。这些值可以是数值、文本或者日期。

    1.2K40编辑于 2023-07-21
  • 来自专栏从百草园到三味书屋

    公开重症监护数据MIMIC代码仓库介绍

    ; 医疗领域进入数字化革命(本文是2017年接收),引出形成MIMIC-III数据库; EHR二次分析需要临床专家和数据科学家的合作,在EHR数据库上推导或者定义一些概念是需要资源的,对于没有特别强的临床背景或者数据科学技能的人来说巨大障碍 ; 该文介绍MIMIC代码仓库,介绍与重症相关概念的导出以及相关假设条件等; 公开数据已经逐渐有了,公开相应的数据代码同样重要。 an outline of the data-capture process 社区 让研究人员和数据维护人员、临床人员共同提升代码 结论 公开数据库的案例已经不少,为了让研究更加透明,也需要公开相应数据分析和数据处理的代码 补充 代码库地址:https://github.com/MIT-LCP/mimic-code 之前以MIMIC-III为主,现在mimic-iii和mimic-iv合并在一起了 mimic数据库为了让研究者访问更加方便 从代码仓库导出的概念concepts都放到mimic_derived数据集里 ---- Johnson, A. E. W., Stone, D. J., Celi, L.

    2.3K10编辑于 2023-03-09
  • 来自专栏五分钟学算法

    数据结构与算法——2-3

    因此,引入了 2-3 树来提升效率。2-3 树本质也是一种平衡搜索树,但 2-3 树已经不是一棵二叉树了,因为 2-3 树允许存在 3 这种节点,3- 节点中可以存放两个元素,并且可以有三个子节点。 2-3 树定义 2-3 树的定义如下: (1)2-3 树要么为空要么具有以下性质: (2)对于 2- 节点,和普通的 BST 节点一样,有一个数据域和两个子节点指针,两个子节点要么为空,要么也是一个2 -3树,当前节点的数据的值要大于左子树中所有节点的数据,要小于右子树中所有节点的数据。 (3)对于 3- 节点,有两个数据域 a 和 b 和三个子节点指针,左子树中所有的节点数据要小于a,中子树中所有节点数据要大于 a 而小于 b ,右子树中所有节点数据要大于 b 。 2-3树查找 2-3 树的查找类似二叉搜索树的查找过程,根据键值的比较来决定查找的方向。 例如在图 2.1 所示的 2-3 树中查找键为H的节点: ?

    87510发布于 2019-09-03
  • 来自专栏往期博文

    数据挖掘】任务2:医学数据MIMIC-III数据处理

    涉及到的预处理方法包括插值,去噪,缺失值填充,离群点数据处理,可视化等。 数据集说明 patients:包含所有患者数据。 chart_events:包含了所有可供患者使用的图表数据。 这是因为在病人的电子图上显示实验室值是可取的,因此这些值是从存储实验室值的数据库复制到存储chartevent的数据库中。 提取LABEVENTS表格中PO2和PCO2数据 # 根据采集时间来读取数据 df = pd.read_csv('mini_label_events.csv', index_col='CHARTTIME ,将这些数据进行删除处理 ipl2.dropna(axis='index', how='any', inplace=True) # any表示只要有一个缺失值则整行删除 处理后的数据如下表所示 ipl2 我选择删除偏离均值三倍标准差数据的方式进行去噪。

    2.6K20编辑于 2022-09-01
  • 来自专栏mysql

    hhdb数据库介绍(2-3)

    主备数据一致性检测 管理平台提供逻辑库、存储节点、配置库维度的主备数据一致性校验功能。主从数据一致性检查,可校验主库与从库之间的表结构与表数据是否一致。 此外,还可以添加定时计划,定期检测所选逻辑库中的数据一致性情况。 全局表数据检测 管理平台提供全局表数据检测功能,可选择具体逻辑库中的全局表并检测该表在所有数据节点中数据是否一致。 数据增量预测:可以根据历史数据记录,提前规划存储节点/配置库数据容量。 集群数据量报表:集群数据量变化趋势图、集群数据量分布图、逻辑库数据量分布图、表数据量分布图。 数据恢复 支持数据备份后在界面发起数据恢复请求。可按照恢复时间点对备份数据进行恢复,也可支持库级别、表级别数据恢复,保证数据完整性。

    67210编辑于 2025-03-07
  • 来自专栏mimic数据库

    MIMIC数据提取教程 - 官方提供的时间函数(一)

    mimic数据库中有非常多的指标是需要根据时间计算出来, 跟时间有关的指标都需要通过官方的时间函数进行计算得出MIMIC数据库常用的几个时间计算函数如下 一、DATETIME_DIFF函数1.1 实例: import numpy as npimport pandas as pdimport matplotlib.pyplot as pltimport psycopg2schema_name = 'mimic '# 连接到MIMIC-IV数据库conn = psycopg2.connect(dbname='mimiciv', user='postgres', password='mimic', 1.2.2 拓展:等宽直方图直方图(histogram)是数据库中的一种重要的统计信息,可以描述列中的数据分布情况。 Equi-width Histogram(等宽直方图)是将数据最大、小值之间的区间等分为N份,每个桶中最大、小值之差都为整体数据最大、小值之差/N,既所谓“等宽”。

    1.8K00编辑于 2023-12-12
  • 来自专栏Seebug漏洞平台

    MIMIC Defense CTF 2019 final writeup

    如果用户名被直接拼接到了数据库名字中,将.转化为_, ./dbs/mimic_{username}.db 直接访问相应的路径,就可以下载到自己的 db 文件,直接本地打开就可以看到其中的数据数据库里很明显由 filename 做主键,后面的数据是序列化之后的字符串,主要有两个点,一个是 file_type ,这代表文件上传之后,服务端会检查文件的类型,然后做相应的操作,其次还会保存相应的文件路径 抛开这边的数据库以后,我们再从黑盒这边继续分析。 当你上传文件的时候,文件名是 md5(全文件名)+最后一个.后的后缀拼接。 对于后缀的检查,如果点后为 ph 跟任何字符都会转为 mimic 。 于是只能思考别的利用方式,这时候我们会想到数据被储存在sqlite中。 如果我们可以把 sqlite 文件中数据修改,然后将文件上传到服务端,我们不就能实现任意文件读取吗。

    1.3K20发布于 2019-06-02
  • 来自专栏AI机器学习与深度学习算法

    学习分类 2-3 感知机

    数据包含三个特征的感知机模型如下所示。 感知机是非常简单的模型,基本不会应用到实际的问题当中,但是它是神经网络和深度学习模型的基础模型。 图片 下表示收集到的六个训练数据。 我们将权重向量与数据的特征向量内积大于 0 的数据返回值 1,而将内积小于 0 的数据返回值 -1。我们可以将其定义为一个新的函数,这个函数被称为 判别函数。

    67310编辑于 2022-11-08
  • 来自专栏mimic数据库

    Python连接MIMIC-IV数据库并图表可视化

    之前我们讲解了如何提取MIMIC-IV数据数据: 这种直接SQL提取方式很直接,但是不是最好的方式也不利于数据的进一步统计分析、可视化和预测分析, 所以我们这里讲解下: 如何用python语言连接我们装好的数据库 ,并做简单的数据可视化(图表展示) 本文主要是将MIMICIII版本官方代码内的教程升级成mimic-iv版本 , 不同之处在于两点 数据读取方式: MIMICIII教程使用的直接读取csv文档的方式 , 我们这里连接数据 数据和代码更新:因mimic-iv数据表更新了很多,所以可视化代码也需要更新  数据来源:PostgreSQL数据库 前置条件, 学会安装python环境、anconda代码包集成环境 、ide编辑器(本期文章) 一、 连接mimic-iv数据库 1.1 安装psycopg2包  主要三种方式     Pycharm编辑器 嫌费事的同学也可直接安装Anaconda集成环境 也可用命令行工具 三、 小结 在这篇项目中,我们使用python连接数据库方式来获取MIMIC数据库的数据,给出了一些SQL查询的应用例子,以及数据集的探索尝试; 然后基于获取到的数据集,我们利用pandas函数来对数据集进行操作

    1.2K10编辑于 2023-12-12
  • 来自专栏算法无遗策

    动画 | 什么是2-3树?

    2-3树正是一种绝对平衡的树,任意节点到它所有的叶子节点的深度都是相等的。 2-3树的数字代表一个节点有2到3个子树。它也满足二分搜索树的基本性质,但它不属于二分搜索树。 2-3树查找元素 2-3树的查找类似二分搜索树的查找,根据元素的大小来决定查找的方向。 动画:2-3树插入 2-3树删除元素 2-3树删除元素相对比较复杂,删除元素也和插入元素一样先进行命中查找,查找成功才进行删除操作。 2-3树为满二叉树时,删除叶子节点 2-3树满二叉树的情况下,删除叶子节点是比较简单的。 动画:2-3树删除 -----END---

    1.1K10发布于 2020-01-02
  • 来自专栏JAVA高级架构

    Java数据结构与算法解析——2-3

    平衡查找树的数据结构能够保证在最差的情况下也能达到lgN的效率,要实现这一目标我们需要保证树在插入完成之后始终保持平衡状态,这就是平衡查找树(Balanced Search Tree)。 2-3查找树概述 2-3树是最简单的B-树(或-树)结构,其每个非叶节点都有两个或三个子女,而且所有叶都在统一层上。2-3树不是二叉树,其节点可拥有3个孩子。不过,2-3树与满二叉树相似。 一棵2-3查找树或为一颗空树,或由以下节点组成: 1)2-节点:含有一个键和两条链接,左链接指向的2-3树中的键都小于该节点,右链接指向的2-3树中的键都大于该节点。 所以只需要常数次操作即可完成2-3树的平衡。 ? 性质这些本地操作保持了2-3树的平衡。对于4-node节点变形为2-3节点,变形前后树的高度没有发生变化。 下面是2-3查找树的效率: ? 最后贴上一张2-3树的构造过程: ? JAVA架构

    1.5K70发布于 2018-04-19
  • 来自专栏desperate633

    2-3课 检索数据检索列检索排序数据

    这两课主要介绍sql中利用select语句对数据的简单检索。 检索前几列或者后几列 select prod_name from products limit 5; select prod_name from products limit 5 offset 5; 检索排序数据

    1.3K20发布于 2018-08-22
  • 来自专栏LoRexxar's Blog

    wctf2018 cyber mimic defence Writeup

    本身使用战争与分享赛制,却要求了每队必须出一道windows题目,大部分人都选择了内核驱动级别的re和pwn,只有LCBC出的“拟态防御”和智能合约审计可以一做,关于智能合约的部分有机会会再分享,这里只研究一下mimic cyber mimic defence 代码挺简单的,flask完成,主要的功能几乎只有登陆注册,功能核心基本都在user类中,而调用到user类的view只有登陆部分,所以漏洞也就是在这里。 ,然后不同的数据库会对应不同的闭合符号,在每次查询时都会向4个数据库同时查询,然后对比返回结果,只有3种以上相同的结果才会被返回。 我们有两个办法解决这个问题 1、找到至少3种数据库都支持的查询方式 2、只攻击其中1种数据库 这里我们很难找到支持第一种办法的注入方式,因为在不同的数据库中,储存表名列名字段的都是不同位置,我们最多只能使用最普通的 那么我们果断是由第二种方式,既然我们的每次查询都会进数据库,那么我们直接时间盲注就好了,有个问题在于,比如mysql,我们需要处理单双引号闭合方式不同的问题,当闭合方式不同时,我们就没办法获得数据了。

    49330编辑于 2023-02-21
领券