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FeaturePlot_scCustom作图
在浪费一些时间之后，我发现了有团队推出了FeaturePlot_scCustom() function, 请移步 https://samuel-marsh.github.io/scCustomize/index.html 根据官网的介绍，代码如下：# Show specific features in each sample.p <- FeaturePlot_scCustom(seurat_object = object1 plots <- lapply(1:length(p), function(i) p[[i]])所以最终的代码如下：# Show specific features in each sample.p <- FeaturePlot_scCustom
38410编辑于 2024-07-13 - 来自专栏生信补给站
scRNA分析 | 定制 美化FeaturePlot 图，你需要的都在这
（2）scCustomize 修改 p11 <- FeaturePlot_scCustom(seurat_object = sce2, features = "CD3D") p22 <- FeaturePlot_scCustom name = "RdBu"), pt.size = 1, split.by = "sample" ,ncol = 4) （2）scCustomize 中FeaturePlot_scCustom 函数 ，算是修正了这个小bug FeaturePlot_scCustom(seurat_object = sce2, features = "CD3D", split.by = "orig.ident
12K30编辑于 2023-08-25 - 来自专栏生信技能树
展示你的特征基因：带"辣椒粉"的markers基因umap图
################ umap4：scCustomize library(viridis) library(Seurat) library(scCustomize) # 绘图 p <- FeaturePlot_scCustom 生成一个存储多个ggplot对象的list p_merge <- list() for(i in 1:length(g)) { # 打印动态 print(g[i]) # 绘图 p_merge[[i]] <- FeaturePlot_scCustom 生成一个存储多个ggplot对象的list p_merge <- list() for(i in 1:length(g)) { # 打印动态 print(g[i]) # 绘图 p_merge[[i]] <- FeaturePlot_scCustom
55000编辑于 2025-03-11 - 来自专栏生信技能树
5种方式美化你的单细胞umap散点图
marker： ################## umap4：scCustomize library(viridis) library(Seurat) library(scCustomize) FeaturePlot_scCustom 现在找不见了，当时还专门在群里问了来着哈哈哈哈） 还可以轻松地修改配色： # 修改颜色 # Set color palette pal <- viridis(n = 10, option = "D") FeaturePlot_scCustom
9.9K00编辑于 2025-01-11
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