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From raw counts to TPM
Allgene) <- Allgene$Geneidallgeneexpression <- Allgene[,3:9]geneLength <- Allgene$LengthtpmMatrix <- convertCounts
51740编辑于 2023-07-27 - 来自专栏分析工具
Count数据转换为TPM数据方法整理-常规方法、DGEobj.utils和IOBR包
结果是一致的方法二：R包 DGEobj.utilsload("gfe.Rdata")#提取上面处理好的基因长度列effLen = gfe$lengthlibrary(DGEobj.utils)CC_res <- convertCounts 求高手指点~综合上述分析，暂时还是选择常规方法和DGEobj.utils R包中的convertCounts函数吧~参考资料：1、https://hbctraining.github.io/Training-modules /planning_successful_rnaseq/lessons/sample_level_QC.html2、https://rdrr.io/cran/DGEobj.utils/man/convertCounts.html3
1.3K10编辑于 2024-07-13
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