- 综合排序
- 最热优先
- 最新优先
- 来自专栏生物信息学、python、R、linux
ggforce画图
ggforce基于对ggplot2的扩展，可以更好的展示相应的视图，并根据数据绘制轮廓以及区域放大。 1.形状的扩展与收缩 library(ggplot2) library(ggforce) # Adapted from geom_polygon documentation ids <- factor( ggforce通过提供一个辅助函数将ggplot的数据形式转换促进这项工作。
1.8K10发布于 2020-06-04 - 来自专栏R语言数据分析指南
ggforce优雅的绘制多组椭圆图
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用「ggforce」包来自定义绘制多组椭圆图可以看作与韦恩图类似但是在布局上也有些许不同，下面小编就通过一个案例来进行展示数据为随意构建无实际意义仅作图形展示用 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggforce) library(PrettyCols) 自定义颜色 bg <- "white" # 设置背景颜色为白色
61720编辑于 2023-08-18 - 来自专栏生信补给站
ggforce|绘制区域轮廓-区域放大-寻找你的“onepiece”
ggforce是ggplot2的扩展包，“擅长”于根据数据绘制轮廓以及区域放大。先将整体分为几个重要的“版图”，然后根据“线索”重点放大后在此区域进行精细“搜寻”，最终找到“ONEPIECE”！? 一 载入数据，R包 #载入R包 library(tidyverse) library(ggforce) library(nycflights13) #使用airports数据集 head(airports 二 ggforce绘制轮廓 1 添加轮廓 geom_mark_...()系列函数能够非常简单的围绕数据组绘制轮廓,以下四个参数可以绘制不同的轮廓： geom_mark_circle() geom_mark_ellipse 3 更改主题设置 ggforce作为ggplot2的扩展包，也能直接使用ggplot2的主题设置 p + geom_mark_rect(aes(label = tzone), show.legend = 三 ggforce区域放大 如果“宝藏”的区域就在上述的位置之一（全图展示），现在发现更可能在某个区域，那就使用facet_zoom()函数放大或聚焦在特定区域。
1.4K20发布于 2020-08-06 - 来自专栏R语言数据分析指南
ggforce优雅的绘制线圈棒棒糖图
欢迎关注R语言数据分析指南 加载R包 library(tidyverse) library(janitor) library(ggtext) library(ggforce) library(ggfx
46150编辑于 2023-07-11 - 来自专栏R语言数据分析指南
ggforce优雅的绘制线圈棒棒糖图
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用「ggforce」包来自定义画线圈来绘制棒棒糖图，下面小编就通过一个案例来进行展示数据为随意构建无实际意义仅作图形展示用，希望各位观众老爷能够喜欢。 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(janitor) library(ggtext) library(ggforce) library(ggfx) library(colorspace
31220编辑于 2023-08-18 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
跟着Genome Biology学作图：R语言ggplot2+ggforce画桑基图
桑基图可以简单理解成两个柱子，然后柱子之间有连线，柱子可以借用ggplot2的geom_rect()函数来做,连线可以借助ggforce的geom_diagonal_wide()来做，但是相对比较繁琐， 2+0.1,ymin=76.15,ymax=100), fill="#af9dcc")+ theme_void() image.png 链接指定的区域 library(ggforce
2K11编辑于 2023-01-06 - 来自专栏作图丫
绘图-完美简单的分组边界你应该学这个！
ggforce设计的目的是为ggplot2图形进行补充，更好的反映数据的分布情况。在本文中，主要介绍了ggforce对散点图添加分组边界和一些附加的可视化功能。 ggforce安装 ###安装ggforce及其他需要用到的包 install.packages("tidyverse") install.packages("ggforce") install.packages = "\\N") %>% ggplot(aes(lon, lat, color = tzone)) + geom_point(show.legend = FALSE) p 用ggforce 是ggplot2的一个很棒的补充包，可以很清晰地反映数据的分布趋势和特征，除了本文提到的内容以外，ggforce还有很多有趣的功能，比如ggforce包中geom_sina参数可以整合小提琴图和箱型图去对数据进行可视化 希望大家可以在绘图的时候应用到ggforce去让你的图片更加美观！
1K10编辑于 2022-03-29 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
R语言的ggplot2+ggforce包绘制散点图并添加分组边界
之前的推文介绍过ggplot2绘图添加椭圆分组边界和圆形分组边界，借助的函数分别是 stat_ellipse() ggforce包里的geom_circle()函数 今天查找桑基图的资料的时候发现了一份介绍 ggforce这个包的使用方法的文章 https://rviews.rstudio.com/2019/09/19/intro-to-ggforce/ ，发现发现添加分组边界还有其他的实现方法，今天的推文记录一下 首先是矩形的分组边界 使用的是 geom_mark_rect() 函数 df<-iris colnames(df)<-paste0("V",1:5) library(ggplot2) library(ggforce 添加圆形的分组边界 使用到的是geom_mark_circle()函数 df<-iris colnames(df)<-paste0("V",1:5) library(ggplot2) library(ggforce 添加椭圆分组边界 用到的是geom_mark_ellipse（）函数 df<-iris colnames(df)<-paste0("V",1:5) library(ggplot2) library(ggforce
2.3K30发布于 2021-03-15 - 来自专栏优雅R
「R」ggplot2 图区域放大
这个功能今天工作的时候需要，就搜了一下，有个 ggforce 包可以做这个事情（之前还 mark 过，哈哈）。 简单用示例代码展示如何使用它，主要是根据数据的选择进行放大或者根据坐标范围进行放大。 安装： install.packages("ggforce") 加载： library(ggforce) 先看一个正常的图： ggplot(iris, aes(Petal.Length, Petal.Width 更多学习见包文档：https://ggforce.data-imaginist.com/[1] 参考资料 [1]https://ggforce.data-imaginist.com/: https:/ /ggforce.data-imaginist.com/
2.4K10发布于 2020-07-02 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
这种显著标明怎么绘制？一个技巧解决，超简单~~
具体内容如下： R注释操作 Python注释操作 R注释操作 在使用R进行可视化绘制中，起注释作用的绘图函数有很多，这里还是介绍基于ggplot2绘图体系中的绘图函数，主要介绍R-ggplot2和R-ggforce R-ggforce 注释操作 R-ggforce包中有几个绘图函数可以实现较为灵活的注释效果，且语法较为简单。 官网为：https://ggforce.data-imaginist.com/reference/index.html。 "black",size=3) + scale_fill_nejm() + labs( title = "Example of ggforce "black",size=3) + scale_fill_nejm() + labs( title = "Example of ggforce
86630编辑于 2022-10-25 - 来自专栏数据驱动实践
ggplot2拓展功能：局部放大和边际密度图
02 — ggforce：局部放大 ggplot拓展功能 第二部分的局部放大。 #-----ggforce：Zoom in a scatter plot-------# # Key function: facet_zomm() [in ggforce] (Pedersen 2016 The R code below zoom the points where Species == "versicolor". library(ggforce) ggplot(iris, aes(Petal.Length
2K10发布于 2020-11-03 - 来自专栏单细胞天地
让Single cell UMAP注释支棱起来
分享是一种态度 最近在画UMAP的时候发现有的时候细胞亚群的注释与点重合颜色上不是很搭配，同事提出让注释“支棱”起来，首先想到的是ggforce中的geom_mark_ellipse，实践中遇到一些问题 （比如，ggforce会受outlier影响，看起来比较乱），于是有了这一篇Single cell的记录。 ggforee 受outlier影响 尝试用ggforce注释 library(dplyr) library(Seurat) library(SeuratData) library(patchwork ) library(ggforce) ##InstallData("pbmc3k") data("pbmc3k") points <- data.frame(pbmc3k.final@reductions 因为有一些cluster（Naive CD4 T）存在异常值，ggforce中的函数会包含所有的点。所以应该将异常值去掉，这个方法有很多，我使用的是之前用到的置信椭圆的方法。
1.3K20发布于 2021-09-15 - 来自专栏R语言数据分析指南
ggplot2优雅绘制别致条形图
❝本节来介绍如何使用「ggplot2结合ggforce」来绘制别具一格的条形图，下面小编通过一个案例来进行展示，图形仅供展示用，希望各位观众老爷能够喜欢。 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) library(ggforce) 导入数据 df <- read_tsv("data.tsv") 定义圆点数据 # annotate(geom = "segment", x = 102 / 10, xend = 115 / 10, y = .5, yend = .5, color = "white") + # 使用 ggforce ::geom_circle 添加一个圆形 ggforce::geom_circle(data = tibble(x = xo, y = yo), aes(x0 = xo, y0 = yo, r =
57230编辑于 2023-09-11 - 来自专栏生信技能树
文献配套GitHub发表级别绘图之本质上是散点图的PCA图
我下面展示第二种方案：借助ggforce这个包里的facet_zoom()函数。不过还是原文有些出入，我还是很喜欢R语言+AI美化，这才是王道！ # install.packages("ggforce") library(ggforce) # 通过xy设置聚焦区域 plt+facet_zoom(y=pcaScores$PC2<20 & pcaScores $PC2> -15, split = F) ggforce包是由Thomas Pedersen开发的ggplot2扩展包。 有兴趣可以了解以下：https://rviews.rstudio.com/2019/09/19/intro-to-ggforce/ 。实用性非常强，以后再来介绍这个包吧！
69020编辑于 2022-03-03 - 来自专栏R语言数据分析指南
R中优雅的绘制环状sina图
加载R包 library(tidyverse) library(lubridate) library(scico) library(ggforce) 导入数据 df <- read_csv("data.csv month(gas_day_started_on)) 数据可视化 df %>% ggplot(aes(x=mth, y=gas_in_storage_t_wh,group=mth)) + # 使用ggforce 包中的geom_sina函数绘制sina图 ggforce::geom_sina(aes(color=gas_in_storage_t_wh), alpha=.5, shape=21)+ # 添加文本标签
1.6K30编辑于 2023-09-27 - 来自专栏单细胞天地
你到底想要什么样的umap/tsne图?
今天我们就主要地看一下ggforce这个包带给我们的可能性。 umap$layers umap$scales umap$mapping umap$coordinates umap$facet umap$plot_env umap$labels 然后，我们请出ggforce library(ggforce) umap + facet_zoom(x = RNA_snn_res.2 == "14") 想要细致刻画某个亚群，这不失是一个方法： ? 参考资料 https://www.r-bloggers.com/the-ggforce-awakens-again/ https://rviews.rstudio.com/2019/09/19/intro-to-ggforce
2.7K10发布于 2020-07-09 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2甜甜圈图包裹饼图
今天的推文我们来模仿一下论文中的figure2a image.png 我的思路是用scatterpie这个R包来做，首先画一个大的饼图，然后画一个稍微小一点的圆，再画一个稍微小一点的饼图就能够实现上图的效果，画圆用到的是ggforce image.png 因为论文中提供的数据需要手动整理成以上的格式，为了节省时间，我这边只整理一组数据 加载需要用到的R包 library(readxl) library(scatterpie) library(ggforce
63610编辑于 2024-04-03 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
可能会用到的R语言包~2
image.png ggforce 绘制部分分离的饼图 https://www.data-imaginist.com/2016/announcing-ggforce/ ?
1.3K10发布于 2020-11-05 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
跟着Nature Plants学作图：R语言ggforce做甜甜圈饼图展示基因组中转座子的比例
00941-x 柑橘体细胞变异2021NP.pdf 今天的推文我们来复现一下论文中的Figure4a image.png 里面的饼图是三类转座子的一个比例，外面一圈是再进一步分类的转座子的比例 这个用R包ggforce 里面的geom_arc_bar()函数很容易实现 首先是构造作图数据 library(ggforce) dat01<-data.frame(x=c("A","B","D"),
82230编辑于 2023-11-03 - 来自专栏庄闪闪的R语言手册
基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（2）
graphics and image processing library(rsvg) # Render svg image into a high quality bitmap library(ggforce 0.9, margin=unit(c(0.1,0.1,0.1,0.1), "cm")) ) inset 修改坐标轴值样式 使用 ggforce polygons <- ggplot() + ggforce::geom_regon(aes(x0=c(seq(3,10,1)), y0=rep graphics and image processing library(rsvg) # Render svg image into a high quality bitmap library(ggforce 并使用 stat_function() 在图形中将其添加； 设置自定义主题(my_theme)，简化代码，统一主题，方便绘制其他图形使用； 使用 annotation_custom() 添加子图； 使用 ggforce
1.3K20编辑于 2022-05-24
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号