conda:Linux的App store下载下载conda的精华版-miniconda进入minconda的镜像网站(清华)安装64位/32位的最新版本cd 到自己目录,使用weget下载安装直接运行代码安装 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh-最后激活一下source ~/.bashrc配置镜像安装软件之间爸镜像配置好,可以加快下载速度:# 使用北外的镜像conda channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes使用#查看安装的所有软件 conda list#安装conda install fastqc -yconda install fastqc=0.11.7 -y #指定版本号环境管理不同项目所需呃软件如果处理不同项目可能用到软件的不同版本 我们就可以创建不同的“conda environment”#查看当前环境conda info --envs #(前面带*的就是当前激活的)#创建名为rna-seq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件
Linux 常用解压软件命令 [root@hadoop1 software]# tar -zxvf ifstat-1.1.tar.gz [root@hadoop1 software]# tar xvf test_docs.tar.Z [root@hadoop1 local]# gzip -d kafka.txt.gz [root@hadoop1 local]# bzip2 -d kafka.txt.bz2 Linux 常用的压缩软件命令 [root@hadoop1 local]# tar zcvf jdk1.7.tar.gz jdk1.7/ [root@hadoop1 local]# tar -jcvf mysql.tar.bz2
这是100个 Linux 命令中的第59和60个命令,主要是用于管理软件的 rpm 和 yum 命令,以及 Linux 中关于软件的一些你应该知道的基础知识。 时生成了哪些目录和文件,还可以过滤出提供了哪些命令行工具 rpm -ql httpd rpm -ql httpd | grep 'bin/' (3)查询某个未安装的包的依赖性 rpm -qRp zip-3.0-1.el6. 软件包中的相关概念 软件包的命名 在 rhel/centos/fedora 上,包的名称以 rpm 结尾,分为二进制包和源码包。 包全名包含了一个软件包关于包名、版本号、适用架构等信息。 epel 仓库 vim /etc/yum.repos.d/epel.repo [epel] name=epel baseurl=http://mirrors.sohu.com/fedora-epel/6Server
脱产班Linux周末内容 日期 主题 内容 1 Linux入门 "计算机硬件、操作系统概述 物理服务器、机房、云服务器 GNU/GPL 、开源协议 Linux发行版 VMware虚拟机安装CentOS 7.x Xshell优化 ssh远程连接详解 Linux文件目录结构详解 Linux绝对相对路径 Linux环境变量、系统 系统用户管理、sudo提权 Linux文件目录权限、特殊权限 Firewalld iptables防火墙 软件包管理之yum、rpm Linux计划任务crontab Linux系统服务管理systemctl " 3 linux部署项目 "Linux编译安装python3.x Linux虚拟环境管理virtualenv、virtualenv wrapper Linux下Django group、user、crond、mount Ansible-Roles AnsiblePlaybook部署、管理Nginx 基于python实现RPC服务 " 6
Linux进阶部分又分了很多小的部分,我们刚讲完了Linux日常运维。 讲的那些东西都算是系统自带的,但是Linux作为一个服务器操作系统,肯定是要安装运行软件来满足我们的业务需要,本章基础软件部分,将从下面几个部分来讲解: Linux基础软件-软件安装(本章节) Linux 基础软件-yum(一) Linux基础软件-yum(二) Linux基础软件-ntp Linux基础软件-chrony Linux基础软件-dns(一) Linux基础软件-dns(二) Linux基础软件 -nfs Linux基础软件-lvm Linux基础软件-Selinux&库文件&swap 前面的操作都是基于默认自带的软件,而且我们讲过很多命令,默认最小安装的情况下,都是不自带的,都需要额外安装,那我们应该如何安装这些软件呢 一般卸载用的基本不用,因为它会卸载一些依赖软件,可能导致其他软件不能正常使用。 升级:输入yum update packagename,其中 packagename 是你想要升级的软件包的名称。
所谓 “架构”,就是将软件的结构打好,然后在结构内按部就班的施工就好了。软件架构 6 个方面软件架构涉及六个维度,分别是 “稳定性”、“高性能”、“一致性”、“扩展性”、“观察性” 和 “安全性”。
2.2 Linux的性能监控 本节以Ubuntu Linux为例进行介绍。 1. 负载为1表示当前单核CPU全部占用,如果一台机器有3个CPU,每个CPU都是双核的,这是负载最大值为1×2×3=6。
创建小环境:-n 指定小环境的名字 rna,并指定环境的python版本为python=3 conda create -y -n rna python=3 创建小环境成功后会出现3个done 图片 三、安装软件 图片 1.安装软件的方法: 图片 安装 conda install <software> 出现三个done 显示安装完成 图片 2.安装特定版本 图片 3.特殊情况 图片 4.查看conda 环境中已经安装的软件 conda list #基本用法 conda list fast #查看符合正则表达式的软件 conda list -n rna #查看指定环境的软件 5.删除软件 conda remove <software > conda remove -n rna <software> #删除指定环境里的软件 6.常用命令 图片 7.安装软件的另一种方式:用yml文件安装 • 导出当前环境: conda env export envname > env.yml • 导入环境: conda env create -n envname --file env.yml 8.mamba 安装软件更加丝滑 #安装mamba conda
Linux 软件管理 1、软件管理简介 Redhat和Centos中软件管理是依靠软件包管理器(RPM)来实现的。 RPM(Redhat Package Manager)软件包管理器提供了在linux操作系统中安装,升级,卸载软件(程序)的方法,并提供对系统中所有软件(程序)状态信息的查询;除了这些功能外,RPM软件包管理器还提供了制作软件包的功能 : 主包:bind-9.7.1-1.el5.i586.rpm 子包:bind-libs-9.7.1-1.el5.i586.rpm 子包:bind-utils-9.7.1-1.el5.i586.rpm 6、 软件包的获取途径 6.1 系统发行版本的光盘 linux的ISO镜像文件自带了非常多的RPM安装包,且这些软件版本是最适合当前linux系统的。 [root@zsl ~]# cd /mnt/AppStream/Packages/ [root@zsl Packages]# rpm -ivh zsh-html-5.5.1-6.el8_1.2.noarch.rpm
linux常用shell命令=命令+选项+参数 find 查找文件/目录 cd (change directory)切换目录 cd #root根目录 cd / # 文件不存在建之 touch -c -t 时间 +文件名 #将档案时间改为特定时间 例:touch -c -t 05061803 test.php 将档案时间改为,5月6日 apt-get install 软件/包 #安装包 apt-get update 软件/包 #更新软件 apt-get remove 软件 aaaaa”,追加到名为tet文档的最后 echo dddd > tet 用字符串“dddd”替换原来tet中所有的文档 ls >> tet 将ls指令显示的内容追加到文档tet中 ps -ef 查看linux ps -ef | grep www* 查看所有带www的进程 kill -9 进程号 可以关掉对应的进程 kill -15 进程号 等该进程运行完就关闭该进程 apt-get install 软件包名
1.5 系统初始化进程Linux系统的开机过程是这样的,即先从BIOS开始,然后进入Boot Loader,再加载系统内核,然后内核进行初始化,最后启动初始化进程。 初始化进程作为Linux系统启动后的第一个正式服务,它需要完成Linux系统中相关的初始化工作,为用户提供合适的工作环境。同学们可以将初始化进程粗犷地理解成从我们按下开机键到看见系统桌面的这个过程。 原本以为这对大家的日常使用影响不大,但许多服务管理命令都被替换了,因此如果您之前学习的是RHEL 5或RHEL 6系统,可能真有点不习惯。 2multi-user.target多用户的文本界面3multi-user.target多用户的文本界面4multi-user.target多用户的文本界面5graphical.target多用户的图形界面6reboot.target ~]# ln -sf /lib/systemd/system/multi-user.target /etc/systemd/system/default.target如果有读者之前学习过RHEL 5/6系统
failovermethod=priority 5 baseurl=http://mirrors.cloud.aliyuncs.com/centos/$releasever/os/$basearch/ 6 yum -y install 软件包 安装软件过程中出现依赖安装的时候 Linux系统会暂停提示y或n,则-y 含义是回答全部问题为是 yum -y install nginx 已加载插件:fastestmirror 6.png – 搜索软件库中的 RPM 包 用处:当你不知道你想要安装的软件的准确名称时,你可以用该命令来搜索软件包。你需要在”search”参数后面键入软件的部分名称来搜索。 ’ – 从特定的软件包库安装特定的软件 用处:该命令用于从特定的软件包库安装特定的软件(本例中我们将使用命令从软件包库 epel 中安装 phpmyadmin 软件包) 命令:# dnf –enablerepo 但在我看来,正因如此,所以 DNF 包管理器不会太受那些经验老道的 Linux 系统管理者的欢迎。举例如下: 在 DNF 中没有 –skip-broken 命令,并且没有替代命令供选择。
◆ 概述 病毒和恶意软件越来越成为计算机系统的最大的威胁,近年来,随着linux系统在云计算和企业服务中的应用越来越广泛,对针linux系统的病毒和恶意软件也越来越多,因此,如何保护你的计算机免受病毒的威胁 针对计算机的防护,杀毒软件是一个重要手段,下面我们列出一些你可以获得的最好的免费防病毒软件。 ◆ 适用于 Linux 的最佳防病毒软件 1. ClamAV ClamAV 是一款开源防病毒软件,可检测病毒、恶意软件、特洛伊木马和其他威胁,它也免费提供,这使其成为 Linux 上最好的防病毒软件之一。 Rootkit Hunter 的特点 Rootkit Hunter 使用 SHA-1 哈希比较来扫描和检测恶意软件和其他恶意项目。 它与大多数 UNIX 系统兼容。 它使用命令行界面,重量轻。 6. ◆ 小结 上面为您带来适用于 Linux 系统的最佳杀毒软件。相信从上面的列表中,你能找到适合于自己的最佳linux防病毒软件。保护你的数字资产免受计算机病毒和恶意软件的威胁。
tr命令 # tr 'a-z' 'A-Z' < /etc/fstab # # /ETC/FSTAB # CREATED BY ANACONDA ON THU AUG 14 21:16:42 2014 # # ACCESSIBLE FILESYSTEMS, BY REFERENCE, ARE MAINTAINED UNDER '/DEV/DISK' # SEE MAN PAGES FSTAB(5), FINDFS(8), MOUNT(8) AND/OR BLKID(8) FOR MORE INFO # UU
Linux 常用软件安装 htop apt undate apt install htop Oh My Zsh 安装 # 1.安装zsh包 # centOS yum -y install zsh # raw.githubusercontent.com/robbyrussell/oh-my-zsh/master/tools/install.sh)" # 5.查看主题 ls ~/.oh-my-zsh/themes # 6. plugins/zsh-syntax-highlighting/zsh-syntax-highlighting.zsh >> ~/.zshrc Java 下载 # 解压 tar -zxvf jdk-8u152-linux-x64
1.Linux中安装软件 Linux中安装软件一般有三种方式: 源代码安装 rpm包安装 yum安装 1.1 源代码安装 有些软件本来就是开源的,如果不想用别人直接发布好的软件,我们就可以把源代码下载下来 很简单,我们的机器内部一定内置了目标服务器的地址链接 2.Linux系统的生态 如何选择系统 假设我们要去选择一个系统,Linux系统各版本的底层都是一样的,Linux各系统的区别不会是简单的系统区别, 软件包管理器 yum 3.1 什么是软件包 在Linux下安装软件,一个通常的办法是下载到程序的源代码,并进行编译,得到可执行程序 但是这样太麻烦了,于是有些人把一些常用的软件提前编译好,做成软件包 Linux 机器通过 XShell 传输文件. "el7" 表示操作系统发行版的版本,"el7" 表示的是 centos7/redhat7,"el6" 表示 centos6/redhat6.
/configure 如果您想把软件安装到指定目录,应该用#. 键入如下命令: make clean make distclean 至此,软件的安装结束 3.软件的卸载 3.1.软件的卸载主要是使用rpm来进行的。 卸载软件首先要知道软件包在系统中注册的名称。 -7.8-7.el6.x86_64 3.2.确定了要卸载的软件的名称,就可以开始实际卸载该软件了 #卸载软件,参数e的作用是使rpm进入卸载模式。 对名为[package name]的软件包进行卸载 rpm -e [package name] #由于系统中各个软件包之间相互有依赖关系。如果因存在依赖关系而不能卸载,rpm将给予提示并停止卸载。
软件安装 1.1 软件安装方式 在Linux系统中,安装软件的方式主要有四种,这四种安装方式的特点如下: 安装方式 特点 二进制发布包安装 软件已经针对具体平台编译打包发布,只要解压,修改配置即可 rpm (安装过程需要联网) 源码编译安装 软件以源码工程的形式发布,需要自己编译打包 1.2 安装JDK 上述我们介绍了Linux系统软件安装的四种形式,接下来我们就通过第一种(二进制发布包)形式来安装JDK 从插入模式,切换到指令模式 ESC 6). 按:进入底行模式,然后输入wq,回车保存 :wq 4). RPM:全称为 Red-Hat Package Manager,RPM软件包管理器,是红帽Linux用于管理和安装软件的工具。 实际上是这样的,Linux的远程连接工具有很多,而finalShell只是其中的一种,而还有很多的远程连接工具并没有上传下载的功能,这个时候就需要依赖于lrzsz这个软件了。
在Linux中,安装软件通常有三种途径:既可以使用安装包,也可以借助于APT,还可以从源码安装。他们各有特点,操作方式也不尽相同。 Linux下的软件既可以是软件安装包,就像windows一样,也可以是源码包。 而对于安装包而言,不同的Linux发行版所使用的格式不一样,比如RedHat使用的是yum格式安装包,Ubuntu则使用deb格式 以Ubuntu为例,安装软件的第一种方法,就是搜索并找到所需要的deb 但是这种办法一般不推荐使用,因为Linux下软件一般都只包含最精简的代码,不会包含所依赖的库或者其他函数接口程序,这就导致我们直接安装deb包时常常会发现系统缺少它所依赖的其他库或者服务,不得已需要先安装它们 然而,有时我们需要研究、改造软件源码,在Linux世界中绝大多数的软件都遵循GPL开源条款,我们可以获取源代码并编译他们,例如我们获取了jpeg库的源码,在源码顶层目录中编译安装的三部曲如下: .
localinstall *rpm #当前路径所有包(如装dell omsa包的时候) 缓存rpm包到本地 vi /etc/yum.conf keepcache=1 #保留缓存的头文件 (headers) 和软件包