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MIMIC数据库，常用查询指令SQL基础(一)
SELECT 语句 SELECT 语句用于从数据库中选取数据。 结果被存储在一个结果表中，称为结果集。 SQL SELECT 语法 SELECT column1, column2, ... table_name：要查询的表名称。 语法 以下是 SELECT 语句中使用 WHERE 子句从数据库中读取数据的通用语法： SELECT column1, column2, columnN FROM table_name WHERE [condition1 table_name：要查询的表名称。 column：要查询的字段名称。 value1, value2, ...：要查询的值，可以为多个值。 table_name：要查询的表名称。 column：要查询的字段名称。 value1：范围的起始值。 value2：范围的结束值。
1K40编辑于 2023-07-21 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC-IV 数据查询加速教程
MIMIC-IV查询加速保姆级教程为什么查询会这么慢？ 这个过程时间比较长，2分钟左右，耐心等待我们现在看看文章开头的SQL查询速度， 9秒就完成了查询PostgreSQL 索引索引是加速搜索引擎检索数据的一种特殊表查询。 一个数据库中的索引与一本书的索引目录是非常相似的。拿汉语字典的目录页（索引）打比方，我们可以按拼音、笔画、偏旁部首等排序的目录（索引）快速查找到需要的字。 基础语法如下：CREATE INDEX index_nameon table_name (conditional_expression);隐式索引隐式索引 是在创建对象时，由数据库服务器自动创建的索引。 虽然索引的目的在于提高数据库的性能，但这里有几个情况需要避免使用索引。使用索引时，需要考虑下列准则：索引不应该使用在较小的表上。索引不应该使用在有频繁的大批量的更新或插入操作的表上。
80910编辑于 2023-11-28 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC数据库安装保姆级教程（上）
安装前准备 安装mimic数据库前，我们需要先准备以下工具： 1，postgres数据库安装包； 2，7z安装包； 3，mimiciv数据安装脚本； 4，mimiciv数据集； 为了方便同学们学习，小编已经把上述需要的软件已经整理好了 ，关注“科研收录”公众号，后台回复"mimic安装"就可以获取下载地址。 安装Postgres数据库 mimic官方推荐使用postgres数据库进行数据分析。 安装7z解压缩软件 因为mimiciv数据非常大，压缩包就有8G，导入完数据后将近100G，不能直接将数据导入数据库，需要使用到7z解压缩工具进行数据解压导入。 7z进行mimic的数据导入。
1.7K41编辑于 2023-07-21 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC数据库安装保姆级教程（下)
mimiciv数据文件需要在官网申请权限才可以下载使用，不知道怎么申请的同学，可以参考小编以前的文章： MIMIC数据库下载权限申请保姆级教程（上） MIMIC数据库下载权限申请保姆级教程（下） 安装脚本介绍 01 创建数据库 打开psql 在psql中执行以下代码创建mimiciv数据库 #创建mimic数据库 DROP DATABASE IF EXISTS mimiciv; CREATE DATABASE mimiciv OWNER postgres; 02 创建表 执行以下语句创建表，注意：windows系统下脚本目录请使用正斜杠 #切换到mimiciv数据库 \c mimiciv #生成表，create.sql ，通过7z加载mimiciv数据，其中mimic_data_dir为mimiciv数据存放路径 # 设置mimic数据存放路径 \set mimic_data_dir 'D:/mimic/mimiciv-data /mimic-iv-2.2' # 加载数据 \i D:/workspace/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/load_7z.sq 数据导入过程会比较漫长
2.2K31编辑于 2023-07-21 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC数据库安装保姆级教程（上）
安装前准备 安装mimic数据库前，我们需要先准备以下工具： 1，postgres数据库安装包； 2，7z安装包； 3，mimiciv数据安装脚本； 4，mimiciv数据集； 为了方便同学们学习，小编已经把上述需要的软件已经整理好了 ，关注“科研收录”公众号，后台回复"mimic安装"就可以获取下载地址。 安装Postgres数据库 mimic官方推荐使用postgres数据库进行数据分析。 安装7z解压缩软件 因为mimiciv数据非常大，压缩包就有8G，导入完数据后将近100G，不能直接将数据导入数据库，需要使用到7z解压缩工具进行数据解压导入。 7z进行mimic的数据导入。
97060编辑于 2023-07-21 - 来自专栏从百草园到三味书屋
公开重症监护数据库MIMIC代码仓库介绍
； 医疗领域进入数字化革命（本文是2017年接收），引出形成MIMIC-III数据库； EHR二次分析需要临床专家和数据科学家的合作，在EHR数据库上推导或者定义一些概念是需要资源的，对于没有特别强的临床背景或者数据科学技能的人来说巨大障碍 疾病严重程度评分Severity of illness scores 在回顾性数据库中难以计算 大多都是在前瞻性实验中获取的； 常规收集的数据缺相应元素。 有些特征未纳入结构化电子病历系统，另外则是对某种情况的患者没有统一的协议来定义状态 目前MIMIC代码库中有： acute physiology score(APS)-III simplified acute ，为了让研究更加透明，也需要公开相应数据分析和数据处理的代码 补充 代码库地址：https://github.com/MIT-LCP/mimic-code 之前以MIMIC-III为主，现在mimic-iii 和mimic-iv合并在一起了 mimic数据库为了让研究者访问更加方便，很大一个改变是部署在云上比如google的云平台，云平台上需要big query语法来访问，所以现在代码库关于数据提取的代码更新以
2.1K10编辑于 2023-03-09 - 来自专栏mimic数据库
Python连接MIMIC-IV数据库并图表可视化
之前我们讲解了如何提取MIMIC-IV数据数据： 这种直接SQL提取方式很直接，但是不是最好的方式也不利于数据的进一步统计分析、可视化和预测分析， 所以我们这里讲解下： 如何用python语言连接我们装好的数据库 ， 我们这里连接数据 数据和代码更新：因mimic-iv数据表更新了很多，所以可视化代码也需要更新 数据来源：PostgreSQL数据库 前置条件， 学会安装python环境、anconda代码包集成环境 、ide编辑器（本期文章） 一、 连接mimic-iv数据库 1.1 安装psycopg2包 主要三种方式 Pycharm编辑器 嫌费事的同学也可直接安装Anaconda集成环境 也可用命令行工具 首先，我们定义查询语句，然后读取查询并将结果存成dataframe类型。 三、 小结 在这篇项目中，我们使用python连接数据库方式来获取MIMIC数据库的数据，给出了一些SQL查询的应用例子，以及数据集的探索尝试； 然后基于获取到的数据集，我们利用pandas函数来对数据集进行操作
1.1K10编辑于 2023-12-12 - 来自专栏Golang开发
Redis(7)——慢查询
慢查询日志就是系统在命令执行前后计算每条命令的执行时间，但超过预设阈值时，会将这条命令的相关信息(执行时间 执行耗时 命令的详细信息）记录下来。 设置慢查询时间阈值 slowlog-log-slower-than就是预设的阈值,单位是微妙 默认是10000微妙，如果超过阈值就会被记录在慢查询日志中，lowlog-log-slower-than = slowlog-max-len 慢查询日志最多存储多少条，redis 使用一个列表来存储慢查询日志，slowlog-max-len 就是列表最大长度 slowlog-log-slower-than OK 127.0.0.1:6379> config set slowlog-max-len 1000 OK 127.0.0.1:6379> config rewrite slowlog get 获取慢查询日志 slowlog get [n] 可选参数指定查询条数，慢查询日志由4个属性组成，分别是慢查询日志的id,执行命令的时间戳，执行命令的耗时，具体的执行命令和参数 1) (integer) 1104
78720发布于 2019-05-29 - 来自专栏往期博文
【数据挖掘】任务2：医学数据库MIMIC-III数据处理
在他们的ICU停留期间，病人信息的主要存储库是他们的电子图表。电子图表显示病人的日常生命体征和与他们的护理有关的任何额外信息：呼吸机设置、实验室值、代码状态、精神状态等等。 这是因为在病人的电子图上显示实验室值是可取的，因此这些值是从存储实验室值的数据库复制到存储chartevent的数据库中。 label_events：实验检查信息表，主要是患者的实验室检测记录信息 数据集下载方式：https://download.csdn.net/download/qq1198768105/85259010 导库
2.5K20编辑于 2022-09-01 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC-IV，重症医学数据库介绍和使用说明
一、MIMIC IV数据库简介 MIMIC数据库就是一个可为临床研究者提供临床数据的利器。 另外，MIMIC是一个公开数据库，所有患者的信息都经过脱敏处理，发文不需要临床伦理审查。 以下各类疾病都有涉及： 二、数据库样本量 MIMIC 数据库目前已经产生了MIMIC Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ三个版本 MIMIC数据库包含了BIDMC所有内外科ICU患者的数据，数据团队为保护患者隐私，对患者信息进行去标识化处理 这些生命体征保存在生命体征表中 vitalsign_hl7 table 急诊收治的病人可通过遥测技术进行监测。每分钟的生命体征都被传送到医院的中央服务器，这些生命体征都被记录在这里。 ): 所有文本报告，出院、超声、心电、影像等报告 五、官网及数据库下载网址 官方介绍见 MIMIC官方网站 : https://mimic.mit.edu/ MIMIC-IV 数据库下载见 MIMIC-IV
10.8K70编辑于 2023-07-21 - 来自专栏mimic数据库
Python连接MIMIC-IV数据库并图表可视化
之前我们讲解了如何提取MIMIC-IV数据数据： 这种直接SQL提取方式很直接，但是不是最好的方式也不利于数据的进一步统计分析、可视化和预测分析， 所以我们这里讲解下： 如何用python语言连接我们装好的数据库 ， 我们这里连接数据 数据和代码更新：因mimic-iv数据表更新了很多，所以可视化代码也需要更新 数据来源：PostgreSQL数据库 前置条件， 学会安装python环境、anconda代码包集成环境 、ide编辑器（本期文章） 一、 连接mimic-iv数据库 1.1 安装psycopg2包 主要三种方式 Pycharm编辑器 嫌费事的同学也可直接安装Anaconda集成环境 也可用命令行工具 首先，我们定义查询语句，然后读取查询并将结果存成dataframe类型。 三、 小结 在这篇项目中，我们使用python连接数据库方式来获取MIMIC数据库的数据，给出了一些SQL查询的应用例子，以及数据集的探索尝试； 然后基于获取到的数据集，我们利用pandas函数来对数据集进行操作
83510编辑于 2023-12-12 - 来自专栏mimic数据库
MIMIC数据库提取教程-提取某种疾病下的实验室指标
小编今天以提取患“肺栓塞”患者的实验室指标为例子，教大家如何提取mimiciv数据库的实验室指标。 提取的最终结果如下：02操作步骤第一步，因为mimic中的疾病数据是根据icd编码查找的，所以我们需要先找出“肺栓塞”对应的icd编码，从下表可以看出肺栓塞的icd编码大部分都是以“415“开头的第二步 我们需要根据icd编码从诊断表diagnoses_icd中查出患了“肺栓塞“的患者的信息，并根据患者分组，此处小编已经把所有患者都查出来了，患了“肺栓塞”的患者标志为1，没有患这个病的标志为0第三步，查询实验室指标对应的 itemId，这需要从字典表d_labitems中根据指标标签查询，小编这里只查询了“血红蛋白”的itmeId，我们查询的是血气中的血红蛋白，其他指标查询方法类似第四步，从实验室指标表labevents 查找实验室指标的信息，并根据患者分组03合并结果小编现在已经分别查询出来了患了“肺栓塞”的病人，以及对应的实验室指标，最后需要把这些SQL语句合并后，才能输出在一张表格，其中使用了with子查询，分别把诊断数据跟实验室指标数据作为子查询
1.4K70编辑于 2023-07-21 - 来自专栏Java核心技术图谱：原理·对比·避坑
数据库圣经--聚合查询 子查询 分组查询 合并查询
数据库初始化操作操作流程及作用 截图中的命令是 MySQL 命令行下的数据库初始化步骤： 切换数据库命令：use test_002作用：将当前操作的数据库切换为test_002，提示 “Database ，导入指定路径下的student.sql文件 —— 该文件通常包含表结构创建语句、初始数据插入语句，用于快速初始化数据库。 查看当前库的表命令：show tables作用：查询test_002库下的所有表，结果显示该库已生成 4 张表。 适用场景 主查询需要同时匹配多个字段的条件（如 “薪资和部门 ID 同时等于某个人的信息”）。 常用运算符 =、IN（部分数据库支持≠、NOT IN） 常用嵌套位置 WHERE 子句中。 departments d ON temp.dept_id = d.dept_id WHERE temp.avg_salary ≥ 6000; 注意事项 必须给临时表起别名（如temp_dept）：数据库无法识别无别名的临时表
27310编辑于 2025-12-23 - 来自专栏Devops专栏
数据库-多表查询-连接查询
数据库-多表查询-连接查询 同时查询多张表获取到需要的数据 比如：我们想查询到开发部有多少人，需要将部门表和员工表同时进行查询 多表查询的分类： 准备数据 -- 创建部门表 create table -- 只查询一张表不能查询出员工名字和部门名字，需要使用多表操作 select * from emp, dept; 完成多表操作的两种方式： 表连接 子查询 1. 联合查询 Union （Mysql 支持） Mysql 为了查询所有表的关联数据，可以将左右连接的查询 联合一起来执行。 语法格式： -- 使用union联合合并左右外连接的查询结果，就是相当于全外连接查询了。 -02-24 | NULL | +------+-----------+------+-----------+--------+--------+------------+---------+ 7
14.9K20编辑于 2022-01-17 - 来自专栏python-爬虫
数据库,单表查询,多表查询,子查询
数据库查找方式进阶 一.单表查询 1.查看表单选择段落 1.disinct 所有内容去重:select disinct * from 表名称; 指定字段去重:select disinct 字段 from .......) as 新名字 2.in关键字查询 "查询平均年龄大于25的部门名称 子查询方式: 平均年龄大于25的部门id有哪些? 筛选出平均年龄大于25的部门id 拿着部门id 去查询部门表查询" select name from dept where id in (select dept_id from emp group on emp.dept_id = dept.id group by dept.name having avg(age) >25; 3.exists关键字查询 xists 后跟子查询 子查询有结果是为 既然是表就能链接起来 #综合练习: "查询每个部门工资最高的员工信息 先查询每个部门的最高工资 将查询结果与员工表联合起来 在加条件判断部门id相同并且 最高工资相同 则显示" select *from
6.5K40发布于 2019-07-22 - 来自专栏chimchim要努力变强啊
pg跨库查询
一、背景 不同库的数据表想要关联查询，但是pg不支持跨库查询 二、解决 使用dblink,首先需要在目标数据库上创建dblink，通过执行`create extension dblink`。 示例： db1库的user表 db2库的company表 首先访问db1库,执行以下sql便能查询到db2库company表数据 select id,company_name from dblink(
58510编辑于 2024-09-12 - 来自专栏icecream小屋
数据库查询
内连接：内连接也叫连接，还可以被称为普通连接或者自然连接，内连接是从结果表中删除与其他被连接表中没有匹配行的所有行，所以内连接可能会丢失信息。由于两表之间没有相同数据,会造成数据的缺失.
4.8K30发布于 2019-12-26 - 来自专栏IT云清
7.Elasticsearch请求体查询
本文目录： - 请求体查询 - 空查询 - from 和size - 注意get请求 请求体查询 轻量搜索 —query-string search— 对于用命令行进行即席查询（ad-hoc 然而，为了充分利用查询的强大功能，你应该使用 请求体 search API， 之所以称之为请求体查询(Full-Body Search)，因为大部分参数是通过 Http 请求体而非查询字符串来传递的。 空查询 空查询将返回所有索引库（indices)中的所有文档： GET /_search 查询people索引下的user类型的所有文档： GET people/user/_search 可以在一个、多个或者 _all 索引库（indices）和一个、多个或者所有types中查询: GET people/user,teacher/_search from 和size 分页会用到from 和size GET people/user/_search { "from": 0, "size": 2 } 注意get请求： 某些特定语言（特别是 JavaScript）的 HTTP 库是不允许 GET 请求带有请求体的
84170发布于 2019-01-22 - 来自专栏mimic数据库
手把手教会你认识跟安装MIMIC-IV数据库物化视图
我们在科研分析创作时，每次连表查询的数据都没有存储在电脑磁盘中，每次打开电脑都要重复的输入代码进行查询，耗时耗力。为了将连表查询的结果保存在硬盘每次打开直接查看到数据结果，就需要进行物化视图。 官方的物化视图mimic-iv数据库官方的视图安装脚本可以在官方网站下载，官方地址为：https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/main/mimic-iv/concepts_postgres ，成功进入postgres数据库。 进入默认数据库后，我们输入命令切换mimic数据库，输入【\c mimiciv】可以看到已经进入了mimiciv数据库，接下来我们继续物化视图，找到刚刚官方提供的两个sql，首先执行第一个sql，postgres-funcitons 2.生成物化视图首先，我们切换目录为 C:\Users\Administrator\Desktop\mimic-code-main\mimic-iv\concepts_postgres 执行代码\cd
1.6K10编辑于 2023-11-17 - 来自专栏全栈程序员必看
sql的嵌套查询_sqlserver跨库查询
嵌套查询 1. 概述 2. 普通子查询 2.1. 子查询执行后返回一个值时，可在子查询与父查询之间用比较运算符连接 2.2. 概述 在 SQL 中，一个形如 SELECT-FROM-WHERE的语句称为一个查询快；当一个查询块存在于另一个查询块的 WHERE子句或 HAVING子句中时，称前一个查询块为子查询，称包含它的查询块为父查询或外部查询 ； 采用子查询的查询称为嵌套查询，嵌套查询可将多个简单的查询构造成一个复杂的查询，体现了 SQL 强大的查询能力； 嵌套查询在执行时由内向外处理语句，因为处理父查询时要用到子查询的查询结果，所以子查询的处理要先于它的父查询 普通子查询 普通子查询指子查询可独立完成的查询，它的执行过程为：先执行子查询，然后将子查询的结果用于构造父查询的查询条件，再由父查询根据查询条件确定结果集合； 普通子查询一般可分为如下两种： 2.1. 相关子查询 相关子查询指子查询的查询条件需要引用父查询中相关属性值的查询，是特殊的嵌套查询； 这类查询在执行时，先选取父查询中的数据表的第一个元组，内部的子查询对其中的先关属性值进行查询，再由父查询根据子查询返回的结果判断是否满足查询条件
4.1K20编辑于 2022-09-22
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