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来自专栏Y大宽
转录因子（TF）的作用方式
co-activator或co-inhibitor到TF-DNA复合体 ---- 基础转录条件和差异调节 Basal转录调节真核生物中，一类重要的TF是general transcription factors（GTFs ），是转录所必需，大多数GTFs不直接结合DNA，而是和RNA pol相互作用的大的转录预起始复合体的一部分。最常见的GTFs有TFIIA,TFIIB,D,E,F，H。这些预复合体结合在他们调节的gene的DNA上游区域。
3.5K41发布于 2018-09-30
来自专栏生信技能树
鉴定新的lncRNA之上游流程
samtools sort -@ 4 -o 3.hisat2_bams/$sample.bam - stringtie -p 4 -G $gtf \ -o 4.stringtie_gtfs 合并gtf后鉴定和筛选新的lncRNA conda activate lncRNA ls `pwd`/4.stringtie_gtfs/*gtf > 5.lncRNA/gtf.list cd 5.lncRNA
2.5K41发布于 2020-03-25
来自专栏生信技能树
lncRNA-seq数据分析之新lncRNA鉴定和注释视频课程众筹
fastp gffcompare # conda search gffcompare mkdir 0.qc 1.raw_fq 2.clean_fq 3.hisat2_bams 4.stringtie_gtfs samtools sort -@ 4 -o 3.hisat2_bams/$sample.bam - stringtie -p 4 -G $gtf \ -o 4.stringtie_gtfs
2K21发布于 2020-03-17
来自专栏生信技能树
服务器被关机，不妨试试看用你的Mac电脑跑NGS流程
fastp gffcompare # conda search gffcompare mkdir 0.qc 1.raw_fq 2.clean_fq 3.hisat2_bams 4.stringtie_gtfs samtools sort -@ 4 -o 3.hisat2_bams/$sample.bam - stringtie -p 4 -G $gtf \ -o 4.stringtie_gtfs
1.9K20发布于 2020-04-14
来自专栏开发运维工程师
技术：Java-Web基础｜生成图片验证码（一）
/8AjR306ayjskb7LfPkrdb5JSxQFQDsOAcE8kZxXoGsXE+m+GLu6sbQnULK1k+ywBWkDyKmVjGOWViFHYnIHDYxPomj2Ph7SbLS9Gtfs /8AjR306ayjskb7LfPkrdb5JSxQFQDsOAcE8kZxXoGsXE+m+GLu6sbQnULK1k+ywBWkDyKmVjGOWViFHYnIHDYxPomj2Ph7SbLS9Gtfs
1.3K01编辑于 2023-11-03
来自专栏生信菜鸟团
鉴定lncRNA流程全套代码整理
重装：重装samtools后，单独测试第一个样本： ---- stringtie 定量 stringtie -p 4 -G $gtf \ -o 4.stringtie_gtfs
4.8K32编辑于 2023-08-23

转录因子（TF）的作用方式

鉴定新的lncRNA之上游流程

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服务器被关机，不妨试试看用你的Mac电脑跑NGS流程

技术：Java-Web基础｜生成图片验证码（一）

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