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  • 来自专栏生信菜鸟团

    R tips:ggplot2进行多维原位图绘制

    scale_fill_gradientn(colors = RColorBrewer::brewer.pal(9, 'Blues')) + theme_minimal() + ggnewscale ) + scale_fill_gradientn(colors = RColorBrewer::brewer.pal(9, "Reds")) + labs( fill_ggnewscale "dat2" ) p_heat_combined 如下图所示,两组数据以不同颜色方案(蓝色是dat1,红色是dat2)的方式组合到了一起,如果不需要分开两个颜色方案,可以关闭上述代码中的ggnewscale

    50800编辑于 2025-01-07
  • 来自专栏小明的数据分析笔记本

    用R语言的ggplot2包复现一下Nature正刊论文中的气泡图

    , "B"="#019e74", "D"="#397eb9"))+ ggnewscale ::new_scale_color()+ ggnewscale::new_scale("size")+ geom_point(data=dat01.longer, aes

    51221编辑于 2024-06-18
  • 来自专栏小明的数据分析笔记本

    跟着Nature microbiology学作图:R语言ggplot2堆积柱形图柱子单独配色/多个图例排序

    Actinobacteriota")), name="Phylum", guide=guide_legend(order=1))+ ggnewscale Negativicutes")), name="Class", guide=guide_legend(order=2))+ ggnewscale Lachnospirales")), name="Order", guide=guide_legend(order=3))+ ggnewscale

    1K50编辑于 2023-08-23
  • 来自专栏小明的数据分析笔记本

    跟着Cell学作图:R语言ggplot2作图展示差异表达的基因

    data.frame(x=c("A","B","C","D"), y=c(20,10,20,10)) 接下来是作图代码 library(ggplot2) library(ggnewscale color=newcol1))+ scale_color_manual(name=NULL, values = c("red","darkgrey"))+ ggnewscale

    1.6K40编辑于 2022-02-17
  • 来自专栏小明的数据分析笔记本

    可能会用到的30个R语言包~第四期

    ezcox 很方便的做Cox回归分析模型和森林图 23 ggstream 公众号 DataCharm 看到的推文 河流图绘制技巧分享 之前有人在公众号留言问过鱼型图,但是自己也不知道,不过好像就是这个 24 ggnewscale github主页 https://github.com/eliocamp/ggnewscale 比如两组数据同时画到一张图上,每组数据都分别映射颜色,这个时候如果要用scale_color_manual ()更改颜色的话是不能按照不同的数据集来修改的,这个时候可以用这个包中的函数 如下代码 library(ggnewscale) library(ggplot2) df1<-data.frame(A=1:

    2K10发布于 2021-05-07
  • 来自专栏小明的数据分析笔记本

    跟着Gut学画图:R语言ggtree包画弦图的简单小例子

    alpha=0)+ geom_tiplab(aes(color=group),show.legend=F)+ scale_color_manual(values = col )+ ggnewscale hratio=3)+ scale_color_manual(values = c("#2398c5","#febf68")) 最终结果 image.png 这里还用到了ggnewscale

    1.5K30发布于 2021-08-31
  • 来自专栏小明的数据分析笔记本

    跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2画图展示捐赠者的临床概况

    scale_color_manual(values = c("Colon"="#d38e91", "Liver"="#1f639a"))+ ggnewscale "Rectum"="#eb553a", "Liver"="#206599"))+ ggnewscale

    68220编辑于 2023-01-06
  • 来自专栏生信技能树-R

    R包下载

    Biocductor_packages <- c('GEOquery', 'hgu133plus2.db', 'ggnewscale

    45800编辑于 2023-03-28
  • 来自专栏R语言数据分析指南

    环状注释热图-进阶绘制技巧

    ❞ library(tidyverse) library(ggsci) library(ggnewscale) library(MetBrewer) df1 <- read_tsv("data.xls

    39710编辑于 2024-06-18
  • 来自专栏R语言数据分析指南

    R优雅的给环状热图添加显著性标记

    关注下方公众号下回更新不迷路 加载R包 library(ggtreeExtra) library(ggtree) library(treeio) library(tidyverse) library(ggnewscale

    99710编辑于 2023-08-18
  • 来自专栏生信菜鸟团

    多分组差异分析结果的两种展示形式

    ,"0d vs. 9d","3d vs. 6d","3d vs. 9d","6d vs. 9d"), y=c(20,22,24,10,10,10)) library(ggplot2) library(ggnewscale newcol2,y=log2FoldChange, color=newcol1))+ scale_color_manual(name=NULL, values = c("red","darkgrey"))+ ggnewscale

    1.1K10编辑于 2024-05-20
  • 来自专栏R语言数据分析指南

    NC图表绘制-ggplot2绘制多组填充热图

    最终结果 R包版本 ther attached packages: [1] MetBrewer_0.2.0 ggsci_3.0.0 ggnewscale_0.4.9 lubridate_

    34910编辑于 2024-04-02
  • 来自专栏R语言的基本操作

    GEO芯片数据下载和在R语言的准备

    Biocductor_packages <- c('GEOquery', 'hgu133plus2.db', 'ggnewscale

    46612编辑于 2024-03-15
  • 来自专栏生信菜鸟团

    GEO数据分析流程之芯片1

    Biocductor_packages <- c('GEOquery', 'hgu133plus2.db', 'ggnewscale

    26010编辑于 2024-06-28
  • 来自专栏R语言数据分析指南

    [nmicrobiol图表复现] ggtree绘制离散型环状热图

    /treedata-book/chapter7.html ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(ggtreeExtra) library(ggnewscale

    1K10编辑于 2022-12-20
  • 来自专栏小明的数据分析笔记本

    如何使用R语言ggtree包在进化树上标记自己取样测序的样本

    tree,groupInfo) ggtree(new.tree,aes(color=group))+ scale_color_manual(values = c("red","gray"))+ ggnewscale

    65210编辑于 2024-02-23
  • 来自专栏小明的数据分析笔记本

    跟着Nature Plants学作图:R语言ggplot2甜甜圈图包裹饼图

    )+ scale_fill_manual(values = c("#deebf7","#9ecae1","#3182bd"), name=NULL)+ ggnewscale

    64110编辑于 2024-04-03
  • 来自专栏R语言数据分析指南

    [Microbiome图表复现] 常规热图添加一些新元素

    (linkET) library(psych) library(reshape2) library(magrittr) library(ggtext) library(ggstar) library(ggnewscale

    61411编辑于 2023-11-30
  • 来自专栏数据科学(冷冻工厂)

    ChIP-seq 分析:教程简介(1)

    clusterProfiler')BiocManager::install('enrichplot')BiocManager::install('msigdbr')BiocManager::install('ggnewscale

    1.1K00编辑于 2023-02-05
  • 来自专栏R语言数据分析指南

    个性化气泡图:创意绘制新风尚

    加载R包 library(tidyverse) library(scales) library(MetBrewer) library(magrittr) library(ggpubr) library(ggnewscale

    37710编辑于 2024-05-17
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