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R语言meta分析（10）功能强大的metafor
介绍 Metafor 程序包由Viechtbauer 开发，除可完成 二分类及连续性变量的Meta 分析外，还可行Meta 回归分析、累积Meta 分析及对发表偏倚的Begg’s 检验和Egger’s 此外，Metafor 程序包是R 软件Meta 分析程序包中唯一可以进行混合效应模型（包括单 个、多个分类或连续性变量）拟合运算的程序包， 还可以检验模型系数并获得可信区间，以及对参数 进行精确检验如置换检验 rm(list=ls()) options(stringsAsFactors = F) my_data <- read.csv('da.csv', header = T) library(metafor
4.2K50发布于 2020-08-28 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
漏斗图(Funnel Plots)这下介绍的够全面了吧！推荐收藏~~
R-FunnelPlotR funnel_plot() 「注意」：由于 R-FunnelPlotR包hi基于ggplot2绘制的，则可以通过plot() 函数对其进行更好的定制化操作(如介绍的例子) R-metafor 包绘制 有一种表现形式更加易被理解的漏斗图形式(contour-enhanced funnel plots),这里用到R-metafor包进行绘制，首先，我们构建数据，如下： library("metafor 上述结果依次如下： 标准漏斗图(Standard funnel plot) 标准contour-enhanced 漏斗图 更改colour的contour-enhanced 漏斗图 更多 详细例子可参考：R-metafor [3]R-metafor包: https://www.metafor-project.org/doku.php/plots。
3.6K20编辑于 2022-02-17 - 来自专栏优雅R
「R」元分析：谁更能从治疗中获益？
该方法被我用于19年发表的文章（见参考文献）中，不过当时我是基于metafor包用几行代码试了一下，然后用邮件咨询文章作者，他使用的是Stata，开发了一个叫ipdmetan的包（比我厉害多了~），最后也是使用 Benefits Most from Treatments” (called ‘deft’ approach, see reference #2). metawho is powered by R package metafor Combine with metafor The result of deft_do() contains models constructed by metafor package, so you can use features provided by metafor package, e.g. plot the model results with forest() function from metafor par(op) More usage about model fit, prediction and plotting please refer to metafor package.
78700发布于 2020-07-06 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
漏斗图(Funnel Plots)这下介绍的够全面了吧~
R-FunnelPlotR funnel_plot() 「注意」：由于 R-FunnelPlotR包hi基于ggplot2绘制的，则可以通过plot() 函数对其进行更好的定制化操作(如介绍的例子) R-metafor 包绘制 有一种表现形式更加易被理解的漏斗图形式(contour-enhanced funnel plots),这里用到R-metafor包进行绘制，首先，我们构建数据，如下： library("metafor 上述结果依次如下： 标准漏斗图(Standard funnel plot) 标准contour-enhanced 漏斗图 更改colour的contour-enhanced 漏斗图 更多 详细例子可参考：R-metafor [3] R-metafor包: https://www.metafor-project.org/doku.php/plots。
1.6K10编辑于 2021-12-21 - 来自专栏生物信息与临床医学专栏
R语言入门之R包的安装
接下来我将和大家分享R包的具体安装： 1）首先获取下载的R包的名字，比如下载metafor这个R包，可以先在官网（https://www.r-project.org/）上找到这个包，了解一下这个包的详细内容和使用说明 ，接下来使用： install.packages('metafor') 即可顺利安装该R包。
4.4K30发布于 2020-08-06 - 来自专栏好奇心Log
漏斗图(Funnel Plots)这下介绍的够全面了吧~
R-FunnelPlotR funnel_plot() 「注意」：由于 R-FunnelPlotR包hi基于ggplot2绘制的，则可以通过plot() 函数对其进行更好的定制化操作(如介绍的例子) R-metafor 包绘制 有一种表现形式更加易被理解的漏斗图形式(contour-enhanced funnel plots),这里用到R-metafor包进行绘制，首先，我们构建数据，如下： library("metafor 上述结果依次如下： 标准漏斗图(Standard funnel plot) 标准contour-enhanced 漏斗图 更改colour的contour-enhanced 漏斗图 更多 详细例子可参考：R-metafor
13.2K50发布于 2021-08-26 - 来自专栏R语言交流中心
R语言实现meta分析过程中的可视化展示
今天我们给大家介绍一个在R语言中进行meta分析的工具metafor包。我们通过这个包把相应的meta分析的常规的一些图为大家介绍下。 1. 接下来我们看下实例： library(metafor) res <-rma(ai=tpos, bi=tneg, ci=cpos, di=cneg, data=dat.bcg, measure="RR", 具体的实现实例如下： library(metafor) ### fitfixed-effects model res <-rma(yi, vi, data=dat.hackshaw1998, measure
4.3K31发布于 2019-07-31 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
模型是啥不知道？！这个方法让你更好理解模型参数
可视化效果如下： plot(resulit01) Example01 Of parameters::model_parameters() 「样例二」：Meta-Analysis 模型参数 library(metafor
87420编辑于 2021-12-13 - 来自专栏Listenlii的生物信息笔记
variance-covariance matrices
51298644 3.https://stackoverflow.com/questions/59277529/variance-covariance-matrix-in-r 4.http://www.metafor-project.org
93441发布于 2020-12-16 - 来自专栏优雅R
「R」使用forestplot绘制森林图
ggpubr包提供的森林图是针对变量分析绘图，我也尝试使用了metafor包的forest画图函数，但太灵活了，我除了感觉文档画的不错，但实际使用却很难得到想要的结果。
8.7K64发布于 2020-07-02 - 来自专栏脑电信号科研科普
JAMA Psychiatry：六种精神疾病中皮层厚度的虚拟组织学及共同的神经生物学过程
个不同的脑区的皮层厚度为因变量，年龄、年龄的平方、性别和一些中心特异性的变量为协变量，建立多个多重线性回归模型，寻找每个队列中疾病组与对照组皮层厚度的组间差异；然后将145个队列的被试者按照疾病类别进行荟萃分析，采用“metafor
1K00发布于 2020-11-20 - 来自专栏生信菜鸟团
【孟德尔随机化】GTEx数据和gwas数据可以直接MR吗？
data.table") library("dplyr") library("tidyr") library("foreign") library("tibble") library("metafor
1.6K10编辑于 2024-04-18 - 来自专栏生信星球
meta分析整合多次差异分析结果
1.载入数据 rm(list = ls()) library(dplyr) library(metafor) library(ggplot2) load("degs.Rdata") head(deg1
14210编辑于 2026-01-27 - 来自专栏CreateAMind
使用Jeffreys先验的元分析：经验频率学派性质
所有频率学派方法和区间均通过 R 软件包 metafor⁵⁸ 实现，以下情况除外：ML 轮廓区间使用自编 R 代码实现，精确方法通过 R 软件包 rma.exact¹⁸ 实现，自助法通过 R 软件包 boot⁵⁹
9710编辑于 2026-03-11 - 来自专栏生信菜鸟团
提供代码数据，向Nature学习如何用基因组数据来分析癌症的演化轨迹
通过使用 'metafor' R 包中的 rma 函数，对分支类别中的突变特征和 CpG 位置的 C>T 表示进行了队列水平分析。
35510编辑于 2025-05-09
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