在本文中,我们将探讨 Pandas Melt() 以及如何使用它进行数据处理。 最简单的melt 最简单的melt()不需要任何参数,它将所有列变成行(显示为列变量)并在新列值中列出所有关联值。 df_wide.melt() 这个输出通常没有多大意义,所以一般用例至少指定了 id_vars 参数。 ='Date', value_name='Cases' ) 指定melt的列 Pandas的melt() 函数默认情况下会将所有其他列(除了 id_vars 中指定的列)转换为行。 我们也可以直接从 Pandas 模块而不是从 DataFrame 调用melt()。 本文代码:https://github.com/BindiChen/machine-learning/blob/master/data-analysis/048-pandas-melt/pandas-melt.ipynb
变为三列:ID,trait,y melt 代码 re1 = melt(data = dat,id.vars=c("ID"),variable.name="Loc",value.name="y") head 1.26506123 -1.9666172 0.1533731 -0.06191171 10 ID_9 -0.68685285 0.7013559 -1.1381369 -0.30596266 5.命令解析 melt 这样就可以用melt命令 melt(dat,c("ID","Loc")) > ex1 = data.frame(Cul = rep(1:10,2),Loc=rep(1:2,each=10),rep1=rnorm 5 5 1 -0.95161857 1.8438620 -1.6015362 6 6 1 -0.04502772 -0.6519499 -0.5309065 > ex1_re = melt
Q&A:在melt和dcast之间反复横跳 写在前面 各位水友大家好,自从上一次发布了改版的推文说明之后,大喵和村长收到了很多水友的问题,我们也对这些问题进行了回复,希望能对大家R语言的学习有所帮助,在此先谢谢各位的支持 25mg 1年 规律 郑浮昌 1 NA NA NA NA NA 在这里我们利用了melt这样一个函数。利用这个函数的目的在于,在data.table中进行数据处理贯彻的是向量思维。 通过使用melt能够达到这一效果,在这里使用了melt中的measure选项,通过patterns进行了关于变量名的正则匹配,将五类同属性变量("^用药名称", "^用法", "^用量", "^服药时间 可以发现经过melt之后的数据,编号依据是曾经的观测记录。现在数据的观测记录发生了改变,因此需要对观测记录进行重新编号。在这里利用了1:.N进行by的分组编号。 长表和宽表之间的相互转换,有时会在数据清洗中用到,对melt和dcast两个函数的理解需要深入。
本文为 AI 研习社编译的技术博客,原标题 Touch & Melt: Tactile Abstraction and Robotic Heat-Forming,作者为 Varun Gadh 。
16 melt透视数据小技巧 melt 方法固定某列为一个维度,组合其他列名为另一个维度,实现宽表融化为长表: zip_code factory warehouse retail 0 pandas 的 melt 方法演示如下: In [49]: df = df.melt(id_vars = "zip_code") 若melt方法,参数value_vars不赋值,默认剩余所有列都是 = df.melt(id_vars = "zip_code",value_vars=['factory','reta ...: il']) 结果: zip_code variable 17 pivot 透视小技巧 melt 是融化数据,而 pivot 结冰数据,它们是一对互逆操作。 基础上再 append 它: In [77]: dfa = df_melt2.append(df_melt2) 数据变为: zip_code variable value 0 12345
先来了解Pandas封装的顶层函数部分,其一:melt()函数,它位于Pandas包的最顶层,结构如下: Pandas | melt() melt()函数的原型如下: ? 执行如下操作: pd.melt(df, id_vars=['A'], value_vars=['B', 'C']) 结果如下: ? 这里面引出2个概念: 宽表( wide format) :指列数比较多 长表( long format) :行数比较多 回头核对官方给定melt的功能和参数 ? 思考 melt()函数的作用,它能将宽表变化为长表。在做特征分析列数较多,即为宽表时,我们不妨选择某些列为unpivot列,从而降低维度,增加行数据实现对数据的重构。 官方解释melt()中变化这个词使用了unpivot,因此大胆猜测它的逆操作为 pivot(),下一讲介绍 pivot.
melt 也可以用来做数据格式转换, 请看下图, 我们可以用 melt 把左表转成右表的格式: ? 首先引入文件(已上传): df = pd.read_csv('/Users/rachel/Sites/pandas/py/pandas/11_melt/weather.csv') 输出: ? 使用 melt 转换格式: df1 = pd.melt(df, id_vars='day') 输出: ? 简单, 自定义一下就好了: df1 = pd.melt(df, id_vars='day', var_name='city', value_name='temperature') 输出: ? 以上, 就是关于 melt 的相关操作, 非常简单, 但是还是要自己敲打一遍才好, enjoy~~~
<- melt(count.dist.tb,id.vars="rn") colnames(count.dist.melt.tb) <- c("rid","cid","count") count.dist.melt.ext.tb <- as.data.table(ldply(seq_len(nrow(count.dist.melt.tb)), function(i){ this.row <- count.dist.melt.tb $rid[i] this.col <- count.dist.melt.tb$cid[i] this.c <- count.dist.melt.tb$count[i] other.col.c <- merge(count.dist.melt.tb,count.dist.melt.ext.tb, by=c("rid","cid ")) count.dist.melt.ext.tb[,adj.p.value:=p.adjust(p.value,"BH")] return(count.dist.melt.ext.tb) }
原始图表 library(reshape2) library(ggplot2) ra.melt <- melt(ra) p <- ggplot(ra.melt, aes(x = variable, y 解决方案 堆叠在数据框的原始顺序中 ra.melt$quality <- factor(ra.melt$quality, levels = ra$quality) p <- ggplot(ra.melt (aes(fill = quality), stat = "identity") + labs(x = "group", y = "percentage (%)") factor(ra.melt 颠倒堆叠顺序 ra.melt$quality <- factor(ra.melt$quality, levels = rev(ra$quality)) p <- ggplot(ra.melt, aes( 如果我们想颠倒堆叠顺序但同时保留图例的顺序,则使用参数* position_stack(reverse = TRUE)* p <- ggplot(ra.melt, aes(x = variable, y
标签:pandas,melt()方法 有时,我们可能需要将pandas数据框架从宽(wide)格式转换为长(long)格式,这可以通过使用melt方法轻松完成。 本文通过一个简单的示例演示如何使用melt方法。 图1 考虑以下示例数据集:一个表,其中包含4个国家前6个月的销售数据。然后,我们的目标是将“宽”格式转换为“长”格式,如上图1所示。 ()方法语法 pd.melt(dataframe, id_vars=None, value_vars=None, var_name=None, value_name=’value’, col_level pd.melt(sales, id_vars = 'country') ##下面的代码是等价的 pd.melt(sales, id_vars = 'country', value_vars = ['Jan 然而,通过利用melt()方法里的var_name和value_name参数更容易。
<- melt(count.dist.tb,id.vars="rn") colnames(count.dist.melt.tb) <- c("rid","cid","count") count.dist.melt.ext.tb <- as.data.table(ldply(seq_len(nrow(count.dist.melt.tb)), function(i){ this.row <- count.dist.melt.tb $rid[i] this.col <- count.dist.melt.tb$cid[i] this.c <- count.dist.melt.tb$count[i] other.col.c <- merge(count.dist.melt.tb,count.dist.melt.ext.tb, by=c("rid","cid ")) count.dist.melt.ext.tb[,adj.p.value:=p.adjust(p.value,"BH")] return(count.dist.melt.ext.tb) }
1.png 转化数据格式 数据格式整理为一列为处理,一列为数值的形式 df_melt = df.melt() df_melt.head() variable value 0 ctl 9.614605 1 ctl 7.617131 2 ctl 5.078861 3 ctl 4.749667 4 ctl 5.167490 df_melt.columns = ['Treat','Value'] df_melt.head() Treat Value 0 ctl 9.614605 1 ctl 7.617131 2 ctl 5.078861 4 ctl 5.167490 使用seaborn模块绘制箱线图 import seaborn as sns sns.boxplot(x='Treat',y='Value',data = df_melt ['Value'],df_melt['Treat']) tukey_result = mc.tukeyhsd(alpha = 0.5) print(tukey_result) Multiple Comparison
「看示例:」melt这个函数,运行melt(dd,y~.)会报错,同时,因为这个函数在data.table用法有变化,因此,也会给出warning信息。 > # 既有warning,又有error时,以warning为主 > melt(dd,y~.) Error in match(x, y, 0L) : 'match'需要矢量参数 此外: Warning message: In melt(dd, y ~ .) : The melt generic To continue using melt methods from reshape2 while both libraries are attached, e.g. melt.list, you can prepend the namespace like reshape2::melt(dd).
= data.frame(ID = 1:10,y1=rnorm(10),y2=rnorm(10),y3=rnorm(10),y4=rnorm(10)) dd library(data.table) melt (dd,id=1) 代码解释: 1,dd为模拟生成的数据框数据,第一列为ID,其它几列为性状 2,使用的函数为data.table包中的melt函数 3,melt中,dd为对象数据框,id为不变的列数, 来信者需求: 怎么用R语言把表格CSV文件中的数据变成一列,并且行名为原列名呢,谢谢 1,csv文件,可以用fread函数读取,命名,为dd 2,数据变为一列,如果没有ID这一列,全部都是性状,可以这样运行:melt (dd),达到的效果如下: [2dtmh98e89.png] 所以,就是一个函数melt的应用。
数据重塑(宽转长): melt函数是reshape2包中的数据宽转长的函数 mydata<-melt( mydata, Python中我只讲两个函数: melt #数据宽转长 pivot_table #数据长转宽 Python中的Pandas包提供了与R语言中reshape2包内几乎同名的melt函数来对数据进行塑型 除此之外,我了解到还可以通过stack、wide_to_long函数来进行宽转长,但是个人觉得melt函数比较直观一些,也与R语言中的数据宽转长用法一致,推荐使用。 奇怪的是我好像没有在pandas中找到对应melt的数据长转宽函数(R语言中都是成对出现的)。 R语言: reshape2::melt reshape2::dcast tidyr::gather tidyr::spread Python: pandas-melt pandas-pivot_table
Matter() # 定义状态 states = ["solid", "liquid", "gas", "plasma"] # 定义状态转移 transitions = [ {'trigger':'melt 好的,现在我们具体来看看调用model.melt()到底发生了什么呢? 它其实是调用self.events['melt'].trigger(model), 好的,看看self.events['melt'].trigger(model)里面是啥? _process(f) 好的,原来是调用self.events['melt']._trigger(model),那么这个实际处理函数_trigger()里面又是啥呢? 总结下,到这里我们执行model.melt(),其实就是执行self.events['melt'].transitions['solid'].execute().
主要就是melt和*cast函数的应用。 具体可参考如下图片 ? 参考的r代码如下 names(airquality) = tolower(names(airquality)) head(airquality) # melt md = melt(airquality ,id= c("month","day")) md = melt(airquality,id = c("month","day"),variable.name = "climate_variable",
do.call(grid.arrange, c(plot_list, nrow =2, ncol = 3)) # 绘图 combined_plot 3,分celltype进行绘制 需要前期使用reshape2的melt 对象中提取细胞注释以及基因表达量 gene <- c("CD3D","CSTB","APOE","EGFR","VEGFA","IL6") exprs$Cell <- rownames(exprs) exprs.melt , 10) p5 <- ggplot() + geom_half_violin(data = exprs.melt[exprs.melt$group == 'MET',], = vars(celltype), scales = 'free_y') #在上图基础上叠加,绘图逻辑相同 p51 <- p5 + geom_half_violin(data = exprs.melt [exprs.melt$group == 'PT',], aes(x = gene, y = Expr, fill = group),
用reshape2::melt将2维数据转换为一维数据 df_melt<-reshape2::melt(df,id.vars="x",variable.name="year",value.name="value ") Arguments data data frame to melt id.vars vector of id variables. image.png 将长数据转换为宽数据 将上述df_melt转化为宽数据框df df_cast<-reshape2::dcast(df_melt,x~year,value.var="value")
一 reshape2包中两个主要的函数 melt—将宽型数据融合成长型数据;cast—将长型数据转成宽型数据 此处用R内置的airquality数据集,首先将列名改成小写,然后查看相应的数据 library (reshape2) 1.1 melt函数 (宽转长) id.vars中指定相应变量;variable.name和value.name分别对variable和value列重命名 airMelt1 <- melt(airquality) 1.1.2 将month和day共同作为ID variables(那些能够区分不同行数据的变量共同作为变量),且修改长数据中的列名 airMelt2 <- melt(airquality airMelt3 <- melt(airquality, id.vars = c("month", "day")) 1.2.2 一个数据单元有一个以上的数据。